Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.75 -0.01 0.52 -0.96 1.54 1.06 1.12 1.15 -0.27 -0.04 -2.28 -2.53 -1.47 -2.35 -0.27 -1.9 -0.69 -1.31 0.55 0.75 0.27 -0.25 0.52 2.44 -0.01 -1.27 -1.02 0.63 -1.0 -0.19 0.36 -0.49 -0.15 -0.07 -2.31 -0.52 0.02 -0.0 -1.1 -0.68 -1.84 -1.69 -0.47 -0.33 -0.45 -0.16 0.32 -0.99
-0.99 -0.73 -0.01 -4.18 1.07 1.79 1.6 1.44 -0.12 0.16 -0.81 -1.08 -0.7 -2.31 -0.15 -1.15 -0.66 -1.09 -0.42 -0.11 -0.14 -0.19 -0.53 1.35 0.35 -0.89 0.69 0.02 -0.58 -0.34 0.58 0.38 0.11 -0.19 -1.08 -0.06 0.6 -0.24 -0.72 -0.71 -1.41 -1.7 -0.52 -0.12 -0.64 -0.33 0.22 -0.1
-1.61 -1.94 -0.71 -1.4 0.99 0.65 0.89 0.67 -1.22 0.31 -1.29 -1.42 -0.1 -1.02 0.03 -1.57 -0.7 -1.3 -0.1 0.19 0.35 -0.02 -0.96 1.73 0.42 -1.08 0.85 0.15 0.01 -0.15 0.57 0.23 0.47 0.05 -1.09 0.28 0.6 -0.06 -0.68 -0.11 -0.27 -0.6 0.11 -0.03 0.15 -0.07 0.21 -0.31
-0.16 -0.38 -0.24 -1.03 0.55 0.78 0.6 0.7 -0.45 0.16 0.2 0.39 0.12 -0.76 0.1 -0.94 -0.04 0.28 -0.15 0.1 0.15 0.17 -0.7 1.46 0.72 0.08 0.61 -0.24 -0.68 -0.29 -0.03 -0.09 -0.4 -0.62 -0.06 -0.68 -0.11 0.25 -1.19 -0.63 -0.39 -0.51 -0.26 -0.28 -0.59 0.18 -0.19 -0.12
-2.22 -1.9 0.27 -4.01 1.52 0.57 0.35 0.31 -0.72 -0.46 0.64 0.63 -1.01 -1.43 -0.98 -1.16 -0.42 -0.82 0.59 0.64 0.33 -0.08 0.27 2.99 0.64 -0.71 1.25 -0.75 -1.69 -0.81 -0.57 -0.18 -0.56 -0.58 -1.5 -1.71 -0.38 -0.38 -1.35 -0.45 -0.76 -0.85 -0.44 -0.56 -0.94 -0.32 -0.51 -0.82
0.53 -1.88 -0.67 -1.82 -0.75 1.24 1.76 1.37 -0.26 0.34 -2.63 -1.78 -0.47 -1.92 -0.16 -1.28 -0.66 -1.71 -0.14 -0.24 -0.91 -0.29 -0.9 3.0 -0.31 -2.57 -1.47 -0.29 -0.54 -0.39 -0.12 -0.51 0.16 -0.2 -1.53 0.52 -0.21 0.87 -2.38 -0.25 -0.81 -1.01 -0.25 -1.18 -0.51 0.78 0.12 -1.13
-0.08 -0.66 -0.98 -1.91 0.29 1.16 1.05 0.99 -0.06 0.29 0.45 0.38 -0.28 -1.07 0.01 -0.58 -0.12 -0.35 -0.62 0.11 0.15 -0.23 -1.8 2.35 0.45 -0.56 0.45 -0.66 -0.51 -0.44 -0.11 0.12 -0.16 -0.36 -1.14 -0.95 -0.35 0.09 -1.47 -0.59 -0.28 -0.57 -0.26 -0.52 -0.52 0.1 -0.5 -0.01
