Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.03 0.28 -0.9 -2.75 1.56 0.65 -0.13 0.2 0.12 -0.28 -0.01 -0.39 -0.99 -0.26 -0.05 -0.17 -0.41 -0.13 0.9 0.15 0.22 -0.14 -0.78 -0.57 -0.71 0.77 -1.02 -0.44 -0.02 -0.69 0.34 -0.26 0.18 -0.14 0.15 -0.44 0.88 1.17 0.99 -0.51 0.2 -0.35 -0.13 -0.22 -0.18 -0.13 -0.0 -0.23 -1.39 -1.08 -0.34 0.01 0.04 -0.4
0.34 0.23 0.27 -3.5 1.1 0.66 0.35 0.29 0.51 0.45 0.35 0.52 -0.42 -0.26 -0.21 -0.17 -0.21 -0.26 0.34 0.12 0.17 0.84 -0.46 -0.44 -0.18 -0.27 -0.1 -0.3 -0.18 -0.3 -0.34 -0.3 -0.32 -0.42 -0.31 -0.23 -0.13 0.03 -0.26 0.1 0.35 0.12 -0.31 0.09 0.08 0.25 -0.19 -0.21 -0.46 -0.45 -0.38 -0.35 -0.11 -0.3
0.13 0.87 1.14 -3.24 1.41 0.75 0.52 -0.01 0.63 -0.33 -0.22 0.76 -0.95 0.36 0.28 0.29 0.38 0.47 0.96 0.65 0.74 0.33 -0.63 -0.03 -0.39 -0.97 -0.95 -0.77 -0.36 -0.89 -0.03 -0.2 0.22 0.21 0.17 -0.98 -1.14 -0.53 -1.19 -0.91 0.42 -0.75 -0.65 0.01 -0.59 0.08 -0.73 -0.53 -0.71 -0.73 -0.63 -0.53 -0.53 -0.63
0.33 -0.13 0.06 -4.52 0.64 0.38 0.1 0.11 0.84 0.63 -0.08 1.43 -1.41 0.43 -0.44 -0.52 -0.65 -0.63 0.02 0.75 0.73 0.85 -1.1 -1.41 -0.59 0.46 0.71 -0.91 -0.3 -0.74 -0.69 0.91 -0.81 -0.99 -0.86 0.71 0.29 1.0 0.36 0.02 0.37 0.52 -0.66 -0.27 0.12 -0.01 -0.63 -0.84 -1.25 -1.07 -1.16 -0.72 -0.96 -1.11
-0.46 -0.39 -0.74 -4.85 0.5 0.01 0.01 -0.51 0.49 -1.07 -0.65 0.49 -1.22 -0.53 -0.43 -0.32 -0.28 -0.2 0.7 0.6 0.28 0.07 -0.29 0.05 0.32 0.23 -0.33 -0.05 -0.17 -0.42 -0.66 -0.83 0.22 -0.02 0.18 -1.36 0.58 0.56 0.43 -0.3 1.28 0.1 -0.16 0.67 -0.02 1.21 -0.01 -0.23 -0.69 -0.61 -0.35 -0.23 0.24 0.21
1.31 0.95 -0.65 -5.73 1.47 0.69 0.79 0.57 -0.11 0.19 0.39 -0.35 -1.53 -0.48 0.23 0.31 0.31 0.2 0.15 -0.6 -0.63 -0.25 -0.29 -0.1 -0.78 -0.89 -0.82 0.13 -0.51 -0.06 1.1 -0.44 0.22 0.13 -0.13 -0.01 -0.42 -0.98 -0.83 -0.02 0.16 -0.07 -0.13 -0.23 -0.5 -0.15 0.04 -0.06 -0.4 -0.11 0.08 -0.7 -0.51 -0.92
