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Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.52 0.82 0.74 -4.05 1.4 0.5 0.22 0.09 0.09 -0.17 0.14 0.22 -0.91 -0.19 0.13 0.28 0.07 -0.16 1.15 0.48 0.35 0.25 -0.66 -0.3 -1.03 0.37 -0.23 -0.53 -0.3 -0.73 -1.16 -1.74 0.26 -0.21 0.1 -1.41 0.53 0.35 0.5 -0.11 -0.41 0.36 -0.21 -0.51 0.17 -0.6 -0.14 -0.3 -0.51 -0.47 -0.12 -0.7 -0.5 -0.84
0.64 1.1 0.76 -3.62 1.53 0.76 0.46 0.17 -0.09 -0.27 -0.1 -0.09 -0.75 -0.12 0.67 0.58 0.63 0.67 1.36 0.05 0.12 -0.29 -0.47 0.36 -1.17 -0.89 -1.23 -0.15 -0.28 -0.38 -0.61 -0.88 0.7 0.07 0.45 -1.19 -0.52 -0.38 -0.7 -0.58 -0.7 -0.3 -0.24 -0.92 -0.47 -0.96 -0.02 -0.1 -0.54 -0.53 -0.34 -0.51 -0.37 -0.73
0.66 0.97 0.56 -3.61 1.22 0.6 0.44 -0.3 -0.07 -0.92 -0.68 -0.03 -0.91 0.22 0.25 0.29 0.08 0.11 1.05 -0.1 -0.18 0.15 -0.52 -0.37 -0.48 0.03 -0.21 -0.36 -0.25 -0.54 -0.09 -0.69 0.41 -0.22 0.17 -0.53 0.31 0.35 0.23 -0.14 0.05 0.12 -0.18 -0.34 0.1 -0.27 -0.1 -0.18 -0.56 -0.49 -0.22 -0.38 -0.26 -0.61
0.9 1.16 1.1 -3.39 1.14 0.8 0.15 0.4 0.43 0.04 0.07 0.36 -0.97 0.24 0.72 0.68 0.55 0.66 1.38 0.48 0.49 0.56 -0.88 -0.63 -1.2 -0.36 -0.89 -0.41 -0.47 -0.48 -0.95 -0.79 -0.01 -0.47 -0.22 -0.95 -0.26 -0.33 -0.26 -0.27 -0.47 -0.17 -0.37 -0.77 -0.35 -0.75 -0.19 -0.38 -0.82 -0.89 -0.79 -0.9 -1.16 -1.2
0.64 0.67 0.15 -3.73 1.62 0.95 0.3 0.53 0.41 -0.05 -0.0 0.25 -1.04 -0.01 0.44 0.27 0.52 0.41 1.41 0.3 0.28 0.6 -0.67 -0.08 -0.71 -0.46 -0.67 -0.46 -0.33 -0.52 0.15 -0.31 0.25 0.11 0.15 -1.58 -0.42 -0.22 -0.52 -0.62 -0.53 -0.21 -0.4 -0.6 -0.54 -0.87 -0.39 -0.42 -0.56 -0.47 -0.31 -0.59 -0.63 -1.0
0.25 0.84 0.96 -3.67 0.8 0.71 0.17 -0.01 0.21 -0.23 -0.17 0.31 -0.87 0.49 0.12 -0.02 0.36 0.34 0.79 0.06 0.26 0.22 -0.45 -0.53 -0.99 -0.25 -0.22 -0.05 0.07 -0.27 -0.27 -0.51 0.19 -0.1 0.11 -1.06 -0.07 -0.16 -0.11 0.24 -0.54 0.23 0.12 -0.57 0.25 -0.47 0.17 0.19 -0.2 -0.32 -0.2 -0.58 -0.8 -1.03
0.41 0.28 -0.54 -4.13 1.5 0.71 0.49 0.13 -0.01 -0.39 -0.3 -0.12 -0.99 -0.0 0.48 0.58 0.41 0.43 1.46 -0.12 0.08 1.05 -0.95 -0.31 -0.61 0.68 -0.7 -0.97 -0.37 -1.02 -0.49 -0.86 0.1 -0.31 0.07 0.04 0.48 1.34 0.6 -0.79 -0.2 -0.48 -0.88 -0.41 -0.21 -0.54 -0.72 -0.69 -1.14 -0.9 -0.6 -0.73 -0.46 -0.91
