Heatmap: Cluster_160 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.49 -0.93 0.7 -0.82 1.53 1.28 0.95 0.83 -0.76 0.01 -2.69 -2.47 -0.62 -1.97 -0.17 -1.1 -0.62 -0.13 0.5 0.72 0.62 0.44 0.91 1.03 0.47 -1.23 0.25 0.13 -1.22 -0.44 -0.04 -0.37 -0.28 -0.17 -0.94 0.26 -0.13 -0.02 -0.96 -0.35 -0.85 -1.03 -0.29 0.07 -0.73 -0.03 -0.13 -0.24
-0.08 -0.16 -0.13 -1.37 0.75 -0.29 -0.42 -0.74 -0.58 0.05 -0.94 -1.12 0.04 -0.41 -0.13 -1.95 -0.26 -0.65 0.01 -0.12 0.02 0.13 -0.81 1.78 0.03 -0.66 -0.26 -0.0 0.06 0.08 0.14 -0.21 0.3 0.5 0.15 -0.21 0.17 0.41 -0.06 0.24 0.05 0.02 0.35 0.18 0.22 0.39 0.06 0.13
-5.6 -2.59 -2.12 -3.73 -0.29 0.43 0.4 -0.28 -1.93 0.15 -2.8 -2.59 -1.53 -3.18 -0.46 -1.38 -1.12 -0.29 -0.87 -1.14 -0.23 0.77 -4.59 3.13 -0.87 -3.62 -2.93 0.85 -2.26 0.24 1.08 -0.62 0.66 0.06 -3.9 -0.0 0.52 1.81 -1.35 0.04 -0.89 -1.85 -0.27 0.91 -0.64 1.81 0.49 -1.13
-0.72 -0.14 0.69 -0.17 1.26 1.13 0.65 1.15 -0.34 -0.02 -2.49 -2.45 -0.32 -1.16 -0.24 -0.54 -0.19 0.04 0.71 0.81 0.97 0.86 0.12 1.46 0.24 -0.13 -0.87 -0.38 -1.69 -0.46 0.02 -0.89 -0.04 -0.43 -2.14 -0.33 0.17 -0.2 -1.07 -0.36 -0.93 -0.87 -0.28 -0.44 -0.23 -0.22 -0.33 -0.62
-2.65 -2.5 -0.96 -0.14 2.06 1.09 1.04 0.88 -0.94 -0.06 -0.64 -0.54 -0.29 -1.11 -0.3 -1.77 -0.95 -1.04 -1.11 -0.85 -1.23 -0.57 -2.83 1.35 0.48 -1.63 0.04 0.45 0.68 -0.05 0.35 0.18 0.49 0.31 -1.5 0.47 0.57 0.02 -0.29 -0.37 -0.48 -0.41 -0.01 -0.24 -0.31 -0.03 0.07 0.4
-0.39 -0.89 -1.26 -1.19 0.38 0.68 0.94 0.99 -0.19 0.68 -2.32 -2.31 -0.05 -0.97 0.36 -0.7 0.38 -0.79 0.41 0.18 0.13 0.35 -0.44 1.34 0.87 -0.05 0.04 0.3 0.29 -0.39 0.25 -0.93 -0.31 0.01 0.7 -0.33 -0.32 -0.06 -0.77 -0.37 -0.56 -0.71 0.07 -0.04 -0.93 -0.01 0.01 -0.25
-0.7 -0.08 0.47 -2.83 1.4 1.32 1.23 1.32 -0.63 -0.38 -1.58 -1.42 -0.83 -2.21 -0.7 -0.64 0.95 -0.24 0.67 0.99 0.86 0.33 -0.17 1.03 0.24 -1.29 -0.22 0.12 -0.27 -0.68 -0.14 -0.71 -0.45 -0.46 -0.3 -0.31 -0.09 -0.01 -1.14 -0.57 -0.97 -1.34 -0.16 -0.17 -0.89 -0.09 0.02 -0.78
