Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.68 0.81 -2.93 -3.33 -1.06 -0.08 0.68 -0.2 1.68 0.45 0.46 1.69 -1.58 0.48 -0.4 -0.32 0.11 -0.13 0.29 0.1 -0.04 0.76 -0.16 0.26 -0.06 -0.54 -0.76 0.02 -0.02 -0.36 0.26 -0.45 0.45 0.57 0.54 -1.26 -0.8 -0.84 -1.06 -0.59 -0.32 -0.29 -0.13 -0.31 -0.32 -1.06 0.07 -0.01 -0.75 -0.45 -0.19 -0.13 -0.54 -0.75
-0.21 -0.66 -2.24 -3.61 -1.57 0.63 1.24 0.31 0.83 0.89 0.7 0.74 0.5 0.41 -0.2 -0.41 -0.1 -0.14 -0.25 0.04 0.19 0.44 -0.32 -0.3 -0.48 -0.66 -0.05 -0.45 0.14 -0.43 0.65 0.96 0.05 0.55 0.03 -0.35 -0.79 -0.12 -0.66 -0.18 -0.5 -0.33 -0.04 -0.43 0.32 -0.62 -0.18 0.03 -0.58 -0.55 -0.77 -0.13 0.05 -0.01
0.55 0.38 0.02 -5.38 -0.51 0.34 0.72 0.28 0.39 0.18 0.27 0.31 -0.55 0.51 -0.14 -0.15 -0.12 -0.17 0.02 -0.25 -0.21 0.28 0.11 0.23 -0.38 -0.45 -0.06 -0.01 0.38 -0.05 0.86 -0.06 0.19 0.29 0.22 -0.5 -0.56 -0.01 -0.52 0.06 -0.48 -0.08 -0.02 -0.35 0.28 -0.68 -0.03 0.16 0.05 -0.08 -0.04 -0.36 -0.5 -0.69
-0.63 -0.85 -7.28 -3.4 -5.6 0.5 0.87 0.27 0.67 -0.04 0.68 0.72 0.42 0.2 -0.49 -0.8 -0.6 -0.7 0.01 -0.61 -0.43 -0.66 0.29 -0.35 0.42 -0.03 -0.12 -0.26 0.5 0.27 0.86 -0.68 -0.5 -0.45 -0.43 0.46 -0.48 -0.08 -0.23 0.84 0.14 -0.37 -0.1 0.89 0.55 0.14 -0.05 0.42 -0.16 0.3 0.19 -0.27 -0.13 -0.31
-0.55 0.07 -0.01 -5.46 0.18 1.01 1.35 0.4 1.09 0.66 0.55 1.16 -1.08 -0.41 -0.98 -1.11 -1.18 -1.15 -0.76 -0.53 -0.67 1.86 -0.28 -1.4 0.92 -0.44 -0.49 -1.06 0.78 -0.85 0.04 -1.29 -1.51 0.03 -1.18 0.53 -0.53 0.74 -0.45 -0.26 0.79 -0.5 -0.68 1.17 0.51 0.39 -1.02 -0.25 -1.68 -1.46 -1.58 -1.01 -0.55 -0.53
-0.31 -0.32 -2.85 -4.38 -1.25 0.45 0.95 -0.23 1.22 -0.25 0.02 1.45 0.69 -0.17 -0.04 -0.02 -0.01 -0.08 -0.3 0.59 0.48 -0.09 -0.12 -0.03 -0.16 0.41 -0.14 -0.79 -0.25 -0.59 0.07 -0.58 -0.63 0.2 -0.34 0.36 0.1 0.14 0.21 -0.29 -0.33 -0.74 -0.66 0.11 0.56 -0.18 -0.82 -0.21 -0.09 -0.4 -0.15 -0.01 0.42 0.03
1.08 0.1 -8.15 -5.41 -4.65 1.44 2.33 0.14 0.59 -0.26 0.64 0.44 1.34 -0.21 0.18 -0.29 0.11 0.31 1.03 0.24 0.65 0.5 0.05 0.2 0.13 -3.03 -1.71 -0.34 -0.17 -0.41 1.23 0.22 -0.32 0.42 -0.48 -2.71 -2.88 -3.31 -3.18 -1.43 -1.07 -1.93 -0.58 -0.52 -1.48 -1.0 -0.8 -0.36 -0.38 0.18 0.29 -0.41 -0.56 -0.94
