Heatmap: Cluster_239 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_16170V3.1	-1.62	-0.74	-0.04	-0.43	0.81	-0.34	-0.48	-0.71	-1.85	0.4	-0.49	-0.66	-0.05	-1.62	0.39	-0.81	0.12	-0.33	-0.05	0.06	0.39	0.51	-2.32	0.29	0.13	-0.32	-0.72	0.71	0.56	0.28	0.56	0.1	0.47	0.73	-0.04	0.75	0.49	0.08	0.07	-0.34	-0.86	-0.82	-0.6	0.28	0.09	0.02	0.66	0.36
Pp3c11_25820V3.1	-0.48	-1.11	-0.46	-2.48	1.6	-0.03	-0.67	-0.55	-1.07	0.12	-0.72	-1.16	-0.33	-0.7	0.4	-0.93	0.01	0.7	0.07	0.72	0.31	0.71	-1.89	1.64	0.96	0.42	0.07	-0.78	-1.34	-0.22	-0.61	-0.25	-0.3	-0.17	-1.64	-1.51	-0.27	0.16	-0.28	0.2	0.56	0.57	0.33	0.33	-0.24	0.04	0.04	-0.29
Pp3c12_1780V3.1	-0.28	-1.0	0.05	-1.88	0.94	0.33	0.56	0.49	-0.2	0.43	0.21	-0.24	0.13	-1.05	0.36	-0.47	-0.32	-0.2	-0.58	0.09	-0.0	-0.25	-4.46	0.43	1.05	0.7	0.69	-0.1	0.21	-0.27	0.37	0.37	0.0	-0.22	0.75	0.52	0.53	-0.38	-1.32	-0.38	-0.71	-1.14	-0.31	-0.29	-0.74	-0.41	-0.33	-0.21
Pp3c12_18170V3.1	-1.17	-1.89	-0.69	-0.97	1.67	1.19	0.87	0.94	-1.53	0.22	-2.9	-2.89	0.2	-0.39	0.32	-1.49	-0.48	-1.02	0.25	0.41	0.62	0.16	-1.4	0.95	0.34	-0.67	0.23	0.42	-1.01	-0.09	0.12	-0.34	0.21	0.09	-1.31	0.18	0.52	0.2	-0.61	-0.11	-0.41	-0.63	0.08	-0.03	-0.12	0.2	-0.12	-0.13
Pp3c13_1310V3.1	-0.56	-0.58	-0.15	-0.55	0.61	0.23	0.33	0.06	0.17	0.22	-0.3	-0.3	0.03	-0.46	0.16	0.12	0.31	0.13	-0.05	0.25	0.01	0.01	-1.87	0.68	0.79	0.24	0.69	-0.11	0.32	-0.23	0.35	-0.14	-0.1	-0.2	0.32	-0.13	0.08	0.17	-0.91	-0.47	-0.35	-0.51	-0.31	-0.42	-0.41	0.18	-0.19	-0.18
Pp3c13_18230V3.1	-1.86	-2.03	-0.46	-0.54	1.89	1.35	1.05	0.9	-2.08	0.45	-1.17	-1.42	0.21	-0.69	0.25	-1.09	-1.06	-1.24	0.03	0.31	0.63	0.38	-2.07	0.64	0.37	-1.14	0.23	-0.13	-1.15	-0.48	0.02	0.42	0.42	-0.11	-0.66	0.59	0.36	0.12	-0.85	-0.45	-0.52	-0.93	-0.21	-0.27	0.14	0.1	-0.22	-0.26
Pp3c14_8750V3.1	-0.92	-1.53	-0.36	-2.49	1.55	-0.4	-0.82	-0.94	-1.56	0.91	-2.11	-2.53	-0.48	-2.03	0.6	-2.01	0.14	-0.29	-0.24	0.17	0.42	0.44	-2.31	-1.21	0.48	-1.01	-1.08	1.03	0.4	0.2	0.8	-0.13	0.53	1.08	0.59	0.87	0.73	0.32	0.01	-0.52	-1.83	-1.58	-0.27	0.15	0.09	0.29	0.94	0.03
