1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0
0.0 0.22 1.17 0.0 0.0 0.12 1.4 0.39 1.44 0.0 0.78 0.0 0.0 0.86 0.75 0.69 0.79 1.52 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.31 0.0 0.0 0.17 0.07 0.0 0.03 0.14 0.03 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.58 0.0 0.14 0.45 0.0 0.0 0.55 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.0 0.05 0.12 0.59 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.4 2.64 0.76 2.95 1.6 0.39 0.43 0.0 0.0 0.13 0.0 0.55 0.51 0.2 0.22 1.17 0.56
0.0 0.0 0.25 0.07 0.07 0.51 0.17 0.17 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.23 0.19 0.06
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.05 0.02 0.05 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.44 0.5 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.14 0.25 0.0 0.19
0.0 0.57 1.4 0.0 0.0 0.97 0.25 0.56 0.58 0.4 0.34 1.62 0.04 0.41 0.0 1.17 1.42 0.34 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.15 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0
0.0 0.0 0.23 0.0 0.16 0.45 0.13 0.13 0.44 0.47 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.2 0.22 0.53 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.16 0.0 0.15 0.2 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.14 0.2 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.3 0.0 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.28 0.48 0.51 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.53 0.03 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04
0.13 0.0 0.43 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.56 1.4 0.0 1.43 2.36 0.69 0.0 0.0 1.94 0.23 1.07 0.37 0.21 1.13
0.0 0.0 3.47 0.0 1.14 2.93 0.0 0.19 2.47 3.97 3.08 4.68 1.19 1.46 0.15 3.36 3.32 2.45 0.88
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.0 0.22 0.0 0.0 0.11
0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.22 0.68 0.73 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0
2.06 0.0 4.05 0.59 0.39 1.95 0.83 0.0 1.38 0.87 0.97 0.93 1.07 0.71 0.0 0.68 0.33 0.27 0.86
0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.53 0.0 0.23 0.79 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.19 0.17 0.69 0.7 0.18 0.73 1.19 1.87 0.63 0.91 0.9
0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.26 0.49 0.0 0.47 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.04 0.34 0.34 0.1 0.35 0.09 0.12 0.4 0.32 0.02 0.04 0.01 0.1 0.04 0.0 0.1 0.24 0.03
0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0
0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.62 0.0 0.61 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 1.13 0.21
0.56 0.35 0.55 0.42 0.48 0.73 0.75 0.73 0.67 0.17 0.19 0.09 0.19 0.78 0.61 0.66 0.47 0.73 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.0 0.0 0.52 0.59 3.13 0.9 0.36 1.24 0.12 0.02 0.0 0.0 0.13 0.1 0.39 0.06 0.35 0.33
0.47 0.66 1.98 2.27 2.33 3.44 2.1 1.49 1.42 0.63 0.54 0.0 0.31 2.47 1.43 0.6 0.48 2.66 1.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)