Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
1.22 0.09 -0.04 -2.17 1.45 0.7 0.97 0.46 0.06 0.28 -2.87 -2.7 -0.0 -0.79 0.35 1.46 0.49 -2.09 1.02 0.36 0.7 0.47 -0.99 -3.5 -1.08 -1.37 -1.78 -0.19 -1.11 -0.12 -0.03 -2.09 0.01 0.1 -1.62 -0.46 -0.12 0.29 -0.8 0.06 -0.48 -0.22 0.32 0.24 -0.34 0.32 -0.43 -0.45
0.11 0.05 -0.02 -2.11 0.92 -0.85 -0.4 -0.54 -0.19 -0.12 -0.89 -0.81 -0.17 0.23 0.35 0.16 0.65 -0.62 0.37 0.71 0.82 0.65 -0.91 -1.58 0.15 -0.61 0.2 -0.4 0.56 -0.01 -0.4 -1.4 -0.07 0.18 0.14 -0.74 -0.47 0.07 -0.83 0.3 0.78 0.62 0.71 -0.08 -0.48 0.1 -0.51 0.13
-0.34 -0.33 -1.19 -2.7 0.81 -0.78 -1.12 -1.07 -0.9 -0.13 -0.36 -0.23 -0.53 -0.55 -0.51 -0.77 0.56 0.65 0.67 0.63 0.86 0.81 0.28 0.48 -0.13 -2.0 -1.15 -0.03 0.01 0.01 0.02 -0.5 0.43 0.11 -0.14 -0.79 -0.18 0.81 -0.5 0.76 0.03 -0.34 0.69 0.41 0.26 0.8 -0.01 -1.06
0.23 -0.68 0.26 -2.5 0.28 -0.88 -1.19 -0.91 -0.54 -0.29 -0.49 -0.53 -0.21 0.07 -0.12 0.13 0.89 -0.08 0.94 1.11 0.87 0.47 0.36 -0.6 -0.21 -0.23 -0.27 -0.24 -0.61 -0.02 -0.6 -0.32 -0.27 -0.07 -0.28 -0.56 -0.51 0.17 -0.3 0.32 0.66 0.64 0.33 0.17 -0.06 0.22 -0.16 0.05
-0.05 -0.27 0.37 -0.82 -1.27 -1.3 -1.32 -1.49 0.27 -0.4 -0.46 -0.44 -0.39 -0.26 -0.58 -0.33 0.97 0.1 0.43 0.51 0.43 0.43 0.33 1.17 -0.4 -0.34 -0.76 -0.11 0.06 0.17 -0.23 -0.19 -0.03 0.24 0.29 -0.78 -0.19 0.19 -0.15 0.37 0.12 0.43 0.11 0.43 0.29 0.27 0.01 -0.27
-1.21 -0.77 -0.47 -1.72 1.43 -1.03 -1.09 -1.31 -1.38 0.36 -0.56 -0.62 0.14 0.9 0.45 -0.44 0.59 -0.61 0.42 0.71 0.64 0.29 0.01 -0.68 -0.04 -0.74 -0.96 -1.18 -0.65 -0.29 -0.89 -0.34 0.21 -0.3 -0.92 0.04 -0.84 0.31 -0.48 0.78 1.0 1.08 0.79 0.52 0.5 0.23 -0.29 -0.92
-2.41 -0.69 -0.29 -3.55 0.92 -0.99 -1.82 -1.18 -1.79 0.2 0.16 -0.04 -0.18 -0.86 0.02 -0.22 0.14 -1.26 0.54 0.82 0.94 0.74 -1.55 -2.48 -0.39 -2.21 -0.6 0.12 1.62 -0.04 0.33 -0.65 0.39 0.51 0.46 0.28 0.25 0.28 -0.38 0.35 -0.57 -0.29 0.51 0.54 -0.07 0.38 0.36 0.2
-0.89 -1.54 -0.63 -2.97 0.32 -0.97 -1.99 -2.61 -1.42 -0.58 -0.6 -0.43 -1.08 -1.12 -0.27 -0.91 0.82 -0.56 1.12 1.17 0.86 0.41 -1.0 -1.9 0.13 -1.41 -0.07 0.53 -0.79 0.78 -0.71 0.05 0.41 0.34 0.18 -0.27 -0.34 0.52 -0.38 0.53 0.24 -0.18 0.66 0.54 0.77 0.63 0.7 0.92
