Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c10_11200V3.1	0.11	0.81	1.24	-0.13	-0.61	-0.68	-1.3	-0.83	0.42	-0.19	-0.2	-0.26	-0.25	-0.79	-0.28	0.48	0.94	0.72	0.31	0.49	0.54	0.42	-1.16	-0.69	-0.47	-0.3	-0.76	0.58	0.37	-0.11	-0.02	0.41	-0.02	0.3	-0.43	0.33	0.09	-0.08	-0.42	-0.36	-1.28	-0.94	-0.41	-0.07	-0.13	-0.06	-0.08	-0.6
Pp3c10_16540V3.1	-1.0	-0.23	0.12	-1.06	1.14	-0.08	-0.37	-0.2	-1.44	0.02	-1.19	-1.39	-0.2	0.08	-0.67	-0.46	0.26	0.81	0.04	0.34	0.56	0.34	-1.39	1.09	1.34	-0.3	0.22	-0.76	-0.91	-0.55	-0.25	-0.7	0.16	-0.09	-1.41	-0.52	-0.43	-0.13	-0.17	0.37	0.77	0.92	0.57	-0.13	0.18	-0.07	-0.3	-0.56
Pp3c10_22760V3.1	-0.81	-0.11	-0.02	-1.84	0.47	-0.32	-0.57	-0.24	-0.21	0.3	-0.82	-0.8	-0.15	-0.91	-0.28	0.19	0.68	0.21	0.51	0.78	0.68	0.53	-1.72	-0.44	-0.44	-0.71	-1.14	0.33	0.48	0.1	0.63	-0.08	0.36	0.34	-0.64	0.19	0.6	0.21	-0.31	-0.1	-0.56	-0.53	0.14	0.16	0.02	0.2	0.62	-0.22
Pp3c10_22890V3.1	0.32	0.41	0.28	-0.91	-1.26	-0.73	-1.09	-0.92	0.54	-1.12	-4.31	-4.53	-1.2	-2.05	-1.18	-0.07	0.66	1.11	0.48	0.33	0.7	0.85	0.11	-0.52	-0.68	-1.34	-2.33	1.27	0.98	0.48	0.54	-0.76	0.05	0.84	0.3	0.02	0.64	-0.61	0.66	-0.45	-3.4	-2.3	-0.28	0.39	0.13	-0.72	1.1	0.1
Pp3c10_4190V3.1	-0.39	-0.5	0.33	-2.77	0.82	-0.0	-0.46	-0.34	-0.95	0.16	-2.97	-3.52	-0.51	-1.6	-0.11	-1.15	0.51	0.19	0.26	0.39	0.62	0.72	-0.55	0.26	-0.06	-1.0	-0.74	0.69	-0.33	-0.05	0.7	0.36	0.56	0.62	-0.54	0.39	1.14	0.15	-0.33	-0.06	-1.01	-0.98	-0.18	0.35	0.29	0.02	0.66	0.07
Pp3c10_4941V3.1	-	-0.39	1.29	-4.54	-3.04	-3.4	-	-4.02	-	-1.98	-1.74	-3.54	-2.1	-1.58	-1.72	-0.16	0.2	1.66	-	0.48	2.0	1.56	-2.84	2.51	0.43	-0.71	-3.42	-0.07	0.27	-0.08	0.84	-2.97	-0.66	0.36	-1.34	-0.1	-0.36	0.3	-0.22	0.71	-2.88	-1.52	-0.93	1.16	0.59	0.97	0.72	-1.42
Pp3c10_9620V3.1	-1.5	-0.18	1.39	-2.46	0.32	-0.71	-0.35	0.22	-1.6	-0.86	-1.57	-1.97	-1.46	-2.75	-0.86	-1.22	0.76	0.67	0.46	0.32	0.14	0.7	1.48	-1.94	-0.43	-0.31	-0.62	1.07	-0.72	0.57	-0.7	0.61	0.22	0.45	-1.12	0.37	-0.26	0.28	-0.35	-0.28	-1.41	-1.53	-0.11	0.75	0.19	0.6	0.66	0.55
