Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-2.04 -1.45 -0.99 -0.81 -0.11 1.07 1.25 1.01 -0.92 0.82 0.14 -0.38 0.77 -0.35 0.5 -1.85 -1.23 -1.45 0.87 0.85 0.12 -0.13 -3.63 -3.6 0.46 -1.04 0.79 0.0 -1.11 -0.08 0.39 1.25 -0.03 -0.43 -0.49 -0.55 0.54 0.85 -1.61 -0.48 -0.55 -0.59 -0.6 -0.67 -0.26 0.8 -0.49 -0.08
-1.41 -0.84 0.48 -1.32 1.49 0.83 0.42 0.24 -0.6 0.53 -0.59 -0.76 0.57 0.41 -0.01 -0.41 -0.06 -0.46 -0.2 0.29 0.02 0.27 -1.72 -1.07 0.1 -0.07 -0.52 -0.26 -0.19 -0.05 0.17 0.11 0.37 0.08 -0.82 -0.27 0.54 0.21 -0.4 -0.16 -0.08 -0.12 -0.02 -0.12 0.01 0.23 0.06 -0.2
-0.89 -0.64 0.06 -2.17 1.42 1.57 0.87 0.93 -2.82 0.23 -2.43 -1.99 -0.15 -0.9 0.03 -2.73 -0.5 -1.32 0.36 0.72 0.76 0.03 -0.02 -2.44 0.43 -0.82 0.55 0.0 -1.5 -0.14 0.14 0.16 0.22 -0.03 -1.88 0.09 0.49 0.63 -0.87 0.05 0.05 -0.32 0.05 0.02 -0.32 0.66 -0.52 0.09
-0.3 -1.07 -0.43 -2.56 1.79 0.77 0.88 0.61 -0.66 0.43 0.3 0.36 -0.02 -0.04 0.16 0.15 -0.56 -0.75 0.37 0.71 0.96 0.61 -1.32 -0.7 0.85 -0.24 0.68 -0.62 -0.8 -0.6 -0.17 -0.07 -0.18 -0.53 -1.17 -1.42 -0.29 0.1 -1.32 -0.18 -1.11 -0.79 0.16 -0.1 -0.36 0.08 -0.09 -1.04
-0.58 -0.81 0.18 -0.22 1.69 1.2 0.81 0.86 -0.56 0.33 -1.24 -1.3 0.31 -0.99 0.14 -0.24 -0.63 -0.63 -0.3 0.1 0.63 0.32 -1.79 -1.09 0.5 -0.66 0.38 -0.27 -0.09 -0.47 0.07 0.07 0.14 -0.07 -0.68 -0.05 0.51 0.01 -0.82 -0.26 -0.1 -0.36 0.03 -0.06 -0.15 -0.02 -0.34 -0.54
-0.76 -0.58 -0.29 -1.79 1.44 0.22 -0.07 -0.13 -0.34 0.32 0.24 0.21 0.23 -0.55 0.29 -0.67 0.17 0.07 0.16 0.34 0.43 0.4 -0.82 -0.78 0.32 0.07 0.19 0.04 -0.48 -0.21 0.14 0.59 0.11 -0.31 -0.9 -0.07 0.32 0.18 -0.84 0.01 -0.3 -0.32 0.19 -0.02 -0.13 0.18 -0.21 -0.32
-1.52 -0.46 0.12 -1.94 2.02 0.48 0.81 0.64 -0.3 0.25 -0.68 -0.7 0.53 0.45 0.02 0.84 -0.28 -0.06 0.08 0.3 0.01 0.54 -1.64 0.09 0.71 0.1 0.27 -0.69 -0.77 -0.66 -0.22 -0.47 -0.42 -0.44 -1.04 -0.8 -0.18 0.24 -0.75 -0.25 0.1 -0.13 0.07 -0.67 -0.55 0.12 -0.84 -0.57