0.32 -0.27 -1.06 -5.27 1.19 0.73 0.37 0.38 0.76 0.19 0.26 0.49 -0.67 -0.06 -0.18 -0.13 0.04 0.08 0.8 0.76 0.55 1.09 -0.79 -0.89 0.06 -0.04 -0.03 -0.78 -1.17 -0.79 -0.39 -0.88 -0.75 -1.4 -1.0 1.37 -0.13 -0.23 -0.17 -0.73 0.79 -0.42 -0.99 0.17 -0.59 0.96 -0.78 -0.95 -0.74 -0.38 -0.5 -0.29 -0.05 -0.09
0.11 0.03 0.59 -2.95 1.23 1.03 -0.18 -0.07 0.47 -0.21 -0.05 0.43 -0.98 -0.84 -0.09 -0.22 -0.24 -0.15 0.58 -0.26 -0.21 0.2 -0.38 -0.81 -0.69 0.59 -0.05 -0.13 -0.17 -0.14 -2.17 -1.42 -0.62 -1.05 -0.8 0.3 0.72 0.63 0.69 0.35 0.01 0.29 -0.21 -0.29 0.2 -0.04 0.12 -0.15 -0.68 -0.28 -0.12 -0.22 0.3 0.37
-0.54 -0.8 -1.18 -4.35 1.26 0.61 0.29 -1.13 -0.25 -1.18 -0.91 -0.37 -1.02 -0.03 0.21 0.19 0.38 0.08 1.11 -0.64 -0.4 -0.46 -0.16 -0.5 -0.47 0.51 0.36 -0.19 -0.52 -0.22 0.43 -0.76 -0.06 -1.09 -0.38 -0.11 0.69 0.38 0.75 0.31 0.25 0.27 -0.2 -0.2 0.23 0.35 -0.26 -0.23 0.58 0.24 0.15 -0.25 0.25 0.26
0.11 0.73 0.99 -3.3 1.34 0.56 0.17 0.46 0.57 0.2 0.36 0.55 -1.06 0.43 -0.29 -0.38 -0.21 -0.37 0.29 0.25 0.22 0.97 -0.85 -0.48 -0.43 -0.17 -0.41 -0.5 0.04 -0.49 -0.44 -0.11 -0.13 0.36 0.02 0.02 -0.2 0.22 -0.22 -0.09 0.29 -0.03 -0.39 -0.2 0.21 0.08 -0.42 -0.35 -0.83 -0.79 -0.84 -1.0 -0.91 -0.86
-1.78 -2.21 -4.62 -2.3 1.13 0.91 -0.67 -0.33 0.06 -0.03 -0.46 0.89 -0.78 -0.42 -1.88 -1.84 -1.71 -2.4 -1.75 0.41 -0.05 -0.09 -0.05 -1.33 -0.18 0.46 0.6 0.53 -0.97 -0.36 -0.21 -0.4 -0.49 -1.91 -0.82 0.24 0.6 0.35 0.46 0.34 1.34 0.82 0.38 0.28 0.0 0.95 0.3 -0.16 -1.12 -0.15 1.07 0.55 0.63 0.35
-1.28 -0.81 -0.54 -4.76 1.3 0.55 0.12 -0.42 0.52 -0.92 -0.73 0.51 -0.14 0.13 -0.24 -0.18 -0.25 -0.42 0.48 0.17 0.29 -0.41 -0.11 -0.18 -0.01 0.63 -0.08 -0.24 -0.18 -0.29 0.05 -0.38 0.05 -0.3 0.05 0.17 0.43 0.37 0.48 -0.14 0.34 0.03 -0.21 0.06 -0.15 0.34 -0.16 -0.25 -0.32 -0.27 -0.2 0.11 0.39 0.2
0.76 0.75 0.68 -3.6 0.99 0.6 0.78 0.05 0.28 -0.45 -0.23 0.27 -0.99 -0.17 -0.06 -0.03 0.04 -0.1 0.01 -0.0 0.17 0.78 -0.44 -1.11 0.21 0.13 -0.37 -0.51 -0.36 -0.41 -0.26 -0.89 -0.46 -0.9 -0.7 0.49 0.12 0.28 0.09 -0.37 0.67 -0.22 -0.49 0.43 -0.09 0.26 -0.48 -0.31 -0.68 -0.33 -0.18 -0.13 0.02 -0.2
