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Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.22 0.17 -0.02 -5.56 0.22 -0.65 -0.46 -0.74 -0.26 -0.93 -0.77 -0.39 -1.33 -1.27 -0.52 -0.63 -0.62 -0.58 0.4 -0.31 -0.36 -0.86 0.13 0.17 1.01 0.01 -0.22 0.06 -0.06 -0.26 0.66 -0.29 0.21 0.21 -0.12 1.02 0.19 -0.14 -0.04 -0.37 1.08 -0.04 -0.04 0.94 -0.41 1.05 -0.02 -0.03 0.04 0.06 0.19 0.24 0.44 0.42
-0.15 0.38 0.37 -5.04 0.12 -0.62 0.17 -0.32 -0.58 -0.51 -0.29 -0.34 -0.97 -0.53 -0.41 -0.45 -0.42 -0.47 -0.03 -0.19 -0.35 -1.02 0.13 0.06 0.99 0.21 -0.19 0.04 -0.05 -0.18 0.67 -0.31 0.08 0.17 -0.23 0.78 0.25 0.21 0.08 -0.38 0.77 -0.24 -0.12 0.82 -0.33 0.72 -0.14 -0.06 0.02 0.03 0.08 0.1 0.29 0.31
-0.02 0.6 0.33 -3.44 0.3 -0.51 -0.02 -0.12 -0.45 -0.44 -0.23 0.07 -0.32 -1.72 -0.63 -0.64 -0.65 -0.61 0.07 0.1 -0.08 -0.16 -0.1 -0.24 1.05 0.33 -0.7 -0.12 -0.3 -0.49 0.92 -0.49 -0.22 -0.05 -0.49 0.88 0.29 0.07 0.14 -0.44 0.95 -0.19 -0.23 1.11 -0.3 0.92 -0.25 -0.1 -0.36 -0.3 -0.11 -0.11 0.19 0.19
-0.07 0.71 0.67 -3.56 0.48 -0.44 -0.3 -0.08 0.15 -0.3 -0.15 0.2 -0.75 -0.53 -0.25 -0.44 -0.34 -0.37 0.33 0.09 -0.03 -0.47 -0.11 -0.09 0.64 0.06 -0.38 0.02 -0.22 -0.18 0.46 -0.31 0.13 0.07 -0.17 0.33 0.13 -0.06 0.0 -0.25 0.52 -0.1 -0.05 0.48 -0.29 0.66 0.03 -0.04 -0.15 -0.13 -0.04 0.01 0.14 0.09
-0.09 0.5 0.17 -5.02 0.43 -0.54 -0.84 -0.01 0.3 -0.17 0.02 0.25 -0.42 -0.11 -0.11 -0.13 -0.2 -0.18 0.25 0.06 -0.06 -0.15 -0.15 -0.26 0.67 0.21 -0.56 -0.19 -0.43 -0.36 0.34 -0.39 -0.03 -0.06 -0.33 -0.02 0.28 0.15 0.18 -0.28 0.75 -0.12 -0.09 1.04 -0.26 0.75 -0.11 -0.07 -0.23 -0.24 -0.19 -0.2 0.12 0.12
-1.24 0.92 -0.93 -4.41 - -0.02 - -2.28 -2.33 -1.9 -1.92 -1.87 -2.4 -0.8 0.83 0.43 1.05 1.03 -1.99 -2.7 -2.31 - 0.89 -0.46 0.99 0.31 -0.36 0.47 -0.03 -0.33 -0.27 -0.94 -0.39 -0.76 -0.45 -0.55 -0.27 0.23 0.16 0.37 1.28 0.13 0.19 1.09 -0.39 1.21 -0.08 0.66 0.34 0.39 0.67 0.88 0.78 0.93
0.38 0.55 0.13 -4.88 0.74 -0.43 -1.87 0.01 0.2 -0.22 -0.12 0.06 -0.4 -1.67 -0.21 -0.26 -0.36 -0.19 0.75 0.24 0.17 0.7 -0.58 0.1 0.59 -0.06 -0.64 -0.03 -0.41 -0.32 0.71 -0.18 0.44 0.06 0.27 -0.36 0.02 -0.16 -0.14 -0.26 0.77 0.07 -0.01 0.55 -0.38 0.87 0.14 -0.13 -0.54 -0.49 -0.23 -0.29 -0.28 -0.34
0.11 1.1 1.49 -3.1 0.9 -0.35 -1.83 0.05 0.06 -0.03 0.03 0.23 -0.1 1.45 0.22 0.13 0.18 0.15 0.75 0.31 0.25 -1.4 -0.61 -0.26 0.15 -0.18 -0.97 -0.4 -0.53 -0.58 0.2 -0.39 -0.01 -0.25 -0.19 0.02 -0.03 -0.24 -0.22 -0.37 -0.02 -0.22 -0.22 0.14 -0.42 0.05 -0.17 -0.3 -0.46 -0.48 -0.41 -0.47 -0.32 -0.33
