Heatmap: Cluster_236 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 1.33 3.2 -0.05 1.68 - - - - - - - - -3.08 3.22 2.86 2.56 - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.06 3.13 3.23 -0.51 - - - - 3.33 - - - - - - 2.54 1.45 -1.76 - - - - - 1.99 - 2.16 -1.45 - - -2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.5
1.17 3.67 0.17 -0.98 - - - - 2.69 - - - - - -2.89 3.92 2.54 -1.67 - - - - - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.05 - 3.02 0.11 - - - - 2.41 - - - - - -2.14 3.15 2.69 - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.45 0.31 - 0.17 -0.2 -0.56 -0.29 1.81 1.26 - - - - - -2.25 4.23 2.9 0.05 -0.29 -1.26 - - - - - 2.82 - - - -2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.31 0.61 0.74 - - - - - - - - - - -2.35 4.05 3.17 -0.51 - - - - - - - 3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.52 3.26 - - 1.38 2.4 3.56 - - - - - - 2.76 1.04 - - - - - - - - 3.05 - - - -2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.7 1.16 2.65 -1.11 1.11 0.22 2.36 2.63 - - -1.54 - -2.24 -4.54 1.89 2.23 0.69 - -2.12 - - - -0.54 -2.17 1.99 - - - -1.88 -2.86 -0.87 - -2.43 - - - -2.19 - 0.23 -0.87 - -0.96 -1.66 - 0.04 -2.18 -2.12
- - - 2.91 2.27 - - - - - 3.24 - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.56 -1.18 0.23 2.48 3.03 -0.51 1.11 1.25 2.97 -6.58 -7.81 -5.8 -6.39 -7.53 -6.67 -1.16 0.58 1.72 0.83 0.01 -0.21 -0.7 2.32 1.05 -0.96 0.53 -3.27 -7.27 -7.86 -5.85 -8.55 -6.84 -6.16 -8.04 -7.01 -7.24 -6.65 -5.71 - -6.34 -6.01 -6.46 -7.39 -8.1 -8.05 -6.05 -7.61 -6.8
- - - 2.58 - - - - - - - - - - - 4.67 3.2 0.38 - - - - - - - 2.56 - - - -2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.07 - 2.14 - - - - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 2.78 1.6 2.85 -1.78 -2.81 - - 2.72 -4.63 - - - - -5.98 3.12 2.31 -0.61 - - - - - -0.63 - 3.0 - - -3.98 - - -3.59 - - - - - - - - - - - - - - - -4.42
- 3.0 3.36 2.92 0.98 - - - - - - - - - -0.24 1.21 2.45 - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.04 1.5 2.53 - - - -0.86 - - - - - - - 4.85 0.91 0.73 - - - - - -0.65 - 0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.45 - - - - - - - - - - - - -2.55 3.17 3.08 - - - - - - - - 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.78 3.12 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.49 - - - - - - 3.44 - - - - - -0.93 - - - - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.95 0.56 1.02 - - - - -0.47 - - - - -1.7 -3.85 4.25 2.54 -0.83 - - - - - -1.59 - 3.2 -1.09 - - -5.91 - - - - - - - -2.31 - - - - - - - - - -
- 2.85 0.96 2.1 - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.16 - 1.5 1.36 - - - - - - - - 4.61 3.09 - - - - - - - - -0.47 - - - -3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.03 - - - - 1.25 - - - - - - 4.04 3.41 - - - - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.94 0.5 -0.24 - - - - - - - - - - - 4.98 2.0 - - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.17 1.06 1.12 -1.26 -0.16 1.22 0.54 0.53 1.77 -1.84 - -5.24 -0.95 -1.84 -1.31 3.27 1.29 1.0 1.32 0.34 0.03 -0.39 1.87 0.43 -0.21 -0.5 -1.59 -6.26 -6.94 -5.46 -4.86 - - - - - - -2.72 - -4.45 -2.02 -1.83 -1.97 -5.59 -5.77 -3.22 -6.33 -7.03
- - - 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - -
2.14 2.32 -1.06 -0.51 -1.28 -1.46 -3.54 - -3.99 -0.32 - - -0.41 -2.6 -1.12 4.01 1.48 -0.23 -1.63 -0.77 -1.9 -2.37 1.79 -2.01 0.03 2.08 -2.41 - -2.58 -2.18 -2.72 -3.91 -1.0 -4.11 - -1.2 0.15 -3.89 - -2.41 -2.38 -3.55 -3.38 -2.95 - -2.12 -2.53 -2.65
