Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
- - - - - - - - 1.75 - - - - - -0.34 3.74 4.06 - - - - - - - - 3.74 - - - -1.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.04 -2.37 0.23 -5.12 0.52 -1.09 -0.63 -0.19 -1.99 -2.56 -6.27 -7.49 -1.61 -2.05 -3.58 -0.01 2.98 -3.3 0.37 0.87 3.01 2.33 3.73 - -0.58 -3.95 -5.01 - -5.66 -2.41 -3.75 -4.08 -4.94 - - -5.77 -5.54 -1.41 -4.77 -1.97 -6.25 -5.77 -1.81 -3.19 -5.41 -1.96 -3.0 -7.31
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.6 - - - - - - - - - - - - - 4.48 2.93 - - - - - 3.38 - 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.14 - - - - - - - - - - - - 0.7 - - - 3.47 - 1.79 2.07 - 1.17 - - 4.44 - - - - -0.34 - - - - - - - - 0.27 - -0.41 - - -0.62 - -
- - 2.73 - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.56 - - - - - - - - - 3.89 - 4.22 - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.34 0.69 0.9 - -2.6 -1.7 0.09 -3.17 - -5.1 - - -4.16 -1.95 -6.53 -0.33 4.09 -2.63 3.82 2.94 -2.32 -3.3 0.14 - -2.27 -2.92 - -3.22 - -4.82 -4.5 - -6.5 - -3.83 -4.43 - -2.92 - -4.73 - - - -3.7 - -3.37 - -5.33
2.23 - 0.35 -1.98 -1.81 0.05 -3.07 -1.95 - -2.27 -3.28 -2.12 -1.1 -0.01 -3.15 - 3.46 -0.9 3.67 3.39 -2.56 -2.9 - - -0.77 -1.81 -2.44 -3.14 - -4.23 -3.15 - -2.98 - -3.62 -2.42 - -2.22 - - - - - - -2.84 -0.99 - -1.76
- - 0.24 - 0.37 - - - - -0.12 - - - - - - 4.63 - 3.19 2.12 - - - - 2.17 0.67 - - - -1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.58 -1.18 -2.55 -7.75 0.0 1.63 0.83 0.8 -0.44 -1.62 -4.05 -4.03 -1.1 -1.24 -1.65 1.84 3.08 - 1.88 0.67 -1.55 -0.69 2.11 - -5.47 -6.34 - - -6.52 -1.61 -3.02 -2.13 -2.08 -4.33 - - -5.02 -0.38 -3.44 0.32 - 0.97 2.52 -0.14 -1.59 -0.1 -1.67 -8.53
- - - - 2.6 - - - - - - - - - - - 4.87 - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.71 - 2.65 - - - - - - - - - - 2.02 4.37 1.72 - - - - - - 0.92 2.62 - - - -1.1 - - - - - 1.87 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -0.15 -0.85 -1.54 -3.83 0.52 1.38 1.56 -2.61 - 2.89 1.17 -0.14 0.48 -0.62 0.27 - - 0.95 -0.54 1.1 0.95 0.36 1.78 1.26 0.21 -2.1 1.45 0.8 - -0.79 - -2.97 - 1.39 -2.61 0.49 - - -0.81
- - -2.21 -2.01 -0.26 -2.9 -3.4 -2.19 - 0.0 -0.82 -1.29 0.87 1.56 1.03 - -3.65 -3.5 0.41 0.74 0.54 -0.2 - 1.86 1.18 -2.6 0.45 0.25 -1.36 -0.65 0.36 -1.71 -0.31 -0.95 -0.02 -0.5 0.95 0.13 0.63 0.76 1.3 0.73 0.16 0.6 -0.21 0.82 0.02 0.06
- 3.32 2.31 - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - 4.22 - - 2.48 -0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.67 -1.19 - - - - - 0.09 - -1.02 -1.17 1.66 0.18 -0.14 1.42 - - - - - - 0.57 - 1.81 - 2.32 0.44 0.29 0.79 -0.88 -0.17 - 0.72 - 0.55 1.24 1.09 -0.35 0.65 2.47 - 0.38 -0.76 - - 0.47
- - - - - - - - - - - - - - -1.02 - 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.73 - - - - - - - - - - - - 4.16 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.73 - - - - - - - - - - - - 4.16 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.0 0.81 1.01 1.03 -4.06 1.74 1.48 1.14 1.68 -2.23 -2.2 -1.24 -3.46 -2.89 -2.54 0.87 3.31 0.23 -0.14 -1.8 -2.33 -4.38 -2.43 0.8 -2.54 -0.47 -2.24 -0.73 -1.91 -0.24 -1.21 -1.65 -1.2 -0.69 -2.45 -1.96 -1.49 -1.71 -2.17 -1.39 -2.43 -2.15 -1.54 -2.22 -0.5 -2.05 -2.17 -0.72