-0.4 0.84 1.86 -0.41 2.59 0.77 1.48 1.12 -0.35 0.68 -3.44 -3.93 -0.24 -0.34 0.44 1.24 -0.66 0.01 0.31 -0.18 -0.83 -0.27 -1.6 -2.32 -1.51 -4.06 -4.01 -3.2 -2.07 -1.12 -0.77 -2.75 0.28 -0.71 -4.81 -2.36 -2.58 1.17 -1.26 -0.17 -2.51 -1.8 -0.47 -0.42 0.14 1.27 0.48 -2.65
0.19 -0.18 0.01 -1.82 1.41 -0.4 0.23 0.14 -0.19 -0.09 -2.14 -1.61 -0.26 0.12 0.93 0.32 0.11 -0.23 0.24 0.83 1.06 0.67 -0.91 -0.71 -0.03 -0.64 -0.52 0.01 0.06 0.15 -0.51 -1.51 -0.17 -0.06 0.48 0.03 -0.14 0.27 -0.32 -0.18 -0.14 -0.35 -0.09 -0.37 -0.32 0.19 -0.76 0.4
-0.43 -0.28 0.27 -2.27 -2.39 -1.26 -1.16 -0.95 0.0 -0.07 -0.97 -0.91 -0.19 -0.16 -0.71 -0.39 0.55 0.16 0.5 0.8 0.52 0.34 -0.22 1.44 0.05 -0.32 -0.67 0.19 0.06 0.1 -0.12 -0.54 -0.06 0.36 -0.12 -0.12 -0.3 0.6 -0.18 0.51 0.15 0.49 0.38 0.15 -0.11 0.65 0.08 -0.36
-1.86 -1.03 -0.58 -3.97 0.53 -1.01 -1.41 -0.81 -1.23 -0.84 -2.37 -2.62 -0.99 -1.08 -1.28 -1.44 0.53 -0.38 0.93 1.62 1.61 0.83 0.97 -0.52 -0.1 -0.59 -0.15 0.35 -0.47 0.14 -0.73 -0.46 0.05 0.36 -0.15 -0.36 -0.35 0.25 -0.19 0.47 0.63 0.85 0.4 0.44 0.19 0.28 0.21 0.16
-1.02 -1.22 -0.92 -2.44 1.24 -0.39 -1.42 -1.49 -2.38 0.93 -1.6 -1.55 0.64 0.93 0.55 -1.03 0.49 -0.19 0.11 0.71 0.8 1.06 -3.86 -0.87 0.2 -1.33 -0.6 -0.69 -1.35 -0.46 0.1 -0.83 0.21 0.0 -1.82 -0.2 -0.25 0.38 0.11 0.97 0.95 0.7 0.96 0.34 0.29 0.3 -0.16 -0.48
-0.17 -0.29 0.58 -2.36 0.88 0.44 0.05 0.2 -0.42 0.08 -2.5 -2.7 -0.85 -0.64 -0.64 1.44 -0.07 -0.66 0.53 0.94 0.59 0.27 -2.48 -1.3 0.06 -1.74 -0.65 -0.05 -0.2 -0.14 0.05 -0.88 0.24 0.17 0.01 -0.42 -0.28 0.81 -0.32 0.43 0.15 0.01 0.52 0.11 -0.01 0.85 0.05 -0.37
-2.38 -3.06 -2.79 -4.08 -1.26 -19.38 - - -7.69 -0.07 -1.04 -1.41 -0.19 0.62 -0.1 -1.34 -0.67 -1.78 0.77 1.48 0.63 0.72 -9.11 -2.57 -0.18 -3.15 -0.2 0.2 0.38 0.04 -0.1 0.16 0.46 0.38 0.3 0.09 0.31 -0.07 0.98 1.05 1.12 0.99 1.24 0.93 0.82 0.17 0.28 0.66
-1.36 -0.41 -0.52 -2.3 1.45 0.17 -0.8 -0.76 -1.69 -0.14 -2.31 -2.26 0.12 1.24 0.16 -1.05 0.27 -0.49 0.55 0.54 1.01 0.83 -1.22 -0.34 -0.09 -0.05 -0.59 -0.61 -1.16 -0.53 -0.34 -0.73 0.05 -0.23 -1.22 -0.39 -0.12 0.15 0.1 0.73 1.02 0.97 0.8 0.14 0.15 0.27 -0.55 -0.01
-1.7 -1.0 -0.19 -0.06 0.5 -0.51 -0.26 -0.33 -0.74 0.11 -0.07 0.06 -0.19 -0.38 -0.53 -1.2 -0.34 -0.56 0.09 0.55 0.45 0.17 -0.82 -1.87 -0.35 -1.11 -0.3 0.32 0.35 0.11 -0.14 0.03 0.49 0.55 -0.53 0.38 0.02 0.7 -0.04 0.45 0.06 0.23 0.09 0.79 0.48 0.82 0.54 -0.37