Pp3c15_14660V3.1	-1.96	-0.15	-0.04	0.79	1.41	0.52	0.11	0.16	-0.59	0.25	-0.33	-0.38	0.03	-0.99	-0.4	-1.31	-0.05	-0.25	0.24	0.18	0.17	0.28	-0.82	0.85	0.66	0.27	0.93	0.26	-0.1	-0.28	-0.23	0.19	-0.22	-0.07	-0.52	0.09	-0.29	-0.12	-0.69	-0.2	-1.35	-1.12	-0.17	-0.05	-0.44	-0.18	0.49	-0.37
Pp3c16_10570V3.1	-	-2.6	-1.44	-4.91	-0.93	-1.54	-1.53	-1.5	-0.53	1.01	-4.1	-2.87	1.63	0.8	-0.07	-	-1.47	-0.08	-1.54	-0.65	-4.28	-1.28	-	2.31	1.2	0.01	0.94	0.16	-0.02	-0.72	1.3	0.63	0.27	0.63	-0.43	0.28	1.33	0.47	-1.29	0.3	0.34	-0.28	0.07	-1.06	-0.53	0.35	-0.13	-0.38
Pp3c17_1180V3.1	-1.3	-0.9	0.25	-3.28	2.02	0.19	-0.03	0.35	-1.1	0.06	-1.69	-1.45	0.35	0.31	0.14	-1.83	-0.49	-0.46	-0.26	-0.13	0.25	0.24	-1.43	1.3	1.05	-0.13	1.54	-0.51	-1.0	-0.55	-0.3	-0.98	-0.42	-0.43	-0.56	-0.22	-0.17	0.33	-0.52	0.13	0.36	0.24	0.23	-0.22	-0.48	0.32	-0.93	-0.28
Pp3c17_6470V3.1	-1.22	-0.96	0.18	-2.51	1.29	0.52	0.69	0.57	-0.94	0.36	-0.83	-0.86	0.41	-0.01	0.06	-1.28	-0.41	-0.28	0.39	0.61	0.36	0.23	-1.73	0.32	0.34	0.11	-0.05	0.16	-0.04	-0.06	0.09	-0.46	0.09	-0.03	0.12	0.15	0.12	0.13	-0.61	-0.16	0.09	0.03	0.05	-0.32	-0.18	0.12	-0.26	-0.31
Pp3c18_13930V3.1	-1.2	-0.98	-0.43	-1.31	1.08	0.04	-0.08	-0.01	-0.55	0.14	-0.75	-0.89	0.01	-0.21	0.11	-0.39	-0.55	-0.57	0.13	0.47	0.51	0.34	0.65	1.13	0.87	-0.45	0.9	-0.03	-0.06	-0.34	0.3	-0.8	-0.13	-0.06	0.33	-0.22	0.27	-0.06	-0.59	-0.11	-0.09	-0.24	-0.0	-0.14	-0.31	-0.07	-0.36	-0.06
Pp3c18_4410V3.1	-0.73	-0.94	-0.44	-0.22	0.95	0.69	0.64	0.56	-0.48	0.46	-0.49	-0.66	0.31	-0.45	0.12	-0.29	-0.44	-0.41	-0.08	0.05	-0.15	-0.18	-3.4	0.52	0.82	-0.02	0.93	0.35	0.07	-0.16	0.52	0.13	0.15	-0.04	0.06	0.4	0.56	0.12	-0.95	-0.68	-0.69	-0.96	-0.42	-0.43	-0.64	0.04	-0.23	-0.17
Pp3c18_8900V3.1	-0.65	-0.33	0.59	-0.9	1.48	0.76	0.95	0.73	-0.69	0.01	-0.33	-0.62	0.15	-0.1	-0.38	-0.02	-0.63	-0.35	-0.29	-0.07	0.22	0.51	-1.87	0.64	1.02	-0.49	0.95	-0.46	-0.35	-0.67	-0.33	-0.46	-0.43	-0.2	-0.35	-0.17	-0.53	-0.04	-0.66	0.1	0.47	-0.0	0.09	-0.41	-0.5	0.0	-0.73	-1.22
