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Heatmap: Cluster_246 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.89 0.35 1.35 -2.55 -0.58 -0.15 -0.35 -0.38 1.04 -1.17 0.05 0.09 -1.09 -0.92 -1.12 -0.74 0.98 0.25 0.93 0.39 0.01 0.27 1.95 -0.89 -0.42 -1.25 0.04 -0.24 -0.12 -0.12 -0.53 0.31 -0.38 0.01 -0.2 -1.0 -0.52 -0.06 -0.67 0.16 -0.84 -0.79 -0.22 -0.13 -0.37 -0.03 -0.45 -0.68
0.31 0.82 1.83 0.47 -2.16 -1.18 -1.06 -1.0 0.17 -0.75 -1.61 -1.59 -0.91 -0.89 -1.32 0.1 0.73 0.35 1.53 1.22 0.67 0.28 2.14 -1.7 -0.69 -0.88 -0.46 -0.2 -0.41 0.09 -0.53 -0.17 -0.36 -0.02 -0.69 -0.72 -0.85 -0.13 -1.07 -0.25 -1.11 -0.71 -0.31 -0.26 -0.71 -0.04 -0.19 -0.47
0.24 0.6 1.11 -1.82 -1.2 -0.18 -1.02 -1.11 0.59 -0.62 -2.38 -2.81 -0.12 -0.06 -0.74 -0.34 0.04 -0.17 1.55 0.87 0.74 0.84 1.17 -0.53 -0.52 -1.19 -1.33 0.23 -0.02 0.07 -0.13 -0.56 -0.35 -0.1 -0.07 -0.57 -0.13 0.51 0.12 0.01 -0.37 -0.2 0.13 -0.02 -0.36 0.53 -0.3 -0.16
0.75 0.89 1.56 -0.31 -2.34 -2.35 -2.64 -2.64 0.41 -1.11 -2.87 -2.95 -0.48 0.12 -1.44 0.39 1.08 1.13 1.17 0.83 0.6 0.6 1.6 0.98 -0.65 -1.02 -1.78 0.0 -0.67 0.09 -0.61 -0.96 -0.41 -0.16 -0.6 -0.75 -0.49 -0.22 0.09 -0.2 -0.49 -0.26 0.03 -0.32 -0.29 -0.24 -0.48 -0.6
1.12 1.11 0.69 -1.08 -3.29 -2.27 -1.85 -1.79 1.1 -0.46 -1.13 -1.42 0.06 0.46 -0.22 0.97 0.68 0.65 1.1 0.91 0.55 0.63 1.27 -1.29 -0.93 -0.12 -0.67 -0.18 -0.04 -0.08 -0.76 -0.12 -0.22 -0.12 -0.18 -0.71 -0.76 -0.41 -0.07 -0.32 -0.72 -0.64 -0.02 -0.7 -0.19 -0.41 -0.43 -0.44
-0.3 0.85 2.14 1.45 -2.25 0.24 0.27 0.32 0.36 -0.79 -1.4 -1.26 -1.79 -3.14 -1.16 -0.15 1.43 0.44 1.07 0.58 0.72 0.42 2.74 -0.87 -0.87 -1.37 -1.03 -0.72 -0.17 -1.0 -0.85 -0.44 -0.96 -0.57 -1.06 -0.49 -1.0 -0.63 -2.08 -1.73 -3.04 -2.49 -1.17 -1.11 -1.31 -0.67 -0.62 -1.1
0.85 0.76 1.21 -0.85 -2.65 -1.77 -1.65 -1.64 0.4 -0.38 -0.99 -0.91 0.15 0.2 -0.35 0.13 0.41 0.52 0.88 0.83 0.4 0.26 1.58 -0.26 -0.6 -0.7 -1.21 -0.3 -0.33 -0.09 -0.32 -0.01 -0.24 -0.12 -0.38 -0.5 -0.26 0.2 -0.24 0.01 -0.31 0.12 0.09 -0.1 -0.39 0.23 -0.19 -0.4