0.04 0.7 0.74 -3.32 0.24 -0.41 -0.08 -0.08 0.04 -0.25 -0.19 0.14 -0.83 -0.4 -0.15 -0.14 -0.18 -0.15 0.18 -0.03 -0.16 -0.37 -0.13 -0.11 0.61 0.21 -0.54 -0.14 -0.3 -0.45 0.35 -0.42 -0.08 -0.06 -0.34 0.98 0.2 0.06 0.11 -0.51 0.78 -0.26 -0.27 0.71 -0.44 0.6 -0.19 -0.19 -0.15 -0.16 -0.12 -0.1 0.16 0.15
0.29 0.79 0.78 -3.96 0.17 -1.04 -10.09 -0.3 -0.29 -0.47 -0.41 -0.06 -0.54 0.36 0.58 0.65 0.59 0.58 0.05 -0.03 -0.08 -10.45 -0.19 0.1 0.58 0.06 -0.8 -0.28 -0.29 -0.38 0.42 -0.22 0.09 -0.02 -0.23 0.26 -0.07 -0.07 -0.12 -0.55 0.72 -0.31 -0.14 0.83 -0.35 0.65 -0.11 -0.25 0.03 -0.09 -0.17 -0.17 0.21 0.23
0.01 0.72 0.68 -3.81 0.5 -0.48 -0.06 -0.02 0.07 -0.25 -0.09 0.2 -0.78 -0.55 -0.31 -0.39 -0.37 -0.42 0.3 0.09 -0.11 -0.32 -0.13 -0.03 0.61 0.34 -0.37 -0.14 -0.35 -0.44 0.4 -0.32 0.09 0.18 -0.2 0.39 0.26 0.2 0.16 -0.37 0.68 -0.18 -0.18 0.53 -0.31 0.62 -0.17 -0.14 -0.22 -0.21 -0.12 -0.14 0.1 0.07
-0.06 -0.06 - -0.35 -2.47 0.33 0.21 -0.83 -0.62 -1.01 -1.05 -0.43 -1.06 1.12 0.22 0.13 0.5 0.35 -0.09 -0.96 -0.91 0.81 -0.1 0.38 0.0 -0.12 -1.27 0.17 -0.02 -0.45 -0.23 -0.15 1.15 0.39 0.87 -0.71 0.05 -0.05 -0.19 -0.8 1.05 -0.19 0.31 0.5 -0.27 0.47 0.34 0.22 -0.43 -0.28 -0.18 0.04 0.11 0.05
0.41 0.71 0.59 -3.11 0.12 -0.28 0.04 -0.02 0.11 -0.27 -0.12 0.04 -0.42 -0.13 -0.48 -0.5 -0.55 -0.48 0.16 0.11 0.06 0.23 0.04 -0.25 0.98 -0.04 -0.14 -0.1 -0.29 -0.4 0.3 -0.93 -0.54 -0.53 -0.86 0.86 -0.03 -0.29 -0.2 -0.76 1.0 -0.41 -0.44 0.88 -0.6 0.9 -0.52 -0.56 -0.03 -0.01 0.04 0.05 0.29 0.34
0.22 0.58 0.27 -5.15 0.27 -0.31 -0.3 -0.22 0.01 -0.43 -0.29 0.06 -1.13 -1.67 -0.49 -0.49 -0.44 -0.38 0.07 -0.1 -0.31 -0.55 0.37 0.26 0.74 0.3 -0.26 0.24 0.03 -0.09 0.41 -0.31 0.08 0.11 -0.22 0.04 0.26 0.12 0.18 -0.64 0.43 -0.44 -0.19 0.48 -0.45 0.36 -0.24 -0.15 0.21 0.28 0.36 0.35 0.58 0.61
-0.24 0.29 0.55 -4.18 -0.42 -0.82 -0.87 -0.64 -0.32 -0.75 -0.65 -0.35 -0.96 -0.96 -0.52 -0.5 -0.64 -0.61 -0.21 -0.23 -0.44 -1.31 0.12 -0.02 0.98 0.1 -0.27 0.31 -0.13 -0.0 0.65 -0.17 0.24 0.23 0.0 -0.01 0.38 0.07 0.17 -0.07 0.8 0.21 0.22 0.8 -0.18 0.85 0.29 0.23 0.15 0.12 0.23 0.25 0.44 0.46
0.21 0.67 1.55 -4.48 -0.05 -0.05 0.62 0.43 0.72 0.43 0.41 0.72 0.23 0.24 0.07 0.06 0.01 0.07 0.15 0.6 0.55 0.69 -0.24 -0.57 0.89 -1.61 -0.71 -0.21 -0.59 -0.38 0.54 -0.86 -0.6 -1.02 -0.88 -0.34 -1.29 -1.68 -1.5 -1.06 0.75 -0.62 -0.52 0.41 -1.2 0.81 -0.35 -0.71 -0.55 -0.36 -0.22 -0.22 -0.29 -0.6
