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Heatmap: Cluster_141 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
HCCA
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.73 -2.16 -0.91 -0.39 0.23 0.96 0.99 0.94 -1.87 0.33 0.78 0.85 0.39 -0.22 0.49 -1.85 -0.62 -0.52 -0.68 -0.59 -1.2 -0.89 -2.27 -2.3 0.3 0.41 0.53 0.45 0.0 0.12 0.54 0.48 -0.24 -0.16 -0.06 0.3 0.53 0.36 -0.87 -0.3 -0.01 -0.13 -0.27 -0.32 -0.68 0.37 0.03 0.19
-2.8 -1.6 -1.12 -1.06 -0.15 -0.09 0.28 0.3 -1.4 0.17 0.2 0.08 -0.37 -1.25 -0.15 -1.6 -1.26 -1.61 -0.8 -0.75 -0.82 -0.92 -3.67 -2.41 0.34 -0.2 0.47 0.93 0.93 0.51 0.78 0.03 0.5 0.66 1.84 0.8 0.76 0.61 -0.45 -0.12 -0.49 -0.73 -0.38 0.36 -0.39 0.65 0.6 -0.04
- -2.88 -3.06 -1.44 -1.02 0.96 0.37 0.26 -1.33 1.04 -1.46 -1.83 0.15 -2.6 0.81 - -2.47 -1.74 -3.76 -0.7 -2.17 0.51 - -1.61 1.58 -2.45 0.57 1.2 1.02 0.09 1.41 0.82 0.81 0.28 1.53 2.02 1.63 -1.65 -1.7 -0.73 -1.46 -2.9 -0.57 -0.66 -1.36 -1.62 -0.31 0.2
-1.42 -1.33 -0.59 -4.2 0.22 0.75 0.99 0.72 -0.7 0.08 -0.55 -0.41 -0.4 -1.44 0.18 -2.69 -1.26 -1.34 -0.16 0.21 0.67 0.57 -2.04 -0.73 0.12 -1.05 0.29 1.13 0.79 -0.13 1.18 0.54 0.62 0.39 0.32 0.49 1.29 -0.28 -0.45 -0.4 -1.55 -1.71 -0.22 -0.19 -0.11 -0.44 0.19 -0.12
-1.32 -0.98 -0.37 -3.66 -0.34 1.0 1.0 0.68 -0.37 0.9 -2.39 -2.49 0.06 -1.67 0.58 -2.37 -0.11 -0.73 0.07 0.76 -0.34 -0.48 -1.09 -2.93 0.21 -1.01 0.16 0.89 0.29 0.16 1.41 -0.18 0.47 -0.14 0.18 0.64 1.31 0.64 -1.36 -0.48 -0.82 -1.46 -0.19 -0.71 -0.81 0.67 0.0 0.27
-0.02 -1.16 -0.93 -3.08 0.19 0.9 1.11 0.56 -0.45 1.01 -0.79 -1.18 0.23 -1.03 0.36 -0.94 -1.99 -1.78 -0.62 -0.65 -0.52 -0.18 -3.76 -1.56 -0.33 -1.66 0.59 0.74 -1.29 0.21 0.89 1.07 0.22 0.47 1.04 0.63 0.4 0.85 -0.71 -0.65 -2.27 -2.16 -0.2 0.1 -0.75 1.09 1.02 -0.39
- -3.83 -2.54 -1.49 0.17 0.36 -0.2 -0.04 -3.48 0.71 0.52 0.31 0.65 -0.28 0.36 - -0.89 -0.67 -0.83 -0.49 -0.72 -1.2 -5.53 -2.73 0.58 0.25 0.71 0.94 0.42 0.02 1.61 1.03 0.68 0.61 -0.45 0.87 1.64 -0.04 -0.59 -0.44 -1.35 -1.64 -0.5 -0.39 -0.44 0.14 0.44 0.23
-2.52 -1.37 -0.89 -4.69 -0.4 -1.14 -0.49 -0.52 -0.51 0.39 -0.46 -0.54 0.48 0.06 0.69 -3.58 -0.72 -0.58 -0.62 -1.22 -1.71 -1.8 -3.44 -4.1 -1.04 -0.3 -2.36 1.33 0.96 0.51 1.34 0.66 0.73 0.28 1.11 1.37 1.38 0.85 -0.89 -0.22 -0.07 -0.31 -0.17 -0.61 -0.47 0.73 0.09 0.94