-0.52 -0.31 -0.33 -2.07 1.2 -1.28 -1.71 -1.67 -0.11 0.04 -3.07 -2.66 -0.46 0.83 -0.26 1.11 0.56 -0.6 0.39 1.79 0.69 -0.09 -0.22 -1.61 0.21 -1.53 -0.15 -0.1 -0.66 -0.08 -0.45 -0.97 0.16 -0.17 -1.48 -0.91 -0.33 0.37 -0.55 0.39 1.13 0.85 0.47 -0.0 0.35 0.32 -0.45 -0.01
0.44 0.4 0.6 -1.79 0.91 -0.51 -0.23 -0.22 0.19 -0.5 -3.14 -3.12 -1.11 -0.23 -0.24 1.53 0.52 0.05 -0.18 1.59 0.55 -0.25 1.32 -1.55 0.53 -0.99 -0.45 -0.28 -0.69 -0.21 -1.07 -1.75 -0.47 -0.43 -0.85 -1.09 -0.77 0.07 -0.65 0.33 0.99 0.67 0.37 -0.43 -0.27 0.04 -0.95 -0.26
-3.95 -3.03 -2.41 -5.18 -0.95 -0.85 -2.02 -2.82 -6.46 -0.18 -0.45 -1.03 0.43 0.29 -0.51 -2.27 -0.89 -2.81 0.59 0.83 0.4 0.61 -7.67 -2.87 -0.06 -3.99 -0.38 0.08 0.87 0.41 0.28 0.72 0.57 0.7 0.74 0.32 0.76 0.12 0.51 0.88 0.54 0.61 1.1 0.93 0.88 0.3 0.53 0.17
-1.47 -0.66 -0.34 -2.47 0.8 -1.46 -2.15 -1.9 -0.82 0.35 -1.98 -2.09 -0.52 -0.7 -0.23 -1.58 0.38 0.56 0.21 0.29 0.73 1.04 -1.02 0.61 0.22 -0.26 -0.42 0.42 0.14 0.46 -0.09 -0.58 0.62 0.46 0.29 -0.48 0.14 0.9 -0.27 0.4 -0.26 -0.19 0.98 -0.02 0.14 0.87 0.32 -0.41
-0.44 -0.26 0.35 -0.78 0.8 -0.64 -0.54 -0.61 -0.82 0.01 -0.5 -0.38 -0.24 -0.65 -0.13 -0.06 0.46 -0.22 0.32 0.75 0.66 0.33 -0.56 -0.9 0.01 -0.85 -0.34 0.06 0.12 -0.04 -0.26 -0.22 0.15 0.1 -0.06 0.14 -0.08 0.35 -0.28 0.43 0.26 0.44 0.48 0.28 0.12 0.33 0.05 -0.13
0.38 -1.02 -0.44 -2.88 0.76 -0.03 0.06 -0.06 -0.64 0.09 -0.79 -0.8 0.04 0.31 0.26 0.57 0.44 -0.88 1.07 0.75 0.77 0.7 -1.34 -0.56 -0.35 -0.69 -0.6 0.2 -0.4 -0.34 -0.07 -0.63 0.1 0.17 -0.84 -0.12 0.14 0.03 0.07 0.28 -0.11 -0.12 0.46 0.3 0.1 0.02 0.05 -0.34
-1.0 -0.53 -0.55 -0.47 0.56 -0.38 -1.14 -1.11 -1.46 -0.1 -0.52 -0.54 0.22 -0.01 -0.41 -0.05 0.39 -0.48 0.6 0.64 0.56 0.43 -1.76 -1.69 0.22 -0.83 -0.0 0.23 0.79 -0.08 0.0 -0.14 0.19 0.31 0.32 -0.07 0.24 0.18 0.06 0.53 0.04 0.12 0.43 0.52 0.27 0.22 0.34 -0.39
-6.19 -3.0 -4.21 -5.84 1.01 -7.48 -8.61 -9.29 -6.79 0.14 -0.28 -0.87 -0.19 0.14 -0.66 -2.28 -0.83 -3.17 -2.01 0.35 0.85 -0.17 -5.67 -2.24 0.62 -3.56 -0.01 0.06 0.57 0.6 0.32 0.12 1.06 1.11 0.52 -0.06 0.62 -1.75 0.32 1.11 1.29 0.62 1.39 1.1 1.06 -1.33 0.65 0.75
