1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
5.51 1.47 1.87 0.52 2.06 2.44 27.67 13.46 64.14 15.85 5.82 0.58 1.34 6.26 9.68 8.65 10.69 10.14 6.01
0.16 0.55 0.26 0.12 0.0 0.25 0.13 0.0 4.52 0.8 0.06 0.0 0.0 0.0 0.39 0.11 1.26 0.02 0.0
0.0 0.41 0.46 0.0 0.06 0.12 0.05 0.23 1.0 0.1 0.06 0.16 0.05 0.08 0.15 0.22 0.39 0.2 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.87 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 2.52 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.62 0.81 0.33 0.66 0.11 2.79 0.29 5.05 0.32 0.3 0.0 0.28 0.11 0.11 0.71 0.32 1.71 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.34 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.38 0.16 0.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.1 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.23 0.44 0.3 0.42 0.63 0.75 0.83 3.49 0.18 0.51 0.83 0.45 0.49 0.33 1.13 0.75 1.49 0.6
0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 3.35 3.06 3.1 1.9 0.54 0.86 1.74 1.63 0.93 0.29 1.73 0.43
0.62 3.48 0.11 0.0 0.0 0.05 0.16 0.02 3.6 0.59 0.42 0.01 0.02 0.14 0.14 0.09 1.74 0.46 0.25
0.22 1.73 0.15 0.09 0.01 0.09 0.08 0.13 48.65 2.62 0.18 0.21 0.24 0.09 0.13 0.33 1.73 0.19 0.34
0.87 0.2 2.47 0.26 0.17 0.23 1.92 0.96 4.01 0.71 0.55 0.0 0.4 0.39 1.63 0.65 0.78 1.66 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 2.78 0.1 0.54 0.0 0.48 0.27 0.82 0.15 0.02 0.59 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.79 0.34 0.72 0.0 0.0 0.0 2.44 0.13 0.12 0.0 0.1 0.23 0.81 0.2 0.59 0.54 0.06
2.28 8.82 1.9 0.97 2.17 3.74 6.05 0.56 5.44 2.08 3.36 0.23 1.76 1.35 4.51 1.83 6.15 3.52 4.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.1 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.67 0.22 0.06 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.47 0.27 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.12 0.0 0.0 0.18 0.0 1.74 0.17 6.26 2.34 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.46 0.35 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.23 0.15 0.24 0.04 0.08 0.02 0.37 0.16 0.52 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.13 0.17 0.11 0.32 0.05 0.57 0.2 0.03 0.01 0.0 0.02 0.1 0.06 0.02 0.19 0.06
1.13 0.95 3.07 0.5 1.28 0.0 3.03 0.72 2.54 0.88 0.69 0.0 0.85 0.77 1.41 1.92 1.29 2.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.29 1.34 0.33 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.64 0.31 1.22 0.98 0.07 0.05 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.04 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.1 0.46 1.12 0.32 0.2 0.21 0.62 0.79 0.2 0.1 1.28 0.3
0.01 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 1.65 0.0 3.34 0.0 0.04 0.0 1.51 0.03 0.0 0.0 0.45 0.57 0.0
2.6 5.05 3.32 0.0 0.5 0.82 19.45 9.24 34.86 8.42 0.33 0.0 2.22 1.25 0.0 4.93 1.57 0.37 0.73
0.0 0.0 0.0 0.19 0.22 0.0 0.24 0.4 0.77 0.65 0.37 0.0 0.23 0.37 0.12 0.17 0.3 0.22 0.11
0.03 0.02 0.04 0.07 0.0 0.03 0.1 0.0 27.59 3.29 0.99 0.17 0.04 0.15 0.2 5.98 15.75 0.99 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.42 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.47 1.15 0.0 0.28 0.26 0.0 1.74 0.26 13.3 0.81 0.0 0.0 0.0 0.08 0.24 0.0 0.0 1.08 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.19 0.18 1.03 0.0 0.17 0.2 0.0 0.2 0.27 0.23 0.29 0.28 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
0.02 0.24 4.93 3.49 1.4 0.48 0.98 0.35 44.27 3.12 0.18 0.0 7.79 0.26 0.34 0.36 0.24 0.74 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.39 0.05 0.14 0.05 0.15 0.04 0.0 17.06 0.27 0.34 0.0 0.06 0.18 0.06 0.11 0.13 0.1 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.04 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.06 0.04 0.15 0.03 0.0 0.12 0.03 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.24 0.05 0.9 0.25 0.25 0.0 0.28 0.09 0.06 0.12 0.33 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.62 0.24 4.57 0.09 0.12 0.0 0.35 0.07 0.48 0.56 0.51 0.12 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.02 5.08 0.01 0.29 0.0 0.11 0.64 0.3 1.49 0.98 0.3 0.0
0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.1 0.0 0.0 0.31 0.17 0.33 0.23 0.08 0.0
0.0 0.24 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.04 0.18 0.0
3.0 4.45 1.31 2.79 3.9 1.72 13.12 0.67 23.44 1.34 0.58 0.04 10.72 0.7 1.36 0.15 0.23 1.9 0.3
1.31 3.03 1.01 0.8 1.53 0.66 0.32 0.16 4.97 2.82 0.65 0.46 2.33 0.52 0.95 0.46 0.71 1.3 0.59
3.56 0.0 0.99 0.0 0.0 0.59 0.47 0.57 15.13 7.25 1.28 2.37 0.09 1.05 0.29 4.11 5.52 2.99 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.36 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.76 0.08 2.77 1.58 1.36 1.42 55.61 20.03 933.85 63.97 49.54 22.97 1.77 26.77 16.33 108.22 144.52 32.75 59.04
0.26 0.54 0.67 0.31 0.24 0.61 0.19 0.12 47.61 4.24 0.25 0.5 0.07 0.51 0.42 0.34 1.02 0.63 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
939.45 836.2 1113.01 709.45 1258.45 1775.81 1257.89 1964.47 4509.24 2853.32 402.52 313.72 352.8 1004.86 105.66 277.68 261.42 1064.63 927.97
939.45 836.2 1113.01 709.45 1258.45 1775.81 1257.89 1964.47 4509.24 2853.32 402.52 313.72 352.8 1004.86 105.66 277.68 261.42 1064.63 927.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)