Heatmap: Cluster_211 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.04 0.68 1.39 -1.2 -0.9 -0.66 -1.19 -0.74 0.68 -0.85 -1.67 -1.63 -0.65 -0.46 -1.56 -0.5 1.48 0.86 1.07 1.19 0.6 0.51 2.14 -0.98 -0.32 -0.52 -0.29 -0.64 -1.43 -0.37 -0.85 -0.72 -0.28 -0.44 -1.29 -0.87 -0.98 -0.06 -0.86 0.27 -0.15 -0.17 0.03 -0.12 -0.3 -0.01 -0.46 -0.28
0.83 0.89 1.42 -0.68 0.02 -0.42 -0.67 -0.68 0.82 -1.19 -1.69 -1.68 -0.72 -1.01 -0.93 0.64 1.08 0.8 0.9 0.82 0.33 0.56 2.43 -0.43 -0.45 -0.41 -1.09 -0.18 -0.93 -0.25 -0.83 -0.88 -0.83 -0.7 -0.93 -0.91 -0.82 -0.53 -0.61 -0.61 -1.18 -0.94 -0.29 -0.33 -0.59 -0.47 -0.41 -0.26
0.5 1.37 2.19 0.56 -2.78 -1.34 -1.67 -1.59 0.7 -0.9 -1.77 -1.63 -0.25 -0.36 -0.8 0.52 0.69 1.54 0.51 0.73 0.34 0.3 2.33 0.49 -0.42 -0.28 -0.77 -0.94 -1.22 -0.56 -1.18 -1.05 -1.36 -0.89 -1.38 -1.47 -1.21 -0.05 -1.44 -0.55 -0.87 -0.51 -0.6 -0.62 -1.28 -0.03 -1.06 -0.82
0.54 0.92 1.51 0.3 -0.48 -1.02 -1.23 -1.68 0.46 -0.78 -1.56 -1.41 -0.63 -0.82 -0.65 0.29 0.62 0.57 1.19 0.83 0.51 0.45 2.3 0.02 -0.55 -0.53 -1.51 -0.32 -0.38 -0.07 -0.47 -0.5 -0.5 -0.36 -0.6 -0.94 -0.6 -0.11 -0.83 -0.61 -1.35 -0.73 -0.25 -0.35 -0.48 -0.05 -0.34 -0.27
1.54 0.59 2.15 -1.13 -3.77 -2.0 -0.2 -0.05 0.49 -1.91 -3.02 -3.43 -1.74 -3.71 -1.64 1.05 1.2 1.23 1.99 1.3 1.65 1.0 2.3 0.13 -0.41 -0.65 -1.59 -1.57 0.58 -1.34 -2.1 -1.75 -2.01 -1.29 -2.36 -2.44 -2.25 -1.51 -1.95 -1.27 -2.13 -1.38 -1.14 -1.13 -1.02 -2.02 -1.36 -2.06
-0.42 0.84 1.39 0.37 -0.3 -0.7 -1.18 -1.11 0.08 -0.19 -1.16 -1.19 -0.23 -1.28 -0.35 0.27 0.77 0.97 0.69 0.78 0.8 1.16 2.19 -0.45 -0.09 -0.12 -0.72 -0.68 -0.77 -0.18 -0.53 -0.75 -0.81 -0.54 -1.35 -0.72 -0.74 -0.15 -1.15 -0.3 -1.13 -0.79 -0.2 -0.09 -0.88 -0.12 -0.05 -0.46
-0.26 0.46 0.8 1.17 -0.19 -0.71 -0.95 -0.54 -0.39 -1.23 -1.36 -1.38 -1.38 -0.73 -1.04 0.11 0.93 0.88 1.12 1.16 0.68 0.19 2.79 -1.11 0.01 -0.15 0.26 -1.02 -1.93 -0.7 -1.56 -0.96 -0.63 -0.77 -1.93 -1.75 -1.33 -0.3 -0.4 -0.05 -0.5 -0.1 0.05 -0.41 -0.22 -0.31 -0.59 -0.89
