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Heatmap: Cluster_144 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.06 0.21 1.21 -3.39 -0.21 0.66 0.6 0.03 0.82 -0.24 0.3 0.84 0.14 -0.2 -0.62 -0.65 -0.62 -0.71 -0.26 -0.04 -0.12 0.14 -0.33 -0.77 -0.55 0.38 0.08 -0.57 0.09 -0.66 0.12 0.05 -0.37 0.46 -0.37 0.94 0.22 0.74 0.36 -0.11 -0.02 -0.2 -0.33 0.09 0.47 -0.09 -0.65 -0.16 -0.66 -0.44 -0.41 -0.75 -0.64 -0.5
0.37 0.64 1.19 -2.78 -0.37 0.33 0.16 0.05 0.09 -0.02 0.01 0.05 -0.44 0.91 -0.44 -0.46 -0.37 -0.52 -0.06 -0.31 -0.3 0.05 0.09 -0.31 -0.33 -0.0 0.45 0.14 0.27 0.02 -0.12 -0.38 0.03 -0.02 0.01 0.06 -0.12 0.25 -0.04 0.28 -0.28 0.15 0.1 -0.29 0.28 -0.26 0.02 0.2 -0.03 0.08 0.13 -0.49 -0.91 -1.04
0.71 0.81 -0.14 -3.73 -0.14 0.5 0.08 0.28 -0.27 -0.05 0.13 -0.25 -0.58 -0.6 -0.27 -0.31 -0.19 -0.13 0.52 -0.27 -0.1 0.04 -0.15 -0.42 -0.27 -0.03 -0.05 0.04 0.39 -0.01 0.55 -0.18 0.04 0.04 -0.05 0.17 -0.01 0.46 0.06 0.16 0.02 0.07 -0.03 -0.18 0.45 -0.19 -0.07 0.19 -0.05 -0.21 -0.2 -0.25 -0.14 -0.3
0.6 0.93 1.48 -4.73 -0.05 0.57 0.67 0.13 0.13 -0.21 -0.09 0.25 -0.66 0.16 -0.01 -0.02 0.05 -0.03 0.24 -0.1 0.0 0.66 -0.35 -1.39 -0.03 0.22 -0.31 -0.49 -0.27 -0.63 -0.33 -1.03 -0.68 -0.82 -0.96 0.92 0.15 0.51 0.25 -0.14 0.33 -0.17 -0.4 0.28 0.22 0.04 -0.44 -0.21 -0.67 -0.37 -0.34 -0.5 -0.34 -0.52
0.27 0.08 0.91 -2.86 -0.14 0.47 0.5 -0.08 0.66 -0.22 -0.12 0.65 -1.06 0.28 -0.38 -0.48 -0.3 -0.34 0.28 -0.22 -0.25 0.91 -0.66 0.26 -0.36 0.25 -0.2 -0.86 0.02 -0.9 0.9 0.69 -0.34 0.55 -0.15 -0.04 0.01 0.97 -0.06 -0.47 0.29 -0.12 -0.58 0.16 0.33 -0.2 -0.81 -0.33 -0.92 -0.86 -0.81 -0.26 -0.22 -0.36
0.9 0.51 0.46 -3.98 -0.19 0.32 0.72 0.19 -0.03 -0.12 -0.14 0.09 -0.76 -0.27 -0.33 -0.27 -0.18 -0.26 0.02 -0.2 -0.03 1.05 -0.49 -0.07 -0.03 0.1 -0.3 -0.6 -0.05 -0.59 0.74 0.53 0.26 0.72 0.24 0.39 -0.19 0.65 0.01 -0.26 0.4 -0.36 -0.6 0.2 0.01 0.11 -0.64 -0.38 -0.8 -0.6 -0.44 -0.72 -0.66 -0.74
0.62 0.75 1.11 -2.46 -0.28 0.58 0.44 0.11 0.51 -0.21 0.02 0.23 -0.47 -0.59 -0.17 -0.39 -0.26 -0.25 -0.11 -0.17 0.02 -0.33 -0.14 -0.41 -0.04 -0.23 0.08 -0.23 -0.12 -0.3 0.42 -0.05 -0.08 -0.16 -0.06 0.36 -0.2 -0.13 -0.11 -0.03 0.35 -0.08 -0.3 0.21 0.21 0.29 -0.22 -0.14 -0.19 -0.17 -0.13 -0.15 -0.18 -0.19
