Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.19 0.22 0.69 -0.64 -0.98 -0.31 -0.36 -0.04 0.15 -0.14 -0.62 -0.72 0.22 0.35 -0.5 -0.34 0.63 -0.03 0.26 0.14 0.12 0.09 0.19 -0.85 -0.9 -0.79 0.02 -0.5 -0.44 0.21 -0.4 -0.05 0.16 0.14 -0.6 -0.81 -0.41 0.42 -0.5 0.65 0.48 0.62 0.53 0.52 0.29 0.5 0.16 -0.14
0.21 0.38 0.52 -2.27 -0.57 -0.27 -0.94 -0.8 0.26 -0.42 -1.3 -0.96 -0.53 0.3 -0.34 0.07 1.28 -0.19 0.34 0.4 0.36 -0.01 1.49 0.72 -0.6 -0.47 -0.18 0.05 -0.84 0.37 -0.7 -0.62 0.11 -0.25 -0.89 -0.57 -0.86 -0.24 -0.05 0.43 0.11 0.11 0.53 0.0 0.19 -0.16 -0.13 0.29
-0.52 -1.44 -0.76 -3.13 -3.4 -1.24 -1.47 -1.6 -0.82 0.2 -0.29 -0.14 1.25 1.41 -0.66 -0.92 -1.1 -0.74 0.22 0.2 0.31 0.49 -1.97 -1.14 1.08 -0.1 1.21 -0.27 0.02 -0.6 -0.04 0.18 -0.31 -0.0 0.24 -0.19 -0.25 0.84 0.2 0.47 0.62 0.68 0.3 0.27 -0.4 0.86 -0.16 -0.79
0.66 0.68 0.95 0.46 -1.03 -0.63 -0.56 -0.54 0.19 -0.05 -0.35 -0.33 0.39 0.76 -0.22 0.83 0.62 0.54 -0.24 0.04 0.27 0.26 -1.52 -0.69 -0.48 -0.47 -1.15 -0.66 -0.43 -0.38 -0.45 -0.17 -0.36 -0.22 -0.39 -0.87 -0.47 0.16 -0.33 0.37 0.59 0.64 0.31 0.19 -0.34 0.21 -0.18 -0.64
-0.54 -0.36 0.23 -0.26 0.61 -0.1 -0.59 -0.6 -0.76 -0.44 -1.81 -1.93 -0.5 -0.49 -0.18 -0.54 0.33 0.15 0.56 0.55 0.62 0.75 -0.44 -0.19 0.26 -0.8 -0.08 0.19 0.16 -0.26 -0.45 -0.54 0.08 0.14 0.12 0.45 -0.06 -0.24 0.18 0.32 0.41 0.52 0.36 0.57 0.08 -0.21 0.41 -0.11
-0.46 -0.61 0.41 -0.52 -1.06 -0.96 -1.39 -1.27 -0.18 0.14 -2.55 -2.93 0.25 0.28 -0.34 0.04 0.31 -0.23 -0.1 0.19 0.0 -0.16 -0.41 -1.37 -1.09 -0.52 -1.34 -0.02 0.24 0.28 0.38 -1.35 0.39 0.57 -0.76 -0.81 0.07 0.89 0.06 1.25 0.68 0.51 1.11 0.87 0.15 0.92 0.12 0.09
-0.05 -0.23 0.63 -0.42 -1.11 -1.23 -1.23 -1.13 0.05 -0.32 -0.47 -0.48 0.43 0.73 -0.32 0.46 0.47 0.47 0.06 0.22 0.01 0.21 -0.38 -0.15 -0.29 -0.06 -0.64 -0.59 -0.4 0.17 -0.46 -0.39 -0.24 -0.2 -0.1 -0.26 -0.35 0.41 0.04 0.64 0.96 0.96 0.39 0.12 -0.04 0.45 -0.4 -0.28
0.25 0.09 0.27 -1.78 -0.91 -0.79 -1.04 -1.12 0.02 0.06 -0.98 -1.02 0.56 0.79 -0.07 0.06 0.4 -0.58 0.64 0.46 0.19 0.28 -0.21 -0.66 -0.67 -0.17 -0.3 0.04 -0.03 0.26 -0.22 -0.47 0.17 0.27 0.26 -0.27 -0.08 0.18 -0.01 0.34 0.37 0.36 0.64 -0.01 -0.0 0.25 -0.24 0.27