0.34 1.19 1.05 -3.31 1.27 0.69 0.45 -0.15 0.08 -0.4 -0.25 0.02 -0.89 0.17 0.3 0.2 0.13 0.37 1.33 0.06 0.18 0.13 -0.81 -0.34 -0.38 -0.07 -0.97 -0.78 -0.34 -1.02 -0.12 -0.54 0.14 -0.11 0.08 -0.93 0.07 0.37 -0.03 -0.66 0.35 -0.33 -0.4 0.03 -0.26 0.17 -0.37 -0.49 -0.94 -0.8 -0.44 -0.41 -0.18 -0.47
0.34 0.8 0.5 -5.85 1.23 0.65 0.52 -0.2 0.08 -0.63 -0.5 0.04 -1.09 0.06 0.33 0.33 0.16 0.15 1.08 0.2 0.11 0.3 -0.95 0.44 -1.03 0.14 -0.62 -0.54 -0.38 -0.85 -0.13 -0.56 0.92 0.55 0.82 -0.64 0.28 0.42 0.13 -0.5 -0.14 -0.04 -0.37 -0.64 -0.33 -0.42 -0.23 -0.58 -0.76 -0.7 -0.4 -0.54 -0.47 -0.95
0.35 0.37 0.06 -4.23 0.88 0.52 0.3 0.09 0.03 -0.4 -0.2 0.01 -0.7 -0.02 0.1 0.05 0.14 0.1 0.75 -0.16 0.02 0.23 -0.53 0.28 -0.99 0.21 0.05 -0.21 -0.06 -0.2 -0.47 -0.09 0.6 0.28 0.73 -0.72 0.3 0.39 0.26 0.18 -0.5 0.29 -0.13 -0.72 0.36 -0.61 -0.1 -0.13 -0.2 -0.28 -0.24 -0.57 -0.62 -0.92
0.57 1.12 0.86 -4.51 1.08 0.62 0.23 0.05 -0.12 -0.22 -0.09 0.13 -1.09 0.53 0.38 0.24 0.4 0.39 1.34 0.29 0.37 -0.14 -0.63 0.64 -0.99 -0.49 -0.33 -0.21 -0.32 -0.35 -0.41 -0.76 0.72 0.35 0.68 -1.34 -0.33 -0.42 -0.52 -0.45 -0.7 -0.09 -0.31 -0.72 -0.55 -0.98 -0.21 -0.44 -0.44 -0.48 -0.29 -0.39 -0.65 -0.95
0.34 1.09 1.15 -4.96 1.41 0.78 0.01 0.41 0.48 0.17 0.07 0.79 -0.95 0.11 0.22 0.29 0.3 0.18 1.16 0.68 0.76 0.4 -0.92 0.39 -1.35 -0.9 -0.7 -0.53 -0.5 -0.63 -0.46 -0.32 0.76 0.21 0.66 -1.69 -0.74 -0.9 -0.94 -0.49 -0.76 0.17 -0.34 -1.01 -0.53 -1.26 -0.15 -0.41 -0.87 -0.68 -0.47 -0.75 -1.08 -1.51
0.54 0.87 0.57 -4.0 1.05 0.81 0.25 0.15 0.18 -0.27 -0.06 -0.08 -0.98 -0.36 0.24 0.42 0.24 0.23 1.01 0.12 0.27 -0.01 -0.47 -0.17 -0.73 -0.12 -0.42 -0.25 -0.0 -0.32 -0.35 -0.38 0.33 0.07 0.22 -0.77 -0.11 0.25 -0.1 -0.16 -0.39 -0.05 -0.1 -0.54 0.12 -0.68 -0.03 -0.06 -0.35 -0.36 -0.17 -0.38 -0.32 -0.62
0.28 0.77 1.19 -3.73 0.86 0.69 0.25 0.18 0.37 0.05 -0.03 0.33 -0.75 0.27 0.45 0.38 0.35 0.42 1.1 0.21 0.33 0.58 -0.45 -0.47 -0.79 -0.46 -0.29 0.05 -0.04 -0.21 -0.51 -0.65 -0.0 -0.25 -0.13 -1.68 -0.28 -0.36 -0.37 -0.11 -0.63 0.13 -0.03 -0.74 -0.03 -0.87 0.07 -0.03 -0.42 -0.36 -0.24 -0.45 -0.65 -0.97