-0.98 -0.19 0.11 1.05 1.64 1.02 0.84 0.8 0.09 -0.37 -0.88 -0.91 -0.41 -1.54 -0.48 -2.27 -0.46 -0.64 -0.19 0.08 0.15 0.04 -1.43 1.28 0.19 -1.3 -0.19 0.05 -0.36 -0.24 0.34 -0.43 -0.03 -0.1 0.03 -0.26 -0.02 -0.13 -0.84 -0.2 -0.07 -0.4 -0.05 0.18 -0.07 -0.15 -0.09 -0.22
-5.59 -4.59 -6.36 -6.51 -5.54 -1.77 -1.56 -4.16 -4.46 -1.57 -5.69 - -2.18 -0.87 -4.04 - -5.6 -7.2 - -6.21 - - - 3.56 -3.74 -3.41 - 2.11 0.1 1.11 0.57 -0.1 0.84 1.11 0.28 0.99 0.76 1.24 0.8 -1.15 -1.61 -2.62 -2.48 1.64 0.15 1.53 0.94 -0.17
-0.46 0.36 0.53 -0.39 -1.23 -0.19 0.52 0.22 0.28 -0.0 -2.22 -2.24 0.07 -1.08 -0.53 -0.25 -0.64 -0.33 -0.24 -0.92 -1.52 -1.41 -2.68 2.36 0.17 -0.6 0.08 0.91 -0.28 0.43 0.51 -0.36 -0.08 0.18 -1.11 -0.69 0.9 0.86 -0.91 -0.27 -0.14 -0.12 -0.13 -0.37 -0.68 0.87 -0.15 0.22
-1.14 -0.5 0.4 1.46 1.79 0.82 1.05 1.06 -0.45 -0.27 -0.93 -1.2 -0.36 -0.58 -0.57 -0.1 -0.24 -0.02 -0.06 -0.41 -0.3 0.05 -1.38 1.16 0.27 -0.04 -0.4 0.1 0.61 -0.3 0.2 -0.73 -0.6 -0.22 -0.42 -0.29 -0.35 -0.04 -0.67 -0.71 -0.71 -0.62 -0.58 -0.63 -0.88 0.02 -0.44 -0.42
-3.18 -2.06 -2.31 0.86 2.06 1.99 1.39 1.87 -2.92 -0.14 -3.19 -3.49 -0.89 -2.93 0.52 -1.93 -4.56 -4.29 -4.38 -3.1 -1.68 -2.36 -6.26 1.67 1.82 -2.17 1.29 0.24 -0.69 -0.09 -0.18 -1.23 0.24 -0.54 -3.07 -0.02 0.03 -0.37 -1.29 -0.27 -1.61 -1.44 -1.76 1.58 0.18 -0.49 -0.04 -0.7
-1.57 -0.14 0.62 -3.0 1.04 0.44 0.43 1.23 -1.9 -0.06 -0.36 -0.63 -0.2 -0.74 -0.4 -1.2 0.71 -0.35 0.89 0.78 0.63 0.34 0.62 0.63 0.49 -0.65 0.58 -0.27 -1.11 -0.43 -0.19 -0.09 -0.19 -0.19 -1.27 -0.59 -0.15 0.12 -0.92 -0.16 -0.1 -0.36 -0.16 -0.05 -0.32 0.18 -0.07 -0.55
-0.13 -0.46 0.88 -2.11 0.88 0.48 1.03 1.08 0.02 0.11 -1.27 -1.07 -0.15 -0.27 0.26 -1.11 0.18 0.08 0.3 0.41 0.51 0.64 0.5 0.63 0.4 0.09 -0.18 -0.04 -0.46 -0.25 -0.26 -0.82 -0.28 -0.49 -1.67 -0.79 -0.37 0.01 -0.52 -0.24 -0.7 -0.69 0.03 0.06 -0.19 0.0 -0.23 -0.27