0.14 0.64 0.89 -0.15 -1.65 -1.05 -1.27 -1.34 0.02 -0.39 -1.39 -1.26 -0.2 -0.35 -0.64 0.29 0.6 -0.05 1.5 1.21 0.9 0.75 2.22 -1.36 -0.17 -1.12 -0.51 -0.32 -0.85 -0.16 -0.46 -0.36 -0.15 -0.03 -0.12 -0.67 -0.55 0.0 -0.82 -0.2 -0.93 -0.59 -0.13 -0.38 -0.29 0.11 -0.24 -0.57
0.27 0.57 1.44 -1.92 -2.93 -0.23 0.28 0.09 0.38 -0.63 0.17 0.2 0.04 0.32 -0.73 0.19 1.09 0.32 0.76 0.55 0.27 -0.21 2.12 -0.82 -0.63 -0.24 -0.62 -0.2 -0.9 -0.71 -0.7 0.43 -0.66 -0.62 -0.6 -0.35 -0.55 -0.04 -0.46 -0.52 -0.69 -0.69 -0.76 -0.7 -0.76 0.12 -0.6 -0.76
0.19 0.6 1.49 -1.25 -2.2 -1.27 -0.31 -0.34 0.54 -0.66 -0.35 -0.22 -0.38 -0.16 -0.91 0.26 0.94 0.94 0.68 0.64 0.23 -0.11 2.44 0.54 -0.78 -0.23 -0.83 -0.28 -1.43 -0.37 -1.06 -0.44 -0.73 -0.39 -0.5 -0.78 -1.0 0.06 -0.89 -0.27 -0.73 -0.46 -0.34 -0.23 -0.54 0.06 -0.62 -0.53
-0.42 0.28 0.65 0.85 0.44 0.01 0.25 0.22 -0.45 -0.45 -0.39 -0.49 -0.71 -0.93 -0.72 -0.63 0.89 0.16 0.88 0.73 0.77 0.69 1.47 0.17 -0.25 -0.96 -0.37 -0.32 0.09 -0.27 -0.48 -0.3 -0.08 -0.27 -0.58 -0.3 -0.72 -0.16 -0.66 -0.33 -0.5 -0.41 -0.14 -0.4 -0.27 -0.18 -0.31 -0.4
-0.74 0.63 1.14 2.83 0.86 0.95 0.17 0.46 0.04 -1.8 -3.75 -3.92 -2.45 -2.49 -1.9 -0.95 0.43 0.97 0.9 0.98 0.58 0.25 2.7 -1.32 -0.5 -2.08 -1.17 -1.38 -1.83 -1.09 -1.21 -1.66 -1.14 -1.39 -3.05 -2.47 -1.75 -1.08 -1.96 -0.33 -0.84 -0.6 -0.42 -0.05 -0.95 -1.06 -0.9 -1.75
0.33 1.21 2.07 -0.06 0.16 0.72 1.07 1.54 0.8 -1.66 -1.8 -1.07 -2.21 -1.74 -0.31 0.42 0.81 0.98 1.06 0.79 0.45 0.1 2.33 -0.29 -1.31 -0.32 -2.15 -1.32 -1.17 -0.35 -1.53 -2.41 -1.32 -1.79 -1.7 -1.37 -1.5 -1.05 -2.11 -1.21 -1.46 -0.89 -0.85 -1.04 -1.3 -1.02 -1.0 -1.32
1.43 1.46 1.06 0.65 -3.43 -1.59 -1.04 -0.97 1.18 -0.82 -1.7 -2.0 -0.56 -0.41 -0.93 0.72 0.61 0.82 0.86 0.13 0.48 0.17 2.61 -0.28 -0.88 -0.59 -1.43 -0.35 -0.29 -0.3 -0.62 -0.64 -0.6 -0.39 -0.21 -0.54 -0.89 -0.78 -1.08 -1.09 -1.24 -0.95 -0.82 -1.18 -1.11 -0.79 -0.72 -0.15
