Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 1.64 - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 - 2.51 - 0.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.51 3.76 4.31 1.94 - -0.2 - - - - - - - - - - - - 2.02 - 2.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -12.91 - - - 3.26 4.18 -0.35 1.13 - - - - - - - - - - -0.25 - - - 0.55 -3.0 - - -0.63 - - - -0.31 -1.63 1.79 - 1.71 1.54 1.59 -1.11 - - - -
- - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - 2.32 - - - 3.41 - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - 2.32 - - - 3.41 - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - 2.32 - - - 3.41 - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - 2.32 - - - 3.41 - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.52 - 3.83 - - - - 3.45 - - - - - - - - - - - - 2.23 - - 2.84 2.2 -1.01 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.63 0.93 3.89 3.99 - - - - - - - - - 0.97 - - - - - - 1.54 - - - - 0.91 - - - - - - - - - - - - 1.31 - 1.58 - - - -
- - - - -0.18 2.67 3.63 2.82 - - - - - - - - - - 3.06 - 1.24 - - - 0.42 - - - 0.38 - 1.08 - - - - 1.37 - - - - - - - 0.52 0.9 - - -
- - - - 0.51 3.11 3.99 1.89 - 0.92 - - -0.38 - - - - - - - - - - - - - -0.33 - 1.36 -0.98 -1.07 -0.09 -1.93 -0.29 - - 0.63 1.04 - 0.45 - 0.11 - - - 0.94 0.43 -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.44 - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.69 2.53 1.24 2.19 4.05 - - - - - - - - - - - - 1.47 1.65 1.33 - - 1.41 - 0.93 - 1.97 -2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.33 2.07 3.6 2.06 - -0.95 2.02 - 0.33 - -3.9 - - 0.66 - - - 0.79 - 0.77 1.86 - 1.5 - - -3.27 1.53 - 1.06 -0.58 - 1.69 - - - - - - - - - -0.37 - -
- - - 3.49 2.65 3.34 4.0 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.18 1.04 3.09 3.75 - - - -0.87 -1.03 0.66 - - - - - - -0.27 - - -0.46 1.75 -0.4 2.68 - -0.77 -0.31 0.43 - -1.6 - - -0.73 -0.02 -0.72 - - - - -0.29 - - 0.85 - -1.07
0.2 0.91 -2.38 0.91 -0.31 3.66 3.29 1.68 0.58 -1.56 - - -4.28 -4.61 -1.51 -0.7 -1.26 -1.87 -4.83 -3.64 -2.66 -2.6 - 2.48 -1.59 -2.17 -3.55 -1.19 -1.55 -2.12 -2.0 -0.71 -1.42 -1.85 -4.35 -0.62 -1.23 -2.49 -2.07 -2.82 -2.55 -4.07 -3.18 -1.34 -2.11 -1.87 -1.03 -1.65
- - - - 2.22 - 4.53 - 3.21 - - - - - - - - 3.32 - - - - - - - - - - - -0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.48 1.84 2.19 3.94 - - 1.63 -0.19 0.44 - -2.15 - - -0.61 - - - 0.48 - 1.4 0.91 - 0.69 - 2.02 - - -0.06 - - 0.77 - - - - - - - - - - -0.06 - -1.66
- - - 3.63 1.26 - 5.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.05 - -0.01 3.54 0.63 3.66 3.37 1.88 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - 2.04 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.33 4.19 2.2 - - 3.82 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - 2.35 - - - - 1.53 2.42 - - - - - - - - - - - - - -
