Heatmap: Cluster_217 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_24100V3.1	-0.62	-1.28	-0.51	-3.08	0.3	1.35	1.52	1.37	-0.18	-0.08	0.57	0.59	-1.37	-1.84	0.03	-1.54	-1.29	-0.69	-0.11	0.67	0.76	0.5	-1.93	-0.44	0.95	-0.54	1.09	-0.22	-0.62	-0.33	0.22	0.03	-0.02	-0.19	-0.13	-0.72	0.24	0.0	-1.05	-0.53	-0.81	-1.24	-0.01	-0.34	-0.46	-0.1	-0.02	-0.05
Pp3c10_24900V3.1	-0.97	-0.6	0.56	-1.15	0.77	1.65	1.52	1.52	-0.45	0.29	0.52	0.41	-0.9	-2.61	0.14	-1.17	-0.43	-0.82	0.41	0.51	0.58	0.19	-1.28	-0.32	0.86	-0.9	0.91	0.13	-0.91	-0.35	0.4	0.54	-0.26	-0.63	-0.49	-0.07	0.26	-0.31	-2.08	-1.55	-2.0	-2.63	-0.82	-0.74	-1.4	-0.35	-0.17	-0.53
Pp3c11_19590V3.1	-0.92	-1.34	-0.38	-0.56	0.85	0.83	1.05	0.98	-1.05	0.43	0.24	0.29	-0.41	-2.3	0.16	-1.55	-1.34	-1.06	-0.43	0.01	0.08	-0.35	-2.59	-0.08	0.55	-0.85	0.55	0.59	0.4	0.09	0.34	0.66	0.32	0.13	-0.71	0.53	0.52	0.11	-0.79	-0.31	-1.08	-1.53	-0.06	0.28	-0.23	0.09	0.39	0.04
Pp3c11_19990V3.1	-0.0	-0.83	-0.31	-2.93	-0.68	0.88	1.06	1.08	-0.64	0.43	-0.14	-0.38	-0.73	-2.53	0.15	-1.45	-0.73	-0.79	0.07	0.51	0.62	0.22	-0.06	-1.97	0.73	-0.91	0.83	0.5	0.01	0.1	0.6	0.73	0.3	-0.03	-0.87	0.57	0.69	-0.11	-1.36	-0.63	-1.28	-1.71	-0.11	0.2	-0.73	-0.17	0.54	0.22
Pp3c11_21430V3.1	-0.42	0.12	0.11	0.01	0.34	0.99	1.06	0.89	-0.22	0.08	-0.92	-1.09	-0.13	-1.2	0.1	-0.4	0.27	0.3	0.09	0.43	0.18	0.06	-0.58	-0.45	0.57	0.34	0.14	0.58	-0.49	-0.04	0.6	0.11	-0.25	-0.17	-0.66	-0.25	0.21	-0.2	-1.13	-0.47	-0.8	-1.12	-0.28	-0.42	-0.65	-0.21	0.22	0.05
Pp3c11_24040V3.1	-1.57	-0.93	-0.34	-3.03	0.37	1.37	1.2	1.3	-0.73	0.25	-0.08	-0.24	-0.8	-2.06	0.39	-1.91	-1.02	-1.05	0.21	0.55	0.5	0.17	-0.92	-1.45	0.74	-0.48	1.05	0.66	-0.0	-0.12	0.16	0.97	0.15	-0.01	-0.62	0.49	0.56	-0.13	-1.25	-0.98	-0.99	-1.48	-0.72	-0.2	-0.71	-0.19	-0.16	0.43
Pp3c11_3720V3.1	0.05	-0.65	0.52	-1.31	1.34	0.66	0.67	0.98	-0.24	0.25	-1.64	-1.53	0.06	-1.96	0.44	-1.77	-0.44	-0.08	0.49	0.41	0.32	0.08	-0.81	-1.6	0.73	-0.76	0.62	0.64	0.17	-0.1	0.33	-0.31	-0.17	0.14	0.06	0.08	0.53	0.35	-1.32	-1.05	-0.72	-1.28	-0.55	-0.48	-0.5	0.31	-0.27	0.27
Pp3c12_11410V3.1	-0.02	-0.3	0.25	-0.91	1.07	0.54	0.83	0.67	0.07	0.51	-0.22	-0.29	0.42	-0.77	0.38	-1.44	-0.48	-0.53	0.41	0.46	0.23	0.4	-0.17	-1.48	0.83	-0.42	0.93	0.19	-0.74	-0.39	0.23	0.11	-0.03	-0.22	-0.04	0.49	0.26	-0.19	-1.11	-0.75	-0.82	-1.07	-0.46	-0.71	-0.78	-0.28	-0.46	-0.13