-0.17 -0.22 0.34 -0.82 0.19 -0.14 0.29 0.22 -0.38 0.03 -0.64 -0.62 -0.18 -0.56 -0.29 -0.2 0.45 0.09 0.21 0.32 0.32 0.33 -2.11 2.4 0.26 -0.29 -0.36 -0.2 -0.15 -0.31 0.09 -0.55 -0.25 -0.2 -0.6 -0.47 -0.02 0.4 -0.63 -0.29 -0.25 -0.27 -0.1 -0.51 -0.52 0.38 -0.31 -0.49
-2.16 0.15 -0.16 -1.96 0.49 -0.03 -0.57 -0.01 -0.18 0.23 -1.88 -2.45 -0.22 -2.2 0.03 -1.17 -0.46 0.49 -0.0 0.05 0.15 0.49 0.21 3.11 0.87 -0.35 0.41 -0.44 -1.01 -0.49 -0.05 0.46 0.12 -0.26 -2.13 -0.31 -0.01 0.04 -1.24 -0.82 -1.27 -1.64 -0.46 -0.49 -0.02 -0.03 -0.36 -0.35
-1.16 -1.86 -1.0 -2.07 0.11 0.59 1.22 1.29 -1.16 0.04 0.63 0.67 -0.62 -2.64 -0.09 -0.58 -0.73 0.09 -0.31 -0.14 -0.22 -0.29 -2.47 2.59 1.61 0.1 1.48 -0.26 -0.73 -0.47 0.01 -0.16 -0.58 -0.61 -0.09 -0.38 -0.07 -0.21 -1.72 -1.34 -1.44 -1.71 -1.04 -1.02 -1.66 -0.28 -0.35 -0.32
-1.02 -0.76 -0.08 -1.41 0.89 0.84 1.32 1.09 -0.29 -0.11 0.35 0.56 -0.17 -0.4 -0.17 0.61 -0.01 -0.73 0.55 0.09 0.03 0.19 -0.91 2.56 -0.22 0.09 0.06 -0.57 -0.01 -0.79 -0.9 -1.96 -0.78 -0.73 -0.42 -2.48 -0.45 -0.36 -1.14 -0.76 -0.32 -0.02 -0.17 -1.39 -1.58 -0.3 -1.23 -0.44
-0.35 -0.35 0.27 0.32 1.75 0.84 0.85 0.87 -1.22 -0.16 -2.29 -2.15 -0.47 -1.14 -0.28 -2.67 -0.65 0.15 0.09 -0.15 0.03 0.11 -1.69 2.5 0.78 -0.46 0.72 0.31 -1.17 -0.17 -0.22 -0.17 -0.24 -0.46 -1.61 -0.11 0.07 -0.14 -1.3 -0.57 -0.8 -1.35 -0.6 -0.48 -0.73 -0.18 -0.42 -0.61
-1.25 -0.44 -0.13 -1.24 0.72 0.78 0.94 1.03 -0.23 0.3 -0.44 -0.45 -0.16 -0.87 -0.11 -0.12 0.03 -0.28 0.28 0.65 0.68 0.53 -2.01 1.78 0.62 -0.31 -0.54 -0.18 -0.62 -0.33 0.09 -0.22 -0.16 -0.3 -0.78 -0.57 -0.18 0.07 -1.08 -0.32 -0.11 -0.34 -0.2 -0.42 -0.45 0.03 -0.32 -0.64
-1.16 -0.98 -0.13 0.06 1.28 0.94 0.83 0.9 -0.97 0.07 -1.51 -1.57 -0.43 -1.34 -0.24 -1.42 0.04 -0.64 0.6 0.9 0.95 0.08 -0.1 1.75 0.6 -0.94 0.33 0.07 -0.18 -0.49 0.12 -0.14 -0.02 -0.21 -0.84 -0.25 0.14 -0.1 -1.41 -0.59 -0.65 -1.03 -0.27 -0.4 -0.69 -0.05 -0.25 -0.4