- 2.21 - 1.64 - 2.55 3.64 - - - - - - - 0.05 - 2.9 - - - - - - - 1.41 3.39 - - - -1.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.03 - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.54 - 4.14 3.38 - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.06 3.3 - - - - - - 2.37 - 2.71 - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.23 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.47 - - - - - - - - - - - - - - - 1.15 - - - - -
- - - - 1.83 - 3.34 - - - 3.35 3.58 - - - - - - - - 1.94 - - - 0.11 - 0.67 - 1.27 -2.74 - - - - - - - - - - 1.0 - - - - - - 0.11
- - - - - 2.42 3.77 1.91 - -0.29 - 0.38 1.44 - - - - - - - - - - - 3.43 0.55 2.59 - 0.49 -0.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.2 2.26 - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.04 3.64 3.27 2.04 - 1.26 0.01 -0.28 - 0.46 - - - - - - - - 0.91 0.46 0.5 - - - - -1.37 0.36 -0.15 -1.99 - - - - 0.07 - 0.78 - - - - - 0.88 - -
0.4 - 3.01 - - 1.16 2.62 - - -0.75 - - 0.09 - -2.58 - 2.35 1.56 1.66 - - 3.35 - - 1.61 0.42 0.13 - - - -0.33 - -0.52 - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.78 -5.39 -5.19 3.86 1.69 3.94 -13.75 -27.97 -1.63 - - - - -1.42 - 1.13 0.2 - 0.52 -0.02 -0.04 - -3.42 0.36 1.33 - - -0.5 -2.87 - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - - -2.33
- - - - 2.69 - - - - - - 4.97 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 5.08 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.49 -1.36 -0.3 0.1 2.07 3.53 0.49 -0.03 -2.04 - - 0.97 2.47 -1.77 2.28 0.64 - 1.91 -0.4 - 0.33 -1.85 - -1.65 1.37 -1.95 - - -4.58 -0.58 - - - - - - - - - - -3.06 - - - - - -1.92
- 1.49 -1.36 -0.3 0.1 2.07 3.53 0.49 -0.03 -2.04 - - 0.97 2.47 -1.77 2.28 0.64 - 1.91 -0.4 - 0.33 -1.85 - -1.65 1.37 -1.95 - - -4.58 -0.58 - - - - - - - - - - -3.06 - - - - - -1.92
- - - - 1.9 - 3.86 - - - - - - - - - - 0.72 2.55 1.56 - 3.84 - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.42 - - 3.09 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - - -
- - -2.18 -3.03 - 3.34 4.56 - - - - - - - -3.32 0.72 -0.41 0.26 - - 0.78 -1.32 -1.84 2.91 - -2.67 - - - -4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.87
- - -1.51 -3.96 - 4.24 4.47 - - -3.02 - - - -1.99 -0.15 -2.01 - -4.41 -2.14 -4.76 - -1.2 - -0.08 -0.45 - 0.48 - - -2.96 -4.2 - -3.76 - - - - - - - -2.98 -5.18 -0.91 - - -2.51 - -
- - - - - 4.75 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.67 - 1.38 2.87 4.18 2.85 - -1.25 - - - - - - 1.52 - 0.61 - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.64 - -2.27
- - - - 1.15 3.9 3.99 3.75 - - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - -2.0 -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - -
- - - - -0.04 1.89 3.24 1.03 - 0.54 - - 0.15 -0.4 -0.25 - -0.98 0.44 1.86 1.31 1.05 0.15 - - 1.47 - -0.01 - -0.2 -0.09 0.55 -1.15 -0.86 - - - 0.8 - -0.04 - - - 0.29 0.26 0.78 -0.5 -0.78 -1.51
- - - 2.15 2.45 2.29 3.76 - - 0.27 - - - - -3.25 - - -0.04 - - - - - 1.38 0.16 - 2.03 -0.19 - - - -0.49 - - - - 1.03 -0.27 - 0.41 - - -0.04 - - -0.46 1.02 -
- - - - - 2.7 3.52 0.19 - - 3.04 3.63 - - - - - - - - - - - 0.08 - 0.14 - 1.36 -0.23 -2.34 - - -1.06 - - - - -0.18 - - - - - - - -0.17 - -2.03