0.6 0.52 0.37 -3.77 -0.22 0.45 0.63 0.26 0.41 0.06 -0.0 0.35 -0.49 0.37 -0.34 -0.31 -0.36 -0.37 -0.34 -0.29 -0.14 0.73 -0.28 -0.08 -0.24 0.01 -0.13 -0.52 0.22 -0.26 0.88 0.45 -0.26 0.68 -0.14 0.72 -0.18 0.51 -0.03 -0.15 0.11 -0.37 -0.4 -0.06 0.19 -0.15 -0.6 -0.19 -0.51 -0.52 -0.57 -0.56 -0.66 -0.73
0.35 0.65 0.92 -3.65 -0.32 0.41 0.58 -0.3 0.15 -0.36 -0.19 0.29 -0.82 -0.09 -0.31 -0.55 -0.38 -0.21 -0.06 -0.15 -0.23 0.2 -0.46 -0.48 -0.23 0.19 -0.27 -0.51 0.12 -0.43 0.91 0.12 0.36 0.42 0.17 0.58 0.23 0.56 0.13 0.09 0.28 -0.05 -0.19 0.17 0.34 0.03 -0.29 -0.04 -0.73 -0.57 -0.43 -0.56 -0.41 -0.45
0.46 0.51 0.52 -4.67 -0.91 0.27 0.02 -0.1 0.18 -0.04 0.05 0.13 -0.05 0.84 -0.51 -0.59 -0.46 -0.48 -0.03 -0.1 0.01 0.61 0.07 -0.68 -0.46 -0.2 0.2 0.24 0.17 0.22 -0.37 -0.44 -0.21 -0.44 -0.22 -0.43 -0.01 -0.13 0.02 0.18 -0.12 0.29 0.43 -0.22 0.46 -0.24 0.58 0.49 -0.29 -0.03 -0.03 0.15 -0.09 -0.27
1.01 0.99 1.5 -0.96 -0.28 0.94 0.46 0.55 0.45 -0.05 0.14 0.74 -0.6 -0.24 -0.57 -0.36 -0.4 -0.55 -0.07 0.34 0.24 0.71 -0.57 -0.26 -0.08 -0.16 -0.66 -0.58 -0.27 -0.61 0.38 -0.51 -0.07 -0.16 -0.05 0.36 -0.33 0.19 -0.19 -0.3 0.12 -0.31 -0.46 -0.07 -0.23 0.12 -0.74 -0.44 -0.91 -0.44 -0.49 -0.55 -0.67 -0.79
0.49 0.63 0.6 -3.38 -0.39 0.17 0.18 -0.03 0.06 -0.21 0.08 0.37 -0.88 0.23 -0.29 -0.51 -0.34 -0.25 0.26 -0.05 -0.1 0.35 -0.1 -0.29 -0.21 0.01 0.0 0.18 0.21 0.04 -0.28 -0.57 -0.02 -0.09 -0.09 -0.23 0.11 0.31 0.02 0.12 0.28 0.17 0.04 -0.06 0.17 0.16 0.27 0.01 -0.05 -0.12 -0.06 -0.15 -0.02 -0.25
0.36 0.02 0.53 -2.91 -0.96 0.61 0.23 0.46 0.64 0.3 0.44 0.76 0.12 0.02 -0.88 -1.24 -0.98 -1.09 -0.71 0.29 0.23 0.34 -0.23 -0.45 0.13 0.07 -0.08 -0.19 0.28 -0.11 0.37 -0.17 -0.33 0.01 -0.21 0.53 0.02 0.3 0.13 0.08 0.0 0.04 -0.09 0.15 0.22 0.2 -0.13 -0.08 -0.51 -0.09 -0.13 -0.3 -0.57 -0.51
1.24 1.32 1.24 -4.47 -0.97 0.55 0.91 0.82 0.45 0.07 0.49 0.15 -0.83 0.21 -0.3 -0.12 -0.13 -0.24 -0.62 -0.54 -0.6 0.69 -0.49 0.44 -0.13 -0.88 -0.1 -0.63 0.22 -0.48 0.05 0.4 0.04 1.18 0.28 -0.1 -1.27 -0.52 -1.13 -0.11 -0.57 -0.47 -0.59 -0.15 0.25 -0.37 -0.67 -0.18 -0.15 -0.38 -0.53 -1.64 -1.14 -0.97
