Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-1.29 -0.45 -0.86 -2.9 -0.11 0.5 0.38 0.49 -1.2 0.46 0.09 0.08 0.75 0.23 0.49 -1.4 -0.27 -0.37 -0.31 0.34 0.14 0.66 -1.79 -1.78 1.22 1.45 0.96 0.06 0.89 -0.21 0.3 0.61 -0.36 -0.72 -0.37 -0.05 0.55 -0.4 -1.4 -0.53 -0.99 -1.48 -0.34 0.25 -1.13 -0.51 -0.09 -0.51
-0.68 -0.07 -0.05 -1.77 0.43 -1.38 -1.35 -0.87 -0.21 0.56 -0.85 -1.04 -0.01 0.23 -0.14 -0.8 -0.1 -0.33 -0.48 0.05 0.56 0.44 -2.88 -1.42 0.46 -0.34 0.38 0.02 0.24 -0.1 0.22 0.36 0.44 0.17 -0.21 -0.71 0.46 0.33 -0.3 0.45 1.14 0.9 0.53 0.15 0.23 0.34 -0.2 -0.12
-1.18 -2.65 -4.19 -4.94 -0.03 -1.89 -2.23 -1.86 -2.35 0.52 -1.23 -1.39 0.19 1.13 0.27 -0.74 0.15 -1.45 0.05 0.87 0.48 0.03 -0.67 -1.65 -0.87 -1.13 -0.85 -0.95 -0.8 0.24 0.17 -0.25 0.34 -0.37 -1.89 -2.18 -0.23 1.2 -0.69 0.84 1.96 1.37 1.32 0.35 0.88 1.18 -0.27 0.3
-0.77 -0.29 -1.48 -3.15 -2.53 -0.16 0.54 0.62 -0.41 0.33 -0.35 -0.37 -0.25 0.44 -0.5 -1.16 -1.48 -1.86 -0.5 -0.48 -0.4 -0.68 -0.02 -2.67 -0.43 -1.7 -0.12 -0.15 -1.19 -0.06 0.02 0.86 0.86 -0.03 -0.33 -0.94 0.34 0.47 0.36 0.62 1.26 1.29 1.48 -0.16 1.09 0.45 0.15 -0.37
-0.6 -0.76 -0.67 -1.8 -0.05 -0.48 -0.4 -0.59 -0.54 0.13 -2.11 -2.47 -0.09 -0.55 -0.33 0.1 0.39 -0.08 0.1 0.48 0.46 0.3 -1.2 -0.91 0.43 -0.58 -0.37 0.26 0.94 0.05 0.2 -0.54 0.27 0.46 1.14 -0.14 0.48 0.24 -0.02 0.26 0.51 0.62 0.42 0.09 -0.1 0.3 0.1 -0.12
-1.65 -0.58 -0.4 -3.26 0.76 -1.47 -0.6 -1.06 -1.15 -0.22 -1.29 -1.05 -0.15 0.33 -0.77 0.0 0.24 -1.03 0.02 0.51 0.33 -0.24 0.88 -0.78 -0.52 -1.5 -0.5 0.25 0.13 0.25 -0.27 -0.02 0.36 0.36 -0.14 -0.07 -0.14 0.52 -0.02 0.83 1.1 0.83 0.7 0.5 0.44 0.57 0.06 -0.1
-2.27 0.01 0.96 -1.86 0.25 -0.04 0.57 -0.11 -2.48 -0.04 -1.26 -1.73 -0.49 -0.85 -0.92 -0.98 0.33 -0.41 1.32 1.29 0.98 0.68 -1.36 -1.13 0.61 -2.14 0.29 -0.2 -0.25 -0.25 -0.03 0.49 0.14 0.36 -0.58 -1.02 -0.07 0.17 -0.57 0.39 0.19 0.3 0.31 0.34 -0.25 0.16 0.29 -0.19
-1.42 -0.81 -0.25 -1.82 0.79 -0.62 -0.79 -0.74 -0.94 0.15 0.19 0.22 0.22 -0.06 -0.29 -0.14 0.01 0.59 -0.27 0.05 0.19 0.3 -1.46 0.64 0.06 -0.8 -0.26 -0.28 0.03 0.08 -0.69 0.11 0.32 0.77 0.32 -0.56 -0.24 0.26 -0.15 0.33 0.68 0.8 0.19 -0.05 0.69 0.25 -0.66 -0.14
