Heatmap: Cluster_136 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.0 0.01 0.63 0.54 0.88 0.3 0.5 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.1 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.04 0.22 0.0 0.02 0.04 0.05 0.03 0.02 0.32 0.3 0.04 0.0 0.73 0.74 1.55 0.0 0.15 0.04 0.21 0.19 0.73 0.0 0.93 0.48 1.12 2.88 0.0 0.03 0.74
1.55 11.17 0.88 2.23 2.36 1.11 3.1 0.09 0.07 0.05 0.04 0.0 0.01 10.14 9.93 6.88 8.48 10.24 1.95 12.47 12.06 6.59 10.22 7.67 0.74 7.88 6.88 14.79 11.14 0.32 9.17 14.31 6.07 19.11 8.05 13.63 17.3 9.93 9.25 2.83 1.38 33.48 31.58 14.34 26.31 12.08 8.2 14.01
0.0 0.01 0.15 0.06 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.01 1.32 0.0 0.21 0.0 0.0 0.76 0.85 1.85 0.0 0.0 0.91 0.12 4.07 0.0 0.0 17.08 8.13 0.21 3.41 0.0 0.0 0.38
6.42 6.44 3.96 3.86 3.37 2.4 2.79 1.26 0.25 0.31 0.1 0.16 1.27 5.9 7.2 5.17 5.89 4.24 1.92 6.43 6.06 3.66 5.02 4.7 1.04 5.41 7.49 4.46 13.97 0.69 4.49 4.11 3.63 5.35 3.41 5.69 9.61 5.32 7.93 3.48 8.08 9.8 8.06 6.58 5.88 2.88 0.14 3.28
0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.14 0.05 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.05 0.08 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.35 2.96 7.47 8.14 0.31 0.01 0.04 0.61 0.35 0.02 0.01 31.45 31.91 0.13 22.01 0.0 0.0 4.88
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.1 0.0 0.01 0.0 0.19 2.41 2.88 9.7 0.0 0.0 1.92 0.51 8.91 0.0 0.04 35.29 3.3 0.05 10.44 0.0 0.0 0.18
0.01 0.07 0.07 0.13 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.06 0.02 0.02 0.06 0.0 0.04 0.01 0.04 0.02 0.1 0.45 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.09 0.02 0.01 0.83 0.94 0.13 0.12 0.0 2.2 0.0 0.0 0.12
0.01 0.07 0.07 0.13 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.06 0.02 0.02 0.06 0.0 0.04 0.01 0.04 0.02 0.1 0.45 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.09 0.02 0.01 0.83 0.94 0.13 0.12 0.0 2.2 0.0 0.0 0.12
0.01 0.07 0.07 0.13 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.06 0.02 0.02 0.06 0.0 0.04 0.01 0.04 0.02 0.1 0.45 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.09 0.02 0.01 0.83 0.94 0.13 0.12 0.0 2.2 0.0 0.0 0.12
1.65 5.41 0.0 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 7.8 7.95 10.38 2.2 2.83 1.11 5.76 2.98 8.62 9.54 4.18 1.88 6.72 3.81 5.17 2.51 1.44 1.62 13.37 7.77 9.35 5.31 4.46 14.74 8.16 11.82 1.75 0.57 16.02 12.8 15.63 15.58 0.0 0.08 7.9