-5.38 1.4 1.74 -0.55 -0.81 0.9 1.88 1.43 -2.69 -1.28 -5.25 - -1.52 -2.35 -3.66 -2.08 0.33 -0.73 1.71 -1.07 -1.32 -0.9 -1.48 -4.26 -1.97 -0.66 -3.14 1.56 -0.02 0.3 -0.28 -1.66 -0.14 0.73 -0.83 -0.39 0.12 1.02 -1.07 0.66 -0.33 -0.32 -0.12 -0.04 -0.49 0.61 0.17 -0.17
0.34 0.72 0.67 -0.81 -1.12 -1.07 -2.44 -1.66 -0.1 -1.12 -2.86 -2.63 0.04 0.85 -1.72 0.6 1.34 0.88 0.49 -0.58 -0.91 -0.37 0.97 -0.16 0.07 0.47 0.98 -0.57 -0.91 0.2 -0.96 -0.03 -0.38 -0.23 -0.67 -0.52 -0.6 0.34 0.24 0.15 0.77 0.54 0.23 -0.18 -0.01 0.26 -0.9 0.25
-0.63 -0.9 0.06 -2.25 -2.99 -1.43 -2.23 -0.76 -1.3 -0.44 -1.57 -2.09 -0.01 1.0 -0.29 -0.26 -0.34 -0.1 0.54 0.38 0.0 -0.12 1.37 -2.31 -1.38 -2.02 -1.62 0.41 0.21 0.35 0.13 0.52 0.34 0.64 -0.05 0.02 0.0 0.65 0.25 0.89 0.76 0.63 0.43 0.05 0.62 0.83 0.02 0.14
-0.6 2.27 0.75 -3.18 -1.07 -0.16 1.5 1.62 -0.05 -2.02 -3.66 -2.26 -4.14 -6.79 -4.27 -1.63 -0.62 -2.34 -1.3 -0.84 -1.83 -2.35 1.7 -4.39 -7.39 -4.6 -5.3 0.77 0.79 0.62 1.62 -0.71 0.6 0.61 -1.08 -0.24 1.37 0.85 -1.21 -0.43 -1.69 -1.28 0.02 -0.14 -0.62 0.78 0.79 -0.86
0.39 -0.11 -0.05 -0.91 -3.01 -3.19 -3.54 -3.6 -0.35 -0.11 -0.66 -1.07 0.62 1.66 -0.71 -0.41 -0.54 -0.87 0.92 0.81 0.33 0.53 -1.73 -0.41 -0.55 -1.66 -1.22 -0.13 0.14 0.1 -0.1 -0.01 0.12 0.25 0.31 -0.24 -0.19 0.48 0.61 0.42 0.87 0.95 0.6 -0.1 -0.09 0.59 -0.16 -0.26
0.02 -0.64 -0.23 -3.32 -0.15 -0.25 0.45 0.57 0.0 0.27 -0.55 -0.25 0.61 0.77 0.08 -1.07 -0.19 -1.01 0.41 0.0 -0.21 -0.85 -0.85 1.0 -0.52 -0.11 -0.0 0.08 -0.29 -0.15 0.01 0.87 -0.13 -0.11 -0.51 -0.62 0.2 0.65 -0.49 0.18 0.36 0.36 0.17 -0.1 -0.29 0.63 -0.61 -0.04
0.07 -0.28 0.65 -0.06 0.36 -0.35 -0.14 -0.15 -0.05 -0.8 -1.97 -1.9 -0.2 -0.27 -0.52 0.16 0.87 0.11 0.59 0.38 0.47 0.07 -0.5 -0.89 -0.14 -0.1 -0.33 0.17 -0.26 -0.14 -0.22 -0.16 -0.03 0.51 0.06 -0.22 -0.21 -0.63 0.1 0.34 0.59 0.62 0.22 0.24 0.1 -0.77 0.4 -0.02
-0.69 -0.61 0.53 -1.35 -2.62 -1.4 -1.89 -1.99 -0.5 -0.42 0.15 0.37 1.32 1.78 -0.46 0.05 -0.18 0.31 0.69 0.16 -0.19 -0.19 -0.54 -0.12 -0.51 0.59 -0.18 -0.67 -0.16 -0.37 -0.83 -0.75 -0.82 -0.41 0.15 -1.12 -0.45 0.19 -0.28 0.76 1.16 1.1 0.56 0.05 -0.29 0.26 -1.29 -0.1