- 2.65 2.4 - -21.94 -3.99 - - - - - - - - - - 4.85 0.01 - - - -0.7 - - - 2.08 - - - - - - - -16.57 - - - -14.88 - - - - -7.43 0.81 - - -25.19 -
-1.34 - -3.19 - -1.11 -1.02 -3.11 0.02 - -2.66 -0.56 -0.47 -1.79 -1.68 -1.45 - 3.34 -4.18 3.51 1.49 -2.0 -4.79 3.49 - -0.47 1.7 0.81 -4.65 - -7.79 - -1.43 - - - - - -3.27 - -3.0 - -4.76 -1.35 -3.21 -4.36 -3.92 - -
- - -0.13 -1.72 -1.82 -0.41 -0.17 - - -2.38 - -1.72 1.11 - -0.48 - 2.98 -1.64 3.62 0.17 - - 0.97 - - 1.72 - -2.16 1.02 -1.22 -3.13 - -3.27 - - - 0.39 0.09 -1.72 -1.88 1.62 - 1.74 - - -0.09 -0.61 -0.43
- - - - - - - - - - - - - - 1.39 - 5.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.63 2.89 - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.16 - - - - - - - - - - - - - 4.37 2.76 - - - - - - 2.95 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - - - - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - 3.31 - - 2.8 - - - - -
- - - - - - - - - -1.27 - - - - -2.94 - 3.71 - 3.64 3.82 - - - - - 0.85 - 0.07 - -1.56 - - - - - - - - - -0.3 - - - 0.73 - 1.06 - -
0.01 0.32 0.9 -3.21 2.97 0.64 0.57 -0.14 -0.07 -0.25 -6.82 -6.59 -0.65 -0.32 -1.33 -1.44 -0.44 0.16 0.49 -0.71 -1.22 0.0 2.17 -0.08 1.52 -2.53 0.84 -2.12 -2.23 -0.73 -1.31 -0.58 -0.12 -1.44 -2.52 -1.61 -0.74 -0.57 -1.77 0.07 0.0 -0.7 -0.11 -0.42 -0.94 -0.54 -0.85 -0.27
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.01 0.71 1.76 -0.25 0.12 - - - - - - - 1.18 - 2.53 0.02 4.23 -0.03 2.64 - - -0.42 -0.81 -0.76 - - - 0.3 - -0.36 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.87 - - - - - - 2.57 - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - - - - -
- 0.43 -1.53 - -0.78 -1.5 -1.76 -1.61 - -0.14 - - 1.51 -0.64 0.61 - 3.75 -0.74 2.28 2.56 -3.4 -3.71 -2.3 -2.59 0.98 1.89 2.77 - -4.26 -8.02 - - - - - - - - - - -3.04 -0.69 -3.34 -5.13 - - - -4.93
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.18 -4.1 -1.83 -8.86 0.12 -0.08 0.64 -1.15 -4.57 -1.57 -7.64 -9.86 -1.44 -0.35 -2.41 -5.35 4.46 -5.87 2.97 2.38 -0.56 -3.01 0.35 -7.68 -1.96 -5.95 - -7.43 -3.28 -3.46 -5.31 -6.04 -4.99 -7.24 -8.88 -5.33 -5.47 -2.61 -8.03 -0.49 -2.63 -0.6 -0.66 0.33 -4.13 -2.9 -2.46 -6.49
- - - - - - - - - 1.48 - - 1.94 - - - 1.58 - 3.73 1.73 - - 2.51 2.84 1.77 1.48 - - - - - - - - - - - 1.47 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.06 1.96 - - 3.58 1.53 - - - - - - - - - - - 0.15 - - - 1.73 - - - 1.57 2.05 3.6 - - 1.8 - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - 4.82 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.17 - 2.72 - - - - 1.6 - - - - -1.13 - 4.42 - - - - - - - - 3.08 - - - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.71 - -0.38 - - - - - - - - - - - 4.09 0.72 - - - - - 4.23 - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.56 - - - - - - - - - - 2.73 3.72 - - - - 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.45 - -1.58 1.37 0.6 1.68 - -2.78 - - -0.14 -0.4 0.51 - 0.15 -0.53 2.61 1.85 - 0.84 - -0.49 2.04 -1.29 3.74 -1.39 - -1.91 -1.34 -1.79 - - - - - - - - - - -1.62 -0.68 - - - -2.08
- - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - - - - 5.2 - - - - - - -8.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.83 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.53 - - - - - - - - - - 4.74 4.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.77 - 4.97 - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - 1.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.68 -1.66 -2.48 -4.25 2.71 -3.85 3.09 2.22 -1.13 -6.4 -6.71 -5.98 -6.48 -7.48 4.6 -3.61 -2.83 -1.49 -5.54 -4.0 -5.29 -4.22 -1.11 -2.93 -5.77 -4.2 -6.02 -5.95 -6.65 -4.3 -6.88 -6.8 -7.03 -6.7 -5.97 -7.04 -6.99 -4.84 -6.67 -5.9 -7.67 -6.55 -5.65 -6.07 -6.58 -5.05 -7.03 0.05
- - - - 0.69 3.53 - - - 0.71 - - - - 1.66 - 4.72 - - - - - - - - 1.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.96 - 2.36 - - - - - - - - - - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.55 - - - - - - - - - - - 4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.01 - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 2.76 - - - - - 2.88 - 3.08 - - - - - - - - - - 3.45 - - - - - - - - - - -
- - - - -5.04 -0.86 -3.84 -2.01 - 0.62 - - -1.01 -4.77 -0.76 - 4.38 -0.61 0.26 1.15 2.12 -0.48 3.15 -0.96 0.37 -2.2 -3.58 - - -1.34 -1.77 -5.23 -5.6 - - - - -0.55 - -3.82 - - -0.86 -2.34 - -0.59 -0.98 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -4.02 -0.11 1.12 - 1.42 1.76 -0.89 0.4 -0.51 - -0.07 -0.68 0.24 1.61 - -0.13 1.35 -2.88 0.73 0.4 -1.04 - 1.11 0.27 2.88 -30.16 - -3.32 0.3 -0.29 - -0.51 -3.52 -1.43 - -0.9 -0.79 -1.1 -0.49 0.54 -0.52 -0.01 -2.88 0.17 - -8.93 1.37
- - - -1.77 -1.0 - - - - 1.53 - - 0.22 -1.33 0.22 1.69 2.45 -2.2 - -1.36 2.26 1.43 - - 0.75 1.72 0.01 1.28 0.52 -0.12 1.32 0.36 -0.68 0.96 -0.81 1.21 0.4 0.48 - - - - - -0.38 -1.86 -1.14 -1.42 -2.15
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.96 -0.12 1.79 - - -1.03 0.79 - -0.19 - 0.46 - 1.92 -1.45 - -0.31 - -0.74 - 1.16 -1.25 - -1.15 - - 1.0 0.41 - 0.57 - - - -0.6 1.83 - 0.0 - 0.29 3.57 1.48 0.22 1.26 -0.39 -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.11 - 2.23 - - - - - -0.23 - - - - 3.02 2.09 - - - - - - - - 0.67 - -0.67 -0.03 0.92 0.52 0.87 0.42 -0.49 - -0.55 -0.26 1.09 0.35 - - - 0.01 1.05 -0.65 -0.62 - -0.12 2.87
- - - 4.01 3.35 - - - - - - - - - - - 4.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -6.34 0.79 -2.29 - -0.19 -23.66 -0.44 -3.37 -4.75 -2.01 -2.8 -0.94 0.35 -0.21 -1.44 2.5 2.77 1.77 1.3 0.26 -1.91 0.71 -3.74 0.16 0.7 0.73 -0.4 -0.4 -2.34 -0.18 0.54 -1.32 0.78 -0.39 -0.82 -0.14 -0.48 -0.53 -2.14 -0.09 -0.58 -1.27 -0.88 0.55 -0.11
- - -2.68 -0.22 0.87 - -0.17 1.18 - 1.05 -2.09 -1.25 0.65 -0.71 0.66 - - - -1.64 - - - - -0.46 -2.47 - - -0.86 0.41 0.27 1.21 -2.26 1.0 0.41 1.94 -0.44 0.77 -0.99 -0.28 1.56 1.86 1.03 0.63 1.02 0.84 -1.1 0.79 0.62
3.0 - 2.78 - 4.21 - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - - - - 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.68 - - - - - 0.52 - - - - -1.12 - 2.82 - 4.19 1.61 - - - - 0.97 3.16 - - - -1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.26 4.52 - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.