Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.0 0.0 0.0 5.15 0.27 0.53 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.32 1.28 0.09 182.25 99.08 84.09 43.98 48.82 3.61 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 1.55 0.29 0.01 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.89 1.58 5.63 173.1 167.56 183.0 128.55 127.83 18.48 4.7 0.01 0.11 2.3 0.36 8.46 1.8 4.72 5.56 5.24 7.91 8.96 5.77 0.99 3.05 9.38 3.73 1.96 0.28 0.15 0.29 0.76 0.01 0.22 0.21 0.02 0.25 0.28 2.72 0.1 0.58 0.01 0.04 0.44 0.38 0.32 2.01 0.09 0.14
0.31 1.08 1.52 27.09 22.7 25.71 23.94 22.19 4.02 0.1 0.02 0.06 0.11 0.07 0.07 1.42 0.56 2.02 0.4 0.26 0.41 0.38 0.22 1.87 1.7 0.54 0.67 0.12 0.05 0.16 0.15 0.21 0.07 0.13 0.02 0.06 0.13 0.18 0.05 0.07 0.09 0.05 0.07 0.07 0.01 0.18 0.21 0.19
6.22 1.01 0.71 108.04 65.64 49.96 55.02 55.34 5.59 0.07 0.0 0.0 0.04 0.02 0.09 4.68 0.24 0.78 0.1 0.2 0.0 0.03 0.12 2.26 0.15 0.16 0.0 0.27 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.02 0.11 0.05
0.0 0.0 0.41 14.93 2.55 1.57 4.14 0.82 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.94 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.61 0.0 2.17 183.5 14.5 19.77 11.84 9.83 14.08 0.09 0.47 0.41 0.48 0.07 0.36 1.93 1.32 5.5 0.27 1.04 1.1 1.05 1.75 3.03 0.7 1.02 0.26 0.28 0.28 0.4 0.3 0.36 0.13 0.17 0.21 0.52 0.51 0.06 0.27 0.37 0.31 0.2 0.44 0.5 0.26 0.17 0.14 0.42
10.11 0.21 0.1 143.9 19.21 38.46 32.84 31.28 27.31 0.09 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 3.88 0.32 0.57 0.37 0.09 0.0 0.32 0.0 2.35 0.09 0.24 0.0 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 1.56 3.23 50.03 1.4 3.81 6.46 9.61 5.1 0.26 7.83 9.21 0.46 0.27 0.24 1.26 1.4 1.19 0.73 0.4 0.39 0.4 0.7 4.14 0.5 1.47 0.57 0.15 0.43 0.23 0.13 0.13 0.06 0.14 0.9 0.13 0.03 0.2 0.05 0.17 0.18 0.15 0.11 0.09 0.13 0.16 0.1 0.24
12.48 32.06 71.98 200.85 53.64 27.62 27.12 25.58 9.8 10.27 4.75 2.82 6.97 4.66 12.39 4.27 48.49 30.85 42.76 48.83 22.7 24.71 17.36 17.29 23.66 11.41 42.77 34.09 17.89 30.47 12.1 20.62 22.31 33.63 10.25 28.54 13.14 15.09 22.64 24.07 26.35 30.18 16.4 39.46 24.0 15.03 37.25 23.44
2.05 0.0 14.15 417.17 554.64 407.47 337.92 276.2 44.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.08 0.0 1.91 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 4.45 4.69 35.31 24.77 21.67 20.65 19.63 3.1 0.36 0.86 0.84 0.2 0.06 0.35 0.72 1.0 4.6 1.59 0.78 0.49 0.57 0.21 5.66 3.35 0.98 5.24 0.65 1.14 0.45 0.6 0.83 0.45 0.24 0.26 0.6 0.69 0.85 0.05 0.12 0.05 0.01 0.08 0.12 0.04 0.96 0.61 1.2
0.0 0.58 1.93 39.41 21.98 30.77 31.95 22.48 2.28 0.0 0.78 0.73 0.1 0.0 0.17 0.41 1.19 0.51 0.0 0.19 0.23 0.28 1.84 2.0 0.45 0.76 0.3 0.0 0.22 0.2 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.15 0.13 0.29 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