-1.42 -1.62 -1.81 -2.4 -0.74 -0.21 -0.53 -0.59 -0.78 0.72 -0.97 -0.88 0.67 -0.78 0.17 -1.57 -0.93 -0.41 -0.09 -0.09 -0.22 -0.03 -2.0 -2.19 0.68 0.55 0.62 0.88 -0.31 0.24 1.23 0.77 0.34 0.41 -0.56 0.43 1.14 1.11 -0.41 -0.26 -0.85 -0.93 -0.22 0.14 -0.4 1.09 0.66 0.05
-0.2 -0.99 -2.17 -3.01 -0.88 -0.38 0.55 0.27 -0.41 0.82 -2.21 -2.31 0.93 0.35 0.57 -1.89 -1.09 -2.15 -2.12 -2.31 -2.44 -2.22 -3.53 -4.04 -0.85 -0.69 -0.51 1.2 0.77 0.35 1.0 -0.17 0.74 0.85 0.36 0.61 1.42 0.95 0.05 0.25 -0.78 -0.9 0.42 0.18 0.47 0.96 0.85 -0.2
-1.65 -2.37 -1.0 -2.33 0.58 -0.27 -0.04 -0.2 -1.24 0.56 -0.17 -0.26 0.37 -0.31 0.13 -1.19 -0.27 -1.51 -0.08 -0.01 0.19 0.21 -1.89 -1.86 0.45 -0.58 0.68 0.05 -0.51 0.09 0.56 0.24 0.37 0.41 1.04 0.32 0.26 0.19 -0.47 0.26 0.7 0.59 0.37 0.31 -0.12 0.23 0.43 -0.01
-3.56 -2.59 -0.87 -2.89 1.28 0.34 0.29 0.24 -2.21 0.38 0.27 0.25 0.49 -0.19 -0.03 -2.57 -0.51 -1.34 0.05 0.36 0.06 0.08 -4.77 -2.21 0.55 -0.82 0.41 0.33 -0.32 -0.09 0.42 0.37 0.36 0.42 1.31 0.5 0.48 0.09 -0.52 0.07 -0.01 -0.17 0.15 0.1 0.02 0.0 0.33 -0.27
-0.08 -0.76 0.03 -2.66 0.32 0.16 0.39 0.24 -0.57 0.52 0.22 0.12 0.23 -0.71 0.42 -0.94 -0.47 -0.97 -0.38 0.13 0.04 -0.14 -0.31 -2.29 0.42 0.38 0.44 0.62 -0.12 0.12 0.66 0.32 0.14 0.11 -0.68 0.02 0.49 0.46 -0.74 -0.17 -0.22 -0.2 -0.12 -0.08 -0.48 0.38 0.33 0.09
-1.56 -2.44 -1.02 -1.74 0.42 0.61 0.36 0.17 -0.83 0.61 0.51 0.41 -0.05 -1.7 0.43 -1.59 -0.94 -1.18 -1.01 -0.72 -1.01 -0.84 -3.55 -0.32 0.57 -0.44 0.46 1.0 0.88 0.35 0.85 1.18 0.46 0.23 0.46 0.75 0.77 -0.18 -0.89 -0.42 -1.01 -1.36 -0.46 0.35 -0.54 -0.2 0.92 0.0
-2.09 -2.55 -1.92 -2.61 0.38 1.03 0.91 1.07 -1.34 0.57 0.38 0.27 0.91 0.59 0.77 -2.35 -1.28 -2.38 -1.31 -0.75 -1.16 -1.69 -2.87 -3.35 -0.51 -0.85 0.12 0.43 0.66 -0.02 0.46 0.11 0.4 0.22 1.23 1.23 0.95 -0.09 -0.29 -0.16 -0.44 -0.62 -0.1 0.09 -0.17 -0.14 -0.12 -0.01
-3.29 -1.0 -0.7 -1.48 0.63 1.2 0.83 0.93 -2.76 0.3 0.55 0.54 -0.35 -1.89 0.27 -1.62 -0.73 -0.66 -0.07 0.24 0.05 -0.13 -1.47 -0.39 0.65 -0.53 1.01 0.45 -0.04 0.22 0.29 0.73 0.2 0.18 -0.66 0.38 0.46 0.02 -0.69 -0.25 -0.85 -0.99 -0.39 -0.03 -0.44 -0.07 0.08 0.38