Pp3c12_1620V3.1	-1.46	-0.44	-0.13	-2.66	1.11	1.58	1.41	1.54	-1.02	0.24	-0.74	-0.92	-0.72	-2.83	0.07	-0.65	-0.18	-0.65	0.68	0.65	0.61	0.35	-1.48	-1.19	0.74	-0.3	0.38	0.51	-0.09	-0.22	0.46	0.34	-0.07	-0.25	-0.28	0.33	0.4	-0.4	-1.59	-1.09	-1.8	-2.58	-0.57	-0.41	-1.18	-0.35	0.17	-0.07
Pp3c12_17790V3.1	-1.56	-2.08	-0.15	-0.22	0.26	1.76	1.61	1.61	-0.96	-0.01	-0.89	-1.14	-0.49	-1.11	0.15	-1.01	-1.98	-1.87	-0.6	-0.29	-0.46	-0.35	-1.47	-2.96	0.48	-1.27	1.36	-0.03	-0.51	-0.04	0.17	0.55	0.13	-0.08	1.02	0.3	0.5	-0.04	-0.68	-0.44	-0.2	-0.57	-0.29	-0.27	-0.57	-0.18	-0.44	0.62
Pp3c12_3430V3.1	-0.2	-0.36	0.45	-0.28	-0.53	0.24	1.68	2.06	0.3	0.01	-0.48	-0.49	-0.87	-2.08	-0.1	-0.68	-0.97	-0.75	0.18	0.24	0.2	-0.23	-0.22	-1.33	0.51	-1.49	0.49	0.34	0.37	0.04	0.04	-0.08	-0.08	-0.03	0.53	0.19	-0.15	-0.02	-1.2	-0.6	-1.11	-1.59	-0.24	-0.44	-0.88	0.03	-0.06	0.14
Pp3c12_4230V3.1	-0.51	-1.33	-1.02	-1.64	0.45	0.91	1.54	1.52	-0.08	0.35	0.12	0.08	-1.08	-2.65	0.3	-1.37	-1.59	-1.24	-0.24	0.22	0.33	0.02	-1.22	-1.03	0.89	-0.54	1.14	0.19	-0.24	-0.03	0.38	0.79	0.15	-0.23	-1.12	0.09	0.47	0.29	-1.56	-0.87	-1.4	-1.89	-0.34	-0.07	-0.41	0.21	0.39	0.21
Pp3c14_22460V3.1	-0.44	-0.92	-0.73	-1.27	1.14	1.16	1.44	1.42	-0.29	0.5	-0.18	-0.14	0.12	-1.38	0.35	-0.87	-0.23	-0.34	0.51	0.09	-0.33	-0.22	-2.38	-2.39	0.46	-0.17	0.27	0.04	-0.38	-0.17	0.32	0.1	-0.11	-0.25	0.43	0.16	0.35	0.22	-1.31	-0.63	-0.65	-0.82	-0.33	-0.36	-0.97	0.16	-0.08	-0.24
Pp3c14_4760V3.1	-0.79	-0.96	-0.45	-0.94	-0.03	0.43	1.14	0.98	-0.21	0.49	0.45	0.52	-0.51	-1.49	0.55	-1.59	-1.52	-1.08	-0.49	-0.12	-0.01	-0.21	-1.66	-0.94	0.86	-0.92	0.76	0.47	0.06	0.05	0.7	0.25	0.31	0.04	0.61	0.55	0.32	-0.06	-1.01	-0.27	-0.54	-0.85	-0.09	-0.1	-0.41	-0.13	0.29	-0.06
Pp3c16_19090V3.1	0.1	-0.05	0.08	-0.82	0.58	1.63	1.58	1.42	0.09	0.14	-0.78	-0.63	-0.52	-2.65	0.14	-0.45	-0.41	-0.53	-0.18	0.2	-0.11	-0.63	-1.68	-1.11	0.96	-0.28	0.85	0.41	-0.05	0.04	0.62	0.16	-0.43	-0.66	0.51	0.27	0.44	0.1	-2.44	-1.07	-1.38	-2.18	-0.77	-1.36	-1.83	0.02	-0.66	0.04
Pp3c16_2030V3.1	-0.49	-0.78	0.14	-1.57	1.24	0.78	0.89	0.79	0.11	0.24	-0.34	-0.19	-0.08	-1.72	0.27	-0.84	-0.2	-0.44	0.23	0.53	0.46	0.25	-1.18	-1.23	0.4	0.2	0.61	0.23	0.08	0.0	0.31	-0.05	-0.04	-0.24	0.12	0.21	0.5	0.19	-1.17	-0.68	-0.99	-1.32	-0.37	-0.42	-0.93	0.12	-0.16	-0.06
