Heatmap: Cluster_252 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
-0.73 0.31 0.26 -1.59 0.02 -0.92 -0.51 -0.62 -0.61 -0.14 -0.09 -0.18 0.44 0.57 -0.34 -0.15 0.74 0.3 -0.04 0.25 -0.13 0.27 -1.0 -0.33 0.18 0.45 0.18 -0.08 -1.38 -0.09 -0.4 0.37 0.07 0.14 -0.13 -0.24 -0.05 0.22 -0.17 0.23 0.32 0.42 0.24 0.26 0.19 0.31 -0.12 -0.01
0.36 0.59 0.64 -0.88 0.6 -0.36 -0.0 -0.15 0.45 0.12 0.78 0.74 0.07 -0.86 -0.22 -0.1 0.46 -0.08 -0.17 0.08 0.19 0.02 -2.75 -0.69 -0.0 0.57 0.22 -0.28 -0.25 -0.21 -0.08 0.43 -0.21 -0.05 -0.22 -0.42 -0.13 -0.16 -0.72 -0.19 -0.41 0.01 -0.13 0.12 -0.29 -0.15 0.1 -0.45
0.53 0.61 0.56 0.32 -0.93 0.39 1.08 1.69 1.53 0.12 -0.63 -0.71 0.92 0.65 -0.59 -0.28 0.66 -0.03 0.17 -0.75 -0.97 -0.92 -2.81 -0.68 0.38 1.59 0.31 -1.68 -2.44 -0.68 -0.08 0.01 -1.0 -1.9 -2.17 -1.67 -0.29 0.7 -1.58 -0.9 -0.39 -0.42 -0.61 -1.51 -1.58 0.54 -0.89 -0.35
0.39 0.91 -0.01 -1.43 -0.46 0.19 0.46 0.73 0.92 0.28 0.01 0.06 1.69 1.27 0.09 0.06 0.08 0.99 -1.31 -0.98 -0.89 -0.24 -5.52 0.48 0.7 1.98 0.56 -1.69 -2.77 -1.24 -0.25 -0.56 -0.87 -1.79 -0.19 -1.46 -0.19 0.5 -1.39 -1.01 -0.76 -1.28 -1.15 -1.87 -1.36 0.52 -2.1 -1.16
-0.17 -0.5 -0.27 -3.61 0.66 0.64 0.94 0.73 0.26 0.32 0.39 0.3 0.33 -0.24 0.1 0.33 -0.08 -0.47 -0.02 0.19 -0.07 -0.09 -1.78 -2.02 0.51 -0.08 0.3 0.0 -0.47 -0.15 0.2 0.47 -0.16 -0.05 -0.66 -0.36 0.25 0.31 -0.97 -0.18 -0.1 -0.27 -0.15 -0.2 -0.37 0.27 -0.2 -0.18
-0.23 0.35 0.75 0.47 -0.64 -0.71 -0.64 -0.78 0.46 0.24 -0.02 -0.06 0.02 -1.47 -0.2 -0.33 0.5 0.04 0.82 0.4 0.44 0.45 -1.21 -1.18 0.03 -0.39 -0.13 0.22 0.04 0.26 0.1 -0.06 -0.28 0.19 -0.59 -0.23 -0.22 0.3 -0.95 -0.11 -0.19 -0.15 0.01 0.17 -0.45 0.42 0.49 0.22
-1.08 -0.23 0.13 -1.55 -0.93 -0.02 -0.13 0.18 -1.03 0.56 1.42 1.42 0.68 0.17 -0.02 -0.12 -0.2 -0.17 -0.44 -0.01 -0.37 -0.48 -3.77 -0.64 0.66 0.33 1.04 -0.9 -0.42 -0.19 -0.44 1.38 -0.35 -0.05 0.13 0.46 -0.44 -0.03 -0.67 0.11 -0.75 -1.16 -0.47 0.13 -0.56 0.15 -0.67 -0.47
0.79 -0.09 0.36 -0.75 -0.04 0.5 0.47 0.51 0.46 -0.35 -0.02 0.01 1.1 -0.27 -0.06 0.75 0.07 0.73 -1.15 -0.14 -0.74 0.09 -3.33 -0.06 1.02 2.08 0.31 -0.53 0.41 -1.06 0.15 -0.62 -1.99 -2.31 0.43 -1.56 -0.48 -0.55 -2.52 -0.44 0.51 -0.24 -0.52 -1.31 -1.57 -0.44 -1.87 -0.37