-1.83 -1.85 -0.69 -2.18 0.48 0.05 -0.01 0.2 -2.3 0.78 0.34 0.02 0.44 -0.53 0.15 -2.49 0.12 -0.46 0.25 0.18 -0.19 0.25 -5.16 -0.47 1.03 -0.66 0.47 0.24 0.64 -0.12 0.7 0.41 0.42 0.21 -0.17 0.63 0.62 0.12 -0.65 -0.29 -0.24 -0.4 0.01 0.11 -0.09 0.15 0.31 -0.19
0.19 -1.14 -1.3 -2.42 0.04 -0.08 0.38 0.24 -0.4 0.35 0.96 1.09 -0.3 -1.04 0.39 -0.81 -1.65 -1.11 -0.93 -0.53 -0.25 -0.49 -1.97 -1.73 0.41 -0.52 0.71 0.45 0.65 0.11 0.62 0.81 0.44 0.21 0.17 0.33 0.52 0.13 -0.44 -0.11 -0.28 -0.73 0.04 0.04 -0.14 0.06 0.39 0.25
-1.61 -0.84 -0.27 -1.44 0.74 -0.69 -0.73 -1.05 -1.24 -0.39 -1.19 -0.9 -0.78 -0.99 -0.39 -1.43 0.35 -1.52 0.43 0.44 0.64 0.53 -0.12 -2.54 -0.72 -1.77 -0.46 0.92 0.42 0.39 -0.52 0.97 0.64 0.68 1.76 0.86 0.04 -0.13 0.07 0.28 -0.62 -0.69 0.18 0.35 0.75 -0.13 0.05 0.05
-1.89 -2.43 -1.27 -1.7 -0.61 -0.27 -0.05 -0.13 -1.38 0.66 -0.41 -0.8 0.08 -1.24 0.49 -1.88 -1.53 -1.44 -1.55 -0.58 -0.6 -0.39 -3.79 -2.17 0.36 -0.86 -0.3 0.48 1.06 0.58 0.88 0.93 0.5 0.28 1.67 0.63 0.88 0.5 -0.65 0.26 0.12 0.02 0.34 0.38 0.12 0.54 0.44 0.26
-1.63 -1.63 -0.81 -3.9 -0.38 -0.01 -0.09 -0.43 -1.63 0.52 -2.95 -2.47 0.73 -0.5 1.02 -1.69 -0.51 -1.16 -0.42 -0.1 -0.2 -0.53 -1.5 -2.18 0.43 -0.32 -0.01 0.5 0.54 0.28 0.7 0.33 0.82 0.64 2.1 1.36 1.44 -0.15 -0.44 -0.64 -1.03 -1.13 -0.22 -0.39 -0.4 -0.24 -0.02 0.15
-2.11 -1.42 -0.6 -3.09 0.77 -0.13 -0.06 0.16 -1.5 0.5 -0.38 -0.43 0.08 -1.09 0.23 -1.46 -0.57 -0.61 -0.76 -0.69 -0.11 -0.26 -1.45 -1.38 0.47 -0.42 0.36 0.61 0.37 0.13 0.81 0.29 0.69 0.44 0.66 0.84 0.61 0.24 -0.16 -0.01 0.01 -0.27 0.19 0.36 0.01 0.17 0.75 0.27
-3.81 -4.01 -1.79 -4.26 -0.23 -0.14 -0.16 -0.05 -1.7 0.47 0.95 0.88 0.8 0.25 0.62 -1.66 -2.11 -2.0 -0.37 -0.07 -0.14 -0.09 -2.82 -2.49 0.91 -0.5 1.36 0.26 -0.03 -0.38 0.09 0.32 0.12 -0.11 2.14 0.54 0.6 -0.2 -0.73 -0.27 0.1 -0.35 0.03 -0.36 -0.33 -0.23 -0.24 0.04
-1.78 -2.14 -1.31 -1.61 0.8 0.72 0.46 0.39 -1.92 0.25 -0.24 -0.21 -0.14 -1.5 0.37 -1.82 -1.38 -0.67 -0.46 -0.32 -0.03 -0.29 -1.78 -0.28 0.78 -1.12 0.59 0.65 -0.66 0.25 0.43 0.39 0.42 0.31 1.65 1.44 0.48 -0.26 -0.48 -0.54 -1.08 -1.34 -0.28 0.46 -0.2 -0.35 0.7 0.09