1.06 0.53 -0.18 -5.25 -1.13 0.51 1.52 0.78 0.23 1.0 0.48 0.41 -0.59 0.3 -0.21 -0.07 -0.08 -0.12 0.03 -0.45 -0.25 0.48 -0.22 0.24 -0.96 -0.57 -0.15 -0.43 -0.2 -0.09 -0.48 1.01 0.38 0.09 0.43 0.64 -0.58 -0.52 -0.58 0.26 -0.74 -0.49 -0.68 -0.74 0.0 -1.04 -0.55 -0.26 -0.31 -0.14 -0.2 -0.85 -0.79 -1.03
-0.71 -1.01 -3.59 -6.87 -1.17 0.87 1.92 -0.7 1.59 0.92 0.47 1.52 0.26 0.39 -0.67 -0.77 -0.49 -0.71 -1.38 -0.35 0.09 1.28 0.32 -1.18 0.65 -1.15 -1.05 -1.0 0.23 -0.61 0.22 0.08 -1.15 -0.34 -1.18 0.49 -1.27 -0.8 -1.11 -0.31 0.35 -1.55 -0.7 0.94 -0.5 0.35 -1.32 -0.39 -1.35 -0.3 -0.05 0.82 0.09 -0.17
0.01 -0.16 -2.15 -5.49 -1.28 0.52 0.75 0.86 1.41 0.82 0.68 1.68 -1.43 1.32 -0.02 -0.23 0.11 -0.0 0.58 1.12 0.89 1.33 -0.44 -0.42 -1.6 -0.29 -1.14 -0.11 0.23 -0.51 -1.84 -0.56 -0.23 0.24 -0.3 -1.8 -0.32 0.07 -0.44 -0.8 -1.37 -0.38 -0.12 -1.36 -0.05 -1.91 -0.02 0.03 -0.59 -0.72 -0.68 -0.72 -0.75 -0.95
0.39 0.37 -0.6 -5.15 -0.01 0.37 0.85 0.7 1.36 0.79 0.58 1.57 -1.2 0.91 0.42 0.34 0.53 0.42 0.95 0.88 0.83 1.01 -0.57 0.19 -1.8 -1.44 -1.54 -0.18 0.19 -0.35 -1.04 -0.59 0.3 0.54 0.2 -5.75 -1.13 -1.05 -1.39 -1.0 -1.41 -0.66 -0.24 -1.55 -0.66 -2.52 -0.06 -0.17 -0.55 -0.65 -0.55 -0.57 -0.88 -1.15
-0.1 -0.45 -3.56 -3.74 -0.62 1.16 1.67 -0.06 0.57 -0.81 -0.05 0.27 -0.13 0.3 0.5 0.19 0.35 0.34 1.08 0.96 1.1 0.31 0.01 -0.31 -0.26 -0.65 -0.62 -0.73 -0.39 -0.71 0.43 -0.41 -0.19 -0.68 -0.51 -0.05 -1.06 -1.14 -0.84 -0.76 -0.36 -0.85 -0.65 -0.28 -0.32 -0.16 -0.78 -0.26 -0.46 0.03 0.35 0.44 0.68 0.11
-0.39 -1.26 -3.52 -5.78 -3.78 0.95 2.0 1.13 1.95 0.89 1.36 1.23 0.19 -0.08 -1.3 -1.23 -0.8 -1.17 -0.42 -0.68 -0.81 1.09 -0.01 -0.82 -0.3 -1.22 -0.08 -0.44 0.53 -0.05 0.82 0.26 -1.98 0.73 -1.7 -1.0 -1.49 -0.2 -1.15 0.84 -0.8 -0.86 -0.78 -0.23 0.42 -0.64 -0.89 -0.05 -1.26 -0.4 0.01 -0.85 -0.58 -1.37