0.44 0.11 1.0 -2.24 1.27 0.37 0.74 0.01 0.19 -0.24 0.02 0.13 -0.51 -0.13 -0.79 -0.72 -0.64 -0.83 -0.93 0.03 -0.09 0.66 -0.21 -1.16 -0.17 -0.38 0.39 -0.09 0.23 -0.19 -1.09 -1.2 -1.1 -0.87 -1.03 0.04 -0.06 0.66 -0.17 0.33 0.35 0.45 -0.11 0.18 0.61 0.3 -0.15 -0.1 -0.25 -0.58 -0.44 0.15 0.56 0.36
0.6 0.88 0.79 -2.56 1.05 0.53 0.48 -0.47 -0.41 -1.47 -0.85 -0.46 -1.08 -0.45 -0.01 0.05 -0.08 0.05 0.64 -0.33 -0.28 -0.2 -0.62 -0.51 -0.57 1.02 -0.39 -0.53 -0.42 -0.67 -0.31 -0.54 0.17 -0.34 0.01 0.95 0.8 0.93 0.96 0.02 0.07 0.01 -0.39 -0.26 0.17 -0.25 -0.43 -0.37 -0.79 -0.39 -0.46 -0.35 -0.13 -0.44
0.58 0.22 0.64 -2.37 0.98 0.33 0.38 -0.02 -0.33 -0.33 -0.17 -0.04 -0.28 -0.5 -0.45 -0.07 -0.51 -0.56 -0.29 -0.01 -0.35 0.11 0.2 -0.27 0.23 0.46 0.44 0.07 -0.02 0.01 -0.53 -1.14 -0.47 -0.53 -0.66 -0.12 0.51 0.24 0.46 -0.0 0.11 0.27 -0.32 0.06 0.08 0.05 -0.3 -0.24 -0.01 -0.05 0.01 0.17 0.26 0.21
0.05 0.6 1.59 -2.16 2.28 0.21 0.14 -0.04 0.57 -0.26 -0.13 0.53 -1.54 -0.96 -1.32 -1.41 -1.06 -1.09 -0.17 -0.25 -0.17 -0.06 -1.17 1.11 -0.34 -1.88 -0.08 -0.82 0.31 -1.37 0.57 1.28 0.89 1.91 0.75 -0.5 -1.74 -1.05 -2.11 -0.74 -0.05 -0.61 -0.87 -0.11 0.22 0.02 -1.01 -0.75 -1.23 -1.72 -1.55 -1.26 -1.08 -0.71
-0.19 0.21 0.31 -4.01 0.81 0.62 0.4 -0.0 0.47 -0.16 -0.11 0.45 -0.78 0.01 -0.44 -0.44 -0.32 -0.36 0.17 0.05 -0.0 0.37 -0.51 -0.49 0.46 0.7 -0.56 -0.7 -0.46 -0.98 -0.23 -0.67 -0.27 -0.51 -0.35 0.44 0.36 0.94 0.42 -0.58 1.18 -0.26 -0.57 0.64 -0.16 0.8 -0.74 -0.67 -1.03 -0.9 -0.93 -0.16 0.33 0.24
0.94 1.05 0.6 -3.49 0.81 0.31 0.2 -0.58 0.05 -0.84 -0.29 -0.31 -0.66 -0.63 -0.25 -0.33 -0.24 -0.16 -0.28 -0.33 -0.21 -0.61 -0.32 -0.75 -0.15 0.5 -0.13 -0.14 -0.21 -0.29 -0.14 -0.45 -0.17 0.01 -0.35 0.77 0.57 0.61 0.32 -0.24 0.55 -0.04 0.0 0.32 0.08 0.27 -0.08 0.06 -0.61 -0.24 -0.19 -0.17 0.0 0.01