-0.8 0.42 0.4 0.09 -1.54 -0.71 -0.43 -0.72 0.01 -0.39 -1.82 -1.96 -0.89 -0.09 -0.19 0.52 0.5 0.64 0.81 0.87 0.48 0.74 1.69 0.14 0.53 -0.4 -0.57 -0.39 -0.12 -0.1 -0.67 -0.93 -0.27 -0.2 -0.9 -1.82 -0.75 -0.23 -0.58 0.0 0.71 0.98 0.23 -0.22 -0.28 -0.3 -0.06 -0.21
0.35 1.03 1.86 0.01 -3.66 -0.66 -0.72 -0.3 0.4 -1.33 -1.99 -1.8 -1.22 -1.39 -0.82 -0.19 1.78 0.85 1.63 1.4 1.39 0.89 2.44 -0.22 -1.03 -0.97 -1.97 -0.54 -1.55 -0.32 -1.45 -1.01 -1.09 -0.7 -1.42 -1.11 -1.77 -0.67 -1.46 -0.93 -1.88 -1.43 -0.79 -1.1 -1.29 -0.63 -0.77 -0.61
-0.03 0.85 0.74 1.0 0.48 -0.09 -0.5 -0.59 0.6 -0.77 -1.6 -1.59 -0.25 -0.14 -0.22 0.3 1.22 0.0 1.04 0.82 0.68 0.45 1.53 -0.92 -0.84 -0.47 -0.6 -0.22 -0.46 -0.04 -0.66 -0.84 -0.51 -0.46 -0.56 -0.95 -0.65 -0.36 -0.22 -0.22 -0.85 -0.74 0.04 -0.35 -0.12 -0.29 -0.73 -0.09
0.25 0.64 0.9 -0.43 -1.01 0.36 -0.01 0.3 1.13 -1.37 -1.88 -1.72 -1.35 -2.49 -1.06 0.39 1.37 0.78 1.05 0.99 0.89 0.47 0.56 -0.97 0.18 -0.09 0.62 -1.03 -0.22 -0.23 -0.72 -0.59 -0.72 -0.85 -0.33 -1.02 -0.68 -0.18 -1.41 -0.78 0.77 0.73 -0.35 -0.67 -0.54 -0.09 -1.02 -0.58
0.4 1.03 1.69 1.06 0.06 0.03 -0.58 -0.71 0.9 -1.37 -2.36 -1.96 -0.94 -0.82 -1.05 1.14 1.45 1.34 0.55 0.59 0.39 -0.05 2.12 0.73 -1.19 0.34 -1.5 -0.92 -1.33 -0.44 -1.43 -1.66 -1.3 -1.16 -1.17 -1.46 -1.42 -0.38 -0.89 -0.69 -1.05 -0.64 -0.56 -0.84 -0.86 -0.41 -1.34 -0.9
0.48 1.1 1.48 0.08 -1.21 -1.0 -1.29 -1.36 0.46 -1.22 -1.83 -1.95 -0.59 -0.09 -1.04 0.65 0.91 1.02 0.72 0.74 0.37 0.38 2.89 -1.28 -0.83 -0.8 -0.97 -0.63 -0.39 -0.52 -1.03 -0.9 -0.84 -0.68 -0.96 -1.07 -0.96 -0.41 -0.59 -0.34 -0.62 -0.31 -0.16 -0.45 -0.5 -0.47 -0.81 -0.98
0.02 0.49 0.75 -1.26 -1.76 -0.13 -0.62 -0.56 0.14 -0.31 -0.46 -0.43 -0.02 -0.09 -0.35 0.34 1.08 0.48 0.53 0.63 0.37 0.0 1.33 -1.34 -0.7 -0.76 -0.63 -0.23 -0.54 -0.15 -0.54 -0.02 -0.07 -0.02 0.23 -0.51 -0.26 0.07 0.23 0.16 -0.18 0.08 0.16 0.1 0.19 -0.0 -0.19 -0.36
0.92 1.14 1.09 -1.41 -0.68 -0.92 -1.49 -1.48 0.68 -0.99 -1.37 -1.44 -0.3 0.09 -0.89 0.98 1.36 0.74 0.74 0.65 0.19 0.1 1.74 -0.22 -0.75 0.01 -0.61 -0.62 -0.3 -0.2 -0.75 -0.95 -0.66 -0.58 -0.79 -1.16 -0.83 -0.2 -0.25 0.06 -0.07 0.05 0.15 -0.11 -0.21 -0.15 -0.73 -0.59