13.23 13.75 0.33 0.92 0.25 0.17 0.62 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.03 17.44 16.47 8.15 13.57 10.34 10.92 13.17 10.17 6.09 7.28 17.89 4.56 16.74 74.49 14.83 23.35 0.26 19.34 9.89 7.06 15.01 8.47 27.37 32.39 15.18 17.1 6.29 7.1 52.03 14.63 6.7 22.3 11.4 13.86 5.6
2.4 9.23 1.9 1.39 1.22 0.37 0.82 0.0 0.02 0.02 0.02 0.16 0.0 6.81 5.62 4.55 6.5 3.85 1.63 8.27 4.6 4.92 6.09 3.38 3.38 3.82 6.81 3.68 1.54 4.42 4.85 3.34 4.39 7.29 5.47 6.52 9.18 8.03 8.95 2.43 1.71 16.27 10.76 5.66 4.17 0.0 2.52 4.06
2.11 0.91 1.35 0.71 1.11 0.7 0.69 0.07 0.05 0.01 0.01 0.0 0.16 1.34 1.15 1.11 0.19 0.22 0.14 0.91 0.91 1.08 1.74 0.39 0.17 0.48 0.28 0.75 1.12 0.15 0.7 0.91 0.68 0.71 0.86 0.88 1.91 1.3 2.21 0.06 0.88 3.04 1.96 1.56 2.18 0.0 0.0 1.04
11.82 5.12 6.86 6.18 3.16 0.58 4.76 0.03 0.02 0.04 0.08 0.0 0.0 11.69 9.24 5.19 1.86 1.29 1.8 3.28 2.64 7.75 5.65 3.37 1.65 4.05 1.9 0.78 7.85 0.85 2.52 3.97 9.76 6.81 6.73 9.48 14.66 6.32 10.28 1.93 2.36 5.74 0.45 2.41 10.08 0.0 0.0 1.41
18.6 10.77 1.84 1.11 1.25 0.58 1.25 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.0 8.71 14.46 8.74 3.22 6.51 3.26 11.58 4.87 10.11 11.56 7.15 3.65 6.4 7.65 19.75 17.85 0.9 9.07 16.59 15.07 39.73 8.62 17.5 20.58 14.04 10.89 11.13 40.65 57.8 24.78 8.22 42.21 0.28 0.0 9.53
2.13 14.38 3.96 2.63 2.52 0.24 1.28 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 12.11 6.61 5.56 0.78 1.16 1.28 15.46 5.26 9.22 12.47 4.81 2.07 5.8 1.02 5.41 3.36 4.06 8.05 4.67 6.96 8.32 9.52 9.64 17.27 11.95 18.26 0.82 2.15 28.27 12.44 13.58 8.58 0.0 0.01 6.05
0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.29 0.11 0.16 0.22 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.05 0.04 0.02 0.46 0.09 1.12 1.19 0.26 0.73 3.71 0.32 0.05 0.24 0.1 0.01 0.0 0.13 0.01 0.0 0.01 0.02 0.12 0.44 0.09 0.57 0.04 2.05 1.02 0.01 4.78 1.47 6.79 0.18 0.94 1.06 0.73 3.14 1.61 12.99 46.47 25.14 3.3 18.92 0.0 0.0 4.55
0.18 0.09 0.08 0.03 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.64 0.04 0.02 0.16 0.16 0.0 0.05 0.08 0.24 0.2 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.15 0.01 0.12 0.03 0.11 0.1 0.04 0.46 0.52 0.69 0.16 0.0 0.0 0.12 0.03 0.03 0.01 0.0 0.22 0.01
0.04 0.11 0.89 0.52 0.36 0.0 0.37 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.15 0.31 0.0 0.05 0.01 0.11 0.03 0.45 1.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.57 0.49 1.67 0.51 0.11 0.14 0.69 0.76 0.0 0.0 10.93 5.87 0.21 5.97 0.0 0.0 0.67
