Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.53 -1.01 -0.74 -3.19 0.38 -0.66 -0.39 -0.88 -2.01 0.54 -0.03 0.12 -0.63 -1.86 0.48 -2.27 -0.53 -0.82 -0.03 -0.14 -0.0 -0.2 -1.38 -1.81 -0.51 -0.68 -0.44 1.28 -0.07 0.6 0.3 0.79 0.33 0.75 0.08 1.43 0.24 -0.03 0.25 -0.24 -1.96 -2.15 -0.17 1.03 -0.0 -0.1 1.82 0.28
-0.79 -0.76 -0.67 -2.95 0.52 -0.11 -0.45 -0.12 -1.13 0.56 -1.19 -1.22 0.06 -1.16 0.59 -1.37 -0.65 -0.86 -0.19 0.06 -0.09 -0.4 -1.92 -1.77 0.4 -0.1 0.13 1.16 0.04 0.19 0.59 0.71 0.57 0.52 0.12 1.3 0.9 0.36 -0.29 -0.41 -0.95 -1.2 -0.24 0.25 0.1 0.33 0.85 0.41
-2.49 -1.85 -1.28 -3.98 -0.29 -0.5 -1.35 -1.42 -1.19 0.06 -2.66 -2.59 -0.79 -0.77 0.12 -1.38 -0.78 -2.04 -0.51 -0.37 -0.09 -0.19 -0.78 -3.27 -0.86 -2.06 -0.94 1.63 0.09 0.74 -0.24 0.41 0.53 1.37 -0.32 1.02 0.35 -0.33 1.72 0.36 -2.34 -2.09 0.35 1.33 1.05 -0.4 1.99 0.77
-0.61 -0.71 -0.48 -3.63 0.67 0.59 -0.06 0.2 -1.24 0.84 -0.27 -0.56 -0.59 -2.16 0.5 -0.95 -0.93 -0.77 -0.51 -0.02 0.18 -0.34 -8.19 -2.46 0.46 -0.21 0.36 1.25 0.03 0.35 0.77 0.74 0.51 0.77 -0.12 1.3 0.79 -0.22 -0.5 -0.56 -1.58 -2.22 -0.42 0.12 -0.4 -0.03 0.94 0.24
-1.78 -1.45 -1.63 -3.98 -0.41 -0.96 -1.0 -1.18 -1.76 0.52 -1.1 -1.27 -0.13 -1.38 0.37 -3.06 -1.86 -1.48 -0.98 -0.65 -0.47 -0.96 -3.79 -3.61 0.14 -1.08 0.42 1.69 0.91 0.43 1.02 0.63 0.74 1.05 1.07 1.63 1.19 0.15 0.36 -0.29 -1.88 -2.34 -0.26 0.46 0.05 0.2 1.39 0.52
-1.21 -1.43 -1.36 -3.91 -0.13 -0.88 -1.01 -1.06 -0.49 0.26 -0.93 -0.97 0.26 -0.75 0.17 -2.83 -0.58 -1.07 -0.17 -0.41 -0.74 -0.5 -1.04 -2.47 -0.76 -0.28 -0.48 1.53 0.22 0.55 0.37 0.85 0.6 0.94 0.96 1.71 0.86 0.13 0.49 -0.19 -1.31 -1.86 -0.06 0.42 0.27 0.18 1.04 0.66
-0.74 -0.7 -1.41 -2.54 0.58 -0.74 -1.23 -1.29 -2.01 0.21 -2.43 -2.71 -0.28 -1.34 0.07 -1.34 -0.46 -0.76 -0.58 -0.31 -0.26 -0.61 0.78 -2.68 0.04 -1.36 0.21 1.13 0.07 0.38 0.54 0.85 0.72 0.68 -0.05 1.48 0.63 0.09 0.29 0.1 -1.07 -1.63 0.17 0.83 0.68 -0.02 1.3 0.76
-4.37 -3.53 -3.98 -7.31 -2.78 0.17 -0.29 -0.64 -11.09 0.42 0.33 0.13 -0.6 -1.95 0.78 -3.34 -2.46 -2.58 -0.56 -0.12 0.01 -0.33 -4.87 -3.66 0.69 -2.55 1.66 1.2 -0.13 0.39 0.46 1.27 0.65 0.73 -0.3 1.54 0.71 -0.18 -0.1 0.25 -0.53 -1.11 0.35 0.85 -0.02 -0.15 1.11 0.72