-0.43 -0.2 -0.15 -0.9 1.37 1.16 1.43 1.01 -0.3 0.09 -0.4 -0.25 -0.05 -0.47 0.11 -0.74 0.12 -0.5 0.19 0.34 0.07 -0.29 0.1 0.59 0.12 -0.26 -0.04 0.16 -0.4 -0.32 0.03 -0.1 -0.26 -0.51 -0.6 -0.17 0.11 -0.07 -1.11 -0.43 -0.64 -0.83 -0.2 -0.42 -0.59 -0.09 -0.27 -0.27
-1.35 -0.96 -0.19 0.41 2.0 1.55 1.2 1.13 -1.68 0.24 -1.63 -1.99 -0.4 -2.07 -0.09 -1.08 -0.23 -0.41 -0.13 0.27 0.25 -0.0 -0.6 1.4 0.66 -0.6 0.39 0.18 -0.97 -0.44 0.53 0.08 -0.19 -0.18 -1.22 -0.12 0.38 -0.39 -1.44 -0.84 -0.88 -1.38 -0.56 -0.57 -1.14 -0.46 -0.05 -0.32
-0.63 -0.96 0.21 1.03 1.49 0.57 0.52 0.67 -0.26 0.06 -1.69 -1.52 -0.41 -1.84 -0.19 -0.16 0.66 -0.0 0.36 0.58 0.25 0.24 -0.23 1.53 0.02 -0.91 -0.62 -0.21 0.11 -0.03 -0.14 -0.42 -0.14 -0.25 -1.67 -0.53 0.0 0.21 -1.19 -0.42 -1.12 -1.01 -0.2 -0.06 -0.48 0.2 -0.06 -0.02
-1.2 -0.21 0.03 -1.42 -0.05 -0.37 0.75 0.42 -0.48 0.47 -1.37 -1.25 -0.62 -1.24 0.22 0.08 0.3 -0.37 -0.01 0.44 0.58 0.61 -2.07 1.53 0.34 -1.02 -0.56 0.2 -0.32 0.32 0.22 -0.72 0.1 0.33 0.86 -0.38 -0.1 0.38 -0.91 0.09 -0.44 -0.43 0.21 -0.05 -0.26 0.34 0.13 -0.17
-1.28 -0.66 0.25 -0.86 1.53 1.28 1.22 1.18 -0.47 0.0 -0.12 0.08 -0.29 -1.87 0.14 -1.09 -0.29 -0.11 0.25 0.24 0.03 0.17 -0.71 2.27 0.86 0.09 0.48 -0.47 -0.98 -0.63 -0.18 -0.46 -0.71 -0.66 -0.67 -0.49 -0.23 -0.24 -1.58 -1.18 -1.23 -1.54 -0.85 -0.79 -1.36 -0.4 -0.53 -0.48
-0.24 -0.94 0.59 -1.97 0.7 1.2 1.16 1.46 -0.7 -0.02 -2.61 -2.76 -1.27 -2.98 -0.38 -1.07 -0.33 -0.91 0.46 0.32 -0.07 -0.27 -1.24 1.59 0.02 -1.77 -0.36 0.75 -0.1 0.11 0.61 -0.07 0.33 0.09 -0.03 0.3 0.73 0.5 -1.47 -0.47 -1.58 -1.99 -0.21 -0.15 -0.8 0.4 0.07 -0.24
-2.91 -0.72 0.53 -2.09 0.86 0.91 1.15 0.94 -2.36 -0.38 -2.03 -2.03 -1.52 -2.94 -0.73 -4.03 -1.25 -1.04 -0.56 -0.04 -0.44 -0.08 -1.11 2.03 -0.34 -2.28 -1.11 0.95 -0.22 0.29 0.7 -1.24 0.6 0.56 -0.28 0.02 0.72 0.62 -0.06 0.24 -0.41 -0.66 0.13 0.29 -0.08 0.62 0.78 -0.35
-2.16 0.28 0.72 1.65 1.56 1.4 0.72 0.84 -0.05 -0.07 -1.98 -1.84 -0.59 -1.1 -0.37 -0.82 0.33 0.35 0.28 0.54 0.25 0.67 -0.39 1.52 0.23 -0.34 -0.51 -0.29 -1.55 -0.87 0.02 -0.66 -0.55 -0.62 -2.46 -0.82 -0.39 -0.16 -1.57 -0.68 -0.92 -0.89 -0.41 -0.51 -1.04 -0.17 -0.47 -0.21