0.9 0.9 1.44 1.93 -0.25 0.43 -0.15 0.3 0.56 -1.19 -1.45 -1.33 -0.33 0.25 -0.89 0.53 0.75 0.33 0.8 0.56 -0.33 -0.48 2.33 -1.25 -1.46 -1.12 -2.02 -1.27 -0.71 -0.44 -1.23 -1.14 -1.23 -0.9 -1.24 -1.62 -1.61 -0.03 -1.11 -0.14 -0.79 -0.58 -0.11 -0.54 -0.82 0.06 -0.85 -0.89
0.05 0.47 0.94 0.22 -0.08 -0.79 -0.7 -0.77 0.14 -0.71 -1.15 -1.38 -0.61 -0.86 -0.9 -0.19 0.5 0.43 0.6 0.8 0.22 0.37 1.89 0.37 -0.5 -1.6 -1.73 0.08 -0.26 -0.1 -0.32 -0.14 -0.16 -0.09 -0.32 -0.59 -0.12 0.21 -0.23 0.11 -0.65 -0.07 0.33 0.13 0.09 0.29 -0.1 -0.36
0.73 0.64 0.62 0.23 -1.62 -1.22 -1.82 -1.89 0.0 -0.4 -1.17 -1.31 -0.57 -0.55 -0.42 0.42 0.32 0.68 0.82 0.63 0.62 0.47 2.07 -1.08 -0.09 -0.94 -1.0 0.03 0.19 0.2 -0.1 -0.38 -0.15 0.05 0.03 -0.51 -0.4 0.2 -0.45 -0.2 -1.01 -0.41 -0.24 -0.11 -0.28 0.27 0.13 -0.57
0.66 0.53 1.25 -0.25 -2.2 -0.6 -0.57 -0.55 0.53 -0.23 -2.12 -2.49 0.32 0.06 -0.3 -0.46 -0.11 0.45 1.07 0.94 0.68 1.01 1.16 -0.37 -0.37 -1.18 -1.66 0.01 0.13 0.18 -0.2 -0.65 -0.37 -0.03 0.03 -0.15 -0.05 0.19 -0.56 -0.2 -0.81 -0.58 0.07 -0.38 -0.63 0.26 -0.36 -0.38
0.27 0.45 1.19 -1.31 -0.53 -0.07 -0.77 -0.88 0.06 -0.89 -2.28 -2.48 -0.59 -0.68 -0.24 -0.28 0.74 0.38 1.43 1.09 0.89 0.82 1.66 -0.53 -1.0 -1.14 -1.48 0.02 -0.11 0.34 -0.5 -0.56 -0.25 0.08 -0.39 -0.39 -0.49 0.2 -0.37 -0.17 -1.59 -0.97 0.03 -0.04 0.08 0.21 -0.06 -0.09
-1.16 -0.23 0.77 -0.93 -0.09 1.02 0.24 0.27 -0.2 -0.03 -0.01 0.02 0.01 -0.14 -0.3 -0.76 0.45 0.01 0.5 0.67 0.49 0.54 1.53 -0.9 0.37 -0.68 0.34 -0.1 -0.51 -0.39 -0.51 -0.49 -0.19 -0.17 -0.85 0.01 -0.47 -0.04 -0.56 -0.24 -0.31 -0.4 -0.03 -0.34 -0.4 -0.03 -0.38 -0.14
0.49 0.39 0.69 -1.77 0.74 -0.88 -1.05 -0.86 0.23 -0.68 -0.83 -1.07 -0.13 0.07 -0.66 -0.39 0.25 -0.44 0.99 0.95 0.52 0.46 1.92 -1.6 -0.57 -1.0 -0.96 -0.04 -0.04 -0.15 -0.46 -0.3 -0.12 0.04 -0.05 -0.25 -0.29 -0.06 0.03 0.05 -0.54 -0.26 0.21 0.03 0.11 -0.01 -0.18 -0.22