6.34 0.0 0.07 111.89 75.21 80.02 92.94 90.38 8.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 4.65 0.3 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.71 2.31 5.04 37.05 3.21 22.83 14.94 8.34 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.24 1.63 0.0 0.27 0.14 0.0 0.0 3.62 1.42 0.13 0.17 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 2.81 4.67 57.93 6.06 8.26 16.08 5.33 6.61 0.43 0.51 0.37 0.36 0.25 0.33 0.0 1.93 1.35 0.42 1.47 0.85 0.19 0.61 10.14 0.51 0.92 0.41 0.35 0.95 0.54 0.37 0.25 0.38 0.18 0.08 0.0 0.12 0.11 0.18 0.62 0.2 0.25 0.75 0.28 0.2 0.18 0.0 0.26
2.26 2.3 4.83 25.34 25.17 17.6 19.25 19.37 5.13 2.39 0.09 0.08 1.15 0.33 2.66 2.04 3.59 2.11 5.73 5.58 3.85 2.47 5.4 0.68 2.68 0.95 2.59 2.81 0.52 2.46 1.69 1.17 1.57 2.36 0.14 0.57 2.07 0.69 0.27 0.49 0.2 0.21 1.33 0.53 1.48 0.63 0.87 0.82
3.1 2.4 3.81 115.63 138.68 79.94 87.45 73.3 10.25 0.18 0.02 0.04 0.05 0.01 0.13 1.51 1.25 1.15 0.89 1.22 0.55 0.51 0.31 0.66 1.32 0.66 0.39 0.42 0.26 0.12 0.1 0.18 0.14 0.11 0.06 0.18 0.22 0.11 0.05 0.08 0.03 0.05 0.06 0.11 0.05 0.18 0.21 0.08
3.77 1.13 3.28 163.69 103.81 80.11 71.87 62.23 26.23 0.15 0.03 0.08 0.08 0.14 0.22 2.62 2.54 1.8 3.68 1.39 1.34 0.92 1.4 0.2 0.55 0.6 0.09 2.23 3.24 1.57 2.34 0.15 1.23 2.66 1.62 0.82 1.87 0.83 1.25 1.63 0.52 0.25 1.23 1.49 0.87 0.8 0.88 1.23
4.83 1.15 6.54 187.34 135.69 133.54 149.54 136.77 4.57 0.54 0.76 0.47 0.15 0.0 0.39 5.1 3.72 5.34 6.73 14.56 28.91 19.63 0.69 15.81 3.89 0.72 0.13 0.07 0.0 0.05 0.0 0.11 0.08 0.0 0.12 0.0 0.07 0.08 0.0 0.05 0.0 0.07 0.08 0.45 0.0 0.16 0.14 0.18
1.61 0.0 0.59 42.3 18.81 17.54 16.63 13.9 1.12 0.2 0.0 0.0 0.07 0.0 0.2 1.87 0.1 0.08 0.0 0.69 0.33 0.39 0.14 0.07 0.34 0.24 0.07 0.53 0.15 0.17 0.25 0.18 0.24 0.41 0.0 0.07 0.81 0.43 0.2 0.09 0.35 0.0 0.14 0.12 0.2 0.54 0.0 0.14
0.0 2.22 3.79 37.53 5.81 6.12 5.45 2.65 2.12 0.06 1.64 1.46 0.12 0.11 0.09 0.3 1.93 0.58 2.18 1.73 2.29 2.04 0.92 3.4 0.64 0.37 0.17 0.02 0.05 0.01 0.07 0.19 0.0 0.03 0.07 0.02 0.02 0.05 0.07 0.04 0.07 0.05 0.07 0.08 0.13 0.05 0.13 0.02
0.16 1.44 0.75 20.32 14.87 14.41 12.09 9.27 3.13 0.07 0.0 0.0 0.02 0.15 0.02 1.19 0.19 0.57 0.47 0.14 0.39 0.21 0.14 0.29 0.34 0.35 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.3 0.1 53.55 27.91 38.2 22.67 37.36 13.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.59 0.1 0.03 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.18 1.34 8.55 40.69 42.84 30.97 34.99 33.76 3.95 1.26 0.31 0.41 0.68 0.27 0.91 1.78 1.05 2.51 1.69 2.1 1.02 1.17 0.58 2.14 3.19 1.29 1.05 1.69 0.42 0.75 1.28 1.13 0.8 0.91 0.64 0.73 1.57 1.2 0.3 0.52 0.29 0.21 0.5 0.46 0.42 1.19 0.76 0.95