-0.16 0.18 0.16 -1.61 0.84 0.03 0.67 0.47 0.31 0.16 -0.67 -0.55 0.31 0.29 0.05 -0.7 0.85 -0.02 0.51 0.54 0.65 0.33 1.42 1.18 -0.04 -0.7 -0.25 -0.84 -1.06 -0.73 -0.65 -0.55 -0.5 -1.12 -0.84 -0.59 -0.36 0.08 -1.01 -0.2 -0.44 -0.49 0.22 -0.43 -0.19 0.1 -0.83 -0.56
-1.95 -1.94 -0.95 1.1 1.31 1.07 1.23 1.14 -1.13 0.45 -2.21 -2.54 -0.14 -0.43 0.39 -2.43 -1.74 -1.1 -0.48 -0.15 -0.19 -0.09 -2.74 1.1 0.52 -1.59 -0.02 0.27 0.2 -0.05 0.22 -0.81 0.28 0.12 0.68 0.25 0.36 0.22 -0.74 -0.24 -0.53 -0.54 -0.1 -0.08 -0.17 0.11 -0.07 -0.22
-0.99 -0.15 0.03 -1.36 1.39 1.06 1.31 1.16 -0.69 0.08 -0.52 -0.29 -0.06 -0.88 -0.27 -0.21 0.13 -0.11 0.43 0.79 0.7 0.38 -1.18 1.15 0.32 -0.59 -0.11 -0.42 -1.49 -0.57 0.1 0.24 -0.35 -0.39 -2.63 -1.03 0.23 -0.3 -1.17 -0.08 -0.81 -0.97 -0.02 -0.17 -0.43 -0.23 -0.16 -0.31
-3.4 0.07 -1.15 -2.49 -0.95 -0.45 0.84 0.09 -2.6 0.59 -4.41 -4.52 0.0 -0.05 0.07 -1.44 -1.24 -0.22 -1.84 -1.2 -0.69 -0.38 -1.51 1.98 -0.2 -0.39 -0.62 0.91 0.45 0.43 0.9 -0.04 0.51 0.5 -0.3 0.79 0.78 0.9 -0.46 0.13 0.05 0.14 -0.38 0.02 -0.46 0.83 0.12 0.36
-6.35 - 0.05 -4.45 -2.8 -3.46 -4.85 -5.1 - -0.14 - -7.62 -1.66 -2.32 -1.37 -1.5 -1.02 -0.74 1.51 0.78 -0.5 -1.99 0.16 -6.89 1.61 -2.44 0.14 -1.64 -2.16 1.01 -0.13 -2.33 1.7 0.87 -3.65 0.96 1.03 2.11 -1.33 1.16 -0.25 -0.34 0.9 0.24 0.71 2.05 0.66 -0.97
-0.21 -0.52 0.74 0.31 1.13 1.12 1.06 1.16 0.24 -0.11 -1.64 -1.77 -0.78 -1.5 -0.57 -0.7 -0.16 -0.17 -0.22 -0.02 0.01 0.27 -3.14 0.29 0.17 -0.33 -0.15 0.6 0.44 -0.24 0.45 -0.71 -0.09 0.25 0.62 0.6 0.12 -0.51 -0.58 -0.47 -0.82 -0.95 -0.45 -0.42 -0.68 -0.54 0.18 -0.3
-0.46 -2.3 0.78 -2.11 -0.13 -1.09 -2.29 -0.48 -0.81 -1.07 -4.9 -5.9 -2.32 -2.07 -2.68 - -1.02 -0.14 -2.02 -0.62 0.04 1.47 -3.09 0.74 0.87 -2.7 -0.8 0.21 0.02 0.49 0.55 -3.09 1.06 1.12 -1.28 -0.11 0.98 1.85 0.32 0.9 0.11 -0.35 -0.09 0.46 0.35 1.91 0.57 -0.95