-1.79 -3.24 - -4.87 -3.69 1.29 1.9 -0.54 1.29 -1.05 -0.15 0.83 0.23 1.32 -0.42 -1.15 -0.03 -0.53 1.05 -1.14 -0.81 0.51 -0.33 -0.47 -0.7 -0.13 -0.61 -0.47 0.81 0.22 1.06 -1.15 -0.94 0.05 -0.4 -0.12 -0.08 0.54 0.28 0.71 -1.37 -0.86 -0.16 -0.37 0.35 -1.1 0.12 0.35 -0.38 -0.17 -0.38 -0.14 -0.21 -0.54
0.3 0.47 0.76 -4.2 -0.84 0.56 1.02 -0.64 0.58 -0.24 -0.02 0.52 0.2 -0.03 -0.44 -0.32 -0.33 -0.19 -0.46 0.04 0.39 0.21 -0.09 -0.7 -0.57 0.16 -0.1 -0.45 0.32 -0.49 0.48 0.39 -0.43 -0.3 -0.58 0.69 -0.01 0.7 0.2 0.03 -0.04 -0.44 -0.17 -0.11 0.39 -0.16 -0.51 0.1 -0.33 -0.24 -0.18 -0.22 -0.46 -0.57
0.47 0.05 -2.08 -5.83 -1.22 0.36 0.69 0.59 0.41 0.33 0.19 0.7 0.06 0.37 -0.22 -0.43 -0.17 -0.36 -0.17 -0.0 0.29 0.56 0.21 0.11 0.13 -0.09 0.11 -0.06 0.43 -0.01 0.18 -0.08 -0.12 0.26 0.08 -0.45 -0.54 0.16 -0.21 -0.0 -0.16 -0.3 -0.22 -0.1 0.29 -0.05 -0.38 0.12 0.09 -0.03 -0.15 -0.37 -0.63 -0.48
-0.63 -0.53 0.6 -2.63 -0.19 1.4 1.75 -0.74 1.05 -0.22 -0.12 0.92 0.94 -0.14 0.32 0.14 -0.13 0.08 0.94 0.19 0.09 1.44 -0.61 -1.66 0.44 -0.56 -1.25 -1.42 0.6 -0.8 0.59 -0.39 -2.14 0.02 -1.79 0.27 -1.15 0.29 -0.67 -1.14 -0.49 -1.78 -1.16 0.65 0.06 -0.37 -1.47 -0.2 -1.9 0.05 -0.2 -0.35 -0.64 -1.13
1.88 1.65 0.42 -1.67 -4.44 1.64 2.21 0.67 1.42 0.05 0.18 0.76 -0.63 0.19 -2.85 -3.17 -2.17 -2.86 -1.13 -0.91 -0.38 1.46 -1.23 -0.64 -0.51 -0.97 -1.04 -0.27 0.93 -0.36 0.13 -0.63 -1.6 1.58 -1.47 -0.93 -1.19 0.57 -1.07 0.37 -1.48 -1.84 -1.04 0.11 0.3 -1.62 -1.8 -0.23 -1.45 -2.0 -1.72 -1.16 -1.27 -2.72
1.39 -0.07 -4.16 -3.22 -5.12 1.12 1.93 1.15 1.0 1.13 1.57 0.64 0.05 0.15 -1.55 -1.7 -1.4 -1.55 -0.46 -0.58 -0.64 1.44 -0.16 -0.17 -1.04 -1.11 -0.58 -0.42 0.2 0.02 0.41 0.03 -0.32 0.02 -0.32 -1.74 -1.24 -0.71 -0.99 1.07 -0.82 -0.34 -0.58 -0.62 0.06 -1.05 -0.32 0.07 -0.77 -0.15 0.07 -1.52 -0.96 -1.38
-0.07 -0.72 -0.32 -4.34 -0.26 1.4 2.02 -0.1 0.59 -0.3 0.22 0.22 -0.28 -0.61 -0.97 -0.9 -1.02 -1.16 -0.6 -0.05 -0.59 0.96 -0.54 -0.97 0.97 -0.33 0.2 -0.96 0.01 -0.66 1.6 -0.65 -1.55 -0.08 -1.45 0.59 -0.42 -0.03 -0.34 -0.41 0.39 -0.56 -1.01 0.94 0.16 0.83 -1.09 -0.77 -0.76 -0.69 -0.56 -0.29 0.31 0.2