0.37 0.9 1.14 -3.6 0.9 0.85 0.44 0.23 0.28 -0.09 -0.19 0.1 -1.25 0.57 0.8 0.76 0.74 0.8 1.28 0.21 0.45 0.64 -0.57 -0.36 -1.06 -0.55 -0.47 -0.36 -0.34 -0.5 -0.63 -0.41 0.05 -0.33 -0.17 -0.51 -0.45 -0.49 -0.43 -0.39 -0.78 -0.19 -0.4 -1.01 -0.38 -1.11 -0.23 -0.33 -0.54 -0.59 -0.39 -0.53 -0.56 -0.95
0.48 0.68 0.39 -3.33 0.99 0.69 0.32 0.19 0.07 -0.08 0.1 0.17 -0.8 0.09 -0.13 -0.13 -0.17 -0.05 1.16 0.4 0.25 0.71 -0.51 0.13 -0.87 0.0 -0.3 -0.18 -0.03 -0.17 -0.55 -0.49 0.47 0.07 0.3 -0.87 0.39 0.11 0.23 -0.12 -0.62 0.09 -0.28 -0.77 -0.05 -0.84 0.07 -0.16 -0.66 -0.62 -0.27 -0.57 -0.49 -0.65
0.55 0.66 0.62 -4.53 1.15 0.78 0.28 0.14 0.13 -0.39 -0.15 -0.02 -1.24 -0.15 0.06 0.13 0.08 0.15 1.21 0.04 -0.13 0.19 -0.62 1.02 -0.55 -0.64 -0.45 -0.29 -0.26 -0.52 0.59 -0.4 1.06 0.76 1.08 -0.85 -0.59 -0.49 -0.78 -0.47 -0.33 -0.22 -0.38 -0.6 -0.4 -0.58 -0.24 -0.39 -0.63 -0.62 -0.4 -0.6 -0.79 -1.11
0.48 0.96 1.14 -3.38 1.06 0.65 -0.02 -0.35 -0.01 -0.79 -0.52 -0.27 -1.0 -0.24 -0.01 0.19 -0.03 -0.06 0.65 -0.18 -0.32 0.63 -0.25 0.12 -0.9 -0.29 -0.08 0.2 0.1 0.07 -0.44 -0.29 0.52 0.3 0.42 -1.39 -0.06 -0.26 -0.22 0.04 -0.6 0.18 0.28 -0.75 -0.01 -0.44 0.44 0.29 -0.41 -0.46 -0.08 -0.2 -0.44 -0.88
0.53 1.36 1.38 -4.65 1.63 0.62 0.23 -0.16 -0.3 -0.89 -0.69 -0.61 -1.36 0.13 0.51 0.82 0.51 0.58 1.79 -0.2 0.08 0.32 -1.12 0.14 -1.03 0.01 -0.79 -0.58 -0.73 -0.98 -0.54 -0.77 0.81 -0.0 0.65 -1.14 0.11 0.05 -0.08 -0.68 -0.39 -0.28 -0.68 -0.94 -0.44 -0.67 -0.43 -0.58 -1.26 -0.88 -0.62 -0.9 -0.74 -1.31
0.79 1.03 0.71 -4.36 1.44 0.84 0.43 0.02 0.56 -0.75 -0.29 0.74 -0.41 0.16 0.08 0.41 0.14 0.13 1.53 0.56 0.61 0.32 -0.71 0.25 -0.32 -0.94 -0.83 -0.32 -0.27 -0.7 -0.26 -0.81 0.53 -0.01 0.45 -1.12 -0.72 -0.9 -0.87 -0.93 -0.28 -0.47 -0.54 -0.4 -0.6 -0.43 -0.3 -0.43 -0.83 -0.62 -0.34 -0.61 -0.68 -1.1
0.45 0.89 1.17 -3.92 1.59 0.64 0.32 0.24 -0.03 -0.37 -0.14 -0.02 -1.28 0.01 0.4 0.44 0.3 0.39 1.84 -0.06 0.1 0.64 -0.84 -0.61 -1.13 -0.12 -0.35 -0.38 -0.22 -0.45 -0.88 -0.84 -0.08 -0.64 -0.15 -1.52 0.25 0.35 0.14 -0.11 -0.7 0.06 -0.4 -0.91 -0.11 -0.81 -0.03 -0.4 -0.73 -0.76 -0.39 -0.73 -0.74 -1.04
0.07 0.59 1.01 -3.92 1.42 0.52 0.5 -0.45 -0.23 -0.9 -0.79 -0.21 -1.25 -0.26 0.08 0.08 -0.02 0.02 1.05 0.02 0.15 0.45 -0.86 -0.14 -0.01 0.42 -0.38 -0.7 -0.41 -0.78 0.33 -1.53 0.18 -0.32 0.19 0.18 0.52 0.61 0.43 -0.33 0.54 -0.14 -0.63 0.39 -0.16 0.37 -0.69 -0.68 -0.69 -0.82 -0.47 -0.46 -0.27 -0.53