0.35 0.49 1.07 -3.41 -0.07 0.53 0.49 0.32 0.35 0.2 0.23 0.23 -0.44 -0.06 -0.38 -0.28 -0.26 -0.39 0.13 -0.26 -0.2 0.74 -0.33 -0.19 -0.35 -0.16 0.49 -0.22 0.21 -0.25 -0.45 -0.24 -0.31 0.25 -0.1 0.23 -0.13 0.28 -0.18 0.26 0.03 0.18 -0.24 -0.16 0.5 0.09 -0.17 -0.18 -0.25 -0.44 -0.33 -0.78 -0.53 -0.6
0.61 0.77 0.74 -3.93 -0.15 0.5 0.72 0.19 0.34 -0.04 0.0 0.49 -0.48 0.05 -0.28 -0.27 -0.05 -0.31 -0.12 -0.22 -0.26 0.7 -0.2 -0.14 -0.02 -0.2 -0.08 -0.34 0.3 -0.41 0.66 0.48 -0.02 0.41 0.06 0.12 -0.53 0.26 -0.36 -0.1 -0.18 -0.32 -0.33 -0.05 0.2 -0.32 -0.4 -0.08 -0.51 -0.24 -0.05 -0.48 -0.69 -0.91
0.08 0.38 0.63 -3.78 -0.47 0.66 0.34 0.07 0.75 -0.1 0.05 0.74 -0.51 -0.13 -0.37 -0.28 -0.4 -0.32 0.08 -0.06 0.05 0.01 -0.34 -0.61 -0.22 0.0 0.16 -0.4 0.24 -0.55 0.72 0.21 -0.62 0.49 -0.41 0.9 -0.21 0.35 -0.11 -0.23 0.23 -0.07 -0.34 0.53 0.42 0.15 -0.49 -0.21 -0.41 -0.45 -0.51 -0.43 -0.37 -0.43
0.41 0.46 0.81 -4.71 0.02 0.43 0.32 0.49 0.37 0.3 0.39 0.36 -0.32 0.13 -0.21 -0.12 -0.1 -0.22 0.08 -0.14 0.0 0.22 -0.07 -0.24 -0.35 -0.42 0.24 0.01 0.24 -0.1 -0.16 0.2 -0.13 0.2 -0.18 -0.24 -0.44 -0.05 -0.37 0.14 -0.12 -0.02 -0.12 -0.18 0.33 -0.04 -0.14 0.03 -0.18 -0.11 -0.12 -0.45 -0.47 -0.52
0.36 0.63 1.04 -4.78 -0.11 0.33 0.3 0.21 0.16 -0.01 0.14 0.15 -0.48 0.43 -0.55 -0.52 -0.59 -0.53 -0.0 -0.36 -0.12 0.72 -0.11 -0.38 -0.1 -0.27 0.13 -0.1 0.5 -0.13 0.27 -0.03 -0.21 0.34 -0.19 -0.19 -0.21 0.44 -0.19 0.16 0.17 -0.2 -0.15 0.22 0.38 0.36 -0.17 0.1 -0.42 -0.33 -0.2 -0.57 -0.55 -0.76
0.41 0.57 1.5 -2.24 -0.06 0.58 0.45 -0.01 -0.04 -0.53 -0.09 -0.23 -0.34 -0.31 -0.32 -0.51 -0.55 -0.46 -0.01 -0.26 0.05 0.2 -0.11 -0.17 -0.37 -0.0 0.01 -0.17 0.14 -0.2 0.22 -0.25 0.35 0.32 0.17 0.27 0.02 0.2 -0.06 -0.03 0.01 -0.1 -0.07 -0.24 0.27 -0.07 -0.11 -0.12 -0.33 -0.27 -0.21 0.06 -0.26 -0.28
0.36 0.56 1.49 -3.82 -0.34 0.4 0.54 0.23 0.57 0.16 0.34 0.42 -0.61 0.12 -0.93 -0.92 -0.69 -0.71 -0.08 -0.38 -0.34 0.87 -0.45 -0.28 -0.08 -0.5 -0.25 -0.52 0.8 -0.6 0.88 0.19 -0.18 0.81 -0.09 0.17 -0.71 0.51 -0.62 -0.26 0.1 -0.38 -0.21 0.21 0.29 0.16 -0.6 -0.08 -0.82 -0.61 -0.62 -0.36 -0.68 -0.67
0.37 0.67 1.14 -2.87 -0.26 0.59 0.35 -0.03 0.43 0.14 0.08 0.39 -0.16 0.06 -0.1 -0.24 -0.13 -0.2 0.18 -0.02 0.06 0.16 -0.25 -0.65 -0.27 0.26 -0.06 -0.49 -0.11 -0.33 0.17 -0.14 -0.4 -0.09 -0.49 0.65 0.22 0.6 0.26 -0.17 -0.1 -0.14 -0.34 -0.07 0.25 -0.16 -0.44 -0.18 -0.67 -0.48 -0.37 -0.21 -0.26 -0.29