2.52 3.21 3.03 2.11 3.48 2.06 2.4 0.22 0.07 0.05 0.05 0.0 0.0 2.26 1.26 1.21 1.42 1.28 0.47 4.12 0.75 1.43 2.0 0.9 1.2 0.93 2.17 1.72 0.46 1.13 1.74 1.76 3.88 10.74 1.32 0.95 7.4 2.39 7.64 1.07 3.54 12.04 1.32 3.33 3.11 0.0 0.0 0.98
10.94 11.99 22.8 22.5 9.16 1.82 18.86 0.12 0.06 0.07 0.15 0.0 0.0 11.15 4.27 8.55 5.02 6.47 2.61 12.6 6.56 12.65 20.89 6.6 1.25 7.49 3.09 13.36 3.18 0.88 11.36 10.81 6.69 7.91 14.44 11.89 8.67 11.77 11.07 2.57 2.48 24.04 20.39 21.14 20.75 22.89 2.27 19.32
6.31 0.47 2.16 1.56 1.14 0.17 1.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.9 0.79 1.68 0.18 0.02 0.27 0.47 0.24 0.61 0.96 0.31 0.28 0.54 3.99 0.16 1.23 0.09 0.37 2.04 2.21 8.98 1.89 0.78 6.54 3.23 5.54 0.2 4.39 20.79 8.7 3.74 12.61 0.0 0.0 4.11
0.04 0.13 0.1 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.17 0.03 0.0 0.07 0.04 0.07 0.0 0.03 0.03 0.11 0.34 0.2 3.4 0.0 0.16 0.0 0.24 0.66 0.58 3.08 0.02 0.44 21.77 0.56 1.37 0.0 0.0 10.42 4.67 0.13 7.96 0.0 0.0 0.31
0.79 3.72 1.26 1.87 1.84 1.44 2.09 0.36 0.15 0.13 0.23 0.0 0.25 2.41 1.42 1.88 0.91 0.78 0.44 1.94 1.04 2.3 2.24 1.03 0.38 1.56 1.54 1.91 3.09 0.44 1.41 1.82 1.49 2.15 1.51 1.9 2.93 2.53 4.25 3.14 0.53 12.45 4.94 2.3 4.36 0.31 2.88 1.32
0.75 3.27 2.82 1.01 2.64 0.06 2.03 2.27 1.08 0.42 0.23 0.0 0.52 6.09 1.79 1.15 2.27 0.81 0.83 1.84 2.16 0.89 1.81 2.3 0.56 2.21 6.89 1.34 4.49 0.42 2.04 2.54 3.13 7.65 1.79 2.95 8.14 5.67 5.85 0.71 1.87 27.36 18.05 3.08 8.23 0.42 1.41 5.29
0.29 0.02 1.5 1.03 1.23 0.25 0.55 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.37 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.13 0.0 0.15 0.02 0.09 0.92 0.01 0.02 0.04 0.39 0.71 0.0 0.17 1.31 0.37 0.96 0.05 0.0 1.61 0.17 0.18 1.11 0.0 0.0 0.12
0.33 2.51 0.27 0.88 0.11 0.0 0.41 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 7.05 1.12 1.32 0.02 0.13 13.05 0.4 0.11 0.0 0.0 7.33 5.55 1.29 82.92 0.02 49.23 0.36 7.56 8.67 3.83 15.11 0.06 0.91 18.03 4.26 10.81 0.04 0.17 139.35 20.94 4.71 14.75 0.0 0.0 3.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.12 2.43 1.91 1.29 0.73 8.87 4.68 0.01 0.36 0.0 0.0 0.0 0.42 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.08 0.49 0.02 0.0 0.0 0.13 0.05 0.0 0.0 0.93 0.85 0.02 1.91 0.0 0.0 0.15
4.1 0.1 0.24 0.38 1.53 1.24 0.78 0.08 0.03 0.03 0.04 0.0 4.12 0.01 0.1 0.01 0.02 0.02 0.23 0.09 0.44 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.05 0.02 0.05 0.03 2.4 1.54 3.94 0.01 0.0 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 23.78 11.68 0.06 13.53 0.0 0.0 1.81