-0.62 -0.7 -0.37 -1.38 0.49 1.53 1.49 1.61 -0.26 0.62 -0.32 -0.29 1.01 0.69 0.38 -1.0 -0.55 -0.23 -0.57 -0.25 -0.92 -0.79 -0.71 -0.38 0.41 0.27 0.46 -0.13 -0.7 -0.29 -0.13 0.06 -0.53 -0.8 -1.73 -0.71 0.07 0.19 -1.4 -0.21 0.07 0.01 -0.27 -0.94 -0.59 0.03 -1.05 0.07
-0.74 -1.21 -0.24 -0.03 1.62 0.53 0.93 0.83 -0.67 0.17 -0.02 -0.17 -0.14 -1.63 -0.13 -1.14 -0.74 -0.59 -0.52 -0.21 0.01 -0.03 -1.17 -1.83 0.44 -0.67 0.54 0.21 0.47 -0.14 0.36 0.25 0.28 0.27 0.11 0.31 0.44 -0.06 -0.66 -0.04 -0.53 -0.51 0.05 0.07 -0.47 -0.07 0.33 -0.38
-1.17 -0.33 -0.99 -2.98 1.22 1.12 0.77 1.01 -0.97 0.34 -0.11 0.05 0.64 0.21 0.34 -1.0 -0.32 -1.45 -0.1 0.28 0.39 -0.44 0.39 -1.16 0.17 -0.63 0.71 -0.42 -0.29 -0.24 0.1 -0.3 -0.23 -0.45 -0.99 -0.64 0.16 -0.05 -0.79 0.05 0.49 0.24 0.22 -0.04 -0.21 -0.02 -0.29 0.05
-1.04 -0.95 0.58 -2.29 2.01 -0.29 -0.31 -0.16 -0.33 0.04 -1.53 -1.77 -0.01 0.24 0.02 -1.55 -0.47 -1.1 0.69 0.73 0.86 0.38 -0.41 -1.06 0.07 -1.51 0.2 -0.01 -0.15 -0.23 -0.21 -0.56 0.4 0.23 -1.54 -0.32 0.12 0.02 -0.25 0.64 0.23 0.03 0.65 0.31 0.31 0.1 -0.18 -0.35
-1.92 -1.25 -0.69 -1.76 1.77 0.24 0.5 0.41 -1.25 0.28 -0.38 -0.49 0.44 0.16 0.2 -1.28 -0.77 -0.64 -0.21 0.47 0.51 0.26 -0.76 -0.63 0.62 -0.9 0.69 -0.17 -0.01 -0.3 -0.11 0.01 -0.06 -0.07 -0.45 -0.1 0.4 0.06 -0.49 0.13 0.46 0.3 0.33 0.13 -0.08 0.03 -0.27 -0.36
-0.87 -0.69 0.16 -1.02 1.57 0.73 0.64 0.48 -0.26 0.28 -1.06 -1.14 0.63 -0.25 0.07 -0.98 -0.49 0.2 0.08 0.47 0.31 0.08 -0.57 -1.45 0.55 -0.26 0.69 0.21 -0.32 -0.34 0.39 -0.05 0.03 -0.09 -0.53 -0.12 0.66 0.18 -0.81 -0.38 -0.37 -0.55 -0.22 -0.28 -0.5 0.09 -0.29 -0.35
-0.78 -0.63 0.4 -1.6 2.0 0.67 0.26 0.36 -1.1 0.42 0.36 0.18 0.25 -0.79 0.16 -1.06 -1.14 -0.68 -0.24 -0.23 -0.06 0.13 -1.5 -2.02 0.72 -0.49 0.85 0.04 0.11 -0.34 0.11 0.01 0.1 0.01 0.13 0.18 0.53 0.05 -0.63 -0.37 -0.65 -0.73 -0.12 -0.08 -0.31 0.03 0.02 -0.43
