Heatmap: Cluster_214 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.46 -0.79 0.39 -2.16 1.48 1.46 1.12 1.09 -1.48 -0.04 -0.53 -0.64 -0.7 -1.92 -0.34 -1.26 0.57 -0.52 0.8 0.79 0.75 0.5 0.51 -1.5 -0.11 -0.97 0.05 0.11 -0.58 -0.24 -0.05 0.24 0.04 -0.3 -1.59 -0.1 0.06 -0.02 -1.05 -0.35 -0.99 -1.1 0.02 -0.12 -0.52 -0.06 0.09 -0.32
-1.04 -0.99 -0.25 -1.4 1.29 1.39 1.0 1.21 -0.32 0.6 -0.7 -0.84 -0.12 -1.47 0.47 -0.93 -0.47 -1.68 0.12 0.43 0.71 0.27 -0.29 -2.22 0.36 -0.7 0.16 0.15 -0.55 -0.25 0.32 0.05 0.17 -0.04 -0.98 -0.06 0.37 0.01 -1.21 -0.25 -0.19 -0.54 0.17 0.07 -0.4 -0.07 0.1 -0.29
-1.06 -0.39 0.83 -1.96 0.6 0.85 1.13 1.43 -0.79 0.64 -0.83 -1.02 0.34 -0.78 0.37 -1.24 -0.53 -0.54 0.12 0.56 0.59 0.46 -1.99 -1.65 0.72 -0.11 0.04 0.17 -0.66 -0.17 0.21 0.01 0.11 -0.2 -1.83 -0.05 0.41 0.3 -1.47 -0.52 -0.09 -0.21 -0.09 -0.55 -0.45 0.27 -0.27 -0.05
-1.29 -0.69 0.07 -2.08 1.29 0.9 1.17 0.86 -1.31 0.33 -0.67 -0.7 0.06 -0.47 0.04 -1.13 -0.44 -0.57 0.21 0.49 0.24 0.05 0.11 -0.63 0.36 -0.57 -0.06 0.48 -0.15 -0.11 0.58 0.13 0.19 0.02 -0.62 0.22 0.54 0.15 -0.74 -0.5 -0.69 -0.94 -0.18 -0.25 -0.27 0.17 0.09 -0.32
-2.27 -1.6 -0.15 -2.0 0.35 1.38 1.33 1.37 -1.56 0.23 -0.66 -0.73 -0.49 -1.27 0.35 -1.22 -1.36 -1.05 -0.2 0.53 0.63 0.49 -2.64 0.07 0.62 -0.92 0.53 0.5 -0.19 0.07 0.49 1.01 0.28 0.04 -0.37 0.08 0.94 -0.3 -0.92 -0.54 -0.85 -1.15 -0.33 -0.01 -0.51 -0.35 0.01 -0.22
0.2 -0.13 1.15 -1.0 1.56 1.3 1.22 0.86 0.09 0.22 -1.01 -0.88 0.34 -0.33 0.18 -0.56 -1.29 -1.06 0.57 0.76 1.01 0.49 -0.34 -2.77 0.35 -1.1 0.06 -0.14 -1.2 -0.62 -0.01 -0.28 -0.28 -0.45 -1.09 -0.09 -0.12 0.05 -1.06 -0.62 -0.77 -1.22 -0.49 -0.66 -0.73 0.07 -0.53 -0.36
-0.77 -0.89 -0.03 -1.41 1.77 1.32 1.2 1.16 -0.77 -0.07 -0.88 -0.91 -0.27 -1.74 0.07 -3.12 -0.87 -1.19 0.5 0.85 0.74 0.09 0.08 -1.98 0.5 -0.46 0.72 0.42 -0.32 -0.21 0.21 0.22 -0.08 -0.14 -0.96 0.2 0.59 -0.08 -1.01 -0.64 -1.29 -1.52 -0.4 -0.28 -0.49 -0.1 -0.32 -0.09
-0.75 -1.28 0.4 -2.24 0.97 0.29 0.67 0.58 -0.55 0.83 -0.55 -0.5 0.3 -0.87 0.54 -1.85 -0.31 -0.35 0.35 0.72 0.95 0.67 -3.28 -1.5 0.75 -0.1 0.23 0.07 -0.32 -0.09 0.52 -0.03 0.06 -0.13 -0.73 0.05 0.41 0.31 -1.15 -0.19 -0.41 -0.6 -0.24 -0.27 -0.57 0.29 -0.08 -0.08