-0.16 0.19 -0.07 -5.58 0.22 -0.58 -0.14 -0.44 -0.44 -0.45 -0.41 -0.44 -1.09 -0.27 -0.35 -0.39 -0.43 -0.44 0.13 -0.43 -0.42 -0.46 0.18 0.07 0.83 0.19 -0.17 0.24 -0.03 0.1 0.46 -0.35 0.09 0.13 -0.2 0.51 0.29 0.07 0.14 -0.26 0.69 -0.12 -0.0 0.6 -0.36 0.66 0.09 0.05 0.21 0.19 0.25 0.29 0.43 0.38
0.06 0.34 0.94 -4.34 -0.31 -0.37 -0.11 -0.32 -0.17 -0.62 -0.42 -0.13 -0.99 -0.08 -0.37 -0.38 -0.27 -0.33 0.21 0.09 -0.02 -0.38 0.0 -0.09 0.69 -0.16 -0.53 0.18 0.06 0.0 0.61 -0.62 0.14 0.03 0.0 -0.83 0.12 0.03 0.04 -0.04 0.59 0.12 0.13 0.55 -0.19 0.61 0.23 0.13 -0.13 -0.2 0.14 0.27 0.38 0.18
0.22 0.17 0.2 -5.53 -0.27 -0.27 -0.53 -0.4 -0.18 -0.54 -0.37 -0.27 -0.85 -3.82 -0.86 -0.88 -0.83 -0.83 -0.37 -0.15 -0.41 -0.12 -0.17 0.42 1.08 -0.1 -0.22 0.09 0.13 -0.21 0.95 -0.02 0.33 0.61 0.42 0.28 -0.13 0.15 -0.19 0.09 0.96 0.16 -0.02 0.87 0.04 1.04 0.1 0.07 -0.31 -0.38 -0.03 -0.05 0.04 0.08
-0.09 0.5 0.41 -3.88 0.4 -0.27 -0.62 -0.35 -0.17 -0.44 -0.39 -0.09 -0.8 -1.22 -0.24 -0.3 -0.27 -0.2 0.52 -0.08 -0.13 -0.9 0.11 0.12 0.47 0.32 -0.4 0.17 -0.02 -0.07 0.35 -0.01 0.36 0.31 0.02 0.02 0.31 0.14 0.18 -0.27 0.18 -0.07 0.15 0.31 -0.14 0.23 0.15 0.17 0.01 0.04 0.12 0.14 0.31 0.27
-0.34 0.77 0.3 -4.87 0.96 -0.07 -0.13 0.21 0.46 0.17 0.28 0.43 -0.35 -0.69 0.11 0.08 0.01 0.0 0.59 0.37 0.24 -0.35 -0.47 -0.69 1.08 -0.33 -0.72 -0.42 -0.7 -0.58 0.76 -0.94 -0.51 -0.76 -0.87 0.56 -0.2 -0.42 -0.29 -0.76 0.98 -0.61 -0.55 0.83 -0.74 1.16 -0.51 -0.56 -0.26 -0.48 -0.46 -0.35 0.04 0.08
-0.05 0.27 0.01 -5.65 -0.0 -0.7 -1.51 -0.2 -0.23 -0.45 -0.26 -0.19 -0.6 -2.02 -0.19 -0.19 -0.23 -0.24 -0.03 -0.26 -0.35 -1.24 0.04 0.32 1.23 0.22 -0.36 0.0 -0.06 -0.27 0.85 -0.1 0.11 0.14 -0.09 0.69 0.05 0.07 0.03 -0.26 0.76 -0.14 -0.06 0.94 -0.14 0.85 -0.15 -0.05 -0.07 -0.09 0.05 -0.0 0.33 0.37
0.11 0.24 1.21 -4.71 -0.57 -0.36 -0.02 0.22 -0.1 0.09 0.21 -0.03 -0.43 -0.05 -0.57 -0.65 -0.51 -0.59 -0.28 0.31 0.11 0.81 -0.21 -0.26 0.49 -0.27 -0.24 -0.04 -0.03 -0.15 0.46 -0.26 -0.27 -0.08 -0.17 -0.07 -0.16 -0.06 -0.19 -0.16 0.79 0.01 0.01 0.48 -0.14 0.95 0.12 -0.06 -0.35 -0.28 -0.14 -0.12 -0.08 -0.18
0.96 0.99 1.16 -4.26 0.52 -0.75 -2.89 -0.01 -0.26 -0.36 -0.05 0.0 -0.58 -0.58 0.39 0.37 0.12 0.42 0.36 0.04 0.06 -2.09 -0.33 -0.04 0.32 0.24 -0.69 -0.06 0.02 -0.13 -0.21 -0.77 -0.06 -0.37 -0.27 0.61 0.23 0.43 0.25 -0.34 0.34 -0.04 -0.29 -0.04 -0.2 0.32 0.15 -0.21 -0.51 -0.48 -0.16 -0.16 0.11 -0.08