0.19 0.04 0.28 -2.17 -1.92 -0.32 -0.54 -0.44 0.15 0.67 -1.57 -1.96 -0.11 -1.21 0.53 -0.07 -0.1 -0.19 -0.75 -0.43 -0.3 -0.19 -1.83 -1.51 -0.1 0.01 -0.79 0.96 0.7 0.39 0.83 0.07 0.51 0.74 0.89 0.97 0.8 0.27 -0.09 -0.37 -2.07 -2.06 -0.46 0.45 -0.03 0.24 1.05 -0.3
-1.22 -0.88 -0.96 -3.29 -0.13 -0.49 -0.27 -0.57 -1.62 0.23 -2.6 -2.52 -0.39 -1.72 0.12 -1.67 -0.65 -0.62 -0.38 -0.16 0.09 -0.2 -2.29 -0.29 -0.05 -0.9 -0.03 1.48 0.64 0.6 0.99 0.27 0.53 0.58 1.35 1.41 0.94 0.32 -0.05 -0.16 -1.6 -1.83 -0.22 0.31 -0.1 0.28 1.13 0.38
-0.98 -0.98 -1.72 -3.97 0.06 0.32 0.28 0.39 -1.44 0.27 0.06 0.12 -0.47 -2.38 0.34 -2.48 -0.84 -1.12 -0.1 -0.18 -0.23 -0.64 -1.27 -2.25 0.38 -1.19 1.07 1.19 0.33 0.13 0.43 0.91 0.48 0.42 0.13 1.35 0.82 0.0 -0.16 -0.26 -1.02 -1.67 -0.16 0.63 -0.14 -0.03 0.84 0.37
-1.09 -0.42 0.05 -2.49 -0.62 -0.77 -0.06 -0.15 -0.3 0.52 -0.27 -0.23 -0.53 -1.87 0.44 -1.36 -0.88 0.67 0.14 0.01 0.27 0.19 -2.63 -0.73 0.15 -0.51 -0.68 0.99 0.36 0.52 0.73 0.42 0.28 0.66 -0.13 1.25 0.42 0.18 -0.53 -0.6 -1.38 -1.71 -0.56 0.6 -0.76 0.17 1.25 0.55
- -5.96 -5.14 -4.67 -1.4 -0.39 -13.31 -2.0 -4.71 0.85 0.06 0.04 0.48 -0.88 0.5 -1.39 -0.33 -0.57 -0.38 0.13 0.07 -0.17 - -4.11 0.28 -2.31 0.27 1.47 0.45 0.4 0.9 1.26 0.43 0.85 -0.06 1.24 1.05 0.75 0.15 -0.42 -1.73 -1.57 -0.39 0.5 -0.06 0.64 1.24 0.54
-2.13 -1.51 -1.32 -3.56 -0.04 -0.05 0.26 0.3 -0.85 0.35 -1.6 -1.96 -0.61 -2.12 0.2 -2.63 -2.08 -1.35 -0.52 -0.08 0.37 0.05 -1.15 -1.76 0.81 -1.53 0.35 1.29 0.53 0.34 0.7 0.8 0.61 0.68 -0.03 1.52 0.85 -0.07 0.13 -0.04 -1.66 -2.11 0.13 0.67 0.13 -0.1 1.26 0.35
-0.5 -1.08 -1.14 -3.96 0.54 0.97 0.76 0.57 -1.23 0.14 -3.48 -3.66 -1.54 -3.81 0.04 -3.54 -0.92 -1.39 -0.06 -0.04 -0.11 -0.55 -1.67 -3.0 0.22 -1.28 0.09 1.78 0.62 0.31 0.92 1.04 0.45 0.46 -0.43 1.61 1.13 -0.04 -0.53 -0.76 -2.7 -3.38 -0.46 0.4 -0.67 -0.15 1.39 0.43