-0.33 -1.05 -0.48 -2.13 1.53 -2.9 -3.29 -3.11 -2.43 0.16 0.48 -0.27 0.11 0.66 -0.63 -1.38 -0.21 -0.9 0.39 0.68 0.3 0.71 -1.65 1.24 0.56 -1.23 0.32 -0.23 0.26 -0.35 -0.38 0.32 0.3 0.07 -0.12 0.06 -0.29 0.21 -0.33 0.16 0.33 0.4 0.53 0.25 0.47 0.36 -0.33 -0.59
0.2 -0.06 0.14 -1.27 0.4 -1.02 -1.11 -1.19 -0.12 -0.17 -0.99 -1.18 -0.52 -0.29 -0.43 0.09 0.69 0.19 0.74 1.07 0.88 0.61 -0.3 -0.58 -0.19 -1.28 -0.37 -0.04 -0.11 -0.01 -0.22 -0.4 0.32 -0.01 -0.78 -0.58 -0.22 0.09 -0.35 0.78 0.18 0.28 0.69 0.58 0.41 -0.01 0.28 -0.47
-0.04 0.14 -0.65 -1.95 1.42 -0.19 -1.7 -1.53 -0.02 -0.08 -1.46 -1.37 -0.84 -0.57 -0.39 0.14 0.54 0.07 0.6 1.22 1.17 0.96 -1.45 -0.21 0.0 -1.48 -0.02 -0.12 -0.15 0.1 -0.45 -0.39 0.23 0.02 -0.49 -0.64 -0.47 0.15 -0.59 0.53 0.06 -0.15 0.88 0.21 0.18 0.2 -0.19 -0.05
-0.6 -0.51 -0.33 -2.92 0.75 -1.13 -1.68 -1.59 -1.77 0.27 -4.65 -4.99 -0.39 -1.07 -0.24 -2.79 0.89 1.0 0.09 -0.08 0.34 0.97 0.6 -2.18 -0.94 -1.22 -2.68 1.53 -0.11 0.72 0.44 -4.18 0.73 0.09 -1.17 -0.77 -0.46 0.78 -0.87 0.74 -0.03 0.2 1.26 0.66 -0.68 0.9 1.46 -0.84
-0.82 -0.92 0.44 -1.8 0.36 -0.33 -0.29 -0.61 -0.9 0.16 -0.12 -0.1 0.31 -0.23 -0.0 -0.36 0.84 -0.01 0.15 0.52 0.76 0.86 -1.48 -1.25 0.11 -0.5 -0.38 -0.19 -0.39 -0.09 0.08 0.38 0.23 0.13 -0.86 -0.24 0.16 0.17 -0.32 0.21 -0.01 0.22 0.49 0.33 0.38 0.1 0.15 0.07
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-1.46 -0.73 2.42 1.66 2.32 1.44 1.93 1.36 -2.43 1.35 -3.49 -4.04 0.23 0.57 0.33 -3.67 -1.41 -0.42 -2.53 -2.2 -3.51 -2.91 -0.69 -3.49 -3.43 -0.95 -4.01 - -5.49 -0.55 -2.15 -4.83 -2.17 -4.4 -4.81 -5.91 -6.59 2.04 -6.06 0.37 0.05 -1.87 0.6 -0.48 -1.38 1.84 -3.04 -3.23
-0.16 -0.01 0.42 -0.96 0.11 -0.65 -0.89 -0.72 -0.29 -0.13 -0.62 -0.51 -0.22 0.03 -0.4 0.16 0.22 -0.7 0.4 0.84 0.73 0.11 -0.52 -0.52 -0.11 -1.36 -0.31 -0.05 0.27 -0.01 -0.21 -0.38 0.15 0.27 -0.1 -0.19 -0.23 0.46 -0.27 0.47 0.5 0.65 0.57 0.26 0.16 0.49 -0.01 -0.18
-4.85 -2.11 -0.63 -5.7 0.14 -1.25 -0.73 -0.58 -3.79 -0.92 0.18 0.23 -1.99 -2.43 -2.97 -2.01 0.57 -1.41 1.48 2.25 1.28 -0.22 2.04 -2.43 -1.79 -3.22 -2.41 0.7 -0.78 0.27 -0.79 -0.25 0.12 0.25 -0.01 -1.36 -0.84 0.62 -0.6 0.77 -0.15 -0.36 0.18 1.43 -0.53 0.67 0.83 -1.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.