0.45 0.66 0.27 -4.23 1.31 0.43 0.28 -1.0 -0.26 -0.7 -0.24 -0.29 -1.33 0.4 -0.09 0.05 -0.13 0.04 1.06 -0.08 -0.01 0.76 -0.58 -1.18 -0.87 0.32 -0.35 -0.3 -0.11 -0.52 -0.45 -1.46 -0.31 -0.69 -0.62 -0.01 0.95 0.92 0.7 0.11 0.21 0.63 -0.06 -0.25 0.19 0.06 0.08 -0.26 -0.72 -0.65 -0.36 -0.35 -0.21 -0.52
0.16 0.81 1.06 -2.67 1.71 0.59 0.03 -0.49 0.18 -0.14 -0.41 -0.12 -0.72 0.29 -0.04 0.31 0.0 0.1 0.97 0.04 0.04 0.2 -0.6 -0.25 -0.8 0.38 -0.19 -0.61 -0.57 -0.64 0.03 -0.02 0.06 -0.08 0.03 -0.11 0.24 0.25 0.14 -0.57 -0.2 -0.14 -0.43 -0.72 -0.15 -0.43 -0.46 -0.5 -0.52 -0.5 -0.53 -0.12 -0.08 -0.14
0.55 0.87 1.24 -4.85 0.9 0.7 0.3 0.07 0.03 -0.41 -0.5 -0.03 -0.84 -0.65 0.35 0.27 0.34 0.23 1.07 0.03 0.14 0.13 -0.61 -0.24 -0.53 0.49 -0.41 -0.44 -0.36 -0.64 -0.22 -1.14 0.16 -0.29 -0.06 -0.55 0.48 0.7 0.43 -0.32 -0.14 -0.01 -0.41 -0.3 -0.03 -0.46 -0.33 -0.41 -0.77 -0.55 -0.17 -0.26 -0.34 -0.74
0.02 0.71 0.54 -6.83 1.25 0.61 -0.33 0.04 -0.14 -0.17 -0.17 -0.1 -1.17 -0.12 0.07 0.08 -0.02 0.11 1.21 -0.07 0.05 -0.11 -0.58 0.46 -0.67 -0.4 -0.34 0.08 -0.04 -0.12 -0.15 -0.33 0.7 0.34 0.53 0.84 -0.3 -0.33 -0.35 -0.18 -0.44 0.16 -0.04 -0.56 -0.12 -0.38 0.18 -0.05 -0.58 -0.5 -0.25 -0.36 -0.54 -0.89
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0.77 0.44 0.31 -4.01 0.95 0.67 0.43 -0.11 -0.09 -0.79 -0.55 -0.1 -1.09 0.18 0.09 0.15 0.15 0.09 0.86 -0.02 0.01 0.17 -0.96 0.55 -0.79 0.38 -0.79 -0.49 -0.58 -0.7 0.12 -0.4 1.15 0.58 1.12 -0.79 0.32 0.55 0.27 -0.47 0.04 -0.09 -0.46 -0.41 -0.39 -0.18 -0.19 -0.46 -0.93 -0.79 -0.48 -0.54 -0.5 -0.94
0.76 0.46 0.53 -1.26 1.59 0.6 0.54 0.31 -0.16 -0.31 -0.36 0.07 -0.61 -0.23 0.22 0.43 0.29 0.18 0.87 0.04 -0.28 0.6 -0.99 -1.49 -0.1 0.08 -0.08 -0.74 -0.91 -1.06 -0.19 -1.68 -0.83 -1.69 -1.02 -0.02 -0.04 0.44 -0.03 -0.45 0.9 0.35 -0.78 0.28 -0.04 0.86 -0.55 -0.69 -0.84 -0.76 -0.57 -0.36 0.18 0.02
0.46 1.3 1.09 -3.18 1.55 0.62 0.17 -0.51 -0.27 -1.31 -0.75 -0.11 -1.18 0.58 0.37 0.39 0.18 0.25 1.21 -0.13 -0.16 0.48 -0.99 -0.02 -0.85 0.31 -0.53 -0.52 -0.43 -0.79 -0.34 -0.76 0.57 0.06 0.47 -1.34 0.39 0.66 0.36 -0.44 -0.18 0.03 -0.37 -0.4 -0.26 -0.53 -0.24 -0.51 -0.92 -0.68 -0.47 -0.91 -0.79 -1.3