0.4 0.29 0.13 -3.77 0.68 0.18 0.42 0.28 0.45 0.04 0.08 0.42 -0.3 0.27 -0.83 -0.79 -0.78 -0.88 -0.53 -0.02 -0.01 0.73 -0.46 -0.41 -0.11 0.57 0.14 -0.4 0.11 -0.37 0.16 -0.43 -0.13 0.06 -0.04 0.19 0.52 0.66 0.61 0.35 0.22 0.13 -0.28 0.1 0.53 0.08 -0.36 -0.1 -0.57 -0.55 -0.49 -0.72 -0.68 -0.8
0.3 0.64 0.28 -3.58 0.73 0.61 0.6 -0.49 0.02 -0.72 -0.26 -0.14 -0.11 0.16 -0.35 -0.41 -0.41 -0.11 -0.18 0.14 0.15 -0.12 -0.38 -0.08 0.38 -0.32 -0.39 -0.34 -0.53 -0.44 0.6 -0.41 0.31 -0.33 0.19 0.84 -0.37 -0.29 -0.49 -0.22 0.68 -0.23 -0.26 0.45 -0.21 0.59 -0.27 -0.23 -0.46 -0.25 -0.3 0.06 0.43 0.25
0.92 0.58 -0.48 -3.05 1.27 0.22 0.57 -0.01 0.44 0.56 0.46 -0.05 -0.91 -0.09 -0.55 -0.52 -0.87 -0.71 -0.43 -0.18 -0.34 0.27 -0.5 0.11 0.14 -0.54 -0.84 -0.16 0.12 -0.67 0.93 -0.29 0.54 0.5 0.41 -0.52 -0.31 -0.18 -0.48 -0.58 0.81 -0.15 -0.22 0.24 -0.19 0.6 -0.41 -0.05 -1.03 -0.7 -0.45 -0.01 -0.09 -0.17
-0.43 -0.46 -0.5 -4.12 0.47 0.1 -0.25 0.14 -0.18 -0.05 0.06 0.09 -1.46 -0.91 -0.71 -0.97 -0.77 -0.7 -0.11 0.08 -0.11 -0.16 -0.64 -0.25 0.33 0.56 -0.24 -0.11 -0.42 -0.32 0.47 -0.16 0.38 -0.09 0.31 0.37 0.62 0.43 0.56 0.04 1.12 0.59 0.05 0.84 -0.15 1.01 0.25 -0.21 -0.46 -0.7 -0.51 -0.24 0.06 -0.01
0.14 0.15 0.28 -4.14 0.93 0.82 0.33 0.14 0.42 -0.07 0.03 0.48 -0.23 -0.75 -0.05 -0.05 0.13 -0.01 0.7 0.41 0.33 0.8 -0.33 -0.6 -0.2 0.48 -0.14 -0.38 -0.03 -0.57 -0.74 -0.98 -0.62 -0.8 -0.73 0.2 0.38 0.58 0.35 -0.4 0.23 -0.25 -0.64 -0.12 -0.05 0.11 -0.66 -0.49 0.02 -0.22 -0.25 -0.28 -0.08 -0.1
0.02 -0.14 2.02 -2.4 1.75 0.43 0.26 -0.11 -0.68 0.03 -0.59 -0.1 -0.5 -0.85 -0.44 -0.29 -0.25 -0.25 0.62 -0.35 -0.19 0.31 -1.06 -2.14 0.42 -0.13 -0.46 -0.73 -0.79 -0.56 0.34 -1.72 -1.51 -1.86 -1.73 0.79 0.3 0.11 0.29 -0.32 1.31 -0.17 -0.87 0.81 -0.53 1.19 -0.41 -0.71 -0.61 -0.5 -0.55 -0.48 -0.08 -0.02