-0.25 0.02 -0.22 -1.39 -3.06 -1.23 -1.03 -1.05 0.51 0.31 1.36 1.48 0.35 0.09 0.05 -0.57 0.27 0.53 -0.47 -0.37 -0.41 0.13 -2.45 -0.04 0.04 0.76 -0.19 -0.22 -0.07 0.06 0.14 0.48 -0.02 -0.08 0.15 -0.05 -0.16 0.25 -0.29 -0.08 -0.5 -0.18 -0.19 -0.12 -0.4 0.25 -0.03 0.1
1.12 0.03 0.67 -0.53 0.53 0.22 0.28 -0.14 0.41 0.24 -0.63 -0.7 0.26 -0.16 -0.15 0.64 0.03 -0.44 0.14 0.44 0.16 0.24 -1.42 -2.21 -0.13 -0.87 -0.51 0.08 0.44 0.1 0.02 -0.28 -0.21 0.02 0.66 -0.56 0.04 0.62 -0.97 -0.31 -0.69 -0.95 -0.14 -0.24 -0.68 0.65 -0.29 -0.08
0.72 -0.04 -1.26 -2.77 -2.56 0.66 1.35 0.99 0.39 0.45 -2.46 -2.76 0.47 -0.31 -0.06 1.35 0.02 -0.49 0.82 0.14 -0.73 -1.09 -1.61 -3.16 0.8 1.82 0.63 1.04 0.26 -0.96 0.28 -1.99 -0.29 -0.58 0.98 0.63 0.69 -0.03 -1.25 -1.31 -3.1 -3.11 -0.74 -1.62 -1.63 -0.17 -1.31 -1.1
-1.26 -0.42 0.46 -0.25 0.17 -0.62 -0.69 -0.85 -1.52 0.61 1.04 0.89 0.77 0.57 -0.1 -1.67 0.42 0.12 -0.35 -0.68 -0.62 0.07 -3.72 -1.02 0.39 0.9 0.52 -0.42 -0.2 -0.33 -0.03 0.07 0.06 -0.06 -0.21 -0.07 0.21 0.23 -0.48 0.05 0.43 0.47 0.15 -0.05 -0.38 0.21 -0.4 -0.18
1.07 0.48 0.59 -1.37 -0.92 0.28 0.58 0.88 0.38 0.05 1.42 1.28 0.29 -0.56 -0.11 -0.25 0.59 -0.28 -0.04 -0.05 0.2 0.04 -0.72 -2.26 -0.45 -0.29 -0.63 -0.54 -0.24 -0.25 -0.54 0.89 -0.42 -0.18 -0.28 0.18 -0.41 -0.06 -1.2 -0.53 -1.26 -1.01 -0.63 -0.32 -0.7 -0.01 -0.59 0.02
-0.06 -0.13 0.34 -2.41 0.28 -0.5 -0.72 -0.3 -0.06 0.14 0.42 0.49 0.53 0.31 -0.2 -0.25 0.23 0.04 -0.27 -0.09 -0.1 0.18 -2.52 -1.02 0.18 0.48 -0.22 -0.05 0.11 -0.15 0.05 0.36 -0.03 0.12 0.07 -0.21 0.01 0.52 -0.27 0.14 0.13 0.29 0.11 -0.05 -0.16 0.54 -0.09 -0.36
0.58 0.36 0.81 -1.67 -0.06 0.53 0.31 0.22 -0.03 -0.19 0.72 1.03 0.23 -0.24 -0.34 -0.23 0.6 -0.19 -0.18 0.13 -0.38 -0.35 -0.45 -1.93 -0.08 0.31 0.24 0.1 0.01 -0.24 -0.24 0.95 -0.38 -0.09 0.01 -0.69 0.11 0.02 -0.73 -0.23 -0.82 -0.8 -0.23 -0.32 -0.09 -0.02 -0.24 -0.54
-0.09 -0.59 0.17 -1.14 -0.68 -0.32 -0.65 -0.29 0.05 0.21 0.56 0.42 0.34 0.04 -0.23 0.62 0.71 0.16 -0.21 -0.01 0.07 0.22 -2.21 -1.15 0.16 0.42 -0.36 -0.29 -0.03 -0.18 -0.07 0.13 0.14 0.2 -0.13 -0.16 0.04 0.29 -0.38 0.18 0.12 0.26 0.13 0.06 0.2 0.3 -0.08 -0.26
1.82 0.95 1.19 -1.79 -1.59 1.21 0.85 0.62 0.85 -0.21 -2.01 -2.86 -0.03 -0.66 -0.62 0.04 0.18 0.89 -1.93 -0.67 -0.83 -1.59 -3.39 -2.55 1.27 1.61 0.59 0.97 -1.4 -0.42 0.6 -0.18 -0.83 -0.77 0.8 -0.94 0.22 0.3 -2.19 -1.3 -1.21 -1.59 -1.46 -2.83 -2.23 0.14 -1.18 -0.5