0.15 0.54 1.13 -2.36 -0.47 -1.07 -0.87 -1.1 0.51 -0.59 -1.86 -1.48 -0.24 -0.13 -0.03 0.5 1.71 0.38 1.15 0.85 0.91 0.82 1.46 -0.96 -0.63 0.02 -1.57 -0.78 -1.21 -0.09 -0.98 -0.6 -0.42 -0.29 -1.4 -1.05 -0.85 -0.34 -0.23 0.08 0.22 -0.02 0.14 -0.21 0.18 -0.36 -0.79 0.07
0.03 -0.2 -0.11 -0.84 -0.59 -0.06 0.85 0.34 -1.06 0.05 -1.44 -1.39 -0.62 -0.86 -0.39 -0.8 0.12 -0.33 0.96 1.03 1.09 0.65 1.53 -0.02 0.52 -1.31 -0.05 0.13 -0.96 0.02 -0.02 -0.18 0.07 0.05 -0.61 0.06 -0.37 0.04 -0.62 -0.02 -0.35 -0.18 -0.05 -0.14 -0.36 0.06 0.13 -0.48
0.37 0.72 1.62 -0.19 -1.45 -0.98 -1.74 -1.77 0.65 -0.58 -1.99 -1.84 -0.33 0.15 -0.66 0.24 1.3 0.64 0.92 0.95 0.67 0.28 2.45 -0.79 -0.81 -0.76 -0.98 -0.63 -1.25 -0.38 -0.94 -1.06 -0.62 -0.61 -1.98 -1.03 -0.89 -0.16 -0.63 0.02 -0.25 0.2 0.16 -0.24 -0.3 -0.28 -0.77 -0.6
0.82 0.12 0.5 -1.13 -2.77 -1.48 -2.42 -2.37 0.2 -0.64 -1.52 -1.31 0.08 0.59 -0.67 0.37 0.95 0.68 0.45 0.86 0.28 0.28 1.49 -0.11 -0.3 -0.11 -0.33 -0.51 -0.33 -0.22 -0.5 -0.98 -0.41 -0.27 -0.56 -0.77 -0.65 0.24 0.03 0.49 0.6 0.87 0.37 0.07 -0.06 0.25 -0.46 -0.44
-0.18 0.74 1.01 1.58 1.21 1.11 0.31 0.73 0.32 -0.77 -2.15 -2.07 -0.21 -0.0 -0.37 0.26 1.3 0.18 0.37 0.78 0.38 -0.26 1.25 -0.74 -0.53 0.33 -0.46 -0.84 -1.41 -0.77 -0.85 -1.15 -0.96 -0.91 -2.41 -1.48 -0.61 -0.32 -0.68 -0.38 -0.48 -0.57 -0.21 -0.58 -0.48 -0.18 -1.05 -0.82
0.35 1.08 1.97 -0.84 -2.4 -0.33 -1.02 -0.86 0.83 -1.3 -3.54 -3.64 -1.7 -2.31 -1.51 0.25 1.76 0.99 1.68 1.43 1.19 0.73 2.03 0.01 -0.71 -0.81 -1.08 -0.43 -2.02 -0.1 -1.36 -1.37 -0.81 -0.41 -1.17 -1.01 -1.56 -0.2 -1.43 -0.62 -1.63 -1.25 -0.6 -0.83 -1.06 -0.13 -0.67 -0.85
-0.23 0.44 1.38 -0.58 -1.25 -0.87 -1.25 -1.58 -0.13 -0.42 -0.66 -0.91 0.04 -0.38 -0.51 0.04 1.15 0.71 1.07 0.7 0.79 0.58 1.47 0.13 -0.22 0.01 -0.53 -0.37 -0.16 -0.0 -0.59 -0.32 -0.24 0.16 -0.32 -0.53 -0.69 0.0 -0.58 -0.17 -0.81 -0.65 -0.2 -0.3 -0.47 0.1 -0.16 -0.22
-0.06 0.81 1.5 -1.41 -1.72 0.16 -0.57 -0.57 0.17 -0.86 -1.57 -1.69 -0.43 -0.48 -0.95 0.59 1.0 0.52 0.99 0.66 0.47 0.39 2.38 -0.94 -0.75 -0.88 -1.26 -0.15 -0.24 -0.04 -0.42 -0.52 -0.41 -0.12 -0.49 -0.64 -0.49 -0.34 -0.34 -0.22 -1.18 -0.64 -0.11 -0.12 -0.3 -0.28 -0.1 -0.52