0.0 0.0 0.14 8.67 1.76 0.96 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.32 0.47 0.27 0.0 0.12 0.12 0.22 0.0 0.37 0.61 0.0 0.08 0.35 0.0 0.14 0.15 0.19 0.1 0.21 0.0 0.0 0.2 0.0 0.34 0.09 0.0 0.0 0.0 0.15 0.1 0.2 0.0 0.16
8.02 6.88 18.28 83.31 67.66 52.95 54.69 45.25 15.19 3.74 0.11 0.14 1.58 0.31 3.07 3.11 10.56 4.38 11.4 13.31 10.87 6.82 3.15 3.32 4.11 0.67 1.38 5.05 2.19 2.74 4.58 0.98 3.77 4.14 1.22 2.35 5.28 4.69 1.68 2.96 0.62 0.6 3.46 3.64 2.07 4.59 3.66 2.18
9.47 3.15 7.74 81.11 68.21 32.88 45.93 39.36 11.56 0.78 0.28 0.31 0.46 0.06 0.4 11.39 1.67 1.56 4.49 2.36 0.95 0.96 0.46 2.98 1.69 0.36 0.64 1.6 0.93 0.81 1.03 1.04 0.55 0.74 0.3 0.76 0.7 0.58 0.26 0.53 0.08 0.15 0.37 0.59 0.36 0.51 0.93 0.57
1.37 5.33 15.54 50.64 32.11 31.52 35.12 30.68 7.68 0.94 0.01 0.0 0.4 0.08 0.91 1.45 2.99 0.85 3.24 3.55 2.31 1.03 0.74 0.24 0.73 0.27 0.18 0.26 0.52 0.23 0.1 0.04 0.12 0.47 0.06 0.06 0.11 0.4 0.04 0.22 0.02 0.03 0.38 0.1 0.1 0.36 0.1 0.19
2.83 3.01 4.29 58.05 45.41 37.05 34.08 30.72 5.96 2.53 0.34 0.41 1.93 0.77 2.27 1.17 2.0 2.63 2.25 1.91 2.85 2.84 0.26 2.51 2.33 1.95 0.89 0.31 0.35 0.88 1.24 0.72 0.65 0.29 0.19 0.69 0.63 3.15 0.19 0.42 0.65 0.54 0.44 0.44 0.19 3.17 0.12 1.9
10.45 5.32 6.16 99.04 83.61 82.03 78.99 65.86 15.46 2.54 0.44 0.64 2.79 1.76 2.78 4.01 1.47 3.58 1.71 1.85 1.22 1.71 1.69 1.11 3.73 2.93 1.2 1.45 0.69 1.53 1.3 2.13 1.07 0.92 0.46 0.82 1.44 2.58 0.5 1.05 0.9 0.71 1.12 0.95 0.82 2.08 0.92 1.95
0.0 0.0 0.44 10.25 2.06 3.48 0.74 0.44 0.0 0.08 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.44 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.63 0.28 0.81 80.44 64.59 31.39 36.84 26.25 6.09 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.52 0.24 0.07 0.41 0.15 0.07 0.17 0.13 0.09 0.05 0.11 0.0 0.05 0.11 0.03 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.1 0.01 0.02 0.05 0.05
3.36 4.45 5.54 16.81 15.14 17.36 17.9 16.39 2.99 4.15 0.7 0.56 0.85 0.17 2.53 1.55 3.69 2.37 1.71 3.7 2.33 2.67 2.11 0.56 3.74 2.34 1.52 0.8 0.61 1.53 0.58 1.3 0.83 0.7 0.14 0.64 1.4 3.04 0.22 0.75 1.95 1.77 1.06 0.93 0.48 2.91 1.25 1.41
0.12 0.86 0.81 43.47 45.91 31.14 24.47 24.88 2.37 0.6 0.03 0.0 0.25 0.1 0.55 0.52 0.6 1.8 1.09 1.05 1.02 0.86 0.47 1.78 1.38 0.24 0.01 0.22 0.13 0.25 0.39 0.04 0.1 0.23 0.06 0.0 0.05 0.6 0.12 0.28 0.02 0.05 0.64 0.28 0.14 0.7 0.45 0.14
2.2 4.18 3.1 19.19 18.69 15.58 17.49 17.66 6.52 3.73 3.2 2.9 2.76 1.47 3.77 2.25 2.37 2.44 3.29 4.19 3.72 3.54 2.25 0.59 5.46 3.69 7.22 1.43 0.65 1.35 1.17 3.31 1.26 0.8 0.27 0.94 2.14 2.12 0.6 1.23 1.07 0.98 1.49 1.83 1.16 2.12 1.46 1.65
3.09 3.86 3.81 30.73 32.11 21.55 18.52 24.8 2.1 0.28 0.22 0.24 0.2 0.07 0.21 0.66 0.51 1.67 1.11 0.69 0.7 0.49 0.12 0.65 0.83 0.47 0.36 0.11 0.06 0.14 0.1 1.14 0.1 0.07 0.04 0.06 0.11 0.36 0.01 0.15 0.03 0.09 0.1 0.28 0.06 0.31 0.07 0.23