0.8 0.69 1.37 0.28 -1.83 0.19 -1.05 0.31 -5.15 -1.2 -0.19 -0.63 0.05 0.38 -1.76 0.81 1.02 -0.46 -0.01 0.96 0.63 0.05 2.85 1.84 -0.04 -0.67 -1.08 -3.56 -4.74 -2.61 - -1.08 -6.21 -5.74 - -4.95 - -1.37 - -2.27 1.61 1.72 -0.33 -4.07 -3.66 -0.45 -4.17 -0.47
0.23 0.45 1.36 0.06 -0.08 0.44 0.24 0.3 0.96 -0.73 -1.98 -2.0 -0.58 -0.57 -0.7 -0.9 1.49 0.58 0.59 0.69 0.23 0.15 2.5 -0.94 -0.39 -0.03 -0.76 -0.52 -1.72 -0.6 -1.3 -0.43 -0.79 -0.53 -0.95 -0.69 -1.16 -0.38 -0.85 -0.57 -0.69 -0.78 -0.52 -0.51 -0.49 -0.23 -0.45 -0.26
0.16 0.91 1.05 0.48 -1.17 -0.59 -0.6 -0.67 0.23 -0.76 -1.85 -1.82 -0.32 0.21 -0.75 0.21 0.2 0.73 0.55 0.01 -0.23 0.12 2.65 0.46 -0.84 -1.18 -1.35 -0.39 -0.26 -0.05 -0.72 -0.78 -0.53 -0.21 -0.33 -0.76 -0.68 0.17 -0.26 -0.05 -0.4 -0.23 -0.05 -0.44 -0.56 0.2 -0.62 -0.35
-0.12 0.09 1.27 -1.66 -1.13 -0.1 -0.28 -0.01 0.27 -0.51 -1.71 -1.79 -0.23 0.19 -0.72 -0.25 0.25 0.27 1.27 0.93 0.93 0.67 1.19 -0.26 -0.22 -0.89 -0.32 -0.08 -0.7 0.06 -0.79 -0.38 -0.49 -0.07 -0.62 -0.46 -0.73 0.47 -0.34 0.1 -0.29 0.1 0.11 -0.15 -0.27 0.52 -0.35 -0.22
1.08 1.23 1.28 -1.2 0.22 -0.16 -0.25 0.04 1.58 -0.6 -1.21 -1.34 -1.4 -3.6 -0.43 0.58 1.14 -0.55 0.97 0.58 0.31 -0.22 2.26 -2.35 -0.52 0.15 -0.49 -0.02 -0.3 -0.05 -0.61 -0.18 -0.78 -0.01 -0.57 -0.46 -0.71 -0.39 -1.84 -1.57 -2.83 -3.36 -1.08 -0.55 -1.55 -0.32 -0.2 -0.1
0.49 0.53 0.67 0.81 -2.48 -1.23 -0.61 -0.8 0.14 -0.22 -1.28 -1.36 -0.32 -1.34 -0.36 0.42 0.21 0.63 0.56 0.77 0.69 0.35 0.79 1.47 -0.18 -0.56 -0.31 0.09 0.11 0.07 -0.3 -0.14 -0.44 0.05 -0.21 0.16 -0.26 0.31 -0.79 -0.48 -1.45 -1.04 -0.34 -0.06 -0.72 0.27 -0.13 -0.19
-0.23 -0.05 0.45 1.22 -2.15 -0.44 -1.43 -0.87 -1.74 -0.11 -0.18 -0.08 0.1 0.32 -0.3 0.05 0.83 0.52 0.49 0.59 0.41 0.39 1.13 0.44 0.03 -0.13 -0.3 -0.57 -0.33 -0.32 -0.63 -0.33 -0.37 -0.32 -0.97 -0.28 -0.73 0.24 -0.19 -0.1 0.02 0.42 0.02 -0.07 -0.21 0.31 -0.41 -0.09