1.95 0.68 -3.9 -0.3 -1.81 -0.14 -0.27 -0.76 1.5 0.06 -1.17 -1.52 1.44 0.15 0.46 0.1 -1.07 -0.1 -0.98 -1.29 -0.4 0.76 -5.68 0.56 -0.15 2.16 0.39 -0.51 -1.66 -0.81 0.05 0.76 -0.45 -1.69 0.23 -1.73 0.72 0.31 -1.93 -1.59 -1.66 -2.05 -0.45 -3.56 -0.59 0.48 -2.99 0.37
0.64 0.92 -0.18 -1.33 1.05 1.2 1.0 0.95 1.06 -0.37 -0.09 0.17 -0.55 -0.96 -0.05 -0.31 -0.24 0.33 -0.55 -0.25 -0.34 -0.02 -1.07 -0.43 0.47 1.17 -0.09 -0.15 -0.89 -0.27 -0.37 0.48 -0.7 -1.0 1.19 -0.77 -0.51 -0.29 -1.22 -0.78 -1.3 -1.67 -0.62 -0.78 -0.79 -0.3 -0.55 -0.13
0.47 0.56 -0.16 -2.52 0.16 1.0 0.92 0.79 0.97 0.03 0.16 0.14 0.45 -0.07 0.25 0.36 0.15 -0.12 -0.18 0.38 -0.08 -0.16 -0.05 -2.31 -0.08 0.25 -0.43 0.67 -0.26 -0.32 0.63 -0.13 -0.44 -0.52 0.48 -0.14 0.31 -0.03 -1.3 -1.39 -1.89 -1.75 -0.92 -1.31 -0.42 -0.01 -0.74 -0.06
-1.22 -0.59 0.29 0.52 -0.81 0.3 0.07 0.07 -0.67 0.41 0.67 0.42 0.38 0.52 -0.15 -0.92 0.44 0.12 -0.74 -0.48 -0.7 -0.21 -2.29 -1.29 0.39 0.9 0.34 -0.35 -0.37 -0.19 0.19 0.22 0.01 -0.12 -0.77 -1.25 0.04 0.54 -0.65 0.1 0.35 0.78 0.35 -0.08 -0.24 0.52 -0.06 -0.46
-0.04 -0.31 -1.62 -1.47 -0.54 1.06 0.86 0.9 0.24 0.81 0.99 0.87 0.94 0.48 -0.08 -0.14 -0.93 -0.54 -0.17 0.15 0.37 0.54 -2.46 -1.3 0.68 -1.01 -0.11 -0.98 -0.89 -0.52 -0.28 0.52 -0.18 -0.56 -0.25 -0.88 0.0 0.71 -1.02 -0.83 -0.49 -0.46 -0.06 -0.38 -0.19 0.81 -0.78 -0.79
-0.39 -0.56 -0.31 -1.94 0.66 0.3 0.64 0.86 0.32 0.52 -0.31 -0.51 0.45 -0.38 0.04 -0.28 -0.52 -0.24 -0.06 0.14 -0.11 -0.11 -2.71 -1.41 0.36 -0.17 0.23 0.3 0.28 0.06 0.6 0.51 0.16 0.16 -0.89 0.07 0.7 0.49 -1.06 -0.33 -0.47 -0.63 -0.21 -0.21 -0.34 0.46 0.05 -0.08
-0.03 -0.3 0.16 -1.96 0.67 0.2 0.55 0.5 0.45 0.33 -0.24 -0.27 0.65 0.31 -0.04 -0.73 0.1 -0.1 -0.21 0.33 0.44 0.42 -2.23 -0.87 0.23 0.2 -0.08 0.05 -0.07 -0.15 0.22 0.4 -0.15 -0.24 -0.47 -0.11 0.25 0.29 -0.64 -0.09 -0.13 -0.56 -0.15 -0.45 -0.21 0.23 -0.34 -0.21
2.03 0.64 -0.86 -2.0 -0.52 -0.22 -0.11 0.64 2.37 -0.57 1.3 1.16 -0.99 -2.22 0.98 0.8 -1.04 -1.69 -1.84 -1.71 -2.7 -2.24 -3.56 -3.04 0.26 1.8 0.72 -0.07 -1.52 -0.75 -2.99 1.76 -2.0 -1.28 0.63 -2.28 -1.42 0.55 -1.96 -2.71 -4.11 -4.83 -1.7 -3.22 -0.84 0.52 -2.85 0.64