1.24 2.48 0.3 36.4 42.9 32.75 28.83 37.62 2.48 3.02 0.34 0.18 2.0 0.19 2.17 0.08 3.4 0.03 13.38 3.64 1.11 0.08 0.54 0.02 0.08 0.22 0.03 0.0 0.0 0.1 0.06 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.66 0.0 0.48 0.02 0.05 1.02 0.75 0.04 0.5 0.18 0.02
2.78 5.55 14.87 116.28 83.38 52.2 53.9 41.72 17.06 0.34 0.06 0.04 0.18 0.03 0.54 1.57 9.17 9.5 16.99 18.86 7.28 8.49 2.1 33.93 18.69 3.41 5.87 0.27 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.09 0.01 0.0 0.1 0.01 0.06 0.0 0.01 0.12 0.07 0.01 0.08 0.05 0.03
2.22 0.1 0.06 35.65 36.31 38.8 35.1 28.0 1.65 0.13 0.0 0.0 0.12 0.02 0.11 1.11 0.24 0.06 0.46 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.07 0.01 0.0
0.0 0.0 0.95 14.71 0.81 2.6 2.84 1.73 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 1.06 0.61 0.75 0.69 0.39 0.16 2.31 3.33 0.0 0.18 0.02 0.1 0.09 0.42 0.06 0.59 0.17 0.24 0.13 0.0 0.16 0.11 0.17 0.8 0.04 0.0 0.08 4.24 0.14 0.23 0.41 0.13
0.39 0.18 2.1 74.87 42.77 66.57 51.27 53.8 7.79 0.36 0.1 0.05 0.18 0.0 0.25 0.34 0.65 2.34 0.18 0.24 0.44 0.03 0.26 0.24 0.58 0.13 0.24 0.59 0.16 0.09 0.16 0.05 0.06 0.05 0.03 0.18 0.12 0.5 0.0 0.21 0.17 0.28 0.14 0.17 0.03 0.25 0.07 0.32
0.48 2.17 3.3 62.6 14.76 23.32 18.48 14.47 2.42 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 1.79 0.57 0.44 0.33 0.84 1.55 1.18 0.0 0.15 6.38 0.2 0.64 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.02 0.02
0.6 0.0 1.67 47.81 43.09 48.74 50.63 49.75 6.37 0.21 0.01 0.01 0.16 0.12 0.16 0.53 0.23 0.6 0.14 0.29 0.08 0.07 0.4 0.01 0.22 0.35 0.49 0.0 0.0 0.06 0.02 0.09 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.57 0.0 0.12 0.04 0.04 0.03 0.21 0.01 0.5 0.11 0.04
2.88 1.76 3.38 50.74 52.09 42.73 36.75 34.08 8.63 4.47 1.23 1.22 3.82 2.01 3.17 1.69 1.21 2.28 2.69 4.36 1.42 1.65 0.89 1.34 8.07 5.99 10.97 2.71 3.63 3.6 5.0 3.94 3.05 1.47 0.86 2.49 4.91 5.22 0.67 2.99 4.48 3.22 1.72 2.95 1.71 4.48 1.13 3.81
17.92 49.55 73.3 1722.3 172.99 702.31 493.59 578.36 62.02 0.03 1.09 1.48 0.24 0.07 0.1 5.47 2.76 4.73 5.75 0.84 2.47 5.14 0.54 33.47 4.86 0.9 0.3 0.0 0.15 0.04 0.02 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
0.04 0.0 0.34 38.22 60.66 55.69 42.98 38.25 2.09 0.0 0.04 0.31 0.05 0.0 0.01 2.14 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.61 0.0 0.0 75.65 67.31 42.05 54.83 41.36 9.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.02 6.61 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.35 19.3 18.87 14.01 11.8 11.35 2.79 0.22 0.0 0.0 0.05 0.35 0.2 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.18 0.0 0.07 0.27 0.38 0.06 0.0 0.26 0.83 0.1 0.1 0.08 0.08 0.24 0.15 0.1 0.05 0.07 0.04 0.3 0.11 0.0 0.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)