-1.75 -0.13 0.03 -1.56 -0.06 -1.01 -1.25 -1.24 -1.62 0.28 -4.18 -4.24 0.27 0.63 -0.67 -1.31 0.53 0.21 1.65 1.25 0.9 0.52 0.24 0.12 -0.4 -2.54 -2.98 -1.8 -1.95 0.1 -1.01 -2.32 0.07 -0.3 -1.64 -1.56 -0.45 1.35 -1.83 0.92 1.06 1.12 1.07 0.89 -0.7 1.41 -0.56 -1.13
0.31 0.43 1.03 0.56 -2.36 -1.22 -1.53 -0.86 0.14 0.25 -1.83 -1.83 -0.23 0.09 -0.19 0.94 0.67 0.72 0.4 0.45 -0.1 -0.28 0.18 0.99 0.12 0.19 -0.81 -0.27 -0.7 0.05 -0.81 -0.76 -0.33 -0.4 -0.88 -0.65 -0.56 0.37 -0.91 -0.2 0.5 1.14 0.17 -0.16 -0.27 0.45 -0.42 -0.17
-0.69 -0.52 0.42 -0.43 -1.76 -1.31 -0.91 -0.96 -1.78 -0.16 0.88 0.83 0.52 0.76 -0.42 -1.77 -0.08 -0.25 0.15 -0.07 -0.22 -0.15 -1.22 -1.15 0.01 -0.33 -0.36 0.18 -0.32 0.19 -0.51 0.22 -0.0 0.23 0.23 0.18 -0.07 0.15 0.41 0.53 0.73 0.87 0.42 0.42 0.32 0.13 -0.01 0.13
-0.73 -0.65 0.1 -1.45 0.71 -0.96 -0.1 -0.03 -0.73 0.14 0.53 0.83 0.24 0.65 -0.01 -3.26 -0.76 -0.44 0.61 0.76 0.59 0.33 -1.28 1.13 0.22 -1.03 -0.01 -0.57 -2.02 -0.02 -0.71 0.23 0.2 -0.34 -3.17 -1.36 0.22 0.66 -0.9 0.84 0.29 -0.11 0.58 0.18 0.22 0.59 -0.93 -0.41
0.64 0.21 1.2 -1.41 -2.25 -1.54 -2.57 -1.96 0.16 0.04 -0.59 -0.81 0.55 0.7 -0.13 0.42 0.84 0.6 0.13 0.12 0.26 0.09 -0.13 -0.62 -0.41 0.47 -0.37 -0.35 -0.37 0.19 -0.21 0.08 -0.11 0.19 -0.24 -0.06 -0.5 0.24 -0.21 0.1 -0.13 0.14 0.09 0.06 -0.34 0.38 0.24 -0.0
- -6.12 -7.78 -8.64 -10.53 -4.53 -3.27 -5.46 - 0.66 3.21 3.23 0.48 3.02 -1.56 - -2.58 -10.02 -8.84 -8.6 -10.86 -1.13 -8.37 -11.04 -3.52 -6.64 -3.68 -7.89 -10.84 -0.72 -1.53 -2.56 -5.23 -8.44 -9.33 -3.52 -4.9 1.03 -9.54 1.43 -0.18 1.74 2.05 -1.91 -8.4 1.14 -7.76 -3.43
0.2 0.16 0.12 -0.35 -1.77 -1.77 -1.96 -1.89 -0.01 -0.39 -0.99 -1.19 0.49 1.07 -0.31 -0.18 0.19 -0.15 -0.05 -0.21 -0.82 -0.61 -0.53 -1.31 -1.19 -1.16 -1.68 -0.1 0.25 0.31 -0.27 0.05 0.12 0.14 -0.11 -0.29 0.31 0.54 0.53 0.69 0.65 1.03 0.95 0.85 0.66 0.63 0.17 -0.02