-0.84 -0.56 0.21 -1.34 1.21 0.03 0.06 -0.0 -1.43 0.27 -0.54 -0.75 0.04 -0.19 -0.02 -0.29 0.48 0.61 0.1 0.73 0.7 0.8 -3.03 0.53 0.36 0.08 -0.38 -0.57 -1.72 -0.33 -0.15 -0.52 0.05 -0.16 -1.89 -0.52 -0.09 -0.11 -0.5 0.37 0.67 0.74 0.47 0.12 -0.14 -0.07 0.02 -0.31
-0.04 -0.33 0.19 -2.54 1.43 0.79 0.2 0.26 -1.06 0.07 -0.12 -0.09 0.03 -0.7 0.09 -0.86 0.21 -0.43 0.8 0.73 0.81 0.38 0.09 -0.29 0.43 -0.74 0.65 -0.02 -0.56 -0.42 -0.07 -0.19 -0.11 -0.21 0.12 -0.23 -0.17 -0.1 -1.19 -0.38 -0.43 -0.57 -0.08 -0.18 -0.4 -0.04 -0.2 -0.14
-0.54 -0.82 -0.37 -1.75 1.56 0.99 0.66 0.85 -0.66 0.47 -0.81 -0.8 0.27 -0.55 0.26 -1.59 -0.07 -0.22 0.09 0.32 0.42 0.36 -2.51 -1.14 0.8 0.01 0.76 0.03 -0.35 -0.25 0.25 0.17 0.02 -0.09 -0.77 -0.13 0.19 0.09 -0.92 -0.42 -0.2 -0.47 -0.1 -0.32 -0.4 0.1 -0.02 -0.11
-1.4 -1.02 -0.45 -1.26 1.65 -0.5 -0.5 -0.34 -1.03 -0.01 -0.56 -0.46 0.19 0.56 0.27 -0.89 -0.45 -1.28 0.48 0.39 0.57 0.46 0.41 -0.88 0.18 -0.35 0.26 -0.19 -0.2 -0.22 -0.2 -0.51 0.23 -0.01 -0.09 -0.06 -0.1 0.04 0.12 0.13 0.53 0.47 0.37 0.07 0.16 0.09 -0.15 0.09
-1.76 -1.88 -1.07 -0.35 1.42 1.49 1.26 1.3 -1.51 0.61 -0.87 -1.24 0.56 -0.31 0.8 -1.81 -1.09 -0.2 -0.5 -0.27 -0.07 0.1 -3.02 -0.16 0.97 -0.04 1.05 -0.66 -0.74 -0.5 -0.15 0.17 -0.2 -0.56 -0.49 -0.53 0.09 -0.19 -1.05 -0.06 0.09 -0.15 0.06 0.3 -0.33 -0.26 -0.22 -0.48
-1.24 -1.29 -0.47 -0.21 2.23 0.66 0.54 0.28 -1.26 -0.05 -0.64 -0.74 -0.11 -0.45 -0.2 -0.67 -0.42 -0.65 -0.11 0.19 0.42 0.1 -1.49 -0.15 0.07 -0.88 0.16 -0.02 -0.11 -0.23 -0.15 -0.1 0.26 0.01 -1.53 -0.11 -0.01 0.02 -0.33 0.36 0.33 0.14 0.42 0.24 0.17 0.09 -0.14 -0.2
-1.19 -1.61 -1.51 0.5 2.34 1.35 1.6 1.26 -1.09 -0.2 -0.07 -0.21 -0.85 -2.64 -0.14 -1.96 -1.8 -1.96 -0.71 -0.64 -0.41 -0.74 -1.38 -0.5 0.23 -1.61 0.82 0.48 -0.55 -0.23 0.27 0.21 0.21 -0.01 0.58 0.96 0.29 -0.59 -0.86 -0.66 -0.96 -1.7 -0.38 -0.11 -0.72 -0.56 0.22 -0.03