0.43 0.72 1.24 1.19 0.19 0.22 0.53 0.62 0.81 -0.75 -1.17 -0.97 -0.22 -0.56 -0.66 -0.08 0.95 0.4 0.39 0.35 -0.02 -0.14 1.41 -0.11 -0.47 0.18 -0.42 -0.38 -0.93 -0.03 -0.68 -0.59 -0.73 -0.42 -0.72 -0.54 -0.58 -0.26 -0.84 -0.45 -0.82 -0.6 -0.46 -0.41 -0.67 -0.3 -0.46 -0.26
0.67 0.69 0.95 -0.07 -1.25 0.61 -0.25 -0.37 0.58 -0.62 -1.32 -1.49 -0.08 -0.26 -0.7 -0.09 0.26 -0.45 1.3 0.57 0.51 0.35 0.47 -0.76 -0.61 -0.97 -1.13 0.18 0.07 -0.02 -0.24 -0.07 -0.22 0.08 0.04 -0.26 -0.01 0.1 -0.28 -0.06 -0.51 -0.23 0.13 -0.12 -0.14 0.15 -0.27 -0.1
0.26 0.84 1.9 -0.74 -2.07 -0.74 -0.25 -0.18 0.21 -0.69 -0.8 -0.47 -1.28 -3.04 -0.43 0.23 1.2 0.82 1.16 0.7 0.28 0.27 2.55 -0.52 -0.25 -0.3 -0.71 -0.09 -0.94 0.07 -0.99 -0.23 -1.28 -0.5 -0.5 -0.38 -0.97 0.16 -1.97 -1.97 -2.53 -3.12 -1.21 -0.69 -2.0 0.09 -0.27 0.42
0.71 0.55 0.86 -0.54 -0.76 0.13 -0.62 -0.78 0.47 -0.66 -1.28 -1.36 -0.81 -0.54 -0.35 0.3 0.45 0.07 1.36 1.15 0.56 0.42 0.66 0.09 -0.83 -1.66 -1.5 0.01 0.17 0.33 -0.23 -0.02 -0.18 0.08 -0.0 -0.44 -0.43 -0.04 -0.27 -0.02 -0.57 -0.29 0.01 -0.03 -0.25 0.09 -0.26 -0.26
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1.11 1.43 0.94 -1.01 1.15 -0.35 -0.24 -0.34 0.79 -1.08 -2.25 -2.61 -0.78 -0.34 -1.26 0.37 0.35 -0.28 0.65 0.46 0.1 0.15 2.4 -1.14 -0.76 -1.17 -1.11 -0.46 -0.17 -0.49 -0.78 -0.81 -0.49 -0.4 -0.37 -0.84 -0.59 -0.2 -0.6 0.02 -0.24 -0.2 0.14 -0.37 -0.29 -0.22 -0.57 -0.88
-0.26 0.25 0.44 2.16 -0.88 0.15 0.43 -0.07 0.08 -1.25 -2.77 -2.53 -1.03 -0.62 -1.48 -0.77 0.77 -0.01 1.1 1.27 1.08 0.34 2.81 -0.87 -0.91 -1.04 -1.17 -0.5 -0.85 -0.47 -0.91 -1.17 -0.96 -0.6 -0.96 -1.18 -0.88 -0.27 -0.89 -0.5 -1.07 -0.82 -0.42 -0.75 -0.87 -0.21 -0.87 -0.67
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-0.25 0.25 0.95 1.34 -0.71 -1.05 -1.02 -1.35 -0.64 -0.43 -1.55 -1.53 -0.34 -0.09 -0.64 0.72 0.96 0.36 0.5 0.68 0.71 0.5 2.46 1.61 -0.59 -0.71 -1.02 -0.97 -1.01 -0.66 -0.86 -0.96 -0.5 -0.47 -1.54 -1.18 -1.09 -0.29 -0.56 -0.17 -0.29 -0.19 -0.13 -0.52 -0.56 -0.2 -0.64 -0.97
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.