-0.58 0.14 0.77 0.1 -1.02 -0.67 0.35 -0.11 0.28 0.19 -0.77 -0.8 0.56 -0.34 0.27 -1.07 -0.09 1.41 -0.49 -0.47 -0.28 0.27 -4.37 0.39 1.28 2.06 1.26 -0.4 -0.05 -0.52 -0.26 -0.57 -0.75 -0.78 1.34 -0.47 0.19 -0.02 -2.2 -1.13 -0.98 -1.13 -1.22 -1.73 -1.73 0.09 -2.34 -0.28
1.02 0.19 -0.03 -1.64 0.87 0.63 0.19 0.3 0.43 0.22 0.33 0.14 0.2 -0.7 -0.19 0.32 0.14 -0.44 -0.61 0.06 0.27 0.23 -0.58 -2.07 0.49 -0.15 0.11 -0.31 0.57 -0.4 -0.11 0.38 -0.0 0.17 0.83 -0.25 -0.01 -0.22 -0.96 -0.48 -1.25 -1.36 -0.27 -0.54 -0.27 -0.18 -0.34 -0.22
-1.26 -0.84 0.11 -1.88 1.17 0.23 0.22 -0.1 0.4 0.78 -0.27 -0.51 0.87 0.28 0.27 -1.07 -0.17 -0.47 0.19 0.34 0.16 0.26 -1.95 -1.55 0.56 0.23 0.33 0.03 -0.84 -0.22 0.39 0.43 -0.09 0.03 -1.61 -0.14 0.4 0.57 -0.81 -0.22 -0.32 -0.45 -0.16 -0.19 -0.5 0.48 0.17 -0.06
0.67 -0.77 -0.38 -1.59 0.29 0.07 -0.56 -0.45 -1.09 -0.02 0.75 0.86 0.13 0.04 0.06 1.79 0.52 0.01 0.21 0.53 -0.04 -0.01 -2.8 -1.36 0.19 1.12 -0.34 -0.43 -0.32 -0.33 -0.41 -0.1 -0.6 -0.35 -0.08 -1.19 0.03 0.26 -0.96 -0.18 0.03 0.1 -0.14 -0.06 -0.57 0.26 -0.59 -0.21
0.9 0.46 0.57 -3.68 -0.17 0.1 0.08 -0.19 -0.63 0.4 1.01 1.06 0.3 0.16 0.1 -0.27 0.46 -0.44 -0.14 -0.07 -0.29 0.01 -1.78 -2.24 -0.2 0.08 -0.6 -0.14 0.37 -0.07 0.49 0.1 -0.32 -0.32 0.43 -0.29 0.05 0.44 -0.73 -0.25 -0.23 -0.25 -0.21 -0.29 -0.73 0.31 -0.35 -0.23
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0.32 0.43 0.04 -0.46 0.92 0.15 0.74 0.49 1.2 -0.26 0.3 0.78 -0.19 -0.83 0.24 0.82 0.55 0.73 -0.63 -0.63 -0.73 -0.71 -1.35 0.06 0.4 0.85 0.73 -0.16 -0.36 -0.67 -0.37 -0.33 -0.85 -0.92 0.42 -0.15 -0.18 0.35 -1.4 -0.85 -0.77 -1.11 -0.87 -0.94 -1.09 0.28 -0.94 -0.61
1.36 0.57 1.01 -0.61 1.02 0.86 0.21 0.31 0.83 0.15 0.1 -0.19 -0.49 -1.15 0.09 1.48 0.57 -1.47 -0.55 -0.46 -0.32 -0.14 -0.13 0.01 -0.42 -0.06 -0.98 -0.33 0.04 -0.41 -0.49 0.61 -0.38 -0.11 0.96 -1.41 -0.33 0.01 -1.36 -1.2 -1.97 -1.79 -0.37 -1.07 -0.8 0.05 -0.83 -0.64
0.38 0.1 0.62 -1.63 1.02 0.45 0.13 -0.08 1.01 -0.09 0.5 0.39 -0.47 -1.45 -0.58 0.84 0.31 -0.7 -0.02 0.38 0.41 0.24 -0.22 -1.8 -0.04 -0.26 -0.35 0.05 0.53 -0.25 0.45 0.46 -0.14 0.06 0.12 -0.13 -0.07 -0.1 -1.14 -0.73 -1.42 -1.65 -0.61 -0.6 -0.76 -0.03 0.28 -0.07