-0.95 -1.06 -0.65 -0.53 2.08 1.27 1.03 1.12 -0.81 0.43 -1.33 -1.23 0.26 -0.23 0.43 -2.04 -0.95 -1.03 0.11 0.24 0.24 0.13 -0.29 -0.75 0.6 -0.81 0.6 -0.11 -0.81 -0.38 0.11 -0.14 -0.02 -0.29 -1.12 -0.51 0.33 0.16 -1.15 -0.14 -0.19 -0.74 0.13 -0.17 -0.3 0.14 -0.44 -0.31
-1.69 -0.32 0.48 -2.96 1.54 1.12 0.87 0.89 -0.27 0.16 -0.38 -0.36 -0.13 -1.11 -0.12 -1.28 0.17 -0.28 -0.01 0.6 0.42 -0.17 -0.66 -0.95 0.68 -0.19 0.97 0.1 -0.76 -0.29 0.07 0.04 -0.01 -0.31 -1.34 -0.15 0.41 0.1 -1.18 -0.38 -0.52 -0.74 -0.15 -0.02 -0.27 0.1 -0.45 0.05
-1.21 -0.18 0.3 -1.95 2.02 -0.19 -0.7 -0.36 -0.91 0.16 0.13 -0.06 0.1 -0.46 0.17 -0.34 0.03 -0.5 0.47 0.34 0.53 0.32 -1.22 -1.57 0.02 -0.44 0.33 -0.05 -0.19 -0.08 -0.07 0.02 0.29 0.11 -0.7 -0.21 -0.03 -0.09 -0.41 0.08 0.01 -0.14 0.32 0.11 0.17 -0.07 -0.1 0.13
-1.41 -1.7 -0.94 -0.27 1.77 0.78 1.26 1.39 -0.73 0.23 0.58 0.47 0.08 -0.77 0.22 -1.59 -1.21 -1.63 -0.3 -0.21 -0.23 -0.5 -0.6 -2.21 0.1 -0.69 0.65 -0.18 -0.41 -0.32 0.33 0.03 0.05 -0.15 -0.59 0.16 0.48 -0.06 -0.79 -0.24 0.02 -0.16 -0.1 -0.21 -0.25 -0.17 -0.15 0.4
-0.0 0.77 0.98 -2.64 2.31 0.96 0.28 0.14 -0.76 0.64 -2.09 -2.45 0.66 0.17 0.38 -0.21 0.04 0.01 0.35 0.43 0.78 0.58 -1.04 -1.01 0.3 -0.82 -0.47 -1.12 -2.73 -1.1 -0.58 0.25 -0.12 -0.82 -4.96 -0.92 0.12 0.15 -1.06 -0.29 -0.37 -0.57 0.16 -0.11 -0.21 0.12 -0.66 -0.74
-0.68 -1.0 0.11 -1.74 1.98 0.38 0.09 0.22 -0.44 -0.0 -0.33 -0.43 -0.25 -0.5 0.06 -1.06 -0.91 -1.05 -0.1 0.22 0.44 0.06 -1.4 -0.78 0.52 -1.36 0.21 0.17 -0.34 -0.26 0.2 0.16 0.32 -0.03 -1.2 -0.25 0.23 -0.29 -0.55 0.31 0.61 0.41 0.54 0.43 0.28 -0.31 0.35 -0.27
-1.01 -0.5 0.83 -0.09 1.37 0.75 1.1 1.25 -0.14 0.23 0.37 0.33 0.48 -0.27 0.05 -1.43 -0.55 -0.76 -0.25 -0.02 -0.18 -0.34 -1.29 -0.09 0.57 -0.15 1.11 -0.3 -0.51 -0.55 -0.07 -0.23 -0.34 -0.45 -0.34 -0.5 -0.14 -0.26 -1.11 -0.38 -0.02 -0.38 -0.18 -0.46 -0.62 -0.4 -0.47 -0.24