0.11 0.68 1.02 0.4 -0.2 -0.39 -0.75 -1.17 -0.07 -1.16 -1.56 -1.38 -0.86 0.03 0.23 0.34 1.19 0.42 1.01 1.12 0.83 0.55 2.33 -0.85 -0.63 -0.31 -0.47 -0.57 -1.63 0.06 -1.45 -1.02 -0.75 -0.8 -1.1 -1.19 -1.44 -0.48 -0.36 -0.29 0.16 -0.11 -0.12 -0.7 -0.51 -0.47 -1.23 0.37
0.5 0.57 0.49 -0.0 -0.06 -0.39 -0.35 -0.53 -0.14 -0.34 -1.51 -1.21 -0.81 -0.2 -0.34 0.91 0.95 0.47 0.63 0.83 0.76 0.79 0.53 -0.6 -0.08 -0.78 -0.94 -0.57 -0.22 0.01 -0.72 -1.27 -0.28 -0.16 0.19 -1.22 -0.93 0.15 -0.65 0.08 0.54 0.8 0.2 -0.32 -0.22 0.15 -0.56 -0.48
-1.19 0.64 1.18 0.61 0.64 -0.47 0.07 0.08 -0.25 -0.53 -0.3 -0.2 -1.03 -1.84 -0.37 -0.15 1.37 0.39 1.17 0.91 0.78 0.33 1.3 -0.73 -0.23 -0.63 -0.18 -0.01 -0.88 0.02 -0.76 0.04 -0.41 -0.14 -0.72 -0.27 -0.68 -0.11 -1.22 -0.57 -1.47 -1.33 -0.64 -0.19 -0.55 -0.05 -0.07 -0.14
-0.05 0.2 1.24 -1.01 -0.82 -0.31 -0.67 -0.51 -0.19 -0.12 -0.97 -0.99 0.23 0.25 -0.41 -0.32 0.4 0.41 1.05 1.03 1.15 0.83 1.51 -0.54 0.23 -0.63 -0.89 -0.09 -1.08 -0.41 -0.3 -0.16 -0.29 -0.27 -0.41 -0.27 -0.49 0.1 -0.37 -0.35 -0.47 -0.24 -0.26 -0.46 -0.54 0.11 -0.28 -0.41
0.54 1.22 2.03 -0.03 -0.74 -0.38 -0.87 -0.86 0.9 -1.16 -2.0 -2.11 -0.97 -0.81 -1.09 0.4 1.47 0.84 0.93 0.74 0.4 0.53 2.41 0.79 -1.0 -0.72 -1.37 -0.77 -1.84 -0.65 -1.35 -1.17 -0.77 -0.75 -1.06 -1.19 -1.21 -0.77 -0.96 -0.65 -0.89 -0.78 -0.39 -0.72 -0.52 -0.8 -0.76 -0.62
0.19 0.76 1.47 0.89 -1.62 -1.15 -0.87 -0.84 0.54 -0.96 -3.24 -2.98 -0.4 -0.16 -0.78 0.21 1.75 0.84 0.81 0.88 0.4 0.37 1.76 -0.03 -0.7 -0.39 -1.24 -0.41 -1.28 -0.3 -1.05 -0.89 -0.58 -0.3 -1.45 -0.68 -0.64 -0.13 -0.23 -0.1 -0.54 -0.32 -0.05 -0.09 -0.03 -0.13 -0.53 -0.45
0.27 0.77 1.06 0.46 -1.17 0.06 -0.54 -0.65 0.14 -0.97 -1.5 -1.35 -0.25 0.32 -0.92 0.41 0.46 0.62 1.02 0.76 0.62 0.69 2.19 0.76 -0.22 0.06 -0.39 -0.96 -1.41 -0.5 -0.91 -0.79 -0.77 -0.76 -1.11 -2.05 -0.86 -0.73 -0.35 -0.17 0.17 0.09 -0.04 -0.64 -0.95 -0.66 -0.56 -0.4
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0.74 1.11 0.95 -1.25 -0.7 -0.17 -0.31 -0.02 1.14 -0.4 -0.57 -0.5 -0.36 -0.36 -0.46 0.61 1.0 0.5 0.48 0.31 0.44 -0.03 1.74 -0.8 -0.25 0.47 -0.76 -0.42 -1.44 -0.4 -0.88 -0.69 -0.15 -0.23 -0.94 -0.64 -0.61 -0.4 -0.44 -0.23 -0.57 -0.21 -0.19 -0.16 -0.17 -0.43 -0.39 -0.76