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.45 0.18 -0.53 -0.32 -0.68 3.23 3.0 1.77 -0.66 -1.28 -1.05 -1.49 -1.2 -0.86 -1.92 0.28 -0.69 -1.89 -5.43 -3.31 -6.56 -2.44 -1.83 -4.23 1.02 2.94 0.67 -1.33 -5.28 -1.05 -1.54 -1.26 -2.83 -3.19 -3.89 -1.94 -1.84 -0.94 -3.96 -2.6 -0.69 -0.73 -2.74 -2.17 -4.43 -1.03 -1.62 -0.18
- - - - - - 4.34 4.48 - 2.29 - - - - -0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.88 2.0 1.47 0.45 -2.32 3.4 3.01 1.42 2.04 -2.08 -2.18 -2.16 -2.26 -4.08 -0.64 0.85 0.28 -0.37 -1.87 -3.16 -2.18 -2.81 -1.57 -1.06 -1.01 0.78 -2.32 -4.54 -3.34 -1.91 -1.47 -3.12 -3.61 -4.31 -2.27 -0.12 -2.28 -3.53 -5.76 -5.37 -4.52 -4.48 -5.68 -5.08 -4.22 -3.29 -5.14 -2.09
-1.99 - -1.67 1.58 -0.13 2.72 3.33 1.56 -2.79 0.08 -4.97 - -3.69 0.49 -3.47 -1.6 -2.38 -3.68 - -4.1 -3.42 -3.74 - 2.62 -1.23 -3.08 -1.77 -0.15 0.73 -0.85 -3.77 -6.12 -1.21 -0.35 -4.07 -0.28 -2.51 -1.21 1.08 -2.8 -3.93 -2.84 -1.22 1.55 -1.73 -1.58 -0.7 -1.56
- - - - 1.04 - 4.81 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 - - - 0.81 - - - 0.66 - - 0.97 - 0.97 1.09 - 0.44 - -0.85
- - - - 1.04 - 4.81 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.32 - - - 0.81 - - - 0.66 - - 0.97 - 0.97 1.09 - 0.44 - -0.85
- 4.04 - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.77 4.36 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.03 0.62 -0.37 -2.46 3.07 2.66 -0.55 - -1.62 - -2.52 -1.24 -0.43 -1.79 1.67 0.96 -1.95 1.21 -1.22 -2.03 - 1.98 -0.49 -2.75 1.39 -2.64 0.38 -2.42 -1.16 0.61 - -0.08 -0.79 -2.54 0.49 0.96 -2.17 - -2.46 -1.87 -1.2 -2.37 -1.75 -2.61 - -1.88 -0.76
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.83 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.82 - 3.03 - - 0.74 - - - - - - - - - 3.76 - 2.95 - - 2.75 - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.81 2.66 3.73 2.78 - - - 2.19 - - - - 2.95 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.39 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.89 1.27 3.69 2.7 - 0.89 - - 1.87 - -4.02 2.0 - - - 0.55 - - - - 0.58 - - - 1.05 - 1.39 - - - - - - - - 0.19 - - - - - 2.05 - -
- - - - 0.42 4.27 1.65 2.76 - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.55 - 2.77 - - - - 5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.66 - - - 4.49 - - - - - - - - - - 1.67 - - - - - - 2.46 - - - - - - - - - - - - 2.79 - - 2.76 - - - - - - -
-2.64 1.27 0.45 -1.53 -4.37 3.48 3.28 1.28 -0.07 -2.98 -4.34 -4.5 - -4.06 -1.82 2.43 -0.0 0.03 -2.09 -1.6 -0.49 -3.08 -0.45 0.41 -0.81 -0.44 -0.74 -0.32 -2.56 -0.61 -2.43 -1.47 -1.57 -2.19 -4.52 -1.33 -1.85 -1.84 -3.67 -1.45 -2.55 -2.1 -3.87 -3.72 - -2.02 -1.95 -0.21
- - 0.61 - 2.26 3.92 4.27 - - - - - - - 0.44 - 0.73 - - - 1.06 - - - -0.07 - -0.55 - - -3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.13
- - - - 1.54 - 4.06 2.97 - 3.13 - - 2.2 - - - - - - - - - - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.49 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.