-0.92 -0.55 -1.46 -5.39 0.02 -0.24 -0.51 -0.46 -0.62 0.33 -1.6 -1.73 -0.44 -1.23 0.63 -1.19 0.2 -0.54 -0.45 -0.27 -0.3 -0.52 0.26 -2.34 -0.56 -1.19 -0.72 1.45 0.18 0.55 0.15 0.61 0.51 0.86 0.21 1.31 0.71 0.31 0.36 -0.14 -1.9 -2.04 0.01 0.56 0.51 0.31 1.05 0.8
-1.21 -1.26 -0.71 -4.41 1.0 -0.31 -0.45 -0.75 -1.88 0.06 -1.32 -1.49 -0.35 -2.23 0.24 -2.35 -0.73 -1.8 -0.14 -0.08 0.25 -0.28 -1.64 -3.31 -0.22 -1.22 -0.6 1.35 0.94 0.4 0.95 0.2 0.63 0.71 1.25 1.45 1.07 0.04 0.16 -0.16 -1.66 -1.89 0.21 0.46 -0.02 0.01 0.92 0.55
-3.01 -2.5 -1.79 -4.54 -0.02 -0.16 -0.23 0.0 -1.82 0.43 -1.05 -1.53 0.08 -1.67 0.36 -3.51 -1.54 -2.0 -0.15 -0.21 -0.34 -0.55 -2.35 -2.89 -0.24 -1.81 -0.37 1.58 0.18 0.34 1.2 0.91 1.03 0.91 0.06 2.17 1.36 -0.08 0.23 -0.56 -1.52 -1.78 -0.36 0.25 0.15 -0.07 1.11 0.22
-1.26 -0.86 -0.88 -2.67 1.07 0.4 0.1 0.04 -0.27 0.13 -2.13 -2.51 -1.13 -3.03 -0.12 -1.73 -0.88 -1.4 -0.19 0.34 0.26 -0.34 -0.14 -2.21 0.29 -1.22 0.42 1.37 0.61 0.44 0.72 0.75 0.5 0.59 0.38 1.28 0.75 0.07 -0.34 -0.37 -2.14 -2.77 -0.04 0.27 -0.13 0.12 1.0 0.27
-0.52 -0.11 -0.73 -3.19 0.52 0.87 0.61 0.53 -1.34 0.56 -3.33 -3.79 -0.27 -1.64 0.2 -2.12 -1.41 -0.67 -0.56 -0.53 -0.6 -0.47 -0.76 -2.38 0.28 -1.53 -0.15 1.07 0.09 0.33 0.95 0.5 0.48 0.72 -0.18 0.91 0.84 0.21 -0.06 -0.34 -0.44 -0.55 0.05 0.29 -0.32 0.18 1.34 0.53
-1.95 -1.49 -0.65 -2.7 -0.4 0.09 -0.12 -0.73 -1.66 0.51 -0.78 -0.47 -0.32 -0.93 0.29 -2.11 -0.44 -1.21 0.02 0.32 0.16 -0.3 -1.25 -2.82 0.11 -1.45 0.17 1.25 0.08 0.42 0.41 0.95 0.64 1.05 -0.25 1.05 0.59 0.3 0.52 0.02 -1.36 -1.37 -0.08 0.74 0.44 0.22 1.03 0.28
-1.1 -1.0 -1.51 -4.31 0.24 -0.42 -0.83 -0.33 -1.01 0.27 -0.59 -0.6 -0.13 -0.54 0.14 -1.01 -1.09 -1.42 -0.19 -0.23 -0.48 -0.84 -0.11 -2.78 -0.55 -0.92 -0.53 1.02 0.45 0.42 0.48 0.93 0.79 0.71 0.32 1.27 0.88 0.25 0.59 0.12 -0.79 -0.88 -0.06 0.7 0.59 0.22 1.07 0.18
-1.55 -2.44 -2.97 -4.36 -1.2 -0.93 -1.61 -1.17 -2.1 0.39 -0.87 -0.84 -0.24 -1.09 0.25 -2.27 -1.23 -0.87 -1.12 -0.71 -0.62 -0.71 -2.87 -3.06 0.0 -0.35 -0.04 1.52 0.56 0.53 0.54 0.8 0.83 1.16 0.62 1.6 0.68 -0.12 0.69 0.09 -1.26 -1.32 -0.02 1.1 0.54 -0.15 1.77 0.5