-1.65 0.15 0.23 -2.75 1.4 1.26 0.93 0.74 -1.67 0.57 -1.93 -2.07 0.09 -0.85 0.17 -2.37 -0.41 -0.87 -0.01 0.66 0.53 0.42 -1.23 -2.18 0.33 -0.83 0.1 0.37 -1.43 -0.19 0.41 0.57 0.23 0.16 -2.13 0.27 0.78 0.32 -0.72 -0.15 -0.42 -0.66 -0.13 0.07 -0.31 0.39 0.31 -0.08
-0.59 -1.05 -0.33 -3.47 1.46 0.76 0.92 0.95 0.14 0.31 -0.1 -0.19 0.48 0.34 0.0 -1.51 -0.36 -0.81 -0.15 0.49 0.3 0.18 -0.42 -1.71 0.76 -0.35 0.31 -0.19 -0.17 -0.41 0.18 0.2 -0.07 -0.45 -0.25 -0.75 0.36 0.03 -1.1 -0.25 0.09 0.05 0.07 -0.44 -0.31 -0.02 -0.5 -0.25
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-1.06 -0.92 -0.52 0.22 1.08 1.16 1.28 1.24 -0.54 0.2 -0.98 -1.13 0.52 0.14 -0.01 -0.87 -0.18 -0.98 0.06 0.19 0.52 0.44 -2.15 -1.46 0.73 -0.37 0.46 -0.95 -0.87 -0.49 -0.18 -0.11 0.15 -0.04 -0.36 -0.07 0.01 -0.31 -0.5 -0.11 0.26 0.11 0.1 0.06 -0.2 -0.34 -0.31 -0.62
-0.56 -0.5 0.32 -1.62 1.69 1.54 1.55 1.28 -0.59 0.36 0.08 -0.07 0.22 -0.63 -0.04 -0.56 -0.08 -0.56 -0.58 -0.01 -0.07 -0.1 -2.22 -0.72 0.5 -0.12 0.44 -0.01 -1.17 -0.55 0.1 0.28 -0.4 -0.21 -1.83 -0.22 0.11 0.21 -1.26 -0.8 -1.17 -1.32 -0.63 0.0 -0.91 0.17 0.2 -0.5
-0.59 -0.4 -0.15 0.39 1.28 0.85 0.92 0.89 -0.69 0.57 -0.52 -0.68 0.25 -0.39 0.25 -2.02 -0.78 -0.85 -0.06 0.17 0.55 0.43 -2.99 -1.34 0.76 -0.4 0.74 -0.32 -0.76 -0.32 0.16 -0.07 0.14 -0.15 -0.69 -0.32 0.52 0.07 -0.99 -0.02 0.08 -0.19 0.13 -0.06 -0.24 -0.01 -0.27 -0.78
-1.66 -1.4 -0.42 -0.26 1.83 0.8 0.33 0.37 -0.46 0.57 -0.57 -0.49 0.29 -1.0 0.24 -1.12 -0.78 -0.66 0.49 0.57 0.41 0.21 -2.58 -1.66 0.84 0.21 0.84 0.21 -0.75 -0.27 0.32 0.31 -0.11 -0.33 -0.58 0.24 0.48 0.37 -1.02 -0.66 -0.71 -0.99 -0.39 -0.28 -0.62 0.29 0.1 0.0
-1.41 -1.36 -1.52 -3.66 2.02 0.12 -1.01 -1.02 -1.72 -0.18 -0.62 -0.83 0.49 0.89 0.34 -1.11 0.15 -1.37 0.33 0.78 0.65 0.34 -1.04 -1.42 0.14 -0.88 0.45 -0.27 -0.5 -0.18 -0.25 -0.37 0.09 -0.12 -0.4 -0.5 0.11 -0.28 -0.39 0.48 1.07 0.62 0.77 0.19 0.27 -0.24 -0.36 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.