Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_13120V3.1	-	5.36	-1.32	1.6	-2.54	-	-	-1.1	-	-	-	-	-	-	-	-	1.13	-2.14	-	-	-	-	-	-	-	-0.94	-	-	-	-5.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_14610V3.1	-	5.1	-2.88	-2.34	-1.27	-	-	-	1.77	-	-	-	-	-	-	-	0.7	2.2	-	-1.05	-	-	-	-	-	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.61	-	-1.8	-	-	-1.69	-	-	-2.09	-3.83
Pp3c12_12280V3.1	-	5.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.93	-	-	-	2.03	-2.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_3030V3.1	2.57	5.13	-1.34	-1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-6.13	1.85	-0.21	-	-	-	-	-	-	-1.75	-	0.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_1200V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_18176V3.1	-	5.17	1.28	0.02	-0.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.17	-	-	-	-	-	-	0.29	-	2.22	-0.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_18180V3.1	-	5.42	-	0.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.67	-	-	-	-	-	-	1.45	-0.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_2470V3.1	1.43	4.98	0.46	0.77	-0.78	-	-1.02	-	-0.38	-	-	-	-	-	-0.98	1.03	0.98	-0.86	-	-	-	-1.15	-	-	-	1.56	-	-	-	-2.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.74
Pp3c13_2490V3.1	-0.34	5.18	-1.01	-3.92	-2.54	-	-	-	-0.23	-	-	-	-	-	-2.65	1.77	-0.11	-1.7	-1.87	-1.24	-	-1.41	-	-	-	1.85	-	-	-	-5.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_7010V3.1	-	4.76	1.98	2.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.51	-0.63	-	-	-	-	-	-	-	2.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c14_8880V3.1	-	5.44	-	-1.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	0.23	-1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13715V3.1	-	5.08	-0.27	-0.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.81	0.26	1.61	-	-	-	-	-	-0.29	-2.42	1.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13980V3.1	-	5.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-	-	-	-	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_13990V3.1	-	5.51	-	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c15_23350V3.1	-	5.06	-0.66	0.58	-2.65	-	-	-	-2.46	-0.95	-1.06	-	-1.09	-0.85	-0.47	-	1.48	-0.71	-	-	-	-	-	-2.1	-2.38	0.8	-2.95	-	-1.26	-1.92	-	-1.77	-2.16	-	-1.1	-1.03	-	-1.38	-	-2.17	-	-	-	-	-	-0.24	-	-4.27
Pp3c16_15210V3.1	-	5.31	-0.0	0.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.8	0.22	1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.01	-	-	-	-	-
Pp3c16_24400V3.1	-	5.03	-	-	-1.0	1.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.01	0.23	-0.01	-	-	-	-	-	-	-	2.34	-	-	-	-4.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_6000V3.1	-0.43	4.97	1.19	-1.86	-	-	-	-	-0.76	-	-	-	-	-	-4.1	2.4	1.18	-2.12	-	-	-	-	-	-1.55	-	2.17	-	-	-	-4.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_22840V3.1	-	5.51	-	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_19460V3.1	-	5.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.31	-0.15	-	-	-	-	-	-	-	1.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_10470V3.1	-	5.28	-0.26	-	-1.07	-	-1.13	-	-	-	-2.34	-	-	-	-4.57	-	-0.16	0.54	-	-	-	-	-	-	-2.72	1.62	-	-	-1.76	-3.35	-	-	-2.66	-2.39	-	-	-	-1.81	-	-	-	-	-	-1.72	-2.25	-	-	-
Pp3c19_16570V3.1	-	5.42	-	-0.41	-2.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.26	-	0.29	-1.83	-	-	-	-	-	-	-	1.3	-	-	-1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_2690V3.1	-	5.42	-	-0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_8720V3.1	-	4.67	-	3.07	-0.07	-	-	-	-	-	-1.14	-	-	-	-6.16	2.62	1.99	-0.65	-	-	-	-	-	-	-	0.62	-	-	-	-3.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.86	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_16650V3.1	-	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_19620V3.1	-	5.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.76	-	-	-	-	-	-	-	-	1.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_21320V3.1	-	5.2	1.58	-	-1.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.57	-	-	-	-	-	-	0.1	-0.73	1.