-1.97 0.26 0.68 0.52 2.02 0.8 0.72 0.62 -2.58 -0.57 -5.29 -6.18 -0.62 -0.87 -0.49 -0.29 0.14 0.02 0.42 0.32 0.39 0.64 1.02 3.0 0.6 -0.47 -0.68 -1.04 -3.99 -1.31 -0.9 -2.73 -0.64 -0.95 -3.89 -1.92 -1.06 -0.44 -1.07 -0.55 -0.86 -0.69 -0.24 -0.65 -0.54 -0.42 -0.66 -2.14
-1.29 -0.54 -0.11 -0.67 1.2 0.11 -0.23 -0.21 -0.8 0.07 -2.29 -2.39 -0.26 -1.08 0.22 -1.03 0.05 0.66 0.56 0.35 0.41 0.49 0.16 2.53 0.41 0.08 -0.34 0.37 -0.33 -0.27 -0.27 -1.33 -0.23 0.21 -0.82 -0.3 -0.18 0.01 -0.76 -0.5 -0.67 -1.0 -0.35 -0.06 -0.68 -0.03 -0.23 0.08
-0.7 -0.66 -0.16 -2.56 -0.41 0.43 0.76 1.0 -0.78 0.39 -0.81 -0.85 0.13 -0.88 0.24 -1.8 -1.23 0.02 -1.71 -0.29 -1.35 -0.78 -4.29 2.6 0.69 0.07 0.58 0.45 -0.02 -0.11 0.58 0.48 -0.07 -0.4 -1.0 -0.13 0.84 0.35 -1.4 -0.47 -0.44 -0.62 -0.44 -0.57 -0.43 0.29 -0.24 -0.16
-0.72 -0.63 -0.36 -0.42 1.15 1.56 1.82 1.37 0.07 0.07 -0.2 -0.18 -0.85 -2.23 -0.42 -1.31 -0.2 -1.09 -0.01 0.04 0.2 -0.32 -0.77 0.98 0.49 -0.55 0.18 -0.01 1.44 -0.4 0.13 -0.08 -0.31 -0.48 -0.24 -0.99 -0.14 -0.55 -1.6 -0.74 -1.07 -1.42 -0.53 -0.54 -1.28 -0.66 -0.14 -0.03
-0.98 -0.47 -0.18 -3.17 0.75 0.78 1.05 1.32 -1.52 0.35 -2.0 -2.24 -0.14 -1.42 0.16 -2.54 -0.47 -1.08 -0.1 -0.09 0.08 -0.42 -1.23 1.79 -0.16 -1.14 0.11 0.59 -0.69 0.06 0.68 -0.09 0.66 0.38 -1.36 0.55 0.44 0.29 -0.55 -0.33 -0.94 -1.09 -0.12 0.11 0.03 0.2 0.51 -0.21
-1.12 -0.13 0.05 -1.52 0.04 0.17 0.94 0.75 -0.58 0.37 -0.3 -0.43 0.06 -1.02 -0.21 -0.51 -0.21 -0.22 -0.07 0.14 0.05 0.03 -1.41 2.18 0.72 0.09 0.27 0.23 -0.0 -0.2 0.43 -0.15 -0.09 -0.21 0.11 0.12 0.2 0.12 -1.16 -0.8 -0.96 -0.97 -0.54 -0.68 -0.95 0.11 -0.0 -0.41
-0.94 -0.29 0.04 -2.46 0.76 0.52 0.45 0.05 -0.69 -0.22 -0.34 -0.41 0.06 -0.68 -0.3 -0.82 -0.74 -0.63 0.16 0.85 1.06 0.85 -2.48 2.24 0.47 -0.49 0.05 -0.07 0.14 -0.4 -0.03 -0.12 -0.35 -0.11 0.49 0.05 0.01 -0.05 -0.83 -0.64 -1.04 -0.99 -0.53 -0.36 -0.58 -0.03 -0.22 -0.47