-0.81 -0.94 -1.5 -3.01 -1.53 0.17 0.47 0.3 -0.02 0.43 0.37 0.41 -0.22 -1.25 0.32 -0.75 -1.49 -1.64 -1.25 -1.22 -1.17 -1.04 -3.11 -3.6 -0.07 -0.6 -0.1 1.24 1.02 0.31 0.73 0.82 0.28 0.52 1.41 1.2 0.71 0.47 0.04 -0.56 -1.67 -1.4 -0.65 0.22 0.05 0.38 0.73 0.24
-0.61 -3.31 -0.71 -0.93 0.97 0.82 0.69 0.61 -3.78 0.72 -0.41 -0.45 0.09 -1.41 0.39 -4.92 -1.1 -1.29 -0.59 0.26 0.25 0.07 -3.61 -0.45 0.84 -1.04 0.83 0.63 0.34 0.28 0.7 0.7 0.32 -0.12 0.02 0.75 0.84 0.51 -0.91 -0.5 -0.69 -1.12 -0.24 -0.25 -1.01 0.2 0.16 0.37
-3.34 -3.14 -3.68 -3.49 -4.91 0.2 -0.12 0.26 -3.85 0.89 0.86 0.71 -0.07 -1.26 0.44 -3.61 -2.07 -3.01 -1.26 -0.64 -0.7 -0.82 - -2.76 0.7 -2.46 0.9 1.03 1.3 0.09 0.94 1.12 0.73 0.37 1.38 0.88 1.03 0.29 -0.81 -0.21 -0.57 -1.4 0.09 -0.03 -0.1 0.19 0.56 0.4
-1.98 -0.6 -2.28 -1.01 -2.78 0.56 0.28 0.28 -4.02 0.73 0.45 0.04 -0.31 -1.92 0.52 -1.74 -0.81 -1.45 -1.01 -0.29 -0.21 -0.51 - -1.11 0.78 -1.39 0.73 0.64 0.94 0.64 0.84 1.06 0.59 0.02 0.53 0.51 0.94 -0.08 -1.14 -0.21 -0.52 -1.04 0.2 0.38 -0.0 -0.06 0.62 0.83
-2.45 -0.83 -2.66 -2.07 -0.57 -0.23 -0.53 -1.14 -1.66 1.18 -1.87 -1.92 1.32 0.23 0.82 -2.68 -1.62 -0.98 -2.01 -1.32 -2.86 -2.21 -4.1 -1.22 0.7 1.12 0.21 1.19 0.75 0.45 1.39 0.03 0.3 0.12 1.38 0.65 1.35 0.48 -0.98 -0.44 -0.21 -0.29 -0.6 -0.84 -0.69 0.36 0.56 0.35
-0.13 -0.16 -1.27 -2.3 0.59 0.23 -0.42 -0.5 -0.21 0.58 0.72 0.63 0.55 0.23 0.37 -0.94 0.04 -0.88 -0.39 -0.42 -0.22 0.17 -1.68 -1.29 0.67 -0.34 0.65 -0.38 0.02 -0.38 0.18 -0.27 0.01 0.11 1.19 0.36 0.08 0.17 -0.63 -0.19 0.14 0.06 0.2 -0.18 -0.46 0.19 -0.36 -0.02
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-1.86 -1.74 -1.06 -4.64 0.03 1.46 1.18 1.29 -0.89 0.31 -3.57 -3.83 -0.77 -2.29 0.19 -2.66 -1.61 -1.92 -0.31 0.02 -0.13 -0.5 -1.69 0.94 -0.27 -1.67 -0.87 1.12 0.22 0.39 1.08 0.15 0.75 0.51 1.06 1.14 1.13 0.35 -0.57 -0.59 -1.28 -1.81 -0.41 -0.44 -0.37 0.31 0.21 0.02
-1.28 -0.43 -1.48 -3.11 0.56 0.36 0.49 0.31 0.13 0.46 -1.38 -1.63 0.54 -0.47 0.55 -2.65 -0.7 -1.16 -1.29 -0.75 -0.49 -0.38 -3.51 -2.69 -0.15 -0.22 -0.49 0.59 1.16 0.23 1.1 -0.14 0.51 0.32 1.11 0.28 1.4 0.13 -0.7 0.06 0.17 -0.2 0.15 -0.33 -0.11 0.04 -0.49 0.82

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.