-0.18 -0.32 -0.38 -5.96 -1.2 0.52 0.85 0.85 1.47 0.58 0.68 1.61 -0.82 1.22 -0.27 -0.42 -0.06 -0.26 0.47 1.05 0.82 1.37 -0.65 -0.28 -0.69 -0.37 -0.79 -0.52 -0.07 -0.62 -0.94 -0.29 -0.34 0.51 -0.29 -1.99 -0.43 -0.21 -0.48 -0.47 -0.08 -0.36 -0.45 -0.44 -0.07 -0.68 -0.32 -0.22 -0.96 -1.03 -0.79 -0.78 -0.82 -1.03
-1.2 -1.12 -4.18 -3.78 -2.95 0.55 0.94 -0.18 1.08 -0.05 0.46 0.96 0.33 0.03 0.17 -0.11 -0.11 0.03 0.03 0.13 0.17 -0.24 0.34 -0.54 0.22 -0.02 -0.35 -0.25 -0.03 -0.11 0.4 -0.39 -0.82 -0.3 -0.64 0.99 -0.33 -0.08 -0.1 0.25 0.48 -0.52 -0.35 0.48 -0.16 0.22 -0.28 0.06 -0.09 0.27 0.23 -0.1 -0.05 -0.29
-0.41 -1.56 -1.25 -4.71 -0.8 0.32 0.49 0.31 0.94 0.36 0.12 0.97 0.21 0.87 0.16 -0.4 0.22 -0.27 -0.32 0.91 0.92 1.8 -0.55 -1.16 -0.15 -1.07 0.28 -0.53 -0.68 -0.32 -2.04 -0.09 0.2 -1.0 -0.04 -0.36 -0.65 -0.59 -0.54 -0.1 0.4 0.61 -0.27 -0.47 0.52 0.41 -0.21 -0.13 0.58 -1.0 -0.74 -0.74 -0.96 -0.21
-3.25 -6.49 - -3.66 -4.62 1.11 0.9 -0.9 2.5 0.13 0.62 2.07 -0.87 2.35 -0.75 -0.23 -0.42 -0.04 -1.0 -1.73 -1.08 3.37 -0.05 -1.53 -0.35 -2.66 -2.47 -1.53 0.82 -1.34 -0.98 -1.28 -1.82 -0.48 -1.8 -1.03 -4.04 -2.09 -3.99 -3.68 -1.72 -3.8 -0.34 0.69 -1.43 -1.35 -0.77 0.35 -1.89 -1.86 -1.92 -0.42 -0.58 -0.76
-5.21 -7.69 -5.96 -3.66 -4.63 1.08 0.8 -0.09 2.3 0.53 0.78 2.34 -1.13 2.23 -1.03 -0.37 -0.15 -0.32 -0.41 0.54 0.21 2.66 -0.41 -0.55 -1.97 -1.23 -1.63 -1.42 0.8 -1.39 -1.29 0.01 -1.03 0.68 -0.84 -3.24 -2.02 -0.77 -1.65 -3.03 -1.38 -1.7 -0.19 -0.65 -0.03 -2.24 -0.57 0.57 -1.51 -1.65 -1.83 -1.27 -1.05 -1.54
-1.99 -2.33 -1.1 -4.25 -4.72 0.54 -0.59 1.12 1.32 -1.19 -0.13 1.52 -1.01 1.71 -0.76 -1.12 -0.0 -0.02 1.01 1.39 1.06 2.38 -0.83 -0.63 -4.32 0.58 0.05 -0.27 -0.82 -0.93 -2.97 0.57 -0.28 -0.87 -0.56 -6.14 0.56 0.24 0.03 -1.11 -0.07 1.11 -0.53 -4.22 0.31 -2.96 0.61 -0.56 -1.08 -1.25 -1.43 -1.9 -1.37 -1.34
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-0.39 0.16 -6.19 -4.86 -1.74 0.97 1.44 0.36 1.41 0.04 1.2 1.2 0.49 0.09 -0.07 -0.4 -0.26 0.06 0.48 0.12 -0.02 -0.1 0.34 -0.26 0.42 -0.63 -0.74 -0.39 -0.72 -0.14 0.71 -1.13 -0.52 -1.11 -0.59 -0.18 -0.83 -1.34 -0.87 0.18 0.38 -0.8 -0.73 0.47 -0.52 0.2 -0.6 -0.32 -0.29 0.07 0.21 -0.34 -0.13 -0.34