- 3.14 - - - - - 2.5 - - - - - - - 4.5 1.6 2.67 - - - - - - - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.07 - 0.51 - - - 4.37 - - - - - - - - 1.49 - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.9 - 3.48 - - - - 2.85 - - - - - - 4.49 - - - - - - - - - 1.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.44 -0.23 2.68 - - - - - -2.7 1.59 -0.33 -1.17 - -1.66 3.17 1.64 -2.22 - - - - - -1.38 1.24 1.99 2.05 - -0.35 -1.28 -2.06 -1.67 -0.97 -1.87 - - -1.36 -1.64 0.62 -1.74 - - -0.41 2.07 -0.88 -1.66 -0.29 -0.41
0.74 0.61 0.41 3.44 3.33 -0.06 1.22 1.35 2.66 -0.87 -1.87 -1.05 -3.49 -6.27 -3.84 0.92 -1.03 -0.43 -1.52 -6.32 -3.37 -1.75 - -4.99 -4.6 0.04 -4.8 -2.58 - -2.44 -0.33 -0.82 -4.47 -3.87 - - -4.73 -0.96 -3.89 -2.5 -2.69 -3.79 -2.33 -5.4 -7.09 -1.51 -1.22 -4.74
-0.39 - - 3.39 3.94 2.36 1.3 3.25 2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.34 0.48 0.91 - - - - - - - - - - - 5.02 - - - - - - - - - 1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.66 1.79 - - - - - - - - - - - - 4.02 2.39 - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.14 1.25 - - - - 3.89 - - - - 1.69 0.63 - 3.03 - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.71 2.74 0.69 - - - - - - - - - - -4.15 4.57 1.15 0.0 - - - - - - - 2.56 - - - -2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.69 - 0.28 - - - - 2.82 - - - - - -2.38 4.24 1.66 1.62 - - - - - - - 0.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.54 1.36 0.57 3.28 -0.16 -10.75 1.15 1.72 0.13 0.62 - - -1.42 -0.82 -2.04 1.46 -0.11 -2.64 0.74 - - -0.37 - - -1.89 2.67 0.11 - - -2.79 -1.58 -1.13 - - - - - -1.57 - - -0.01 - -2.11 - - 0.56 - -2.17
- - - 3.29 - - - 0.32 - - - - - - - 5.11 1.21 - - - - - - - - - - - - -2.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.68 1.94 0.62 1.92 -2.88 0.48 -0.18 -0.88 0.31 -3.64 -4.9 -2.11 -4.13 - -3.46 3.77 1.26 -2.62 -3.78 -0.55 -0.85 0.85 - - 3.18 -2.79 1.7 -4.81 -1.82 -3.22 -3.93 -4.06 -5.94 - -0.09 - - -4.5 - - -2.98 - -5.04 -4.32 - -4.06 - -6.36
-4.23 1.3 0.02 1.83 0.36 1.38 1.16 1.11 0.51 0.14 -0.9 -1.44 -0.18 0.0 -0.01 3.0 0.84 0.74 -2.1 -0.05 0.2 0.04 1.16 -0.83 -0.47 0.94 -1.37 -1.29 -1.2 -1.63 -2.08 -2.89 -1.46 -1.96 -4.57 -2.53 -2.25 -0.81 -3.41 -1.81 -1.85 -2.16 -1.55 -1.26 -1.08 -2.2 - -2.31
- 2.85 0.67 -0.15 -0.95 -1.95 0.66 1.83 - -1.91 0.14 -0.23 -0.84 -1.79 -2.0 3.04 0.8 0.84 - -1.37 - 1.51 - -1.18 0.39 2.54 0.44 - -0.88 -2.13 -3.67 -1.37 -2.55 -2.98 - - - -0.97 -2.26 - -2.43 -2.77 -0.9 -0.4 -2.84 -1.19 - -0.56
- - 3.29 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.47 3.95 - - - - - - - - - - - - 2.53 1.89 - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.16 1.37 4.01 - 0.87 1.81 1.25 - - - - - - - 3.84 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.31 2.85 -1.21 -1.76 - - - - - - - - - -4.78 3.67 3.28 1.23 - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.92 - 3.57 0.67 - - - - - - - - - - - 2.93 2.46 - - 0.47 - - - - - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.03 3.02 - - - - - - - - - - - 0.93 3.01 2.3 - - - - - - - - - - 1.52 1.88 -1.88 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.22 - 1.42 - 1.01 - - - - - - - 4.9 1.8 - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.44 2.83 - - - - - - - - - - - -1.57 - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.66 0.17 1.0 2.97 0.67 1.26 1.41 -0.21 1.81 -3.85 -0.77 -1.21 - -4.73 -3.61 3.18 0.54 0.01 1.42 1.21 1.34 0.17 -0.79 -2.57 0.42 -0.99 -2.34 -2.43 -1.73 -1.14 - - - - -3.63 - -3.85 - - - - - -5.02 -4.39 - - - -4.45