0.3 1.89 4.73 4.62 4.02 1.18 4.25 0.04 0.92 0.09 0.19 0.01 0.0 2.68 1.87 5.15 0.14 0.01 0.65 2.74 1.56 6.29 6.24 0.72 0.08 0.91 0.57 1.96 0.25 0.07 0.9 6.07 3.18 5.54 3.6 1.34 1.6 3.74 4.36 2.52 0.02 19.88 8.86 3.39 11.44 0.0 0.0 4.2
0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.15 0.58 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.03 0.68 0.29 1.61 0.5 0.0 0.73 0.56 0.34 0.0 0.0 4.72 7.68 0.83 9.32 0.0 0.0 1.82
8.06 16.54 16.61 14.23 12.12 3.67 12.39 0.02 0.06 0.13 0.17 0.0 0.0 9.83 17.85 9.73 7.99 5.85 3.05 13.32 9.92 6.43 6.33 7.03 3.48 7.73 10.29 7.6 10.58 3.39 10.61 8.16 9.6 10.48 7.24 6.02 12.38 9.77 18.56 0.74 27.3 14.2 7.57 7.14 7.07 0.0 2.97 4.32
0.0 0.0 0.13 0.16 0.05 0.02 0.26 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.14 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 0.27 0.27 0.7 0.01 0.01 0.15 1.48 0.28 0.0 0.0 3.83 3.52 0.14 5.16 0.0 0.0 1.14
6.95 15.01 6.22 6.65 5.99 1.41 7.12 0.07 0.09 0.09 0.09 0.1 0.0 8.31 10.68 5.48 4.65 2.38 1.55 10.05 15.53 5.52 6.18 4.44 1.8 5.03 4.69 4.64 5.86 1.5 7.61 3.66 4.45 4.51 4.3 6.35 7.93 6.61 4.75 2.01 2.29 12.78 8.36 8.08 5.26 0.15 0.57 3.66
0.04 0.22 2.66 3.37 1.83 0.26 2.54 0.09 0.01 0.01 0.09 0.05 0.18 11.93 0.75 5.67 0.0 0.05 1.33 0.06 0.0 0.07 0.11 0.54 4.04 1.54 60.68 0.03 2.92 0.07 0.35 4.41 5.9 46.3 0.1 0.73 31.54 8.46 53.55 0.12 13.46 114.26 6.59 0.17 48.97 0.0 0.0 0.35
0.14 0.11 0.38 1.44 0.6 0.11 0.92 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.2 0.03 0.0 0.24 0.0 0.05 0.34 0.06 0.02 0.05 0.12 1.02 0.45 0.6 0.03 3.91 6.62 0.41 0.16 3.4 0.92 3.81 0.07 0.02 0.08 0.78 1.11 1.27 0.0 30.28 9.78 0.75 12.41 0.0 0.0 3.07
0.3 0.1 0.15 0.32 0.37 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.23 0.18 0.0 0.04 0.26 0.16 0.69 1.72 0.05 0.0 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.08 0.87 0.64 1.86 0.44 0.43 0.7 0.68 0.41 0.0 0.0 6.37 5.0 0.82 5.06 0.0 0.0 1.32
11.83 19.29 6.26 3.92 2.64 0.3 3.58 0.02 0.11 0.06 0.14 0.01 0.13 11.51 10.77 7.59 4.94 4.57 2.25 13.42 6.36 8.58 10.01 6.85 1.17 7.51 5.31 12.3 5.92 1.21 9.19 5.46 6.68 8.14 9.13 10.18 19.64 14.19 18.57 5.68 12.31 23.96 12.91 11.3 7.48 5.75 1.55 4.94
9.05 0.14 0.11 0.26 0.45 0.62 0.21 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 2.86 0.08 0.05 0.55 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.03 0.03 0.13 0.02 0.04 1.85 0.31 0.13 0.08 0.54 0.58 3.62 0.23 0.07 3.33 2.74 3.36 0.0 0.0 15.14 4.01 6.8 6.45 0.19 0.0 1.6