-0.15 0.51 -0.77 -7.65 -0.82 0.28 0.76 0.69 1.58 1.33 0.92 1.74 -1.49 1.17 -0.04 -0.33 0.2 0.09 0.61 1.57 1.17 0.74 -0.47 0.05 -1.75 -0.53 -1.01 -0.33 -0.2 -0.76 -1.91 -0.55 -0.18 0.12 -0.18 -3.25 -0.48 -0.39 -0.64 -1.07 -0.86 -0.39 -0.54 -1.43 -0.55 -1.99 -0.41 -0.37 -0.77 -0.82 -0.73 -0.73 -0.86 -1.0
0.06 -0.52 -7.04 -3.48 -4.16 1.47 1.84 0.09 1.36 -0.27 0.36 1.45 0.47 0.12 -0.16 -0.95 -0.43 -0.19 0.83 -0.23 0.02 0.49 0.32 -0.92 0.42 -0.89 -0.91 -0.5 0.29 -0.09 0.09 -1.33 -1.56 -0.73 -1.38 -0.21 -1.26 -0.75 -1.0 -0.02 -0.06 -1.26 -0.68 0.81 -0.27 -0.03 -0.96 -0.18 -0.36 0.65 0.54 -0.07 -0.1 -0.21
-0.83 -1.98 -8.04 -4.1 -2.73 1.12 1.62 0.7 0.98 0.55 0.75 1.32 -0.06 -0.1 0.12 -1.0 0.1 -0.01 0.53 -0.51 -0.03 1.26 0.38 -0.91 0.08 -0.55 -0.33 -0.31 0.32 0.09 -0.3 -1.25 -0.89 -0.67 -0.91 -0.96 -0.91 -0.65 -0.65 0.49 -0.43 -0.71 -0.49 0.31 0.28 -0.43 -0.34 0.07 0.17 0.65 0.49 -0.48 -0.52 -0.62
-1.13 -1.23 -7.13 -4.61 -6.08 1.02 1.29 0.52 1.43 0.36 0.82 1.59 0.3 -0.41 -0.25 -1.91 -0.35 -0.27 0.29 -0.19 0.01 0.07 0.29 -1.17 0.36 -0.06 0.07 -0.39 0.28 0.05 -0.16 -0.96 -1.34 -0.8 -1.35 -0.44 -0.44 -0.44 -0.27 0.53 0.04 -0.6 -0.47 0.92 0.46 0.16 -0.37 -0.11 0.0 0.45 0.34 -0.51 -0.35 -0.54
0.23 -0.52 -5.82 -4.05 -7.35 0.47 1.41 0.62 0.99 0.46 0.93 1.03 0.33 -0.03 -1.0 -0.62 -0.57 -0.71 -0.21 -0.3 -0.18 0.48 0.13 0.37 -0.28 -0.87 -0.32 -0.07 0.17 0.18 1.07 0.1 0.55 -0.07 0.49 -0.95 -1.17 -1.05 -0.97 0.72 -0.5 -0.27 -0.17 -0.08 0.05 -0.61 -0.03 0.2 -0.19 0.4 0.53 -0.99 -1.24 -1.37
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-0.21 -1.32 -6.15 -2.65 -7.22 0.67 2.11 -0.03 1.38 0.19 1.56 1.06 0.21 0.94 -0.63 -1.15 -0.77 -0.77 1.16 -0.54 -0.21 1.33 -0.38 -0.17 -0.11 -1.93 -1.31 -0.75 0.67 -0.51 1.09 -0.04 -0.07 0.8 -0.07 -1.5 -1.91 -1.18 -1.91 -0.26 -0.69 -1.38 -0.53 0.57 0.17 -0.66 -0.39 -0.29 -0.84 -0.35 -0.56 -0.98 -0.65 -1.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.