- - - 3.67 -1.02 -1.8 0.03 0.23 1.9 - -1.73 - - - -5.39 4.45 -2.78 - - - - - - - - - - -0.55 1.54 -1.37 -3.26 - -3.69 0.25 - - - - - - - -2.62 -2.79 - -2.22 - - -1.13
- - - 3.58 - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.16 1.81 0.39 -0.92 -0.69 1.16 0.49 0.38 2.3 -0.83 -2.45 -3.11 -1.03 -2.47 -0.37 3.6 0.38 -1.87 -0.48 0.07 0.9 0.38 1.26 -3.8 -3.22 -5.53 -7.09 -9.74 - -3.83 -2.27 -4.83 -5.69 -10.24 - -8.91 -8.38 -0.45 -5.62 -1.63 -5.76 -2.91 0.38 -1.74 -3.57 -0.35 -2.83 -7.52
-0.4 0.85 - 3.18 - - - - 0.08 - - - - - - 4.5 2.61 - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.29 0.52 3.36 - - - - - - - - - - - 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.41 - 3.12 - - - - - 0.66 2.75 2.42 - - - 3.77 1.24 - - - - - - - - 2.19 - - - -1.96 - - - - - - - - - - - - 1.13 - - - - -
- 3.37 2.18 2.75 -0.42 - - - - - - - - - -3.37 - 2.67 1.05 - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.28 2.9 0.71 - - - - - - - - - - -0.24 - 3.32 - 2.12 - - - - - - 3.97 - 1.14 - -0.41 - - - - - 1.43 - - - - - - - - - - - -
- 0.23 2.92 2.8 - - - - - - - - - - - 1.45 1.44 2.65 - - - - - - 3.22 2.77 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.19 -1.82 2.8 4.12 1.34 0.61 0.79 2.84 - - - - - -3.65 - 2.52 -0.81 - - - - - - - 1.17 - - - -2.99 - - - - - - - - - - - - - - -1.13 - - -
- - 2.45 - - - - - 3.28 - - - - - - 3.93 2.62 - - 0.79 - - - 0.6 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.5 0.73 -0.93 - - - - 2.29 - - - - - - 4.92 -0.31 - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.41 -1.39 1.87 -0.39 2.26 3.21 0.21 -1.11 -3.31 - -0.96 - - -3.61 3.79 -0.52 - - - - - - - - 0.49 -2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.94 - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - -0.03 - - - - -2.77 - - - - - - - - - 0.86 - - - - - - - -
0.17 -7.0 -0.19 2.61 -1.88 2.81 0.91 2.66 2.96 - - - -4.92 -7.04 -7.25 -3.08 1.46 -3.31 -0.03 -3.42 -5.75 - 0.57 -4.71 0.99 2.8 1.01 -6.96 -7.6 -9.17 -6.27 - - - - - - - - - - -7.02 - -7.47 - - -6.99 -
- - 0.2 3.87 1.11 2.29 1.07 - - - - - - - - 3.95 1.7 - - - - - - - - 2.12 - - - -4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.56 2.45 -1.37 1.71 -0.02 -2.27 0.95 0.72 0.23 -1.17 0.03 -1.86 -0.72 -1.03 -1.72 3.08 1.77 0.02 -3.36 - - -3.47 - -0.43 -2.15 3.25 -2.65 - - -1.81 -0.09 -2.17 -4.17 - - - -2.92 -1.09 - -1.18 -1.3 -1.13 -1.39 -4.9 - -1.11 -2.83 -2.26
- - 0.22 3.84 - - - 2.82 1.18 - - - - - - 3.44 3.09 - - - - - - 1.07 - 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.53 1.0 3.66 -2.28 -0.44 2.23 1.39 -0.29 - - - - - - 3.25 2.56 -1.31 - - - - - -0.73 - 2.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.68 - - - 2.9 - - - - - - - - -3.49 4.62 - - - - - - - 2.57 - - - - - -2.68 - - - - - - - - - - - - - - - 1.41 - -0.48
- - 3.61 - - - - - 4.09 - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.84 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.23 1.73 -0.23 -1.35 - - - - - - - - - -5.66 4.64 2.32 - - - - - - - - 2.05 - - - -5.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.07 2.41 -0.29 - -0.55 -2.32 - -0.4 -2.75 -0.09 1.21 -1.07 -2.9 - -1.06 3.65 -0.69 -0.87 - - 0.8 -0.41 - -1.15 0.34 -0.44 1.14 - 0.07 -0.77 -0.69 0.53 0.68 -2.63 1.73 -1.55 -1.4 - -2.34 -0.91 -2.13 - -1.57 - -2.25 -2.58 0.32 -1.46
- - 3.98 - - - - - 4.6 - - - - - - - 1.71 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.39 1.28 2.9 - - - - 2.76 - - - - - -2.6 4.05 2.69 - - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.