0.06 -0.35 0.66 -0.42 -2.1 -1.49 -0.56 -0.62 -1.06 -0.01 -1.02 -1.1 0.21 0.45 -0.52 -1.06 0.62 0.67 0.05 0.1 0.16 -0.08 -0.53 -0.27 0.62 -0.17 0.14 0.13 0.28 0.3 -0.39 0.12 0.03 0.42 -0.87 -0.08 0.04 0.4 0.03 0.1 0.07 0.71 0.26 0.15 -0.3 0.37 0.21 0.6
-0.57 -0.77 -0.58 -1.86 -0.3 -0.18 0.06 0.02 -1.16 0.14 0.19 0.02 -0.15 -0.4 -0.4 -0.5 -0.47 -0.7 -0.02 0.42 0.37 0.35 -1.27 0.4 0.82 -1.09 0.34 0.48 0.79 -0.03 0.18 -0.18 0.22 0.19 0.4 0.2 0.08 0.23 -0.51 0.0 0.47 0.29 0.26 0.23 -0.12 0.28 -0.01 -0.28
-0.93 -0.61 -0.16 -2.23 -0.0 -0.62 -0.37 -0.38 -0.38 0.8 -1.02 -0.9 1.08 1.17 0.11 -0.35 0.73 -0.37 1.13 1.09 0.55 0.02 -1.6 -0.77 -0.55 -0.74 -0.83 -0.92 -0.37 -0.09 -0.17 -0.18 0.17 -0.17 -1.36 -0.29 -0.01 0.49 -0.49 0.31 0.54 0.56 0.21 -0.05 -0.15 0.54 -0.07 -0.29
-0.52 -0.3 0.65 -1.78 0.11 -0.85 -1.18 -1.2 -0.68 -0.08 0.08 0.14 -0.01 -0.21 -0.56 1.53 0.88 0.58 1.68 1.41 0.09 0.24 -2.34 -1.34 0.51 0.15 0.51 -0.9 -1.04 -0.41 -0.59 0.43 -0.54 -0.82 -1.18 -0.66 -0.6 0.13 -1.28 -0.22 0.69 0.87 -0.12 -0.87 -0.7 0.11 -1.18 -0.31
-0.11 -0.54 0.27 -1.8 0.24 -0.96 -1.44 -1.29 -0.25 0.36 -1.47 -1.57 0.25 0.32 -0.14 -0.12 0.34 0.7 0.15 0.15 0.27 0.41 -3.98 -1.19 0.09 -0.33 -0.74 0.18 0.24 0.09 0.17 -0.18 0.28 0.37 -0.36 0.1 0.22 0.41 -0.07 0.46 0.51 0.72 0.2 0.53 0.2 0.39 0.2 -0.15
-0.99 0.1 0.19 -1.95 1.33 -0.75 -1.18 -1.09 -0.47 0.0 -2.89 -3.23 -0.51 -0.35 -0.58 -1.34 0.15 0.38 -0.1 0.33 0.28 0.4 -0.77 -1.11 -0.28 -0.89 -1.02 -0.38 -0.55 0.28 -0.19 -0.51 0.69 0.13 -1.2 -1.64 0.15 0.88 -0.61 0.83 1.28 1.33 0.69 0.32 0.91 0.87 0.04 -0.26
-0.56 0.23 0.06 -0.69 0.51 -0.09 -0.49 -0.44 -1.14 0.13 -2.13 -2.27 0.69 0.62 -0.28 0.01 0.64 0.27 0.23 0.46 0.32 0.16 -0.1 -1.54 0.18 -0.01 -0.6 0.13 0.23 -0.24 0.25 -0.22 0.19 0.33 -0.27 0.27 0.41 0.17 0.19 0.02 -0.21 -0.09 0.12 -0.03 0.14 0.2 -0.09 -0.54
-1.17 0.02 -0.29 -1.94 0.91 0.31 0.3 0.05 -0.47 -0.06 -0.2 -0.0 0.36 0.69 -0.15 -0.19 0.24 -0.26 0.04 0.15 0.09 -0.07 -0.29 0.31 0.23 -0.14 0.07 -0.07 -0.43 -0.16 -0.1 -0.25 -0.1 -0.04 0.15 0.19 -0.16 0.08 -0.06 -0.01 0.25 0.27 0.13 -0.19 -0.17 0.01 -0.23 -0.07