0.01 -0.85 0.3 -1.0 1.37 0.78 0.55 0.85 -0.37 0.42 -1.71 -1.83 -0.05 -0.94 0.36 -1.02 0.03 -0.04 0.48 0.96 0.87 0.53 -2.65 -0.94 0.36 -0.41 -0.28 0.3 -0.62 0.02 0.21 -0.24 0.06 -0.16 -2.02 -0.28 0.38 0.49 -1.07 -0.34 -0.61 -0.71 0.05 -0.15 -0.28 0.34 -0.03 -0.18
-1.18 -0.92 0.48 -2.54 0.77 0.8 0.7 0.75 -1.86 0.43 -0.96 -1.38 0.27 -0.41 0.19 -1.15 0.04 0.12 0.01 0.41 0.62 0.47 -1.79 -1.11 0.81 -0.19 0.7 0.06 -0.31 -0.21 0.21 0.02 0.25 0.18 -0.57 0.2 0.26 0.07 -0.73 0.07 -0.11 -0.15 0.09 -0.21 -0.24 0.08 -0.41 -0.13
-3.02 -2.69 -2.72 -3.07 2.03 1.87 1.51 1.37 -4.03 0.32 -0.08 -0.33 -0.02 -1.04 0.22 -4.23 -2.83 -3.75 0.08 0.69 0.44 0.35 -3.57 -1.77 0.99 -2.66 0.15 0.14 -0.47 -0.28 0.53 -0.49 0.23 0.15 -1.21 0.07 0.3 -0.15 -0.76 0.03 -0.5 -0.71 0.26 0.11 -0.31 -0.2 0.11 -0.42
-1.07 -1.34 0.14 -3.35 1.17 0.33 0.75 0.67 -0.61 0.54 -0.01 -0.25 0.25 -0.49 0.27 -0.67 -0.32 -0.37 0.27 0.83 0.74 0.52 -1.34 -0.71 0.92 -0.55 0.57 -0.18 -0.53 -0.43 -0.06 0.14 0.07 -0.17 -0.87 0.02 -0.0 0.09 -0.92 -0.19 -0.14 -0.22 0.02 -0.06 -0.41 0.19 -0.11 -0.24
-1.3 -0.63 0.19 -3.13 1.74 2.05 1.59 1.7 -1.0 1.05 -2.52 -2.5 0.29 -0.86 0.68 -1.26 -0.3 -0.89 0.2 0.77 0.68 1.09 -3.09 -1.57 0.19 -1.67 -2.13 -0.99 -2.19 -0.39 0.15 -0.43 -0.71 -0.91 -2.51 -1.43 -0.1 0.56 -1.9 0.09 -0.02 -0.41 0.17 -0.6 -1.11 0.34 -0.88 -0.71
-0.2 -0.18 -0.07 -4.59 0.62 0.88 0.77 0.96 -0.61 0.47 -1.6 -1.65 -0.12 -1.19 0.64 -0.64 -0.41 -0.79 0.4 0.65 0.46 0.39 -0.18 -1.04 0.33 -0.76 0.17 0.46 -0.91 -0.1 0.53 0.44 0.3 0.11 -0.74 0.48 0.62 -0.24 -0.93 -0.32 -0.79 -1.48 0.06 -0.02 -0.27 -0.3 0.39 0.21
-0.38 -0.6 -0.3 -1.01 1.49 1.49 1.42 1.34 0.38 0.28 -1.28 -1.3 -0.02 0.0 -0.08 -0.32 0.2 -0.57 0.13 0.65 0.77 0.6 -1.01 -1.35 0.38 -0.05 -0.12 -0.31 -0.94 -0.42 -0.42 -0.49 -0.43 -0.73 -0.45 -1.27 -0.42 -0.12 -1.25 -0.27 -0.32 -0.34 -0.0 -0.18 -0.58 -0.11 -0.18 -0.55
0.19 -0.33 -0.23 -2.04 1.06 0.94 1.39 1.15 -0.1 0.24 -2.26 -2.09 0.06 -0.82 0.17 -0.92 0.47 -0.08 0.8 0.89 0.88 0.31 0.95 -0.96 0.22 -0.37 -0.02 0.06 -0.32 -0.28 -0.19 -0.59 -0.38 -0.37 -0.66 -0.3 -0.03 0.44 -1.33 -0.84 -1.21 -1.44 -0.4 -0.61 -0.65 0.31 -0.83 -0.36
-1.55 -0.68 0.71 -3.12 1.32 0.93 1.3 1.09 -0.34 -0.03 -2.37 -2.44 -0.37 -1.67 0.17 -0.55 -1.16 -1.05 0.75 0.81 0.74 0.29 0.23 -2.51 0.6 -0.64 0.96 0.45 -0.95 -0.33 0.3 -0.23 -0.08 -0.0 -0.86 0.14 0.23 0.28 -0.82 -0.51 -0.93 -0.95 -0.33 -0.04 -0.49 0.21 -0.14 -0.09