0.27 0.67 0.99 -5.77 -0.72 0.53 0.63 0.61 0.31 0.38 0.39 0.29 -0.04 -0.09 -0.58 -0.48 -0.4 -0.6 -0.57 0.01 0.27 0.12 -0.03 -0.02 -0.4 -0.22 0.41 -0.03 0.26 0.02 -0.18 0.46 -0.23 0.27 -0.22 0.37 -0.43 -0.06 -0.4 -0.03 0.06 -0.23 -0.26 -0.22 0.16 0.09 -0.3 -0.15 -0.6 -0.35 -0.13 -0.16 -0.28 -0.44
0.4 0.18 0.92 -3.17 -0.23 0.46 0.6 0.27 0.09 0.11 0.23 0.21 -0.38 0.28 -0.62 -0.91 -0.7 -0.89 -0.38 -0.02 -0.15 0.47 -0.42 -0.02 -0.12 -0.02 -0.01 -0.38 0.13 -0.19 0.39 0.43 0.42 0.55 0.19 -0.15 -0.15 0.18 -0.14 -0.29 0.3 -0.17 -0.2 -0.13 0.15 0.2 -0.19 -0.05 -0.32 -0.3 -0.36 -0.03 -0.17 -0.25
0.41 0.64 1.27 -3.72 0.4 0.4 0.26 -0.03 0.08 -0.13 -0.07 0.32 -0.56 0.27 -0.31 -0.39 -0.48 -0.5 0.06 -0.07 -0.14 0.61 -0.18 -0.72 0.16 0.04 0.18 -0.16 0.09 -0.17 -0.25 -0.52 -0.33 -0.36 -0.37 0.51 -0.17 0.02 -0.06 0.0 0.25 -0.06 -0.15 0.25 0.26 0.33 -0.1 -0.02 -0.64 -0.28 -0.15 0.03 -0.28 -0.44
0.66 0.61 1.08 -3.12 0.04 0.3 0.34 0.27 0.06 0.34 0.05 0.01 -1.1 0.68 -0.31 -0.25 -0.3 -0.32 0.08 -0.36 -0.24 0.56 -0.46 -0.17 -0.11 -0.33 -0.1 -0.4 -0.05 -0.46 -0.11 -0.19 0.03 0.52 -0.04 0.48 -0.22 0.01 -0.33 0.41 0.52 0.0 -0.36 0.24 0.15 0.47 -0.32 -0.31 -0.51 -0.42 -0.38 -0.52 -0.47 -0.68
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0.7 0.74 1.26 -3.31 -0.95 0.23 0.73 0.07 0.91 -0.13 0.25 0.73 -0.32 0.0 -0.76 -0.5 -0.81 -0.84 -0.98 -0.02 -0.16 -0.07 0.3 -0.05 -0.07 -0.94 0.28 0.01 -0.49 -0.15 0.42 0.26 -0.35 0.44 -0.28 0.3 -1.16 -1.42 -1.36 -0.12 0.06 -0.06 -0.4 -0.09 0.31 -0.07 -0.49 -0.22 0.03 -0.06 0.0 0.2 0.37 0.42
0.58 1.25 1.57 -3.84 0.29 0.62 0.83 0.87 0.48 0.43 0.82 0.44 -1.0 0.13 -0.23 -0.43 -0.17 -0.21 0.33 -0.04 -0.02 1.22 -0.42 -1.02 -0.96 -1.2 -0.15 -0.32 0.79 -0.19 -0.87 -0.27 -0.74 0.82 -0.84 -0.98 -1.18 -0.78 -1.14 0.14 -0.55 -0.28 -0.17 -0.54 0.25 -0.66 -0.32 0.09 -0.72 -0.61 -0.55 -0.59 -0.73 -1.09
1.34 1.16 1.19 -3.91 -0.71 0.68 0.71 0.69 0.3 0.22 0.12 0.06 -1.9 0.18 -0.61 -0.59 -0.53 -0.47 -0.32 -0.12 -0.08 0.69 -0.84 -0.03 -0.58 -0.65 -0.2 -0.35 -0.38 -0.45 1.34 0.55 0.45 0.29 0.34 -0.44 -0.54 -0.29 -0.59 0.05 0.04 -0.01 -0.24 0.05 -0.16 -0.1 -0.18 -0.28 -0.73 -0.81 -0.74 -0.93 -0.92 -1.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.