Pp3c16_3260V3.1	-4.91	-1.18	-2.13	-3.19	-2.8	1.63	2.71	2.73	-2.48	-0.79	-1.46	-1.13	-1.69	-2.52	0.2	-0.17	0.24	-2.43	-5.07	-1.75	-3.13	-1.83	-6.82	-1.59	0.17	0.43	-0.1	0.34	0.35	0.15	1.45	-0.14	0.61	-0.37	-0.52	0.29	1.76	-1.94	-2.43	-1.57	-0.87	-1.1	-0.81	-1.43	-1.62	-1.9	-0.41	0.91
Pp3c17_10030V3.1	-0.5	-0.47	0.22	0.18	0.69	1.78	1.7	1.88	0.53	0.54	-2.2	-2.34	0.18	-1.44	0.35	-0.73	-0.53	0.04	-12.77	-7.09	-1.61	-1.68	-1.18	-0.64	0.86	0.87	0.67	0.16	-0.59	0.09	0.66	-0.14	-0.5	-0.75	-0.42	0.04	0.26	0.21	-2.08	-0.72	-0.57	-1.06	-0.68	-1.71	-1.8	0.08	-0.93	0.44
Pp3c17_4860V3.1	-1.41	-0.88	0.26	-1.27	0.78	0.74	0.83	0.88	0.02	0.33	0.5	0.43	-0.1	-1.73	0.26	-0.93	-0.14	-0.04	0.01	0.41	0.32	0.16	-2.69	-0.53	0.62	0.46	0.72	0.31	-0.24	-0.05	0.12	0.53	-0.18	-0.24	0.01	0.36	0.29	-0.05	-1.33	-0.82	-1.14	-1.52	-0.6	-0.33	-1.06	-0.06	-0.01	0.08
Pp3c17_6450V3.1	-0.96	-0.28	0.04	-0.04	0.58	0.99	1.27	1.03	-0.54	0.41	0.2	0.13	0.16	-1.44	0.25	-1.42	-0.91	-0.45	0.23	0.16	0.07	0.01	-3.02	-2.44	0.5	0.49	1.04	0.47	-1.11	-0.28	-0.02	0.45	-0.07	-0.0	-0.46	-0.15	0.29	0.07	-0.75	-0.64	-0.84	-1.33	-0.33	-0.22	-0.64	0.12	0.08	0.16
Pp3c1_18490V3.1	-0.38	-0.45	0.25	-2.83	0.97	1.51	1.39	1.36	-0.86	0.13	0.44	0.35	-0.97	-2.63	0.07	-2.0	0.04	-0.59	0.35	0.66	0.52	0.1	-0.83	-1.99	0.55	-0.41	0.7	0.23	-0.17	-0.16	0.11	0.45	-0.27	-0.59	-0.35	0.27	0.19	-0.07	-1.79	-1.09	-1.41	-1.9	-0.7	-0.29	-1.37	-0.15	0.03	0.14
Pp3c1_32260V3.1	-0.11	-0.16	-0.14	-2.26	0.71	1.04	1.56	1.56	-0.22	0.66	-1.74	-1.81	0.54	-0.76	0.1	-0.9	-0.5	-0.07	-0.01	0.4	0.08	0.03	-1.98	-0.73	1.11	0.53	1.14	-0.03	-1.4	-0.3	0.34	0.07	-0.31	-0.42	-0.9	-0.2	0.44	0.38	-1.61	-1.02	-1.24	-1.45	-0.69	-1.1	-1.33	0.31	-0.5	-0.12
Pp3c1_4500V3.1	-1.32	-0.09	0.09	-0.13	1.49	1.39	0.7	0.89	-0.79	0.3	-1.25	-0.97	-0.49	-2.16	-0.29	-0.93	-0.06	0.18	0.71	0.31	0.17	0.26	-2.09	0.09	0.72	-0.66	0.43	0.76	-0.44	0.01	0.79	0.02	-0.09	-0.17	-1.4	0.04	0.55	-0.21	-1.61	-0.72	-1.23	-1.64	-0.5	-0.5	-1.29	-0.15	0.03	0.45
Pp3c21_15150V3.1	-0.31	-0.07	-0.28	-1.38	0.7	1.27	1.53	1.41	0.65	0.62	-1.22	-1.25	0.28	-1.26	0.46	-0.33	-0.33	-0.77	0.18	0.34	0.05	-0.32	-3.24	-1.94	0.21	0.08	0.25	0.22	-0.04	-0.2	0.61	-0.04	-0.25	-0.52	0.31	0.11	0.47	0.35	-1.76	-0.85	-0.98	-1.39	-0.75	-0.92	-1.14	0.22	-0.34	0.01