-0.76 0.03 -0.88 -2.6 -1.93 0.21 0.41 0.46 -0.74 0.52 -6.52 -6.49 -0.02 -2.01 -0.1 -2.14 -0.97 2.52 -0.9 -0.47 -1.13 0.08 -3.49 0.77 0.7 1.43 -0.87 -0.8 -2.66 0.58 1.18 -1.28 0.41 0.23 -2.6 -1.45 1.1 1.23 -2.35 0.79 -1.13 -1.57 -0.01 -0.21 -0.27 1.3 -0.61 -1.17
-0.87 -0.73 -0.58 -2.01 0.58 0.19 0.26 0.34 -0.85 0.32 0.77 0.83 -0.2 -0.67 -0.31 -1.67 -0.63 -0.21 -0.04 0.18 0.19 0.29 -1.61 0.06 0.9 -0.6 0.57 0.32 -0.14 -0.04 0.06 -0.36 0.2 0.24 0.18 0.12 0.12 0.64 -0.46 -0.12 -0.16 -0.41 -0.04 -0.18 -0.32 0.72 0.12 -0.46
-1.64 -0.28 0.49 -1.49 -1.74 -0.73 -0.79 -0.59 -0.86 -0.19 -0.56 -0.61 0.38 -0.04 -0.37 -0.54 0.64 0.76 1.22 1.06 0.66 0.61 -0.68 0.01 1.03 0.09 0.63 -0.26 -0.16 -0.18 -0.38 0.12 -0.61 -0.16 -0.55 -0.57 -0.39 0.23 -0.59 0.09 0.38 0.58 -0.11 -0.0 -0.74 0.22 -0.28 0.06
0.04 -0.02 1.12 0.04 -2.4 0.45 0.59 0.11 -0.28 -0.38 0.28 0.57 -1.21 -1.89 -0.65 0.55 0.42 0.72 0.38 0.53 0.22 0.36 0.23 -0.35 0.18 -0.98 0.08 0.33 -0.18 0.36 -0.08 -0.1 -0.01 0.23 -0.1 0.27 -0.68 0.01 -1.02 -0.68 -1.28 -1.57 -0.57 -0.48 -0.62 -0.01 0.2 0.5
-0.55 -0.46 -0.36 -1.65 0.42 -1.03 -0.67 -0.77 0.1 0.19 -0.56 -0.63 0.05 -0.5 -0.03 -0.51 0.22 0.95 -0.07 0.1 0.1 0.28 -0.7 0.53 0.29 0.07 -0.55 -0.1 -0.29 0.16 -0.4 0.58 0.16 0.15 -0.68 -0.78 0.05 0.28 -0.36 0.39 0.52 0.67 0.6 0.37 0.23 0.3 -0.07 0.02
-3.06 -1.33 -0.75 -6.49 -3.69 -3.48 -5.45 -3.58 -6.85 -0.26 -3.48 -3.56 0.54 0.04 -0.44 -5.75 -0.6 2.5 -1.05 -0.09 -0.11 1.47 -1.76 0.98 -0.39 -0.72 -1.56 0.1 -0.66 -0.04 -0.49 -3.28 0.75 0.82 0.04 0.06 1.07 0.74 0.59 0.5 1.13 1.2 0.21 -0.2 0.44 0.52 -1.0 0.53
-1.22 -0.37 -0.4 -1.65 -0.12 -0.17 -1.54 -0.6 -0.58 0.01 -0.47 -0.29 0.2 0.35 0.05 0.08 0.41 -0.15 -0.01 0.17 -0.11 -0.04 0.52 -0.83 0.09 0.31 0.28 -0.01 0.26 -0.08 -0.07 0.05 0.11 -0.08 0.06 0.03 -0.03 0.42 0.04 0.14 0.47 0.49 0.27 0.18 0.15 0.51 -0.05 0.19
0.48 0.32 0.99 -0.21 -2.82 -1.04 -0.4 -0.84 0.4 -0.02 -1.01 -0.93 0.64 0.52 -0.31 0.18 -0.44 0.72 -0.23 -0.64 -0.92 -0.42 -1.71 -0.58 -0.44 -0.14 -0.8 0.35 0.19 0.5 -0.01 -0.32 -0.17 0.33 0.33 -0.19 0.02 0.98 0.07 0.06 -0.35 -0.07 0.23 0.02 -0.12 1.05 -0.08 0.15
-0.54 -0.32 -0.38 -2.13 -0.76 -0.04 0.78 0.86 0.29 0.48 -1.17 -1.43 0.2 -1.39 -0.1 -0.09 -0.21 -0.43 -0.3 -0.29 -0.05 -0.25 -1.82 0.57 0.29 -1.14 -0.2 -0.56 0.23 0.25 0.41 -0.58 -0.18 0.54 0.76 -0.87 0.04 0.08 -0.75 0.51 1.04 0.91 0.4 0.2 -0.05 0.18 0.12 -0.14