0.76 0.62 1.34 -0.16 -0.04 -0.83 -0.63 -0.72 0.26 -0.77 -1.86 -1.67 -0.43 -0.36 -0.38 0.12 0.92 0.53 0.88 0.85 0.59 0.37 1.8 0.07 -0.94 -0.56 -1.42 -0.25 -0.58 0.15 -0.7 -0.72 -0.39 -0.18 -0.73 -0.79 -0.79 0.0 -0.38 -0.06 -0.77 -0.39 -0.02 -0.09 -0.15 0.11 -0.28 -0.2
-0.06 0.39 1.15 -0.07 -0.72 -0.27 -0.41 -0.28 -0.25 -0.16 -0.72 -0.59 -0.41 -0.92 -0.17 -0.09 1.03 0.33 1.01 0.89 0.6 0.53 1.38 -0.0 -0.28 -0.33 -0.56 -0.19 -0.44 0.01 -0.35 -0.22 -0.14 -0.16 -0.71 -0.28 -0.45 -0.19 -0.85 -0.39 -0.44 -0.34 -0.19 -0.31 -0.43 -0.08 -0.11 0.2
0.18 0.74 0.95 0.25 -1.96 -0.58 0.28 0.09 0.54 -0.22 -1.71 -1.51 0.05 0.32 -0.59 0.56 0.5 0.74 0.43 0.5 0.51 0.48 1.55 -0.1 -0.39 -0.36 -0.67 -0.91 -0.3 -0.2 -0.49 -0.73 -0.37 -0.27 -0.35 -0.96 -0.59 0.07 -0.99 -0.14 0.19 0.42 -0.18 -0.43 -0.51 0.08 -0.69 -0.48
0.82 0.84 1.45 0.27 -0.78 -0.96 -1.51 -1.43 0.65 -1.09 -2.17 -2.02 -0.72 -0.57 -0.8 0.25 0.66 -0.1 0.92 0.86 0.46 0.2 2.81 -0.94 -1.17 -1.05 -1.79 -0.71 -0.37 -0.1 -0.86 -0.99 -0.75 -0.5 -0.5 -1.11 -0.83 -0.2 -0.36 0.01 -0.54 -0.25 0.1 -0.28 -0.34 -0.1 -0.65 -0.34
0.68 0.93 0.86 0.62 -0.03 -0.78 -1.4 -1.45 0.54 -1.32 -2.0 -2.29 -0.94 -0.52 -1.05 0.43 0.48 0.8 1.21 0.73 0.5 0.46 2.78 -0.31 -1.15 -1.7 -1.78 -0.32 -0.19 -0.4 -0.81 -0.81 -0.58 -0.53 -0.65 -1.16 -0.72 -0.49 -0.49 -0.16 -0.79 -0.34 -0.1 -0.44 -0.26 -0.44 -0.73 -0.49
0.19 0.19 1.18 -1.65 -0.23 0.52 0.77 0.92 -0.49 -0.32 0.63 0.26 -0.69 -1.09 -0.74 0.06 0.94 0.31 0.65 0.72 0.37 0.2 1.33 -0.89 -0.01 -0.8 -0.07 -0.36 -1.45 -0.65 -0.73 0.41 -0.28 -0.2 -0.41 -0.31 -0.72 -0.65 -0.65 -0.28 -0.43 -0.57 -0.16 -0.49 -0.31 -0.54 -0.14 -0.4
0.7 0.8 1.53 -1.09 -2.31 -1.24 -1.79 -1.99 0.6 -0.83 -1.64 -1.4 -0.61 0.1 -1.34 -0.16 1.45 0.42 0.43 -0.08 -0.05 -0.27 2.55 -1.04 -1.21 -0.73 -1.16 0.25 -0.16 0.22 -0.67 -0.9 -0.26 -0.13 -0.2 -0.64 -0.59 -0.03 0.03 -0.01 -0.25 -0.26 0.08 -0.31 -0.2 -0.01 -0.5 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.