0.43 0.07 0.66 0.09 0.27 -0.48 -0.16 -0.47 -0.59 0.12 0.85 0.93 -0.01 -1.18 -0.37 -0.23 0.37 0.41 0.11 0.07 0.19 0.47 -1.19 -1.07 0.14 0.27 0.04 0.06 -0.38 0.09 -0.24 0.4 -0.17 0.24 -0.34 -0.14 -0.25 0.26 -0.73 -0.39 -0.97 -0.78 -0.32 -0.29 -0.4 0.28 0.17 0.45
-0.1 0.31 0.58 -0.75 -0.94 0.33 0.16 0.58 0.46 -0.09 1.24 1.57 0.54 0.47 0.1 -0.12 0.23 0.54 -0.19 0.05 -0.33 -0.1 0.38 -1.04 0.18 0.8 0.76 -0.84 -1.2 -0.39 -1.0 0.73 -1.07 -0.86 -0.22 -1.22 -0.71 -0.28 -1.12 -0.36 -0.42 -0.81 -0.71 -0.76 -0.97 -0.18 -1.41 0.1
-0.49 0.22 0.45 -0.51 0.99 1.02 0.82 0.93 0.15 -0.12 0.67 0.32 -1.01 -2.86 -0.16 -0.27 0.32 -0.57 0.5 0.41 0.17 0.4 -1.87 -2.21 -0.19 -0.91 -0.27 0.41 0.72 0.16 0.54 -0.26 -0.07 0.62 0.21 -0.69 0.02 0.04 -1.34 -0.39 -1.48 -1.41 -0.42 -0.4 -0.95 0.08 -0.16 -0.38
-0.63 -0.31 0.17 -1.07 -1.06 0.08 0.09 0.31 -0.61 0.17 -0.07 -0.22 0.67 1.11 -0.56 -0.4 0.88 1.3 0.55 0.36 0.3 0.26 -0.34 -0.16 0.37 -0.23 -0.74 -0.94 -0.41 -0.4 -0.44 -0.4 -0.36 -0.36 0.86 -0.4 -0.8 0.21 -0.69 -0.15 0.1 0.3 0.16 -0.55 -0.55 0.24 -0.43 -0.28
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0.81 0.49 0.83 -0.82 0.58 0.68 0.67 0.83 0.2 0.11 1.4 1.55 -0.29 -1.49 -0.01 0.14 -0.08 -0.02 -0.13 -0.13 -0.37 -0.4 -1.36 -0.76 -0.12 0.27 -0.45 -0.08 -0.18 -0.29 0.3 0.35 -0.73 -0.83 -0.83 -1.21 0.02 0.21 -1.73 -0.8 -0.92 -0.84 -0.77 -0.81 -1.18 0.25 -0.6 -0.05
-0.18 -0.21 0.37 -2.12 0.18 0.09 -0.33 -0.27 0.3 0.34 0.79 0.49 0.43 -0.15 -0.04 -0.35 0.08 -0.47 -0.32 -0.24 -0.12 0.18 -2.06 -1.66 0.59 0.48 0.46 -0.17 0.41 -0.34 0.19 0.49 0.21 0.12 -0.0 -0.23 0.38 0.1 -0.62 0.03 -0.24 -0.42 -0.07 -0.05 -0.11 -0.0 0.06 -0.34
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-0.67 0.4 0.46 -1.15 -1.27 0.33 0.57 0.14 -0.04 0.06 0.17 0.15 0.08 -0.18 -0.5 0.33 0.67 0.86 0.56 0.28 0.21 -0.12 -2.53 -0.85 0.18 -0.06 -0.24 0.0 0.59 -0.25 -0.08 -0.24 -0.08 0.23 0.34 0.17 0.06 0.24 -0.44 -0.43 -0.81 -0.58 -0.25 -0.11 -0.4 0.17 -0.01 -0.37
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2.82 2.0 1.88 1.65 0.64 1.14 0.56 0.99 1.87 -0.88 -1.03 -0.8 -1.93 -3.66 0.64 1.7 0.7 0.68 -1.51 -2.02 -1.98 -1.91 -1.85 0.23 -2.63 0.85 -3.98 -4.65 -1.93 -2.19 -3.98 -3.62 -2.38 -3.91 -4.2 -4.08 -4.21 -1.61 -4.14 -1.71 -1.23 0.08 -1.68 -2.51 -2.06 -1.35 -3.79 -2.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.