Pp3c19_14100V3.1	-1.11	-0.24	0.22	0.45	0.47	0.34	0.2	0.27	-0.73	0.37	0.68	0.55	-0.5	-3.12	0.13	-0.74	0.35	0.19	0.31	0.26	0.11	0.33	-2.87	-1.08	0.53	-0.01	0.25	0.3	0.99	-0.21	0.5	0.48	-0.03	0.03	-0.1	0.25	0.42	0.08	-1.34	-1.24	-1.77	-2.49	-0.63	-0.15	-1.11	0.14	0.46	0.1
Pp3c19_6480V3.1	-2.18	-1.4	-0.08	-0.91	1.25	0.81	0.78	0.67	-2.01	0.42	-0.98	-1.14	0.32	-0.57	0.2	-1.84	-1.29	-1.41	0.09	0.28	0.36	0.31	-2.06	1.0	0.66	-0.74	0.65	0.3	-0.48	-0.19	0.36	0.32	0.39	0.13	-0.58	0.57	0.6	-0.1	-0.54	-0.26	-0.53	-0.79	-0.06	0.01	-0.11	-0.08	0.14	-0.14
Pp3c1_12020V3.1	-0.87	-1.42	-1.38	-2.7	0.63	-0.77	-0.81	-0.59	-1.39	0.58	-1.32	-1.61	0.15	-0.64	0.46	-1.78	0.07	0.58	0.49	1.03	0.43	0.54	-3.66	0.84	1.04	0.29	0.46	-0.15	0.39	-0.15	0.38	-0.15	0.09	-0.3	-1.47	-0.28	0.48	0.03	-0.57	0.04	0.61	0.47	0.31	0.11	-0.13	0.02	0.07	0.18
Pp3c1_14920V3.1	-0.51	0.14	0.09	-1.49	1.06	1.06	0.53	0.65	-0.75	0.2	0.26	0.25	0.04	-1.66	0.04	0.08	-0.04	0.42	0.17	0.25	0.33	0.51	-2.23	0.86	0.86	0.78	0.67	-0.16	-0.5	-0.4	0.03	-0.06	-0.49	-0.47	-1.05	-0.63	-0.08	0.1	-1.51	-0.71	-0.88	-1.22	-0.42	-0.38	-1.02	0.18	-0.38	-0.3
Pp3c1_22900V3.1	-0.63	-0.79	-0.16	-2.64	1.29	0.31	0.28	0.33	-0.47	0.21	-1.27	-1.38	0.43	0.45	0.4	-0.91	-0.78	-0.84	0.5	0.72	0.61	0.49	-1.02	0.44	0.26	-1.03	0.39	-0.21	-0.54	-0.14	-0.07	-0.25	0.03	-0.26	-0.66	-0.37	0.14	0.11	-0.61	0.25	0.75	0.36	0.3	-0.03	-0.03	0.01	-0.48	-0.11
Pp3c20_23730V3.1	-0.99	-0.37	-0.57	-2.31	0.57	-0.91	-0.85	-0.78	-1.01	0.03	0.84	0.58	0.41	-0.1	-0.36	0.16	-1.15	0.19	-2.39	-1.28	-0.41	-1.03	-2.94	2.11	1.04	0.02	1.26	-0.27	0.09	-0.45	0.07	0.51	-0.1	0.12	-0.44	0.02	0.28	0.31	-0.51	-0.25	-0.09	-0.1	-0.13	-0.17	-0.34	0.43	-0.3	-0.15
Pp3c20_3440V3.1	-1.72	-1.15	0.79	-2.05	1.48	0.32	0.74	0.77	-1.07	0.12	-0.12	0.2	0.24	-0.07	-0.03	-1.23	-1.24	-0.85	0.09	0.25	0.03	0.1	0.03	0.83	0.51	-0.47	0.54	0.28	-0.87	0.06	0.02	-0.34	-0.04	-0.36	-0.49	-0.68	-0.0	0.26	-0.89	-0.04	0.12	-0.05	0.04	-0.3	-0.55	0.2	-0.36	0.09