-0.68 -0.05 0.17 0.13 -1.15 -0.23 -0.0 -0.33 -1.42 -0.03 -1.75 -1.96 0.13 -0.03 -0.59 -0.97 0.04 -0.31 0.06 -0.33 -0.54 -0.39 -1.29 1.27 -0.22 -0.45 -0.56 0.62 0.03 0.1 0.25 -0.36 0.4 0.73 -0.25 -0.16 0.6 0.95 -0.05 0.16 0.18 0.57 0.28 0.05 -0.06 1.03 0.19 -0.19
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-1.88 -0.75 0.22 0.65 1.49 1.13 1.22 1.23 -0.41 -0.54 -0.48 -0.43 -0.88 -2.61 -1.07 -1.29 -0.33 -1.02 -0.53 0.38 0.11 -0.55 -1.33 -1.81 -0.33 -1.42 0.14 0.22 0.09 0.22 0.27 0.26 0.23 0.44 -0.31 0.14 0.28 0.23 -0.73 -0.1 -0.4 -0.67 -0.2 0.3 -0.15 0.23 0.17 0.49
-1.06 -1.81 -1.37 0.61 1.5 1.68 1.03 1.34 -1.31 0.11 -1.97 -2.14 0.13 0.4 0.23 -1.2 -0.16 -1.08 -0.93 -0.36 -0.63 -0.42 -1.94 1.14 0.36 -0.64 0.08 -0.32 -0.65 -0.49 -0.05 -0.21 -0.04 0.54 -2.45 -0.37 -0.04 -0.28 -0.02 -0.1 0.27 0.07 0.13 0.02 -0.1 -0.29 -0.12 0.13
-1.67 -0.07 0.88 -1.48 0.98 0.51 0.94 0.85 0.21 0.09 -0.87 -0.84 -0.17 -0.92 0.12 -1.19 0.8 0.21 0.76 0.61 0.66 0.22 0.56 1.15 0.07 -0.07 -0.22 -0.29 -1.44 -0.36 -0.46 -0.11 -0.36 -0.4 -1.01 -0.34 -0.56 0.21 -1.01 -0.54 -0.64 -0.74 -0.4 -0.42 -0.41 0.1 -0.18 -0.28
-0.5 -1.49 0.2 -2.48 0.65 -0.22 -0.6 -0.06 0.08 0.04 -2.9 -3.53 -0.44 -0.44 -0.84 -0.25 -0.12 -0.98 -0.72 0.3 0.43 0.01 -1.32 1.02 -0.59 -2.62 -3.05 0.4 -0.11 0.16 0.44 -1.24 0.86 0.45 -0.94 -0.22 0.38 1.38 -0.31 0.93 -0.37 -0.27 0.61 0.64 0.53 1.52 0.46 -0.54
-1.36 -0.51 -0.83 -1.78 -1.4 0.67 1.23 0.78 -1.06 0.43 -0.64 -0.43 -0.36 -1.85 0.82 -0.91 -0.6 0.5 -0.55 -0.12 -0.01 -0.13 -1.94 2.09 0.8 -0.4 0.17 0.86 -0.22 0.21 0.34 -0.9 -0.49 0.09 1.22 0.54 0.01 -0.25 -1.49 -0.62 -1.05 -1.25 -0.43 -0.5 -1.2 -0.32 -0.34 0.39
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-2.05 -2.41 -0.92 0.69 1.86 0.94 0.85 0.56 -1.39 0.64 -0.52 -0.67 0.01 -0.7 0.26 -2.59 -1.24 -0.76 -0.47 -0.56 -0.93 -0.44 -3.37 2.0 0.34 -1.35 0.44 0.04 0.57 -0.05 0.19 -0.05 -0.07 -0.04 -2.04 -0.42 0.53 -0.05 -0.73 -0.44 -0.17 -0.38 -0.06 -0.0 -0.68 -0.01 0.26 -0.17
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.