-4.5 -2.68 -2.41 -5.89 -0.01 -1.29 -1.0 -0.92 -2.39 0.54 -2.72 -3.19 -0.63 -2.52 0.32 -3.52 -1.41 -1.79 -0.77 -0.59 -1.07 -1.32 -0.9 -4.01 -1.17 -2.38 -0.6 1.93 1.3 0.71 0.53 1.53 0.91 1.42 -0.1 1.87 0.98 0.06 0.52 -0.26 -2.34 -3.09 -0.47 0.79 0.55 0.03 1.43 0.87
-1.43 -1.01 -1.75 -4.17 0.45 -0.35 -0.47 -0.37 -0.93 0.32 -4.24 -4.59 -0.03 -1.34 0.55 -2.14 -0.28 -0.69 -0.6 0.03 0.54 0.1 -1.22 -2.14 -0.29 -1.06 -1.23 1.01 0.31 0.51 0.82 0.3 1.01 0.78 -0.25 1.85 1.14 -0.4 0.32 0.25 -1.61 -2.07 0.34 0.79 0.38 -0.37 1.04 0.32
-1.47 -0.23 -0.1 -1.07 -0.2 -0.31 0.26 -0.12 -0.79 0.63 -0.67 -0.63 0.05 -1.18 0.15 -1.25 -0.56 -0.59 -0.03 0.02 -0.08 -0.19 -3.49 -1.19 0.24 -0.53 0.15 1.02 0.44 0.18 0.63 0.59 0.55 0.77 0.47 1.15 0.81 0.25 -0.1 -0.41 -1.46 -1.71 -0.44 0.35 -0.11 0.22 0.91 -0.2
-1.31 -0.68 -0.34 -2.65 0.45 -0.34 -0.34 -0.37 -0.72 0.8 -1.64 -1.57 0.14 -0.99 0.6 -1.08 -0.21 -0.42 -0.01 -0.29 -0.31 -0.49 -0.93 -1.12 0.2 -0.41 -0.11 0.84 0.19 0.29 0.47 0.76 0.51 0.59 0.28 1.06 0.62 0.47 0.06 -0.2 -1.25 -1.45 -0.25 0.44 0.32 0.37 1.0 0.19
-0.37 -0.82 -0.36 -2.92 -0.34 -1.05 -0.31 -0.12 -0.37 0.42 -0.34 -0.29 -0.74 -1.81 0.38 -1.18 -0.37 -0.79 0.32 0.36 0.09 -0.39 -0.3 -2.4 -0.11 -1.08 -0.5 1.56 -0.97 0.53 -0.12 0.7 0.36 0.9 0.26 1.59 -0.15 0.02 0.19 -0.09 -1.92 -2.16 -0.09 0.46 0.01 0.02 1.29 0.57
-1.85 -1.52 -1.08 -2.88 0.48 0.17 0.12 0.09 -2.49 0.71 -1.21 -1.39 -0.2 -1.8 0.71 -2.79 -1.05 -0.64 -0.7 -0.5 -0.4 -0.87 -1.9 -2.46 0.34 -0.22 0.34 1.24 0.5 0.62 0.88 0.81 0.56 0.6 0.38 1.37 1.07 0.12 -0.13 -0.41 -1.5 -1.79 -0.33 0.57 -0.19 0.14 1.06 0.37
-2.58 -1.19 -0.96 -3.59 0.33 -0.3 -0.2 -0.12 -0.68 0.71 -2.37 -3.21 -1.05 -2.72 0.33 -6.55 -1.23 -0.74 -0.64 -0.35 -0.17 0.09 -1.76 -2.75 0.56 -1.19 -0.15 1.81 -0.21 0.57 -0.22 1.27 0.63 1.28 -1.12 1.38 0.88 -0.16 0.36 -0.48 -2.69 -2.95 -0.26 1.11 0.28 -0.26 1.66 0.52
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-0.9 -1.15 -0.35 -1.96 1.49 1.28 1.0 1.14 -0.46 0.38 -4.41 -4.93 -1.46 -3.51 0.04 0.66 -1.32 -1.27 -0.7 -0.2 -0.42 -0.14 -2.61 -3.15 -0.74 -2.26 -2.82 1.46 0.78 0.32 0.76 0.17 0.62 0.62 0.26 0.84 1.31 -0.66 -0.2 -0.8 -4.01 -4.03 -0.24 0.61 -0.25 -0.69 1.27 -0.65