-0.68 -0.15 -0.59 -3.29 -0.01 0.07 0.7 -0.08 -0.4 0.16 -2.13 -2.04 -0.18 -0.99 -0.45 -0.74 0.9 -0.83 0.79 0.32 0.57 0.56 -1.32 -2.23 -0.25 -1.05 -1.94 -0.44 0.5 0.66 0.75 -0.25 -0.48 0.59 1.55 -2.24 -0.84 0.83 0.05 0.02 0.65 0.33 0.35 -0.31 -0.86 0.97 0.2 -0.14
0.18 -1.15 -0.11 -4.35 -0.91 -0.6 -0.59 -0.37 -0.3 0.46 -0.97 -1.1 0.23 -0.24 -0.04 -0.13 0.53 0.23 0.54 0.66 0.76 0.54 -2.53 -1.35 0.4 0.38 0.06 -0.23 -0.29 0.02 0.38 0.21 0.2 0.17 -1.38 -0.38 0.21 0.7 -0.84 0.3 0.46 0.37 0.13 0.26 -0.26 0.63 0.13 0.2
-0.58 -0.72 -0.36 -2.31 0.1 -2.08 -2.9 -2.53 -1.0 0.32 -0.83 -0.75 0.38 0.3 -0.05 -1.17 0.19 0.14 0.13 0.47 0.45 0.57 -0.32 -0.92 0.34 -0.31 0.15 0.31 0.23 0.24 -0.1 -0.06 0.17 0.41 -0.02 0.22 0.15 0.18 0.53 0.69 -0.05 -0.09 0.6 0.69 0.34 0.2 0.56 -0.2
-0.36 0.17 0.42 0.4 -1.02 -0.66 -0.46 -0.6 0.1 0.07 -0.33 -0.33 0.64 0.39 -0.39 0.08 0.51 0.34 -0.55 -0.66 -0.63 -0.13 -3.03 -0.06 0.39 0.64 0.52 -0.05 0.78 -0.0 0.39 -0.46 -0.04 0.17 0.21 -0.7 0.44 0.2 -0.23 -0.06 0.06 0.02 -0.07 -0.25 -0.34 0.25 -0.07 -0.22
-2.44 -1.56 -2.0 -2.68 0.29 -1.1 -1.68 -1.75 -2.97 0.12 -0.9 -1.1 0.12 0.7 -0.15 -1.46 0.51 -0.59 0.75 0.91 0.47 0.63 0.53 -1.21 0.12 -0.8 0.06 -1.27 -0.37 -0.13 -0.34 -0.15 0.27 -0.38 -1.4 -0.89 0.04 0.32 -0.42 0.83 1.66 1.36 1.06 0.44 0.25 0.39 -0.27 0.53
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-0.61 -1.25 -0.65 -2.7 0.6 -1.21 -1.74 -1.9 -1.27 0.08 -1.47 -1.67 0.33 0.27 0.14 -1.05 -0.04 -0.78 -0.06 -0.23 -0.37 -0.44 -0.78 -1.58 -0.57 -0.86 -0.72 0.15 0.07 0.33 0.29 -0.04 0.61 0.83 0.42 0.41 0.45 0.17 0.58 0.71 1.12 1.01 0.43 0.64 0.76 0.19 0.2 0.57
0.41 -0.35 -2.28 -3.07 -1.89 -1.57 -1.73 -1.75 0.3 0.32 0.38 0.18 -0.09 0.2 -0.22 -0.41 -0.87 -1.35 -0.68 -0.94 -1.1 -0.95 -1.39 -2.66 -0.47 -1.58 0.3 0.03 -1.18 -0.08 -0.52 0.65 0.46 0.31 0.43 -0.4 -0.12 0.92 0.37 0.66 1.42 1.14 1.55 0.15 0.96 0.97 -0.17 0.1
-0.18 -0.21 0.26 -2.79 -0.88 -0.62 -0.51 -0.67 -0.44 0.63 -2.24 -2.3 0.58 0.3 -0.36 0.03 -0.29 1.4 -0.33 -0.47 -0.32 0.73 -2.03 -0.76 0.09 -0.51 -0.66 -0.43 0.35 0.46 0.26 -1.82 0.33 0.28 -0.63 0.01 0.09 0.9 -0.51 0.62 0.3 0.43 0.28 0.52 0.21 0.88 0.35 -0.24