0.82 0.9 0.88 -2.56 0.98 0.52 0.82 0.05 0.06 -0.57 -0.24 0.07 -0.29 -0.01 -0.04 0.15 0.0 0.05 0.44 0.26 0.52 0.55 -0.33 -1.13 -0.04 0.27 -0.35 -0.45 -0.49 -0.54 -0.52 -1.27 -0.5 -1.03 -0.8 0.38 0.06 0.52 0.15 -0.4 0.39 -0.27 -0.51 0.26 -0.12 0.41 -0.44 -0.34 -0.59 -0.38 -0.26 -0.47 -0.35 -0.51
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0.05 -0.3 -0.7 -4.07 0.77 0.52 0.67 0.18 -0.0 -0.22 -0.22 0.04 -0.27 -0.11 -0.5 -0.65 -0.67 -0.6 0.08 -0.21 -0.29 0.24 -0.6 -0.14 -0.27 0.46 -0.25 -0.82 -0.44 -0.66 0.71 0.98 0.21 0.49 0.34 0.54 0.41 0.81 0.51 -0.09 0.51 0.06 -0.5 0.22 0.22 0.4 -0.56 -0.31 -0.83 -0.76 -0.56 -0.44 -0.14 -0.17
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0.2 -0.27 -2.63 -5.23 0.22 0.22 -0.06 0.3 0.98 1.22 0.53 1.36 -1.13 -0.06 -1.55 -1.4 -1.72 -1.67 -0.35 0.27 -0.07 1.14 -1.03 -1.47 0.3 0.14 0.82 -0.97 -0.55 -0.98 0.34 0.9 -0.51 -0.68 -0.48 0.98 0.06 0.46 0.0 -0.13 0.72 0.48 -0.83 0.51 0.3 0.54 -0.75 -0.76 -1.41 -0.84 -0.8 -0.25 -0.16 -0.26
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-0.09 0.85 0.31 -3.93 1.08 0.42 -0.69 -0.21 -0.09 -0.48 -0.03 -0.21 -1.41 -0.31 0.3 0.43 0.15 0.18 1.14 -0.0 0.14 -0.36 -0.32 -0.63 -0.66 -0.16 0.06 0.13 0.21 -0.01 -0.9 -1.25 -0.1 -0.21 -0.27 -0.52 0.28 0.22 0.02 0.15 -0.01 0.43 0.28 -0.47 0.4 -0.11 0.43 0.3 -0.17 -0.23 -0.11 -0.16 -0.12 -0.4
0.46 0.37 0.61 -3.13 0.86 0.79 0.6 -0.1 0.36 -0.33 -0.2 0.67 -0.94 0.16 -0.01 -0.17 0.14 -0.03 0.63 -0.11 0.02 0.42 -0.45 -0.26 -0.6 0.3 -0.16 -0.27 0.01 -0.42 0.3 -0.63 0.33 -0.05 0.06 -0.31 0.2 0.5 0.23 -0.06 -0.16 -0.12 -0.26 -0.29 0.23 -0.49 -0.22 -0.13 -0.59 -0.52 -0.44 -0.59 -0.54 -0.81
0.22 0.83 0.77 -4.52 2.26 0.89 0.59 -0.07 0.47 -0.46 -0.13 0.44 -0.65 -0.02 -0.1 -0.27 -0.1 -0.21 0.7 0.29 0.4 0.4 -1.05 -0.54 -0.16 0.13 -1.02 -0.86 -0.61 -1.27 -0.24 -0.91 -0.01 -0.34 -0.25 -0.29 0.16 0.48 -0.02 -0.89 0.55 -0.5 -0.76 0.2 -0.51 0.36 -0.63 -0.88 -1.21 -1.13 -0.82 -0.36 -0.05 -0.43
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.