Pp3c11_16200V3.1	-0.03	-0.91	0.75	-3.15	-0.69	0.04	-0.22	-0.51	0.1	-0.07	-2.35	-2.04	-0.91	-1.51	-0.11	-0.69	0.57	-0.8	0.57	0.66	0.67	0.38	0.68	-2.21	-0.82	-1.04	-1.03	0.94	0.28	0.42	0.22	0.02	0.26	0.89	0.18	0.29	-0.03	0.21	0.19	0.32	-1.48	-1.33	0.19	0.81	-0.11	0.22	0.9	0.06
Pp3c11_19160V3.1	0.02	0.71	1.29	-2.48	0.07	0.07	0.55	0.45	0.36	-0.93	-3.2	-2.87	-1.45	-2.12	-1.43	-0.02	1.26	0.08	0.97	0.54	0.72	0.57	-0.38	1.55	-1.07	-2.02	-1.79	1.21	1.1	-0.24	-0.24	-1.18	-0.12	0.52	0.35	-0.29	0.02	-0.21	-0.42	-0.72	-2.52	-2.16	-0.5	-0.74	-0.65	-0.2	-0.45	-0.25
Pp3c11_23050V3.1	-0.51	-0.34	-0.49	-2.9	-1.22	-0.31	-0.48	-0.68	-0.83	-0.06	-3.82	-3.87	-0.13	-0.06	-0.09	-0.4	0.32	0.34	0.27	0.08	-0.26	-0.02	0.23	-0.43	-0.42	-1.1	-1.01	0.92	-0.41	0.38	0.26	0.28	0.68	0.91	-1.0	1.11	0.72	0.29	0.82	0.2	-0.88	-0.96	0.01	0.71	0.62	0.46	0.56	0.3
Pp3c12_22840V3.1	-0.63	-0.34	0.45	-1.3	-0.37	0.23	0.25	0.09	-0.12	-0.13	-2.69	-2.97	-0.96	-1.62	-0.56	-0.83	0.94	-0.74	0.95	0.92	0.47	0.0	0.02	-2.63	-1.02	-1.76	-1.3	1.21	-0.58	0.47	0.24	0.28	0.68	0.76	-1.04	0.41	0.43	0.34	-0.18	0.21	-1.24	-1.24	0.09	0.85	0.22	0.19	0.87	-0.12
Pp3c12_23680V3.1	-0.65	0.49	0.78	-2.19	1.17	0.26	0.32	0.15	0.07	-0.21	-3.67	-4.93	0.12	-0.7	-0.68	0.23	0.52	0.02	0.64	0.76	0.87	0.24	-0.17	2.0	0.38	-0.94	-0.91	-0.06	-0.42	-0.69	-0.19	-0.71	-0.27	-0.04	-0.79	-0.86	0.21	-0.11	-0.46	-0.19	-0.46	-0.59	-0.17	-0.17	-0.27	-0.12	-0.44	-0.63
Pp3c12_660V3.1	-3.66	-0.57	-0.57	-1.4	0.96	-0.74	-1.85	-1.93	-1.71	-0.33	-3.17	-3.24	-0.66	0.21	-0.54	0.11	-0.19	1.17	-0.73	0.2	0.36	0.38	-1.14	1.91	0.66	-0.37	-0.31	-0.39	-0.93	0.22	-0.64	-0.53	0.41	0.24	-0.9	-1.23	0.03	0.37	0.27	0.97	0.17	0.39	0.72	0.37	1.08	0.3	-0.44	0.29
Pp3c13_7030V3.1	0.88	0.36	0.44	-1.83	-1.78	-1.17	-0.6	-1.88	-0.55	0.25	-5.17	-2.84	-0.02	-0.3	0.42	0.0	0.37	0.15	-0.16	-0.55	0.83	0.45	-0.22	-1.58	-0.84	-0.4	-1.35	1.11	-0.07	0.41	0.71	-0.62	-0.06	1.02	-0.23	0.98	0.18	0.59	0.65	0.02	-3.07	-2.6	-0.41	0.58	-0.08	0.59	0.82	-0.22