0.24 0.9 0.08 -4.6 1.83 0.74 0.02 -0.28 -0.12 -0.78 -0.38 -0.17 -1.57 -0.23 0.61 0.54 0.34 0.51 1.56 0.33 0.31 0.27 -1.04 0.63 -1.07 -0.23 -1.21 -0.63 -0.71 -0.84 -0.09 -0.55 1.1 0.36 0.93 -2.35 0.15 0.06 -0.09 -0.82 -0.1 -0.28 -0.37 -0.69 -0.71 -0.71 -0.16 -0.49 -0.98 -0.81 -0.52 -0.58 -0.53 -0.85
0.44 0.9 1.09 -2.69 1.2 0.54 -0.05 -0.35 -0.77 -0.91 -0.82 -0.13 -1.51 0.65 0.46 0.48 0.38 0.48 1.14 -0.25 0.04 0.33 -0.77 -0.28 -1.11 0.03 -0.7 -0.44 -0.32 -0.72 -0.25 -0.35 0.75 0.16 0.65 -0.71 0.17 0.33 0.12 -0.21 -0.21 0.06 -0.15 -0.49 -0.04 -0.66 -0.11 -0.13 -0.66 -0.64 -0.43 -0.51 -0.36 -0.67
0.28 1.27 1.53 -3.95 1.4 0.63 0.19 0.12 -0.03 -0.44 -0.16 -0.05 -1.34 -0.13 0.52 0.6 0.45 0.56 1.6 0.2 0.28 0.11 -0.88 -0.79 -0.94 0.15 -0.64 -0.56 -0.8 -0.76 -0.92 -1.31 -0.08 -0.68 -0.23 -1.15 0.58 0.13 0.38 -0.4 0.07 0.06 -0.51 -0.4 -0.34 -0.35 -0.25 -0.62 -1.06 -0.82 -0.62 -0.66 -0.53 -0.94
1.01 1.46 1.23 -3.51 1.32 0.75 0.08 0.04 -0.1 -0.59 -0.39 -0.29 -1.06 0.08 0.2 0.32 -0.1 0.29 1.03 0.22 0.08 -0.05 -0.63 0.03 -0.47 -0.58 -0.76 -0.36 -0.14 -0.56 0.14 -0.21 0.66 0.22 0.48 -1.62 -0.36 -0.36 -0.5 -0.47 0.01 -0.21 -0.23 -0.51 -0.45 -0.28 -0.07 -0.33 -0.8 -0.74 -0.4 -0.59 -0.41 -0.91
0.27 0.74 0.99 -4.16 0.81 0.63 0.4 -0.26 -0.36 -0.9 -0.54 -0.23 -0.96 -0.14 0.27 0.13 0.1 0.15 1.08 -0.37 -0.12 0.23 -0.75 0.39 -0.69 0.26 -0.27 -0.43 -0.04 -0.59 -0.18 -0.11 0.82 0.55 0.85 -0.59 0.2 0.52 0.17 -0.16 -0.29 0.05 -0.28 -0.49 0.11 -0.49 -0.18 -0.24 -0.72 -0.66 -0.24 -0.59 -0.56 -0.98
0.53 0.97 1.28 -3.12 1.06 0.52 0.16 -0.31 -0.02 -1.22 -0.86 -0.49 -1.5 0.54 0.4 0.5 0.37 0.42 1.41 0.09 0.22 0.37 -0.77 0.59 -1.05 0.05 -0.95 -0.5 -0.56 -0.66 -0.84 -1.04 1.0 0.37 0.95 -0.51 -0.13 0.02 -0.25 -0.74 -0.4 -0.16 -0.38 -0.7 -0.47 -0.79 -0.11 -0.39 -0.71 -0.5 -0.21 -0.61 -0.59 -0.92
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0.54 0.96 -0.03 -5.21 1.5 0.55 0.45 -0.05 -0.08 -0.66 -0.47 0.0 -1.16 0.53 0.41 0.44 0.32 0.36 1.76 -0.09 0.13 0.25 -0.84 0.46 -1.41 -0.2 -0.47 -0.36 -0.34 -0.71 -0.39 -0.57 1.02 0.55 0.99 -1.91 -0.04 -0.02 -0.2 -0.46 -0.86 0.04 -0.31 -1.19 -0.33 -1.16 -0.09 -0.33 -0.78 -0.69 -0.36 -0.83 -1.03 -1.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.