0.24 0.1 0.22 -0.82 -0.73 -1.19 -1.67 -1.68 0.37 -0.73 -1.23 -1.18 0.05 0.39 -0.15 0.64 0.66 0.14 0.57 0.7 0.64 0.6 -0.38 -1.49 -0.05 -0.55 0.29 -0.14 -0.18 -0.09 -0.32 -0.35 -0.14 0.08 -0.29 -0.28 -0.3 -0.52 0.27 0.67 0.67 0.81 0.62 0.21 0.14 -0.68 -0.19 0.06
0.3 0.11 0.45 -1.65 -0.84 -1.09 -2.01 -1.71 -0.73 -0.07 0.71 0.79 0.28 0.64 -0.45 0.33 0.4 -0.26 0.04 0.36 0.19 0.28 -0.66 -1.4 -0.98 -0.87 -0.99 -0.69 -0.92 0.03 -0.6 0.79 -0.29 0.11 -1.1 -1.1 -0.49 0.43 -0.43 0.71 1.21 1.11 0.44 0.47 0.05 0.55 -0.52 0.16
0.79 0.22 0.88 -0.75 -3.39 -1.03 -1.26 -0.85 0.25 -0.04 -0.64 -0.61 0.23 0.63 -0.01 0.57 0.22 0.3 0.03 0.69 0.27 0.17 0.41 -1.05 -1.01 -0.42 -1.49 -0.02 0.0 0.17 -0.58 -0.74 -0.34 0.09 -0.23 -0.45 -0.38 0.5 0.16 0.3 0.56 0.68 0.22 0.09 -0.18 0.48 -0.21 -0.15
-1.56 1.21 0.29 -0.61 0.8 -0.21 0.11 -0.17 -0.62 -0.37 -2.53 -2.41 -0.34 -0.63 -0.38 -0.59 0.1 -0.63 -0.02 -0.4 -0.17 -0.26 1.16 -0.81 -0.29 -1.54 -1.03 -0.02 0.18 0.27 0.11 -0.75 0.04 0.14 0.43 -0.54 0.06 0.15 -0.09 0.41 0.59 0.93 0.42 0.56 0.6 0.17 0.23 -0.04
0.15 -0.71 0.06 -0.91 0.32 -0.71 -0.3 -0.48 0.1 -0.45 0.67 0.71 -0.63 0.05 -0.39 0.39 0.07 -0.08 0.03 0.31 0.21 0.25 -1.17 1.46 -0.37 -0.43 -1.25 -0.62 -0.05 -0.19 -0.78 -0.71 -0.43 -0.45 -0.02 -1.04 -0.98 0.14 -0.28 0.49 0.92 1.13 0.53 0.19 -0.05 0.13 -0.51 -0.16
-4.51 -3.6 -7.68 -6.23 -2.07 -2.79 -3.25 -4.42 -4.38 -1.2 -4.57 -4.61 -1.43 -0.96 -1.67 2.0 -1.78 -5.13 -0.68 -0.79 -2.19 -3.66 -0.22 -0.1 -3.62 -4.5 -4.5 0.91 0.78 0.64 -0.15 -3.73 0.32 0.75 -1.16 -0.21 0.16 0.8 0.82 1.99 1.9 1.65 1.2 1.89 0.35 0.92 0.64 0.28
-0.04 -0.34 0.13 -0.96 -1.66 -2.6 -1.95 -1.98 -0.39 -0.47 -0.65 -0.64 0.01 0.6 -1.19 0.01 0.31 0.0 -0.49 -0.3 -0.27 -0.37 -2.27 -0.88 -0.18 -0.05 0.59 -0.41 0.25 -0.06 -0.74 -0.18 0.04 0.19 -0.04 0.08 -0.09 0.61 0.49 1.15 1.33 1.33 0.79 0.57 0.52 0.67 -0.66 -0.25
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-0.33 0.06 -0.01 0.01 -0.75 0.22 -0.5 -0.21 -0.51 0.19 0.62 0.65 0.09 -0.81 0.06 -0.09 -0.12 -0.66 -0.19 -0.16 -0.55 -0.6 -1.15 -1.88 -0.46 0.57 -0.71 -0.03 0.7 0.51 0.25 0.52 -0.0 0.24 -0.19 -0.44 -0.02 0.47 -0.5 0.06 -0.23 0.15 0.02 0.52 -0.04 0.47 0.49 0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.