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-0.43 0.57 0.45 -6.98 1.1 -0.48 -0.75 -0.6 -0.27 -0.84 -0.71 -0.4 -1.44 1.41 0.57 0.46 0.53 0.5 1.2 -0.05 0.12 0.38 -1.01 -0.56 -0.84 -0.17 -1.37 -0.69 -0.67 -0.76 0.25 -0.4 0.59 0.17 0.33 0.04 -0.07 -0.09 0.05 0.01 0.5 0.13 0.07 0.33 0.11 0.52 0.17 0.24 -0.57 -0.66 -0.62 -0.89 -0.59 -0.58
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0.1 -0.56 -6.62 -4.45 -1.9 0.4 -0.25 -0.75 -0.48 -0.94 -0.55 -0.75 -3.41 -0.38 1.13 0.75 0.83 0.86 0.54 -1.72 -1.56 -1.53 0.47 -0.41 -0.87 -0.86 -2.39 0.47 -0.44 0.22 -0.22 -2.09 0.74 -0.61 0.07 -0.59 -0.45 -1.58 -0.35 -0.49 1.81 -0.14 0.37 0.04 -1.2 0.82 0.64 0.4 0.02 0.39 0.13 1.02 1.02 1.13
0.24 1.01 1.11 -4.14 0.44 -0.6 -1.1 -0.04 -0.15 -0.18 -0.13 0.17 -0.42 -2.02 0.37 0.24 0.22 0.17 0.72 0.28 0.16 -1.76 -0.38 -0.19 0.84 0.37 -1.04 -0.28 -0.28 -0.61 0.41 -0.78 -0.27 -0.27 -0.59 0.49 0.39 0.15 0.17 -0.64 0.64 -0.31 -0.26 0.72 -0.51 0.44 -0.23 -0.25 -0.34 -0.44 -0.29 -0.35 0.11 0.17
-0.01 0.34 0.21 -3.87 0.5 -0.27 0.11 -0.01 0.22 -0.11 0.12 0.3 -0.33 -1.28 -0.25 -0.34 -0.25 -0.3 0.13 0.14 -0.02 -0.22 0.05 -0.03 0.73 0.32 -0.32 -0.02 -0.28 -0.27 0.3 -0.37 -0.13 -0.01 -0.37 0.11 0.14 0.08 0.15 -0.24 0.44 -0.2 -0.18 0.5 -0.27 0.4 -0.2 -0.1 -0.07 0.03 0.07 0.06 0.28 0.34
0.56 0.66 0.96 -5.32 -0.38 -0.68 0.61 -0.2 0.21 -0.99 -0.52 0.28 -0.79 -0.38 -0.8 -0.57 -0.71 -0.53 -0.42 -0.17 -0.06 0.36 -0.16 -0.24 0.52 -0.25 0.04 0.06 -0.5 -0.09 0.79 0.14 0.05 -0.06 -0.09 -0.4 -0.22 -0.23 -0.26 0.1 0.91 0.4 0.06 0.61 0.13 0.6 0.24 -0.05 0.07 -0.11 -0.25 -0.79 -0.13 0.14
0.05 0.62 0.39 -4.0 0.52 -0.53 -0.25 0.18 0.17 -0.06 0.09 0.26 -0.48 -0.12 -0.22 -0.18 -0.24 -0.27 0.1 0.07 -0.1 -0.46 -0.08 -0.18 0.8 0.17 -0.45 -0.14 -0.51 -0.35 0.48 -0.49 -0.15 -0.14 -0.43 0.02 0.27 0.05 0.14 -0.45 0.88 -0.27 -0.24 0.73 -0.6 0.84 -0.19 -0.17 -0.18 -0.19 -0.15 -0.13 0.14 0.15
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0.25 0.74 0.56 -4.38 0.62 -0.23 -0.07 -0.0 0.21 -0.11 0.04 0.27 -0.44 0.16 -0.13 -0.11 -0.16 -0.17 0.41 0.11 0.01 -0.36 -0.24 -0.37 0.81 0.01 -0.63 -0.29 -0.51 -0.44 0.61 -0.57 -0.21 -0.19 -0.42 0.89 -0.1 -0.13 -0.08 -0.49 0.55 -0.48 -0.34 0.59 -0.5 0.76 -0.36 -0.23 -0.3 -0.31 -0.25 -0.18 0.08 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.