Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- 4.98 1.27 - - - - - - - - - - - -4.93 - 2.63 - - - - - - - - 2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.7 -0.69 1.48 - 0.18 1.07 -0.4 - 0.08 0.89 0.17 -0.06 0.17 -0.48 2.09 1.08 1.07 - - -2.29 -0.77 - -0.25 -0.98 0.98 -2.46 -1.6 -4.05 -0.47 -1.5 -3.8 -2.6 -2.28 -1.19 -1.06 -2.59 0.63 - -0.54 -1.58 -1.33 -1.49 -3.91 - 0.08 -2.43 -1.25
- 4.22 3.42 0.36 1.67 - - -2.29 -2.76 - - - - - -3.14 0.65 2.73 -1.91 - - - - - -1.08 - 2.16 - - - -4.56 - -1.75 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.8 0.68 2.05 - - - - -0.98 - - - - - - 3.18 1.54 -0.34 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.96 - -0.27 - - - - - - - - - - - 3.69 0.07 - - - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.96 - -0.27 - - - - - - - - - - - 3.69 0.07 - - - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 1.44 1.06 -2.6 - - - - - - - - - - 3.31 -0.37 - - - - - - - - -0.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.18 1.79 0.22 -0.71 - - - - - - - - - - - 0.38 0.39 - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.1 1.52 - - - - - - -1.6 - - -3.13 - -7.04 1.99 1.72 - - - - - - -2.24 - -0.35 - - -0.76 -3.45 - - -3.68 -1.4 - -2.83 -0.94 - - - - - -2.32 - - - - -4.41
- 4.53 - 1.57 - - - - 0.58 - - - - - - 2.68 2.75 -1.02 - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.78 -0.66 3.13 -1.24 -2.93 0.45 -1.96 -0.11 - - - - - -6.95 1.45 1.78 -2.32 - - - - - -3.66 - 0.73 - - - -5.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.85 2.87 - 0.66 - - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.26 - - - - - - - - - - - - - - 1.48 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.31 4.55 -1.49 2.92 -2.03 - - - 2.5 - - - - - - 2.76 0.95 -3.59 - - - - - -3.35 - -0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.93 0.04 0.0 -4.68 - - - - - - - - - -7.72 2.97 1.85 -1.97 - - - - - - - 1.93 - - - -6.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.93 0.04 0.0 -4.68 - - - - - - - - - -7.72 2.97 1.85 -1.97 - - - - - - - 1.93 - - - -6.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.09 2.46 - 0.05 2.84 - - - - 0.08 - - - -3.89 - 2.3 0.32 - - - - - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.61
- 4.8 - 1.67 0.02 - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.06 2.09 - - - - - - - - - - - - 1.11 1.78 - - - - - - -0.48 - 2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.2 - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.77 -2.25 - - - - - 2.69 - - - - - - 3.14 1.88 -2.24 - - - - - - - 0.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.53 4.58 -1.66 0.92 - -0.29 - - 2.6 -1.44 - - - - -2.94 - 2.08 -1.6 - -2.14 - - - 0.27 - 2.27 - - - -2.75 -2.0 - - - - - - - - - - -2.99 -1.77 - - - - -
- 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.33 2.05 -1.67 -1.96 - -1.68 - - - - - - - - -1.21 -0.54 - - -1.78 - - - -2.67 - 0.12 - - - -6.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.91 1.69 1.7 -2.02 - - - - - - - - - - - 2.41 1.09 - - - - - -0.78 - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 0.11 - - - - - - - - - - - - 3.0 1.17 - - - - - - - - 0.71 - - - -1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.62 1.41 - -3.39 -0.43 1.01 -0.84 - -2.77 -2.3 -1.01 - - -2.83 - 1.6 -2.88 - - - - - -2.04 -2.01 1.33 - 0.09 -1.0 -1.54 -1.98 - -0.21 -0.82 -1.22 -0.04 - -0.72 -0.63 -2.4 - - - 0.99 - -1.31 0.05 -2.05
- 4.29 1.93 -1.27 0.96 -2.01 - -1.53 2.73 -1.43 - -1.67 -1.29 -0.91 -0.39 -1.27 1.24 0.14 -0.15 -2.73 -0.88 -0.75 - 0.05 -1.52 -0.59 -3.26 - - -3.26 -2.51 - -2.24 - -3.17 -1.42 -2.94 -0.51 -2.04 -0.49 -2.48 -2.64 - -1.75 -2.05 -2.0 -2.79 -1.41
- 4.82 - - 1.62 - - - - - - - - 1.17 - 3.31 1.6 - - - - - - - - 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.38 3.08 - 0.23 - - - - -0.22 - -0.41 -0.76 -1.37 0.03 2.08 0.95 -1.56 0.2 - -1.68 0.01 - -0.74 -2.43 1.89 -1.84 -1.65 0.67 -2.23 -2.17 -2.13 -2.92 - 2.17 0.95 - -0.94 - - - - - - -1.46 -0.65 - -
- 4.71 -0.1 0.16 -1.48 - - - 3.29 - - - - - -3.49 - 2.45 -1.09 - - - - - - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.85 4.67 0.29 -1.93 0.77 - - - - - - - - - -1.58 3.13 2.12 0.48 - -0.59 - - - - - 0.97 - - - -3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - 0.32 - - - - - - - - - - -3.36 2.95 1.9 - - - - - - 0.9 - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.64 - - - - - - - - - - - - - - 3.23 2.22 - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.06 - - - - - - - - - 1.66 - - - - 1.46 - - - - - - 1.11 - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.28 4.72 0.62 -0.91 - - - - 0.14 - - - - - - 2.07 2.81 -2.8 - - - - - -2.1 - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.97 - - - - - - 0.11 - - - - - -4.26 2.78 2.11 - - - - - - - - 2.08 - - - -3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.04 0.4 -2.5 - -1.36 -1.71 -0.76 0.36 0.6 - - 1.25 -1.68 -1.31 2.11 0.9 -2.33 - -3.37 - -2.41 - - - -0.51 - - -3.98 -0.73 -2.7 - 0.41 -0.7 - -1.32 -1.32 1.6 -1.57 1.35 -1.12 -0.27 -0.24 -2.63 0.21 1.09 -1.95 -1.95
