Heatmap: Cluster_241 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - 2.96 - - - - - 2.19 - - - - - - - 3.76 - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.08 - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - - - - 3.53 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.04 0.65 2.1 2.33 - - - - - - - -3.63 - 3.63 - - - - 0.63 - - 1.37 3.31 1.8 - - -1.64 - - - - - - - - - - 2.21 - - -0.17 - - - -1.51
- - - 3.33 - - - - - - - - - - -1.1 - 3.72 3.59 - - - - - - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.24 - - - - - - - - - - -0.19 - 2.81 - - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.36 1.62 3.93 1.0 - - - - - - - - - - - 2.19 - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.65 - - - - - - - - - - - - 4.52 1.64 - - - - - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.13 4.16 - - - - - - - - - - - - 3.66 0.73 - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.89 - - - - 3.52 - - - - - - - - 4.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.59 2.81 - - - - - - - - - - - - 3.28 - - - - - - 1.06 - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.2 1.66 2.93 - - - - - - - - - - - 3.16 3.32 0.83 - 1.83 -7.17 - - - - 3.56 - - - -10.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.55 - - - - - - - - - - - 4.0 - - - - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.54 2.22 1.09 - - - - - - - - - - 3.27 3.52 2.07 - - - - - - - 3.84 - - - -3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.88 2.73 - - - - - - - - - - 4.02 2.82 - - - - - - - - 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.26 2.46 - - - - - - - - - - -2.75 3.14 1.1 2.3 - - - - - 0.41 - 4.21 - - - -2.01 - - - 0.06 - - - 0.29 - - - - 1.52 - - - - -1.31
- - 2.16 3.53 -0.08 - - - - - - - - - - 4.4 2.88 - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.1 - - 1.86 0.27 - - 1.12 2.55 - - - - - -2.98 1.96 3.62 - - - - - - -0.22 2.67 2.53 - - - - - - - - - - - -0.34 - - - - - - - -0.34 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 1.82 4.42 - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.21 1.47 3.74 - - - - 3.83 - - - - - - - - 2.35 - - - - - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.55 2.06 1.29 -0.06 -1.98 -3.13 -2.94 -2.61 1.84 -6.31 -6.54 -3.64 -7.91 - -5.13 2.35 1.65 1.82 2.0 2.18 0.19 0.97 -2.27 1.31 -2.15 3.05 -2.46 -5.32 -3.89 -3.83 -7.46 -6.13 -5.66 -4.89 -5.25 -6.49 -5.36 -4.53 - -5.23 - -5.34 -5.11 -6.87 -7.49 -3.86 -6.39 -3.74
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.23 - - - - - 0.22 1.52 - - - -0.59 - 1.49 2.8 - - - - - - 3.49 3.44 - - 0.97 -2.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.13 - - - -0.08 - -1.77 3.54 3.15 - - - - - - - -0.14 3.66 - 0.51 0.18 -1.16 - - - - - - - - - 1.47 - 0.59 0.66 - - 0.72 - -
- - 1.38 - 0.88 - 3.19 - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - 2.55 - 4.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.16 - - - - - 0.67 - - - - -2.37 3.61 3.09 2.9 - 1.87 - - - 2.18 1.31 0.32 - - - -1.93 - - - - - - - 0.5 - - - - - - - - - -
- - 2.56 - - - - - - - - - - - -1.52 - 3.91 - - - - - - - - 4.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.82 2.59 1.64 - - - - - - - - - -2.6 - 3.86 1.51 - - - - - 0.94 - 4.14 - - - -4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.69 1.89 2.07 -0.62 - 1.66 - - - - - - - - 3.51 2.53 - - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.52 3.27 - - - - - - - - - - - - 3.67 1.12 - - - - - 1.36 - 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.18 -0.15 - - - 2.62 - - - - - -2.19 3.15 3.35 - - - - - - - - 3.16 - - - -2.41 - - - - - - - - - - - - - - - 1.8 - -
- - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 - - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.86 - - - - - - - - - - - - 3.27 3.3 - - - - - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.69
- 2.61 0.87 2.18 - - - - 1.7 - - - - - - 4.19 - -0.24 - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.42 3.7 - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.64 - -3.82 3.91 2.63 0.77 -0.16 -0.39 -0.2 -8.41 -7.34 -7.5 -5.44 - -4.17 -3.04 -5.75 -1.81 - -4.85 - -5.49 -4.17 1.84 0.69 3.96 -0.05 - -7.4 -7.68 -7.76 - -9.21 - -7.05 - - - - - -5.54 - - - - - - -5.42
- - 1.87 - - - - - - - - - - - -1.6 - 4.26 - - - - - - - - 4.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.13 0.4 3.15 - - - - - - - - - - - - 3.23 - - - - - - - - 3.43 - - - -3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.0 - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - 4.17 - - - 1.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.05 2.5 1.2 - - - - - - - - - - -2.65 - 3.96 -0.82 - - - - - - - 4.46 -0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.48 0.91 - - - - 2.87 0.0 - 0.91 - - -3.2 2.78 2.66 0.48 - - - - - 2.26 - 3.48 - - - -0.03 - - - - - - - - - - 1.57 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.07 1.54 - 0.92 - - - - - - - - - -1.1 - 4.14 - - - - - - - - 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.04 3.15 - - - - - - - - - - - - 2.47 1.6 - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.72 - - - - - - - - - - - 4.1 4.45 - - - - - - - - 2.48 - - - -2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.61 - 4.23 - - - - 3.93 - - - - - - - 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.96 - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.79 - - - - - - - - - - - - - 3.22 - - - - - - 2.01 - 4.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.71 - - - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.66 - 3.86 - - 2.17 - - - - - - 3.11 - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - -
-0.34 1.17 1.62 -1.09 -1.26 -3.94 - -3.07 1.44 -4.76 - - - - -4.85 0.66 1.14 2.35 0.54 1.44 -0.84 -0.98 -4.27 1.96 -1.07 4.09 -2.39 -4.56 -3.31 -2.32 - -3.6 -2.62 -2.71 -2.21 -1.59 -2.61 -3.97 - -4.58 -5.31 - -3.37 -4.36 -6.06 -4.24 -3.12 -1.75
- - - - - - - - - - - - - - - 3.6 4.13 - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.13 - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - 4.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.71 -0.18 2.14 0.86 - - - - - - - - - - 3.73 3.3 - - - - - - 0.55 - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.68 2.69 - - - - - - - - - - - 2.88 4.36 - - - - - - - - 2.2 - - 2.5 -2.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.37 2.98 - - - - 3.83 - - - - - - 3.4 2.38 - - - - - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.37 2.52 - 0.09 - - - - - - - - - - -1.75 3.47 4.12 1.26 - - - - - 0.37 - 2.83 - - - -1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.49 - 2.77 - - - - 2.48 - - - - - - 2.05 2.95 0.75 - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.64 - - - - - - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.12 3.14 - 2.09 1.64 - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.64 3.05 - - - - - - - - - - -1.8 3.84 3.43 - - - - - - - - 3.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.04 -0.59 - - - - 2.04 - - - - - - 3.67 3.85 0.64 - - - - - - - 3.37 - - - -3.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.94 3.9 - - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.72 3.11 - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.04 2.1 1.32 3.26 -1.49 0.47 0.46 -0.51 0.55 -2.6 -5.0 -3.0 -3.08 -3.43 -3.64 2.43 0.2 1.55 0.44 -1.06 -0.85 -0.34 -1.21 -2.08 0.39 -0.77 -1.52 -2.14 -1.61 -1.5 -1.77 -2.96 -2.64 -1.82 -2.31 -3.28 -1.93 -0.69 -3.25 -2.42 -2.12 -0.95 -2.03 -0.94 -2.09 -1.03 -1.34 -2.65
3.84 - - 3.15 - - - - - - - - - - - - 1.72 1.73 - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.06 - - - - - - - - - - - 4.93 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.92 3.44 0.13 0.31 -0.2 - - -1.05 - - -0.77 - -3.21 4.17 2.72 -1.03 - - - - - 0.13 - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.45 - -
4.07 - 1.77 3.79 2.33 - - - - - - - - - -1.64 - 2.37 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.56 -0.22 -1.04 1.64 -0.66 0.5 -1.05 -0.59 0.6 -1.31 -1.15 -1.69 -0.57 -0.46 -2.0 0.47 2.42 1.53 -0.89 0.23 0.5 0.76 -2.12 -0.56 0.95 3.47 0.68 -3.43 -4.3 -2.45 -2.49 -1.65 -1.87 -1.96 -3.84 -2.82 -1.84 -1.6 -2.72 -2.53 -3.46 -2.92 -2.37 -2.48 -0.41 -1.6 -2.76 -1.92
- 3.74 - 3.83 -0.62 - - - - - - - - - -1.25 - 3.58 1.7 - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.43 - - - - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - 4.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.42 - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.89 - - - - 3.94 - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.7 1.7 - - - - - - - - - - -1.63 - 4.06 1.85 - - - - - - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.52 2.51 - - - - - 2.47 - 4.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.45 - 1.36 2.2 - - - - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - 3.91 - - - -0.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.16 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.87 2.63 - - - - 1.27 - - - - - - - 3.25 - - 3.01 - - - - -0.63 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.48 0.77 - - - - - - - - - - -5.77 - 1.98 0.75 - - - - - - - 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.8 - - - - - - - - - 4.18 - - - 1.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.97 - - - - 5.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.82 - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.35 2.26 - - - - - - - - - - - - 3.78 - - - - - - - - 4.61 - - 0.89 - - 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.22 - - - - - - 3.33 - 4.76 - - - 0.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.0 - 3.57 - - - - 3.62 - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.78 2.86 0.4 - - - 3.43 - - -0.97 - - -2.92 - 1.14 0.78 - - - - - -0.06 - 2.86 -0.47 - 2.54 -3.42 - - - - 0.18 - - - - - - - 1.78 - - - - 0.24
- 3.0 - 3.57 - - - - 3.62 - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.19 1.45 - - 2.36 - - - - -0.14 - - - 1.73 3.63 2.25 - 0.28 - - - 1.38 - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.27 2.74 1.09 1.67 1.44 -0.24 - 1.97 2.59 - - - - - - 1.72 2.44 0.23 - - - - - - - 2.95 - - - -3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.34 - - - - - - - - - - - 3.62 1.74 - - - - - - - 4.86 - - - -0.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-19.08 2.18 2.68 -0.9 -5.31 0.56 -17.23 -2.26 1.71 - - - -0.81 0.41 -3.71 -0.91 2.79 0.98 - -3.03 - -14.36 -5.98 1.44 - 3.51 - - -1.43 -2.29 - -10.42 -27.2 - -11.82 -6.65 0.01 -1.16 -27.24 -26.35 -25.25 1.62 -16.94 -0.88 -32.01 -2.14 - -25.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.