-0.91 -0.68 -0.78 -3.05 0.26 0.11 0.47 0.27 -1.16 0.56 -2.35 -2.45 -0.04 -0.8 0.26 -1.07 -0.31 0.22 -0.32 -0.26 -0.49 -0.19 -1.06 -1.48 0.34 -0.27 -0.03 1.43 0.29 0.27 0.78 0.91 0.2 0.23 0.07 1.12 0.63 0.37 -0.19 -0.48 -1.4 -1.52 -0.24 0.09 -0.35 0.27 1.03 0.35
-0.67 -0.26 0.06 -1.48 -1.22 0.13 0.11 0.15 -0.2 0.83 -0.64 -0.85 0.28 -1.03 0.42 -1.23 -0.54 -0.3 -0.4 0.19 -0.0 0.31 -3.0 -2.13 0.17 -0.18 -0.28 1.0 -0.02 0.16 0.86 0.28 0.38 0.49 -0.22 1.55 0.45 0.56 -0.68 -0.72 -1.2 -1.07 -0.56 -0.31 -0.43 0.54 1.05 -0.13
-0.85 -0.55 0.06 -3.38 0.68 -0.01 0.31 0.06 -0.87 0.47 -0.97 -1.04 -0.35 -2.1 0.24 -1.25 -1.13 -1.03 -0.1 0.11 0.25 -0.14 -2.75 -2.31 0.15 -1.35 -0.01 1.16 0.32 0.35 0.74 0.97 0.53 0.54 -0.82 1.32 0.93 0.12 -0.2 -0.24 -1.74 -2.07 0.03 0.51 -0.13 0.01 1.18 0.12
-1.36 -0.87 -2.31 -3.73 -0.85 -1.27 -1.56 -1.74 -1.14 0.28 -1.27 -1.25 -0.33 -0.52 0.42 -1.69 -1.17 -1.49 -1.13 -0.72 -0.41 -0.9 -0.76 -2.84 -0.58 -1.57 -0.96 1.58 0.84 0.67 0.72 0.68 0.86 1.25 0.73 1.53 0.86 -0.01 0.89 -0.04 -1.55 -1.68 0.07 0.55 0.7 0.01 1.33 0.85
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-1.6 -1.73 -1.46 -1.35 -0.2 0.44 0.11 0.09 -1.55 0.51 0.17 -0.31 -0.15 -1.51 0.6 -1.89 -0.92 -0.73 -0.77 -0.31 -0.71 -0.73 -5.85 -1.83 0.19 -0.4 0.76 1.34 0.51 0.23 0.79 0.87 0.72 0.73 0.32 1.28 1.19 -0.47 -0.16 -0.32 -0.86 -1.45 -0.27 0.38 -0.03 -0.55 0.7 0.24
0.84 -1.04 -0.75 -3.28 0.15 -0.85 -0.51 -0.96 0.01 0.17 -4.26 -4.08 -0.82 -2.02 -0.14 -2.53 -0.3 -0.12 -0.52 -0.35 -0.32 -0.42 -2.07 -2.56 -0.42 -1.32 -0.71 1.96 0.42 0.68 0.22 0.56 0.36 0.94 -0.09 1.64 0.67 0.12 0.57 -0.23 -2.27 -2.3 -0.12 0.61 0.43 0.0 1.4 0.58
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-3.28 -3.41 -1.25 -3.38 0.42 -0.28 -1.2 -0.43 -2.29 0.67 0.1 -0.17 -0.04 -1.64 0.56 -2.83 -1.8 -1.31 -0.74 -0.15 -0.01 -0.52 -1.46 -2.48 0.43 -0.6 0.67 1.03 0.19 0.41 0.83 1.4 0.69 0.53 -0.19 1.09 1.13 0.1 -0.23 -0.42 -1.17 -1.3 -0.34 0.86 0.1 0.08 1.37 0.37
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.