Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.41 1.26 5.17 0.69 0.35 0.42 0.0 0.05 0.01 0.11 0.09 0.02 0.05 0.0 0.06 0.02 1.47 0.58 0.23 0.29 0.0 0.0 0.05 0.14 0.02 0.05 0.01 0.03 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.21 0.0 0.23 0.32 0.18 0.25 0.01 0.01 0.3 0.01 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 5.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.99 14.93 17.67 53.26 145.75 78.5 78.52 68.43 19.86 10.86 2.89 2.89 7.26 2.62 12.33 15.38 25.47 15.05 27.56 41.24 43.81 32.45 20.13 8.29 44.88 16.57 29.51 0.11 0.01 0.58 0.78 0.2 0.24 0.04 0.02 0.02 0.03 2.12 0.12 1.55 4.88 11.24 4.24 1.98 1.15 1.81 1.21 0.43
0.03 0.05 0.02 3.75 12.63 1.36 1.74 0.15 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.76 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0
1.11 1.58 2.32 14.0 40.13 20.67 16.74 13.72 3.59 3.48 1.31 1.33 2.72 1.29 2.61 2.78 3.38 1.52 3.7 7.01 5.74 3.55 5.5 11.51 4.49 1.74 2.19 3.32 1.66 2.72 2.5 2.5 1.7 2.49 0.57 1.35 2.37 2.88 0.94 2.21 1.36 0.96 2.26 2.68 1.62 2.66 1.37 3.34
0.0 0.0 0.0 0.0 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.87 8.92 7.64 68.81 258.33 61.32 94.36 92.84 10.45 0.08 0.05 0.01 0.08 0.04 0.14 2.25 5.6 2.31 13.47 14.75 7.96 2.06 8.98 0.78 0.8 1.07 0.04 0.0 0.02 0.15 0.04 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.17 0.03 0.1 0.03 0.02 0.13 0.13 0.01 0.14 0.07 0.02
0.0 0.0 0.89 18.96 60.92 20.0 13.64 11.38 2.41 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 2.83 0.25 0.44 1.79 0.31 0.13 0.11 0.75 16.02 0.07 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.34 0.0 0.15 11.48 36.4 10.24 7.76 5.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 4.26 10.02 15.97 54.13 27.75 24.25 17.76 2.66 4.62 1.0 0.98 3.69 1.43 4.07 0.5 2.38 3.02 3.72 2.3 2.87 3.28 0.97 2.14 5.52 4.27 7.23 1.33 0.92 1.84 3.75 2.43 2.25 1.22 0.27 3.59 2.33 3.56 1.11 1.96 2.76 1.75 1.45 3.29 1.41 3.39 3.6 3.01
1.57 1.38 0.88 26.86 87.76 22.4 13.94 11.79 3.5 2.1 0.05 0.03 1.12 0.28 1.65 0.43 1.08 15.91 3.08 1.36 0.6 5.48 0.44 1.31 2.46 2.32 1.14 0.39 0.72 1.57 0.59 2.08 0.63 0.9 0.47 0.29 0.48 7.27 0.48 2.63 3.34 6.93 3.09 1.76 0.74 6.69 2.4 1.22
5.18 0.0 0.0 54.09 105.38 24.62 59.56 28.37 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.55 200.31 504.14 107.84 50.56 103.5 15.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.36 4.41 5.34 19.58 44.26 17.17 13.74 9.57 6.05 2.09 0.05 0.08 1.03 0.46 1.65 4.96 5.57 0.08 3.59 2.08 0.52 0.1 8.4 0.01 0.25 0.5 0.96 0.29 0.18 0.71 0.56 0.11 0.3 0.14 0.13 0.29 0.15 2.03 0.3 1.29 0.04 0.17 2.93 1.89 0.43 2.12 0.88 0.08
0.76 0.0 0.64 55.32 136.48 40.89 43.81 37.01 2.22 1.79 1.78 1.0 0.62 0.07 0.61 0.05 0.22 1.33 1.04 0.29 0.08 0.1 0.27 2.14 8.16 8.19 40.75 5.69 3.15 5.6 14.74 4.34 4.42 3.17 0.67 1.81 8.21 12.89 0.91 3.38 1.43 1.7 3.5 1.55 1.58 12.51 3.47 3.66
0.0 0.0 0.0 0.0 1.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 29.83 44.15 15.39 19.29 8.74 4.65 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.12 1.52 0.12 4.86 0.82 0.25 0.87 0.05 0.17 0.25 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.67 0.4 0.15 0.13 0.08 0.16 0.01 0.04 0.02 0.1 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0
6.59 5.53 7.2 14.78 34.38 24.09 20.68 21.66 7.19 6.38 3.2 2.76 3.81 1.79 5.22 4.14 4.2 3.71 13.02 10.86 7.02 5.64 6.02 1.68 7.86 2.54 11.19 3.49 1.12 3.59 4.67 4.99 4.4 3.21 0.53 2.15 4.62 5.47 1.33 4.86 2.21 2.23 5.09 3.48 3.06 5.01 2.98 3.75
0.28 2.05 0.33 8.52 45.01 11.59 4.3 6.55 1.54 0.24 0.0 0.0 0.18 0.05 0.4 0.86 0.24 0.0 0.53 0.22 0.14 0.22 0.0 0.0 0.03 0.22 0.03 0.78 0.81 0.41 0.31 0.11 0.45 0.58 0.0 0.75 0.04 0.0 0.12 0.19 0.0 0.0 0.18 0.3 0.13 0.11 0.36 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.46 3.06 5.64 15.17 60.55 30.0 25.93 22.18 5.06 8.67 7.89 7.41 9.02 5.98 6.87 4.18 5.73 5.27 6.75 7.88 8.36 7.19 1.76 2.8 10.53 4.34 10.43 5.42 5.16 5.64 6.2 9.86 6.07 6.36 3.01 5.85 7.31 6.34 3.76 5.76 6.17 4.63 6.15 4.97 5.36 6.78 4.0 7.08