Pp3c13_7350V3.1	0.41	0.54	-1.29	-1.71	-2.03	-1.22	-1.12	-1.1	0.65	0.28	-4.3	-4.26	0.03	-0.84	0.63	-0.66	0.21	1.08	-1.36	-0.66	-0.03	0.59	-1.37	-0.27	-0.61	0.34	-2.16	0.77	0.63	0.31	0.32	-1.39	0.7	0.5	0.94	0.29	1.03	0.83	0.53	-0.28	-3.69	-2.49	0.04	0.02	0.96	0.74	0.18	-0.53
Pp3c14_11410V3.1	-0.66	0.97	1.74	-2.7	-1.99	-1.12	-0.79	-0.61	-0.52	0.06	-2.58	-2.38	-0.72	-2.0	-0.28	-1.67	0.31	-0.24	0.18	-0.5	-0.36	0.01	-0.1	-3.43	-0.84	-0.95	-1.19	1.15	0.46	0.64	0.63	0.34	0.06	0.95	-0.09	0.9	0.51	0.64	0.24	-0.39	-1.85	-1.98	-0.16	0.56	-0.35	0.62	1.08	0.69
Pp3c14_23100V3.1	-1.47	0.1	0.97	-3.45	0.18	-0.17	-0.18	0.38	-1.38	-0.26	-1.0	-1.02	-1.11	-1.62	-0.74	-0.75	0.83	0.09	0.9	0.7	0.43	0.31	1.02	-1.62	0.34	-0.4	-0.42	0.83	-0.67	0.37	-0.39	-0.11	0.1	0.41	-0.53	-0.4	-0.32	0.24	-0.13	-0.21	-0.72	-0.68	-0.28	0.6	-0.2	0.25	1.23	0.1
Pp3c14_24240V3.1	-1.34	-2.86	-0.55	-2.98	1.2	0.94	-0.14	0.11	-1.78	0.94	-3.63	-4.03	-0.49	-1.94	-0.08	-1.22	0.27	-1.11	1.51	0.68	0.57	0.26	-	-2.84	-0.19	-0.83	-1.32	1.26	-0.01	0.45	0.77	0.88	0.33	0.8	-0.82	0.06	1.19	0.63	-1.09	-0.17	-1.25	-0.75	-0.35	-0.75	-0.44	0.58	0.34	-0.03
Pp3c14_24250V3.1	0.38	-0.43	0.05	-2.84	-0.39	0.38	0.03	0.14	-1.58	0.98	-3.25	-3.7	-0.29	-1.51	0.04	-2.94	0.25	-0.18	0.2	0.41	0.6	0.44	-2.82	-2.36	0.4	-0.91	-0.89	1.16	0.29	0.45	0.87	1.03	0.6	0.86	-1.29	0.34	1.16	0.55	-0.68	-0.18	-1.68	-1.47	-0.23	-0.26	-0.59	0.3	0.64	-0.13
Pp3c14_4830V3.1	-1.52	-0.64	1.31	-1.48	-0.27	-0.51	0.57	0.11	0.51	-0.69	0.05	0.34	-1.07	-1.01	-0.88	1.1	1.17	-0.12	0.13	-0.42	-0.04	0.04	-6.13	1.45	-0.09	0.33	-1.72	0.75	1.36	-0.29	-0.61	-0.35	-0.75	0.08	0.81	-0.43	0.05	-0.46	-0.01	-0.11	-1.3	-1.03	-0.31	0.11	-0.8	-0.33	-0.59	-0.57
Pp3c14_5280V3.1	-0.35	0.13	0.42	-1.51	-0.03	-0.68	-0.64	-0.77	-0.23	0.05	-1.97	-1.94	-0.35	-0.4	-0.43	-1.01	0.92	-0.07	0.4	0.51	0.52	0.27	0.76	-0.6	-0.5	-1.11	-1.46	0.62	0.03	0.27	0.23	-0.41	0.49	0.82	0.02	0.03	0.06	0.12	0.04	0.29	-0.53	-0.4	0.35	0.38	0.3	0.1	0.87	-0.16
