Heatmap: Cluster_190 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_11560V3.1	-	-	3.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	2.72	-2.04	-	-	-	-	-	0.82	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_1270V3.1	-	-	3.55	2.76	0.36	-	-	2.16	-	-1.32	-	-	-	-	-	-	2.5	0.75	-	-	-	-	-	2.19	0.69	2.14	-	-	-	-2.32	-1.0	-	-	-	-	1.31	-	-0.26	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-1.95
Pp3c11_14110V3.1	-	-	3.63	4.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c11_16242V3.1	-	0.13	3.59	1.7	-	-	-	-	0.75	-	-	-	-	-	-3.14	2.81	3.72	0.28	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-3.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_14150V3.1	-	2.56	3.23	1.33	-1.82	-	-	-	1.75	-	-	-	-	-	-	-	3.68	0.18	0.6	2.14	-	-	-	-0.71	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-2.75
Pp3c12_17300V3.1	-	-	3.2	4.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c12_18430V3.1	-	-	4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.15	-	3.84	-	-	-	-	-	-	-	-	3.84	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_10V3.1	-	-	3.96	3.14	1.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.49	-	3.27	-	-	-	-	1.18	2.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_14680V3.1	-0.98	2.56	2.95	1.39	-3.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-4.94	2.88	3.22	-0.34	-	-	-	-	-	-0.21	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c13_20110V3.1	-	-	3.63	4.06	4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c16_11240V3.1	-	-	2.08	2.99	-	-	-	-	3.57	-	-	-	-	1.37	-0.28	-	-	-	-	1.64	-	-	-	3.02	-	-	-	-	0.08	-1.77	-	2.3	-	-	0.32	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.61
Pp3c16_6030V3.1	-	3.44	2.75	2.45	1.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.41	2.44	-	-	-	-	-	1.6	-	3.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c17_12110V3.1	-	1.58	3.77	0.96	-	-	-	-	1.34	-	-	-	-	-	-4.13	-	3.54	0.7	-	2.03	-	-	-	1.88	-	2.38	-	-	-	-3.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.97
Pp3c17_9260V3.1	-4.96	2.54	3.19	3.19	0.68	1.56	2.18	1.27	-3.93	-1.89	-5.03	-	-0.46	-2.32	-1.1	-0.26	-1.22	-0.07	-	-	-2.45	-0.1	-0.82	0.58	-1.78	-1.76	-	-1.71	-2.27	-3.29	-2.27	-5.13	-1.84	-1.84	-2.08	-1.93	-0.74	-1.3	-	-1.82	-	-3.83	-2.58	-2.09	-1.1	-1.16	-4.93	-3.91
Pp3c18_16500V3.1	-	-0.8	3.54	1.36	-	-	-	-	2.39	-	-	-	-	-	-5.28	0.53	3.39	0.02	3.04	-	-	-1.08	-	-1.09	-	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c18_17580V3.1	-	3.48	2.93	0.91	-	-	0.4	-	-	-0.54	1.78	2.07	-	-	-0.15	-	3.17	-	-	-	-	-	-	-	-	2.88	-	-	-	-1.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_20V3.1	2.06	-	3.22	1.71	-1.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.75	3.8	0.56	-	1.79	-	-	-	-	-1.62	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_21250V3.1	-	-	3.65	0.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.98	2.79	2.83	-	-	-	-	-	-	2.65	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_23040V3.1	-	3.46	3.27	0.3	-	-	-	-	0.82	-	-	-	-	-	-3.55	3.46	2.48	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_272V3.1	-	-	3.44	3.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.33	1.45	-	-	-	-	-	-	-	3.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c19_9050V3.1	-	-	3.84	2.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.78	-	3.38	-	-	1.41	-	0.97	-	-	-	3.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_19690V3.1	-	-	4.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c1_25060V3.1	-	-	4.66	4.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_1140V3.1	-	-	4.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.35	-	1.55	-	-	-	-	-	-	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_14390V3.1	-	3.88	1.55	1.98	0.15	-	-	-	1.03	-	-	-	-	-	-2.87	-	3.39	-	-	-	-	-	-	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_16230V3.1	-	-	3.6	2.14	-	-	-	-	1.27	-	-	-	-	-	-2.69	-	3.85	1.8	-	-	-	-	-	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_30V3.1	-	-	3.06	3.43	0.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.24	3.39	0.58	-	2.1	-	-	-	-	-	2.12	0.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c21_7340V3.1	-	-0.48	3.64	1.44	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	-	-6.09	2.07	2.92	-3.17	1.7	0.82	-	0.12	-	0.09	-	2.37	-	-	-1.