-0.86 0.24 -0.49 -0.86 0.56 0.92 1.35 1.1 0.22 0.16 -1.64 -1.93 -0.48 -1.78 0.42 -0.58 -0.9 -0.45 -0.13 0.34 0.55 0.45 -2.18 -1.17 1.08 -0.28 0.82 0.42 0.3 -0.15 0.44 -0.04 0.02 -0.01 0.15 0.4 0.59 -0.23 -1.25 -0.65 -0.89 -1.23 -0.35 -0.51 -0.91 -0.23 -0.05 -0.04
-0.85 -0.5 0.45 -1.57 1.67 1.29 1.4 1.43 -1.13 -0.1 -0.88 -0.87 -0.58 -1.5 -0.62 -0.4 0.14 0.12 0.42 0.97 1.02 0.45 -0.76 -1.24 0.07 -0.94 -0.14 -0.01 -0.2 -0.36 0.17 0.02 -0.18 -0.35 -1.35 -0.77 0.1 0.05 -0.95 -0.42 -0.92 -1.01 -0.26 -0.33 -0.61 0.01 -0.15 -0.38
-0.86 -1.22 -0.64 -2.21 1.49 1.54 1.38 1.22 -0.7 0.51 -1.83 -2.01 -0.15 -1.47 0.44 -0.19 -0.78 -1.89 0.22 0.06 0.47 0.26 -0.73 -1.07 0.24 -1.95 0.43 0.11 -0.93 -0.14 0.37 -0.61 0.24 -0.07 -1.36 0.32 0.32 -0.18 -0.74 -0.17 -0.21 -0.39 0.35 0.11 -0.33 -0.19 0.4 0.13
-1.04 -0.8 0.07 -1.96 1.16 1.12 0.75 0.81 0.05 0.11 -0.29 -0.28 -0.31 -2.15 0.18 -1.0 -0.39 -1.0 0.22 0.56 0.47 0.05 -1.03 -0.13 0.42 -1.0 0.52 0.05 0.3 0.01 0.23 -0.11 0.19 -0.14 -0.25 0.11 0.58 0.04 -0.96 -0.23 -0.62 -1.14 0.12 0.21 -0.32 -0.05 -0.01 0.03
-0.27 -0.82 0.61 -1.66 1.48 0.45 0.71 1.0 -0.4 0.11 -1.09 -1.03 0.06 -0.4 -0.03 -1.31 -0.61 -0.61 0.26 0.44 0.45 0.03 -1.0 -1.31 0.31 -0.71 0.27 0.5 -0.48 -0.03 0.21 0.1 0.13 0.16 -0.78 0.21 0.42 0.09 -0.34 -0.05 -0.45 -0.54 0.06 -0.04 -0.09 0.0 -0.05 -0.02
-2.07 0.71 0.44 -1.71 1.42 0.99 0.86 1.14 -0.14 0.74 -2.8 -3.04 0.37 -0.53 0.52 -2.12 -0.39 -0.53 -0.26 0.18 0.69 0.25 -2.34 -1.89 0.18 -0.12 -0.16 0.5 -0.8 -0.25 0.38 -0.08 0.29 0.23 -2.87 -0.78 0.55 0.43 -0.86 -0.01 -0.86 -0.95 0.16 -0.04 -0.13 0.39 -0.06 -0.37
-1.46 -1.63 0.33 -2.28 1.38 0.74 1.07 1.12 -0.49 0.38 -1.12 -1.46 0.12 -0.48 0.27 -1.63 -0.4 -0.66 0.39 0.74 1.14 0.74 -1.42 -0.83 0.63 -0.78 0.64 -0.11 -0.78 -0.32 0.02 0.04 0.12 -0.18 -2.34 -0.2 0.27 -0.07 -0.85 0.01 -0.2 -0.44 0.2 0.01 -0.2 -0.16 -0.1 -0.47
-1.54 -1.15 0.13 -2.21 1.39 1.07 1.5 1.37 -0.11 0.52 -0.85 -0.67 0.53 -0.23 0.35 -0.85 -1.25 -0.6 0.36 0.65 0.55 0.81 -1.02 -2.04 0.92 -0.87 0.19 -0.36 -1.91 -0.51 -0.19 -0.31 -0.16 -0.35 -1.95 -0.63 -0.03 -0.06 -0.95 -0.18 -0.02 -0.03 0.08 -0.17 -0.47 -0.14 -0.28 -0.16
-0.31 -0.38 0.34 -2.64 1.16 0.97 0.82 1.07 -0.12 0.1 -2.05 -2.06 -0.45 -1.23 -0.09 -1.46 -0.01 -0.55 0.5 0.74 0.49 0.2 -0.97 -1.52 0.12 -0.73 0.12 0.46 -1.25 0.02 0.49 0.1 0.28 0.03 -1.77 -0.08 0.55 0.47 -0.79 -0.13 -0.39 -0.55 0.05 -0.03 -0.22 0.38 0.14 0.28