-0.83 -0.15 -0.09 -1.18 0.87 1.47 1.11 1.42 -0.55 0.09 -0.04 -0.22 -0.18 -1.62 0.07 -0.21 0.06 -0.06 0.12 0.44 0.09 -0.04 -0.55 1.25 0.55 0.51 0.41 0.1 -0.21 -0.37 0.01 0.03 -0.31 -0.33 -0.84 -0.03 -0.04 -0.46 -1.52 -0.9 -1.25 -1.64 -0.65 -0.65 -1.04 -0.49 -0.48 -0.23
-2.11 -0.43 0.2 -2.57 0.97 0.53 0.31 0.59 -1.18 0.32 -3.06 -3.22 -0.06 -2.07 -0.03 -1.87 -0.12 0.58 0.75 1.04 0.93 0.27 -1.1 3.06 1.61 0.5 0.19 -0.57 -2.41 -0.74 -0.03 -2.27 -1.31 -0.99 -2.97 -2.64 -0.62 0.44 -2.56 -0.82 -0.72 -1.09 -0.74 -0.53 -2.08 0.38 -0.53 -1.67
-0.94 -0.65 0.23 -0.19 0.59 -0.17 0.31 0.27 -0.27 0.56 -1.63 -1.75 -0.06 -1.35 0.29 -2.12 0.45 -0.26 -0.13 -0.02 -0.22 0.25 -3.14 1.94 0.2 0.6 -0.49 0.5 0.35 -0.05 0.47 -0.81 0.41 0.41 -1.58 0.26 0.76 -0.0 -0.37 -0.64 -0.88 -1.02 -0.34 -0.21 -0.09 0.05 0.14 0.06
-0.6 -0.76 0.28 -1.37 1.75 0.16 0.13 -0.08 -0.88 0.22 -0.31 -0.49 -0.02 -1.19 -0.14 -1.33 -0.33 -0.65 0.12 0.19 0.19 -0.07 -1.24 1.95 0.46 -0.49 0.06 0.08 0.24 -0.34 0.39 0.04 0.25 0.01 -0.39 -0.19 0.37 -0.16 -0.82 -0.2 -0.52 -0.6 -0.07 -0.17 -0.31 -0.17 0.05 -0.43
-0.97 -0.56 -0.28 -2.66 0.79 0.7 0.81 0.69 -0.82 0.33 -1.68 -1.6 -0.1 -1.22 0.12 -1.07 -0.77 -0.08 0.47 0.69 0.34 0.23 -2.26 2.85 1.0 0.0 0.56 -0.2 -1.26 -0.61 0.21 -0.31 -0.49 -0.63 -1.52 -0.55 0.26 0.37 -1.65 -1.18 -0.94 -1.12 -0.76 -0.93 -1.48 0.19 -0.1 -0.37
-0.51 -0.67 0.36 -0.65 1.17 0.24 0.51 0.48 -0.19 0.31 0.16 0.05 0.1 -0.79 0.05 -1.48 -0.12 -0.29 0.22 0.44 0.27 0.03 -1.74 1.34 0.45 0.11 0.38 0.0 0.21 -0.26 0.05 -0.0 0.02 -0.1 -0.79 -0.09 0.34 0.04 -0.97 -0.59 -0.65 -0.86 -0.27 -0.3 -0.52 -0.03 -0.22 -0.32
-1.55 -0.94 0.17 -1.59 1.07 1.36 1.06 1.16 -0.99 0.42 -0.82 -0.94 -0.58 -2.58 0.19 -0.91 -0.4 -0.98 0.04 0.22 0.26 0.14 -0.59 1.06 0.9 -0.69 0.86 0.38 -0.07 -0.2 0.45 0.02 0.02 -0.33 -0.05 0.46 0.35 0.01 -1.36 -0.75 -1.34 -1.69 -0.51 -0.39 -0.98 -0.08 0.04 -0.26
-1.1 -0.54 -0.07 -1.37 0.81 1.83 1.55 1.61 -1.55 -0.24 -1.42 -1.25 -0.97 -3.4 -0.44 -1.49 -0.2 -0.54 0.28 0.56 0.05 0.01 -1.33 1.83 1.0 -0.27 0.97 0.37 -0.59 -0.22 0.17 0.19 -0.41 -0.61 -0.06 0.22 -0.03 -0.15 -1.81 -1.37 -1.79 -2.29 -1.1 -1.03 -1.6 -0.37 -0.3 -0.03