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c22_7110V3.1	-	2.68	2.46	2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.42	1.92	3.74	0.01	-	-	-	-	-	-	-	3.55	-	-	-	-3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c25_13380V3.1	-	-	3.57	-	-	2.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.78	-	-	-	-	-	-	-	1.46	1.85	-	2.11	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_10310V3.1	-	2.65	2.68	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.77	-	3.99	-	-	-	-	-	-	0.88	-	3.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_10350V3.1	-	-	3.37	2.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.18	1.96	-	2.2	-	-	-	1.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_15710V3.1	-	0.83	3.37	1.25	-	-	-	-1.95	-	-	-	-	-	-	-3.21	2.99	3.83	-	-	2.58	-	-	-	0.85	-	1.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c26_15720V3.1	-	0.83	3.37	1.25	-	-	-	-1.95	-	-	-	-	-	-	-3.21	2.99	3.83	-	-	2.58	-	-	-	0.85	-	1.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c27_1601V3.1	-	3.45	3.76	2.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	-	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c27_5850V3.1	-	3.73	3.87	-	-	-	1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.2	-	-	-	-	-	-	2.5	-	0.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_13130V3.1	-	2.77	3.53	2.93	0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_25910V3.1	-	-	2.75	4.24	0.75	2.53	3.35	2.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_28930V3.1	-	3.59	2.72	-	-	-	-	-	0.36	-	-	-	-	-	-3.99	-	3.62	-	-	-	-	-	-	-	-	3.88	-	-	-0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c2_29220V3.1	0.54	2.71	2.38	-0.03	-0.79	-0.35	-0.26	0.02	1.67	-1.34	-0.67	-	-2.84	-	-1.18	0.47	2.37	0.45	-	-3.26	-1.38	-2.19	-0.29	2.47	0.01	1.81	-1.55	-3.25	-2.35	-1.13	-1.62	-0.8	-1.78	-1.08	-3.73	-1.07	-0.82	-1.23	-2.58	-2.62	-	-	-2.25	-3.8	-2.18	-1.09	-2.17	-1.14
Pp3c2_38360V3.1	-	-	3.68	3.92	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_31930V3.1	-	-	3.91	2.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-1.08	-	4.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c3_3490V3.1	-2.45	0.44	3.57	3.45	1.65	1.46	2.64	2.17	-	-0.42	-	-	-1.63	0.39	0.05	-2.96	-2.66	-2.03	-7.2	-2.74	-1.13	-5.49	-4.08	-	-3.77	-2.91	-4.14	-4.39	-4.67	-3.1	-4.16	-	-3.49	-5.67	-	-4.31	-5.35	-2.48	-3.26	-1.16	-1.18	-3.05	-2.83	-3.27	-4.86	-4.37	-	-6.31
Pp3c3_35120V3.1	-	2.77	3.35	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.36	-	-	-	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c4_24780V3.1	-	3.39	2.99	-	-0.56	-	-	-	-	-	0.55	-	-	-	-3.95	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	2.73	-	0.69	0.36	-1.6	-	-	-0.13	-	0.24	-	-	0.6	-	-	1.92	-	0.41	-	-	-	-	0.09
Pp3c5_10090V3.1	-	-	1.83	3.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.04	3.43	-	-	-	-1.52	-	2.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.59	-	3.04	-	-	-	-
Pp3c5_14180V3.1	-	-	3.34	1.6	-	-	-	-	1.83	-	-	-	-	-	-	3.56	3.56	-	-	-	-	-	-	-	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c5_29008V3.1	-	-	3.37	2.66	-0.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.79	2.81	1.27	-	3.3	-	-	-	1.11	-	2.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c6_15700V3.1	-	2.6	3.68	1.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.51	1.19	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-1.89	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c7_6781V3.1	-	-	-	3.88	4.62	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.05	-	2.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_12680V3.1	-	2.78	3.6	-0.14	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-	3.9	2.45	-0.71	-	-	-	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_17820V3.1	-	-	3.74	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Pp3c9_9480V3.1	2.38	-	3.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.52	-	-	-	-	-	-	-	-	3.48	-	-	-	0.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.73	-	-	-	-	-	-
Pp3s142_3V3.1	-	-	3.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.