Pp3c21_15920V3.1	0.28	0.17	-0.09	-1.87	0.04	1.33	1.16	1.62	0.55	0.28	-0.59	-0.77	-0.56	-1.75	0.18	-0.13	-0.55	-0.43	-0.59	-0.14	-0.24	-0.33	-1.64	-2.23	0.44	0.56	0.11	0.78	0.04	0.05	0.9	0.63	-0.28	-0.47	0.82	-0.39	0.7	-0.05	-1.98	-1.4	-1.21	-1.73	-1.03	-1.15	-1.67	-0.17	-0.39	0.51
Pp3c21_16780V3.1	-1.36	-0.9	-1.51	-2.51	-2.67	0.6	2.24	2.25	-1.14	0.09	-0.16	0.14	-1.27	-2.23	0.23	-1.7	-2.22	-2.46	-0.12	0.35	0.11	-0.55	-1.28	0.96	0.8	-2.48	1.23	0.44	0.22	-0.25	0.67	0.13	-0.05	-0.41	0.79	0.39	0.05	-0.18	-1.81	-0.91	-1.25	-1.86	-0.48	-0.69	-1.33	-0.26	-0.07	0.04
Pp3c21_22570V3.1	-1.11	-1.72	-0.93	-1.08	0.61	1.21	1.59	1.64	-0.99	0.58	-0.95	-1.03	0.19	-0.98	0.63	-1.61	-1.82	-1.03	-0.37	0.14	0.03	0.13	-1.53	-1.7	0.81	-0.77	0.92	0.53	-0.25	-0.08	0.52	0.22	0.06	-0.12	-0.54	0.29	0.64	0.01	-1.27	-0.53	-0.33	-0.66	-0.07	-0.36	-0.54	-0.04	-0.42	0.17
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Pp3c6_28790V3.1	-0.94	-0.05	0.7	-0.76	1.34	1.35	1.19	1.34	-1.15	0.09	0.12	0.08	-1.07	-3.55	0.13	-0.42	0.15	0.13	0.48	0.48	0.34	0.45	-1.73	-0.92	0.67	0.0	0.6	0.09	0.1	-0.21	0.09	0.04	-0.35	-0.44	-1.45	-0.2	0.13	-0.19	-1.63	-1.35	-1.68	-2.28	-0.76	-0.36	-1.46	-0.18	-0.05	0.15
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Pp3c8_5360V3.1	-0.19	0.09	-0.14	-2.44	0.42	0.47	0.68	0.62	0.22	0.58	0.13	0.13	-0.95	-2.41	0.22	-0.43	-0.8	-1.05	0.44	0.42	0.53	0.05	-0.04	-2.66	0.55	-0.78	0.31	0.09	0.2	-0.05	0.85	0.89	0.23	-0.39	0.36	0.31	0.53	0.1	-1.84	-0.97	-1.35	-2.07	-0.36	-0.17	-1.16	0.1	0.47	0.25
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Pp3c9_15240V3.1	-0.86	-1.55	-0.23	-2.97	0.29	1.45	1.65	1.48	-0.3	0.37	-1.1	-1.3	0.29	-0.44	0.38	-0.79	-1.52	-0.97	-0.57	-0.07	-0.07	0.01	-2.35	-1.24	0.98	0.32	0.82	0.0	-0.1	-0.26	0.52	0.45	-0.01	-0.3	0.59	-0.5	1.0	-0.08	-1.21	-0.55	-0.26	-0.8	-0.37	-0.55	-0.81	-0.12	-0.85	-0.29
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Pp3c9_25390V3.1	-1.54	-0.58	-0.33	-2.12	1.08	1.23	1.34	1.23	-0.77	0.51	-1.08	-1.02	-0.3	-2.56	0.44	-1.71	-0.86	-1.17	0.5	0.61	0.26	0.21	-2.44	-2.23	0.67	-0.75	0.59	0.69	-0.69	0.21	0.52	0.46	0.16	0.18	-0.59	0.52	0.63	0.25	-1.29	-0.62	-1.4	-1.74	-0.19	-0.22	-0.97	0.09	0.19	0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.