-2.7 -0.91 -0.19 -0.95 1.03 0.55 0.95 0.58 -0.69 0.13 -2.74 -2.72 -0.45 -2.16 -0.25 -2.58 -0.01 -0.08 0.58 0.54 0.69 0.74 -1.86 3.06 0.31 -0.73 0.12 0.22 -1.31 -0.66 0.42 -0.25 -0.15 -0.24 -1.83 0.16 0.38 0.07 -1.53 -1.01 -1.91 -2.51 -1.06 -0.68 -1.02 0.03 -0.12 -0.79
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-0.22 -1.11 0.6 -2.14 0.93 0.06 0.17 -0.02 0.33 -0.49 -3.37 -3.01 -0.75 -1.33 -1.3 -0.68 0.13 0.07 0.46 0.58 0.44 0.28 -1.82 2.97 0.64 -0.22 0.24 -0.43 -0.72 -0.52 -0.37 -0.14 -0.41 -0.43 -1.31 -1.14 0.05 0.17 -1.1 -0.4 0.19 -0.07 -0.29 -0.24 -0.46 -0.06 -0.75 -0.16
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-0.54 -0.21 -0.07 -0.92 -0.06 0.6 0.98 0.75 -0.98 0.33 -0.86 -0.82 -0.32 -1.52 -0.18 -2.23 -0.01 -0.0 0.58 0.47 0.37 0.0 -0.96 2.51 0.63 -0.12 0.38 0.31 -0.47 -0.28 -0.05 -0.11 -0.18 -0.17 -1.35 -0.03 0.15 0.06 -1.18 -0.79 -1.31 -1.4 -0.49 -0.6 -0.95 0.05 -0.02 -0.2
-0.61 -0.18 -0.04 -0.46 -0.76 -0.02 0.12 0.17 0.03 0.15 -0.41 -0.2 0.14 -0.22 -0.2 -1.08 0.0 -0.1 0.24 0.33 0.29 0.37 -0.96 1.79 0.25 0.08 0.05 -0.25 -0.16 -0.02 0.09 -0.14 0.24 0.11 -0.21 -0.27 0.12 0.23 -0.69 -0.07 -0.39 -0.27 -0.04 -0.05 -0.1 0.29 -0.19 -0.42
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-0.46 -0.56 -1.29 -2.99 0.59 0.78 0.46 0.54 0.06 0.27 0.31 0.41 0.07 -0.52 0.24 -0.67 -1.08 -0.88 -0.37 0.08 0.2 -0.1 -1.76 2.13 0.57 -0.11 0.53 0.13 -0.32 -0.21 0.29 0.23 -0.04 -0.29 -0.05 -0.02 0.26 -0.23 -1.03 -0.48 -0.65 -0.93 -0.21 -0.41 -0.61 -0.28 -0.17 -0.15
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-0.44 -1.02 -0.95 1.32 1.65 0.68 0.4 0.57 -1.36 0.16 -2.16 -2.0 -0.34 -0.62 -0.12 -0.73 -1.01 -0.36 -0.37 -0.03 0.12 0.64 -0.91 2.79 1.17 -0.26 0.57 -0.68 -0.8 -0.61 -0.73 -0.34 -0.53 -0.88 -2.01 -1.08 -0.53 -0.07 -1.27 -0.42 -0.68 -0.75 -0.46 -0.43 -0.57 -0.0 -0.58 -0.85
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.