0.97 3.7 0.81 0.6 -2.98 -1.43 0.57 0.01 1.6 1.33 -1.66 -0.18 1.29 -0.29 0.23 - -0.13 -2.39 - - - - - -2.25 - 2.01 -4.78 - -3.56 -1.05 -0.3 -4.54 -4.82 -4.56 - -3.41 - 1.56 - -0.31 -0.2 -0.11 -1.17 - -4.75 1.05 -4.31 -1.02
- 5.3 -0.61 -1.59 - - - - -1.07 - - - - - -7.02 -1.3 0.85 -0.07 - - - - - - - 1.99 - - -3.44 -6.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.95 1.21 - -3.96 - - - - - - - - - -5.33 3.46 1.03 - - - - - - -2.29 - 0.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.37 -1.15 - -1.55 - - 0.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - - - 0.01 - - - - - - - - - - - -1.88
- 5.01 - - - 0.35 - - - - 0.73 1.85 - - -4.69 - -0.4 1.01 - - - - - 0.71 - 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.03
1.5 4.2 1.54 1.79 -3.14 - -3.87 - -0.46 - - - - - -4.36 2.37 2.91 -0.5 -3.87 - - - - -2.5 - 2.55 - - - -5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.96 4.37 2.72 0.04 -2.79 -1.05 - 0.15 - - - - - - -3.22 -1.17 2.06 -0.97 - -0.38 -0.36 - - - - 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.35 -1.86 - - 1.74 - 1.12 - -1.08 -1.21 - - - -4.09 - -0.04 -1.19 - - - - - - 2.08 2.84 2.97 - - -4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.96
- 4.77 1.37 -0.33 - 1.87 - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - 1.79 1.83 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.13 1.25 0.11 -1.19 - - - 1.57 - - - - - -4.21 - 2.51 - - - - - - - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.12 0.32 0.68 -2.88 - - - - - - - - - -5.9 0.82 1.32 - - - - - - - - 2.55 - - - -3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.19 - - - - - - 1.12 - - - - - -3.47 - 1.76 0.17 - - - - - - - - - - - -2.34 - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - 1.5
- 4.23 1.58 -1.67 0.25 -0.53 -1.26 - - - 1.15 2.34 - - - 2.52 - - - -0.37 - - 1.84 -0.94 -1.31 1.07 1.48 - - -4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 -
- 5.32 - - - - - - 0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.74 - 0.9 0.47 - - - - - - - - - -2.65 - 3.19 0.37 - - - - - - - 2.38 1.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 2.29 0.78 - 0.7 - - - - - - - - - - 0.41 - - 1.08 - - - - - - - - - - - -0.23 - - - - - - - - - - - - - -0.06 - -
0.08 3.98 1.74 1.57 -3.41 - -4.47 - 2.3 - - - - - -4.66 2.92 2.74 -0.68 - - - - - -1.04 - 2.14 - - - -5.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.42
- 4.07 - 0.05 - - - - - -1.55 - - - - -3.87 3.85 2.45 -1.49 - - - - - - - 2.94 - - - - -0.7 -0.45 - - - - - - - - - - -0.91 - - - - -
- 4.77 - 3.14 - - - - 2.75 - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.49 - -1.62 -1.78 - 2.02 1.88 - - - 0.04 - - - 2.5 1.33 1.71 - - - - 0.74 -0.68 - 1.29 - - - -3.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.85 0.71 0.32 -0.93 - - - - - - - - - -3.75 3.64 0.59 - - - - - - - - 0.73 - - - -5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.83 -1.07 1.32 - - - - - - - - - - -5.48 2.64 2.58 0.12 - - - - - - - 1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.55 3.54 0.87 0.09 -1.46 -3.4 0.46 0.22 1.95 0.9 -2.64 -1.73 0.96 -0.41 -0.2 -1.98 1.28 -0.26 -3.02 -4.72 -0.77 -1.07 - -1.38 -5.07 3.23 - - -4.5 -1.99 -1.09 -2.74 -4.85 - - - -5.23 0.4 - -2.27 -0.31 -0.54 -2.62 -3.98 -5.52 0.47 -4.08 -2.57
- 5.29 -0.05 -1.17 - - - - - - - - - - - 2.08 0.4 -2.15 - - - - - - - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.15 2.55 0.86 -0.83 - - - - - - - - - -3.2 - 0.78 - - - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.11 1.36 - - - - - 0.84 - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.8 1.77 - 2.68 - - - - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.62 0.23 - -1.22 0.58 - 1.51 1.77 - - - - - - - 2.84 - - - - - - 1.4 - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 5.13 0.49 - -2.08 - - - - - - - - - - 2.53 0.26 0.43 - - - - - 1.26 - -0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.32 5.01 -0.12 2.32 - - -0.16 -3.07 -0.49 -3.3 - - -2.97 - -5.21 -0.4 1.72 - - - - - - -2.86 - 1.77 - - -3.49 -5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.65 3.04 2.0 0.37 - - - - -1.89 - -1.37 - - -5.19 - 2.09 - - 1.16 - - - - -0.91 -1.2 -1.04 - -1.26 - - - -3.08 - - - - - - - - - - - - - - -2.83
- 5.43 - - - - - - - - - - - - - - -0.66 -0.98 - - - - - - - 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.