-0.45 -0.18 0.76 -1.32 1.11 0.92 1.01 0.75 0.17 0.38 -0.41 -0.44 0.06 0.01 0.2 -0.39 -0.52 -0.93 0.39 0.6 0.72 0.89 -1.2 -1.96 0.24 -0.62 0.06 0.14 -0.28 -0.5 0.22 0.37 -0.18 -0.28 0.08 -0.1 0.1 -0.26 -1.37 -0.77 -0.44 -0.78 -0.31 -0.52 -0.62 -0.42 -0.26 -0.28
-0.78 -0.87 -0.47 -4.07 0.6 0.9 1.14 1.07 -0.8 0.59 -1.86 -1.84 0.0 -1.26 0.6 -0.99 -0.52 -0.48 -0.12 0.42 0.8 0.61 -0.0 -1.25 0.89 -0.6 -0.09 0.35 -0.11 -0.14 0.7 -0.0 0.24 -0.02 0.17 0.74 0.56 0.07 -1.09 -0.18 -1.25 -1.61 0.01 -0.19 -0.69 -0.04 -0.16 -0.27
-1.38 -1.14 0.57 -1.67 1.27 0.74 0.75 0.63 -1.01 0.51 -1.33 -1.53 0.27 -0.54 0.19 -1.81 -0.33 0.11 0.33 0.54 0.54 0.29 -1.72 -0.9 0.95 -0.56 0.22 0.34 -0.54 -0.12 0.52 0.33 0.03 0.04 -1.05 0.14 0.41 0.17 -0.92 -0.38 -0.14 -0.39 -0.19 -0.27 -0.52 0.08 0.05 0.08
-1.17 0.37 0.42 -3.29 1.74 1.5 1.35 1.4 -0.32 -0.23 -0.36 -0.35 -1.0 -2.02 -0.19 -0.04 0.1 -0.36 0.13 0.48 0.35 -0.04 0.53 -2.13 0.09 -1.05 0.34 0.1 -1.53 -0.17 -0.48 0.26 -0.19 -0.13 -1.56 -0.37 -0.45 -0.1 -1.27 -0.53 -0.63 -1.02 -0.25 0.05 -0.45 -0.14 -0.03 0.07
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-0.44 -0.75 0.29 -2.14 1.24 1.22 1.08 1.09 -0.39 0.01 -1.08 -1.15 -0.3 -0.94 0.13 -0.32 -0.36 -0.48 0.55 0.68 0.88 0.7 0.44 -0.72 0.71 -0.16 0.59 0.23 -0.62 -0.68 -0.11 -0.26 -0.08 -0.33 -0.16 0.14 0.37 -0.27 -1.01 -0.86 -0.93 -1.26 -0.57 -0.55 -0.74 -0.37 -0.53 -0.31
-0.5 -0.44 0.27 -3.9 1.45 1.38 1.43 1.27 0.33 -0.51 -2.32 -2.7 -1.55 -3.14 -0.62 -1.68 -0.42 -1.38 0.71 0.9 1.31 0.73 0.3 -2.04 -0.4 -2.95 -0.62 0.07 -0.99 -0.14 -0.03 -0.49 0.46 0.2 0.11 -0.16 0.44 -0.26 -0.62 -0.13 -0.89 -1.52 0.32 0.16 0.19 -0.26 0.08 -0.7
-0.36 -0.18 0.35 -2.55 0.64 0.65 1.06 1.0 -0.39 0.69 -1.54 -1.61 -0.03 -1.08 0.6 -0.47 -0.28 -0.54 -0.11 0.27 0.63 0.45 -2.48 -2.02 0.7 -1.01 0.14 0.24 -0.76 -0.07 0.37 -0.24 0.19 0.18 -0.72 0.56 0.26 0.12 -0.63 -0.03 -0.5 -0.61 0.2 0.07 -0.09 0.02 0.24 -0.12
-0.66 -1.22 0.21 -6.16 1.55 1.64 1.74 1.58 0.02 0.31 -2.91 -3.34 -0.57 -2.29 0.36 -0.58 -0.06 -1.96 1.36 1.22 1.54 1.05 0.26 -4.33 -1.06 -2.45 -1.47 0.0 -0.91 -0.74 -0.09 -0.97 -0.37 -1.11 -0.11 0.43 0.26 -0.08 -1.86 -1.02 -1.59 -2.12 -0.31 -0.7 -1.51 -0.2 -1.03 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.