0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.22 0.02 0.26 0.34 0.0 0.81 0.0 0.09 0.26 0.46 2.79 0.05 0.0 0.22 0.93 1.53 0.02 0.0 14.07 4.26 1.74 16.68 0.0 0.0 1.43
0.1 0.63 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.7 2.0 0.72 0.7 0.1 0.03 0.05 0.55 4.28 0.0 0.12 0.34 0.57 0.62 0.93 0.17 0.27 0.43 0.42 6.04 7.0 9.79 0.15 0.23 0.74 0.52 2.93 0.51 0.68 40.8 5.04 0.36 9.3 0.0 0.0 1.03
5.72 17.18 1.84 1.82 1.18 1.3 2.27 0.3 0.26 0.09 0.12 0.01 0.1 9.98 5.88 4.66 2.39 4.01 1.32 11.27 3.71 7.91 14.87 3.62 0.88 3.93 4.6 18.07 5.27 0.3 9.66 9.94 16.69 29.33 23.66 6.95 9.62 11.83 9.8 2.78 2.28 15.28 23.95 14.24 47.42 0.0 0.69 15.14
3.55 11.99 0.62 0.79 0.73 0.64 0.93 0.07 0.08 0.02 0.02 0.02 0.04 6.01 3.82 4.42 2.77 3.45 1.17 8.87 2.73 6.38 7.84 2.03 1.06 2.67 2.14 10.42 8.4 0.7 5.49 9.86 11.56 25.21 16.05 5.73 8.38 7.07 12.65 3.86 1.78 16.95 17.29 14.69 39.64 0.0 6.41 10.05
5.85 19.47 2.71 2.67 1.25 0.27 3.98 0.0 1.23 0.03 0.31 0.0 0.02 24.05 19.33 20.78 10.15 10.17 3.31 15.34 11.41 17.44 22.9 11.5 3.27 15.87 36.9 11.14 10.28 0.93 15.69 35.06 35.14 84.44 32.01 21.15 44.19 27.48 33.99 10.99 64.77 97.69 85.07 42.07 175.02 23.77 0.16 54.51
0.1 3.67 1.78 1.16 1.95 0.23 1.17 0.0 0.0 0.01 0.01 0.35 0.24 1.34 0.93 0.48 0.02 0.05 6.71 3.15 22.09 0.09 0.41 0.5 0.53 0.43 7.04 1.33 1.61 0.01 2.49 1.33 3.06 11.99 0.53 1.38 13.08 4.06 3.53 0.17 0.0 32.91 0.87 0.4 9.62 0.0 0.0 0.22
0.35 1.57 0.65 0.44 0.99 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 4.03 0.31 2.41 0.95 0.77 1.28 1.48 0.38 6.1 8.65 0.59 0.0 0.77 0.75 0.0 0.68 0.0 0.65 1.68 3.44 18.34 6.87 7.52 5.94 8.81 1.58 0.0 0.0 29.63 10.01 5.85 14.22 0.0 0.06 5.49
1.84 7.2 3.26 0.95 1.58 1.8 2.11 1.49 0.4 0.32 0.2 0.04 0.18 3.64 1.4 3.17 3.78 2.78 1.49 5.39 2.9 2.97 3.46 2.46 1.3 2.51 1.98 2.42 1.68 1.54 4.61 3.88 1.93 4.5 3.35 2.6 4.56 3.43 5.35 1.07 0.09 11.19 6.43 4.73 7.38 0.0 0.0 2.73
1.67 5.86 0.46 0.29 0.19 0.02 0.24 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 4.68 4.13 3.2 3.09 2.64 0.89 4.9 2.18 2.95 3.82 3.16 0.97 2.32 1.32 1.14 1.17 1.27 4.48 2.37 2.67 7.34 2.76 8.22 11.71 4.68 6.03 0.65 0.04 16.52 3.45 1.13 9.58 4.6 0.0 0.18
2.86 10.65 1.27 1.95 1.14 0.01 1.55 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 6.3 4.93 4.42 2.99 2.52 0.56 9.66 3.5 3.93 6.47 4.31 0.49 5.24 1.99 5.83 3.92 0.58 6.49 2.81 3.13 5.45 6.26 6.29 12.37 7.74 5.2 0.29 0.04 10.54 11.89 9.5 7.27 0.05 2.14 7.15

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)