Pp3c21_19780V3.1	-0.91	-0.04	0.03	-0.68	-0.04	0.47	0.35	0.56	-0.81	0.43	-0.47	-0.48	-0.68	-2.42	0.13	-1.2	-0.08	-0.56	0.42	0.36	0.29	0.08	-0.89	0.22	0.39	-1.06	0.55	0.45	0.32	0.09	0.59	0.57	0.35	0.26	0.02	0.59	0.31	0.07	-0.91	-0.64	-1.05	-1.55	-0.22	0.1	-0.43	0.19	0.59	0.38
Pp3c22_15010V3.1	-3.53	-	-3.76	-4.87	-1.23	-2.79	-3.17	-1.99	-	0.43	-1.22	-0.85	0.85	0.78	-0.16	-1.19	-0.08	2.34	-0.39	-0.11	-1.78	-1.62	-2.68	2.43	2.05	0.05	2.05	-0.6	-1.01	-1.11	-0.22	-0.47	-0.53	-1.1	-1.3	-1.51	-0.09	0.97	-2.11	-0.53	0.23	-1.76	-0.19	-1.98	-0.82	1.02	-3.93	1.21
Pp3c22_3810V3.1	-1.62	-1.53	0.16	-0.49	1.32	-0.52	-0.63	-0.64	-0.39	0.24	-0.3	-0.4	0.33	0.15	0.04	-0.96	-0.28	-0.39	0.24	0.3	0.25	-0.06	-1.76	0.38	0.5	-0.32	0.39	-0.14	0.26	-0.21	0.03	-0.1	0.33	0.28	0.01	0.18	0.33	0.34	-0.21	-0.07	0.03	0.12	-0.07	0.25	0.22	0.22	-0.04	-0.14
Pp3c22_6150V3.1	-0.38	-1.22	-0.18	-1.24	1.28	0.48	0.52	0.53	-0.38	0.28	-1.11	-1.16	0.13	-0.45	0.22	-1.89	-0.69	-0.36	-0.31	0.25	0.43	0.2	-1.39	0.72	0.76	-0.37	0.84	0.16	0.0	-0.11	0.37	0.14	0.16	-0.04	-0.28	0.08	0.59	-0.02	-0.88	-0.26	-0.09	-0.58	-0.01	-0.17	-0.3	-0.1	-0.13	0.06
Pp3c23_17640V3.1	-1.21	-2.04	-0.82	-3.9	1.29	0.08	-0.13	-0.27	-1.35	-0.03	-0.6	-0.81	-0.6	-1.69	-0.31	-1.55	-0.02	-0.87	0.5	0.79	0.93	0.85	-0.26	0.32	0.65	-0.58	0.51	0.67	0.32	-0.09	0.22	0.57	0.31	0.46	-0.3	0.73	0.48	-0.16	-0.46	-0.21	-1.0	-1.25	-0.04	0.19	-0.14	-0.22	0.47	0.01
Pp3c24_15860V3.1	-0.95	-0.92	-0.06	-2.79	1.54	0.84	1.21	1.45	-1.41	0.35	-3.47	-3.37	-0.52	-1.3	0.27	-0.42	-0.62	-1.0	0.54	0.61	0.54	0.38	-1.21	0.92	0.36	-1.79	0.01	0.59	-1.39	0.05	0.36	-0.59	0.31	0.11	-2.31	-0.28	0.18	0.25	-0.93	0.08	-0.72	-1.18	0.42	0.02	-0.14	0.06	0.14	-0.28
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Pp3c9_8630V3.1	-1.9	-1.34	-0.48	-2.5	1.32	-0.8	-0.63	-0.66	-1.61	0.42	0.43	0.36	-0.01	-0.09	0.54	-1.31	-0.71	-0.68	0.29	0.83	1.03	0.8	-0.74	1.24	0.61	-0.47	0.37	-1.1	-1.49	-0.25	-0.49	-0.45	0.1	-0.32	-2.13	-1.5	-0.17	0.35	-0.85	0.55	0.77	0.76	0.49	-0.01	-0.03	0.31	-0.35	-0.06
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.