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_26670V3.1	-	5.27	-	-0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.8	-	1.67	1.95	-	-	-	-	-	-	-	0.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_15890V3.1	-	4.92	-0.99	-	1.83	-	-	-	1.3	-	-	-	-	-	-5.4	1.32	2.48	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c20_19970V3.1	-	5.36	0.67	-	-	-	0.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.75	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	-	-	-	-4.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_2300V3.1	-	5.46	-0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.59	-	-	-	-	-	-	-	-	0.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_12620V3.1	-	5.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c23_12590V3.1	-	4.61	-	3.2	-0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.03	0.44	-	-	-	-	-	-	-	2.93	-	1.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_8200V3.1	-	5.43	-	-	-	-	-	0.68	1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_17430V3.1	-	5.19	2.28	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_24660V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_29360V3.1	-	5.44	-2.62	0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.96	-3.88	-	-	-	-	-	-	-	0.5	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_3020V3.1	-	5.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_34760V3.1	-	5.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_4080V3.1	-	5.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.18	-	-	-	-	-0.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_16180V3.1	-	5.5	-	0.13	-1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.71	-0.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_21800V3.1	-	5.31	-	1.57	-	-	-	-	-	-	-	-1.12	-	-	-4.42	-1.69	0.95	-3.0	-	-	-	-	-	-	-	1.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.04
Pp3c3_27080V3.1	-	5.25	1.0	-	-	-	-	-	-	-0.24	-	-	-	-	-	-	1.59	0.01	-	-	-	-	-	-	-	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_29570V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_29580V3.1	-	5.51	1.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_360V3.1	-	5.32	2.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_12431V3.1	-	5.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_4590V3.1	-	5.22	-	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	-	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_12460V3.1	-0.93	5.0	-	0.01	-4.67	-1.71	-	-1.37	2.62	-	-	-	-3.22	-3.1	-3.66	1.98	-0.02	-1.27	-	-	-	-	-	-	-	0.97	-	-	-	-4.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_29860V3.1	-	5.09	2.1	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.69	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_3210V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_790V3.1	-	5.45	-	-0.1	-2.18	-	-	-	-1.17	-	-	-	-	-	-5.79	-0.58	-0.95	-3.98	-	-	-	-	-	-	-	0.42	-	-	-	-7.2	-	-4.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_21890V3.1	-	5.15	-0.67	-0.39	-	-	-1.46	-	0.48	-	-	-3.63	-	-	-6.46	-	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.91
Pp3c7_25870V3.1	-	5.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-	-	-	0.1	2.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c8_16690V3.1	-	5.22	0.02	-1.16	-1.67	-1.03	-0.71	-	0.42	-	-	-	-	-	-6.01	-	-0.54	-0.41	-	-	-	-	-	-	-	1.42	-	-	-	-2.42	-2.49	-2.18	-	-	-0.72	-2.02	-	-2.01	-	-	-	-	-	-2.29	-	-0.75	-	-
Pp3c8_17820V3.1	-	5.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_12710V3.1	-	5.05	0.81	-2.34	-2.73	-	-	-	0.66	-	-	-	-	-	-5.36	-	2.01	-2.54	-	-	-	-	-	-0.66	-	2.65	-	-	-	-6.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_16320V3.1	-	5.36	-	2.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s50_40V3.1	-	5.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.96	1.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s677_30V3.1	0.52	4.39	2.24	2.65	-	-	-	-	2.08	-	-	-	-	-	-5.15	-0.91	2.28	-0.4	-	-	-	-	-	-	-	2.06	-	-	-	-6.22	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3s691_10V3.1	-	5.46	-	-	-1.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-22.67	-	-	-	-	-	-	-17.16	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.