-0.99 -1.17 0.29 -2.56 -0.22 -0.31 -4.79 -1.71 -0.7 0.57 -2.4 -3.15 0.88 0.35 -0.62 1.15 0.44 2.12 -1.92 -0.39 -0.63 0.72 - 0.14 -0.91 -0.09 -1.54 -0.93 -1.55 0.2 -0.05 -2.0 0.4 0.12 -1.1 -1.96 0.58 0.02 -0.25 0.86 0.54 0.86 0.31 1.0 0.16 0.8 -0.03 0.58
-1.55 -0.28 0.21 -0.36 0.2 -0.54 -1.0 -0.8 -1.59 0.24 -2.81 -2.77 0.59 0.5 0.04 -1.09 0.42 0.28 0.72 0.78 0.61 0.36 -0.86 -1.55 0.48 -0.3 0.17 -0.43 -0.91 -0.14 0.01 -0.44 -0.06 -0.17 -1.43 -0.95 -0.13 0.85 -0.63 0.43 1.05 0.93 0.54 0.32 0.01 0.93 -0.03 -0.2
-0.94 -0.19 0.21 -1.88 1.06 -0.08 -0.65 -0.44 -1.26 -0.03 -4.66 -4.88 -0.66 -0.89 -0.35 -1.42 0.28 0.13 -0.1 -0.07 0.13 0.64 -0.82 0.65 0.8 -0.95 -0.98 -0.4 -1.43 0.23 0.18 -1.19 0.39 0.06 -1.65 -1.03 -0.35 0.56 -0.41 0.76 1.32 1.17 0.85 0.73 0.57 0.57 0.55 -0.28
-0.46 -0.53 -0.03 -1.17 -0.32 -0.86 -1.47 -1.33 -0.95 0.16 -1.99 -1.85 0.88 0.98 -0.12 -0.43 0.87 0.25 0.63 0.6 0.68 0.56 -1.15 -1.27 0.0 0.34 -0.56 -0.16 -0.53 -0.25 0.17 -0.51 0.07 -0.2 -0.79 0.2 0.11 0.59 0.24 0.34 0.36 0.46 0.4 0.07 0.07 0.75 0.03 -0.5
-0.82 -0.77 -0.82 -1.52 -0.19 0.1 -0.41 -0.33 -1.01 0.43 -0.14 -0.34 0.29 -0.0 -0.29 1.0 0.91 -0.17 0.99 0.56 0.39 0.28 0.55 -2.11 0.71 -0.57 0.92 -0.52 -0.98 -0.1 -0.11 0.36 -0.1 -0.23 -1.57 -1.23 0.08 0.42 -1.08 0.13 -0.18 0.27 0.22 0.0 -0.25 0.37 -0.22 0.16
-0.81 -0.6 -0.28 -1.61 0.37 -0.67 -1.0 -0.54 -1.47 0.42 -0.7 -0.91 0.07 -0.02 -0.09 -0.47 0.18 -0.32 0.42 0.48 0.06 0.2 -0.38 -1.48 -0.12 -0.52 -0.46 0.05 0.01 0.13 -0.05 0.28 0.32 0.34 -0.31 -0.73 0.13 0.42 -0.15 0.63 0.89 1.12 0.61 0.44 0.24 0.4 0.35 -0.3
-0.31 -0.98 -0.57 -3.05 0.33 -2.03 -2.62 -2.76 -3.37 0.18 -4.27 -4.4 0.36 0.5 -0.21 -2.31 0.39 -0.64 0.61 0.52 0.24 0.09 -1.25 -1.72 -0.06 -0.61 0.16 0.3 0.01 -0.05 0.24 0.03 0.69 0.59 -1.58 -1.03 0.57 0.62 -0.04 0.47 1.71 1.43 0.56 0.08 0.31 0.75 -0.2 0.43
-0.55 0.23 0.6 -0.53 -2.43 -1.09 -0.25 -0.75 -0.11 -0.26 -0.85 -1.03 0.28 -0.22 -0.63 0.14 1.14 0.85 0.89 0.99 0.59 0.24 -1.47 -0.65 0.3 0.56 0.06 -0.57 -1.17 0.01 -0.38 0.2 -0.51 0.04 -1.08 -1.04 -0.67 0.13 -0.47 -0.01 0.67 1.11 0.01 0.24 -0.38 0.05 0.04 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.