0.21 0.07 0.46 7.08 48.03 12.98 9.08 9.8 0.67 2.09 0.13 0.18 1.02 0.84 0.86 0.16 0.38 0.21 0.54 2.37 1.69 1.94 0.4 0.63 3.55 0.51 2.5 1.16 0.9 0.69 0.27 0.62 1.61 0.88 0.27 1.59 1.59 0.87 0.43 0.73 0.31 0.31 0.74 0.32 0.97 0.35 1.07 0.71
0.43 2.44 4.32 35.65 82.29 19.39 12.24 8.71 3.33 2.01 0.03 0.05 1.16 0.26 1.45 0.0 3.88 4.06 1.16 3.69 1.33 3.85 0.0 6.18 4.31 0.92 0.37 2.06 1.02 1.23 2.52 1.14 0.85 1.66 0.14 0.45 2.06 1.99 0.84 1.22 0.78 1.48 1.19 1.69 0.61 1.57 1.11 1.38
20.23 11.88 8.87 79.76 404.23 140.86 127.24 120.21 14.91 1.24 0.02 0.03 0.97 0.31 1.65 22.35 0.69 0.55 0.04 0.39 0.27 0.38 0.0 3.76 0.48 2.18 0.06 0.31 0.07 0.36 0.57 0.09 0.3 0.35 0.0 0.04 0.31 0.58 0.06 0.63 0.0 0.09 1.77 0.5 0.27 0.49 0.48 0.07
1.03 0.44 0.55 31.62 105.92 15.11 8.88 8.83 7.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 1.93 0.35 0.22 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0 9.58 0.29 0.13 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.02 26.84 114.25 22.16 11.3 10.42 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.94 11.77 19.12 25.91 111.51 51.91 51.72 47.46 28.69 12.9 5.87 6.69 10.48 6.36 12.59 6.04 11.5 11.05 14.06 19.48 15.65 11.95 5.05 2.05 13.44 9.01 14.53 15.58 15.45 11.02 12.79 12.81 9.75 9.59 2.81 9.58 15.83 14.08 6.53 9.74 9.72 9.2 9.39 11.02 7.08 14.13 9.07 15.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.34 9.01 13.04 27.43 84.42 40.17 42.13 41.92 4.39 9.66 7.12 6.87 8.13 3.29 10.79 5.11 8.69 7.16 11.63 13.64 14.31 12.71 4.54 6.67 13.95 5.98 13.0 8.62 5.31 7.08 9.24 7.68 8.93 8.25 3.84 7.93 8.98 9.32 4.87 8.48 6.45 5.08 8.96 9.75 7.13 8.98 8.43 9.38
0.0 0.0 0.0 3.18 27.86 3.33 2.84 1.36 0.66 0.92 0.0 0.0 0.36 0.35 1.24 0.0 0.0 0.1 0.63 0.66 0.0 0.53 0.0 0.0 1.05 0.2 0.4 0.0 0.0 0.06 0.12 0.23 0.09 0.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.22 0.51 0.16 0.12 0.0 0.0 0.44 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 4.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
22.88 23.87 38.52 95.57 221.14 83.64 66.28 63.25 21.04 28.2 8.78 9.99 29.85 32.95 28.29 20.22 36.6 18.47 46.56 51.1 53.92 39.71 36.19 17.25 24.39 16.78 22.81 25.61 17.1 24.92 21.46 22.38 30.85 31.2 22.55 25.55 22.9 26.84 27.51 33.88 34.94 37.07 37.65 29.96 32.35 27.12 26.78 29.11
0.0 0.0 0.07 3.6 26.47 6.08 4.05 2.7 0.9 0.24 0.02 0.0 0.42 0.54 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.21 0.74 0.0 0.05 0.45 0.48 0.04 0.09 0.07 0.0 0.53 0.96 0.47 1.55 0.52 0.08 0.58 0.02 0.05 0.27
0.68 0.0 0.12 0.64 3.33 0.86 0.22 0.29 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.16 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.01 0.01 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
5.58 5.05 7.12 19.4 71.64 28.08 30.36 26.13 7.77 8.38 0.18 0.19 5.75 3.44 6.3 6.16 3.22 4.17 7.66 4.17 3.72 4.9 0.85 15.56 7.0 3.22 1.69 7.78 1.86 5.63 6.94 7.72 4.52 3.31 2.49 5.34 5.47 8.35 2.42 3.47 3.88 1.94 2.62 2.19 2.82 7.57 3.04 10.39
0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 7.29 68.22 31.9 8.22 11.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.07 0.01 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.39 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.28 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
6.89 10.4 16.88 31.21 156.45 44.51 30.33 28.48 8.83 10.53 6.25 5.99 8.47 5.45 9.83 3.68 13.46 8.57 17.8 20.18 19.84 18.1 15.9 3.13 15.06 7.19 18.38 8.73 11.05 9.01 9.08 11.34 11.3 10.77 4.78 7.57 11.32 9.85 7.29 11.6 9.39 7.0 12.23 12.65 9.65 10.41 10.68 11.03
17.01 20.49 22.01 65.95 222.63 70.98 67.41 53.19 40.88 27.75 12.29 11.23 25.45 19.77 24.6 9.85 27.61 15.58 23.9 23.99 18.29 16.63 17.86 7.82 30.84 24.01 39.13 21.97 22.89 15.76 22.49 15.81 14.08 14.5 18.99 14.69 19.14 20.49 7.75 11.69 12.6 11.81 15.38 11.67 9.72 20.28 14.97 16.73

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)