Pp3c14_9190V3.1	-0.2	0.69	0.08	-1.06	0.06	0.08	-0.63	-0.74	0.5	0.29	-3.61	-3.32	-0.34	-0.82	0.43	-0.69	0.23	0.28	-0.42	-0.39	0.28	0.07	1.05	-1.62	-0.64	-0.86	-1.71	0.64	0.5	0.21	0.17	-0.65	0.2	0.45	0.14	0.61	0.48	0.35	0.62	0.08	-1.54	-1.6	0.11	0.59	-0.06	0.29	0.73	0.06
Pp3c15_14570V3.1	-0.94	-0.27	-0.39	-0.89	0.73	0.49	-0.56	-0.12	-1.01	0.26	-1.6	-1.64	0.07	-0.23	-0.42	-1.04	0.58	1.03	0.36	0.35	0.17	0.44	-2.23	0.39	1.13	-0.53	-0.12	-0.43	-0.41	-0.35	-0.18	-0.37	0.34	0.24	-0.39	0.2	-0.07	0.5	-0.56	0.33	0.35	0.22	0.37	0.12	-0.07	0.39	-0.15	-0.46
Pp3c15_21950V3.1	-0.61	0.8	1.12	-0.93	0.25	0.62	0.58	0.4	0.8	-1.1	-3.79	-4.31	-1.74	-2.53	-1.37	-2.7	1.09	1.02	1.53	0.99	0.84	1.16	0.12	1.21	-0.17	-3.72	-2.28	0.61	-0.25	-0.23	-0.44	-0.74	-0.23	0.31	-0.15	-0.21	-0.56	-0.16	-0.79	-0.53	-3.07	-2.43	-0.35	-0.4	-0.41	-0.13	-0.06	-0.55
Pp3c15_7380V3.1	-0.64	0.75	1.0	-2.52	-0.29	0.11	0.1	0.03	0.25	-0.6	-2.91	-2.88	-1.31	-2.0	-1.11	-0.82	0.91	-0.46	0.86	0.87	0.65	0.3	-0.14	-1.33	-0.68	-1.8	-0.32	0.92	-0.02	0.42	0.04	0.71	0.39	0.68	-0.46	0.31	0.14	-0.12	-0.15	0.03	-0.88	-0.98	0.12	0.2	0.17	-0.14	0.66	0.03
Pp3c16_10280V3.1	-0.14	0.7	0.85	-0.99	-0.83	-0.59	-0.71	-0.78	0.22	0.36	-3.43	-3.88	-0.04	-0.7	0.43	0.32	0.8	0.48	-0.33	-0.02	0.07	0.38	-2.32	0.43	-0.64	-0.2	-2.28	0.57	0.58	0.23	0.03	-0.94	0.14	0.56	-0.11	0.39	0.31	0.54	0.13	0.29	-1.61	-1.17	0.22	0.31	0.27	0.51	0.61	-0.79
Pp3c16_16340V3.1	-0.31	-0.66	0.14	-2.6	-1.82	-0.87	-0.49	-0.29	-0.53	0.27	-3.14	-3.3	0.26	0.05	0.23	-1.54	0.46	0.65	-0.34	-0.08	-0.11	0.04	-0.9	-0.78	-0.32	-0.06	-0.22	0.84	-0.99	0.32	0.14	0.46	0.29	0.76	-0.55	0.99	0.3	0.5	0.83	0.28	-0.42	-0.58	0.21	0.64	0.27	0.51	0.71	0.06
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Pp3c9_14620V3.1	0.49	0.87	0.93	-2.23	-0.92	0.21	0.83	0.87	0.03	-0.96	-5.4	-5.78	-1.8	-2.9	-1.39	-0.82	0.71	1.82	0.72	0.66	1.1	0.7	0.1	1.99	0.42	-1.06	-1.76	0.65	-0.01	-0.43	-0.18	-2.13	-0.19	0.24	-0.33	-0.67	0.05	-0.42	-0.5	-0.94	-2.77	-2.6	-0.63	-0.63	-0.67	-0.46	-0.33	-1.22
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.