Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.23 0.2 0.11 0.13 0.23 0.36 0.13 0.18 0.15 0.1 0.36 0.56 1.0 0.52 0.52 0.69 0.69 0.71 0.58
0.02 0.05 0.15 0.02 0.08 0.18 0.11 0.24 0.11 0.16 0.37 0.69 0.87 0.42 0.81 0.95 0.7 1.0 0.44
0.03 0.02 0.05 0.03 0.06 0.12 0.11 0.06 0.2 0.36 0.52 0.83 0.9 0.61 0.66 0.96 0.7 1.0 0.46
0.37 0.29 0.2 0.18 0.32 0.32 0.15 0.19 0.22 0.2 0.38 0.61 1.0 0.42 0.56 0.7 0.59 0.54 0.39
0.21 0.29 0.17 0.2 0.18 0.34 0.24 0.7 0.38 0.64 0.44 0.81 0.84 0.52 0.56 0.97 0.72 1.0 0.55
0.25 0.28 0.09 0.11 0.17 0.28 0.07 0.09 0.11 0.14 0.32 1.0 0.78 0.42 0.5 0.78 0.65 0.61 0.41
0.17 0.17 0.21 0.22 0.19 0.26 0.22 0.69 0.35 0.92 0.53 1.0 0.62 0.47 0.71 0.75 0.76 0.67 0.61
0.18 0.32 0.09 0.16 0.25 0.39 0.25 0.14 0.29 0.32 0.41 0.64 0.69 0.55 0.65 0.92 0.64 1.0 0.51
0.54 0.44 0.32 0.27 0.36 0.62 0.45 1.0 0.51 0.63 0.68 0.91 0.71 0.66 0.9 0.91 0.93 0.87 0.76
0.0 0.05 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.29 0.48 1.0 0.51 0.38 0.73 0.53 0.93 0.07
0.07 0.16 0.1 0.15 0.11 0.23 0.14 0.06 0.06 0.02 0.32 0.51 1.0 0.37 0.33 0.52 0.49 0.63 0.4
0.11 0.05 0.11 0.08 0.15 0.25 0.03 0.11 0.09 0.16 0.42 0.73 0.42 0.57 0.39 0.6 0.6 1.0 0.59
0.11 0.11 0.08 0.06 0.09 0.15 0.04 0.04 0.33 0.15 0.42 0.77 0.31 0.3 0.18 0.52 1.0 0.33 0.33
0.29 0.24 0.19 0.18 0.25 0.35 0.22 0.29 0.23 0.12 0.51 1.0 0.86 0.52 0.58 0.9 0.8 0.68 0.49
0.1 0.12 0.15 0.21 0.42 0.28 0.31 0.09 0.1 0.15 0.61 0.86 1.0 0.46 0.5 0.98 0.64 1.0 0.67
0.19 0.23 0.23 0.17 0.11 0.12 0.34 0.24 0.26 0.18 0.47 0.77 0.94 0.51 0.58 1.0 0.74 0.89 0.5
0.38 0.39 0.31 0.28 0.3 0.39 0.39 0.37 0.28 0.24 0.56 0.88 1.0 0.53 0.75 0.83 0.74 0.75 0.61
0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.06 0.05 0.04 0.02 0.55 0.64 1.0 0.46 0.65 0.65 0.61 0.64 0.3
0.06 0.11 0.08 0.03 0.14 0.23 0.42 0.68 0.42 0.85 0.54 0.68 0.6 0.63 0.75 1.0 0.81 0.83 0.43
0.08 0.19 0.08 0.09 0.04 0.31 0.16 0.3 0.33 0.16 0.41 0.62 0.32 0.81 0.42 0.54 1.0 0.37 0.45
0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.06 0.01 0.08 0.07 0.3 1.0 0.57 0.36 0.28 0.94 0.66 0.59 0.18
0.14 0.16 0.05 0.1 0.12 0.14 0.09 0.07 0.11 0.03 0.36 0.71 1.0 0.41 0.46 0.57 0.7 0.44 0.54
0.05 0.07 0.04 0.06 0.08 0.16 0.13 0.24 0.24 0.46 0.58 0.91 0.57 0.52 0.6 0.66 1.0 0.67 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.46 1.0 0.46 0.28 0.64 0.27 0.49 0.32
0.06 0.07 0.05 0.08 0.06 0.14 0.08 0.07 0.22 0.34 0.31 0.73 0.6 0.38 0.38 0.61 1.0 0.41 0.31
0.1 0.07 0.04 0.05 0.05 0.09 0.03 0.05 0.12 0.25 0.33 1.0 0.96 0.42 0.46 0.64 0.71 0.85 0.38
0.28 0.29 0.16 0.12 0.17 0.21 0.34 0.33 0.29 0.29 0.5 0.8 0.86 0.55 0.9 0.91 0.71 1.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.06 0.0 0.62 0.43 0.77 0.64 0.55 0.88 0.89 1.0 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.3 0.92 1.0 0.24 0.26 0.68 0.54 0.62 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.3 0.92 1.0 0.24 0.26 0.68 0.54 0.62 0.11
0.43 0.37 0.2 0.18 0.28 0.47 0.22 0.23 0.25 0.2 0.52 1.0 0.99 0.58 0.63 0.76 0.78 0.78 0.61
0.19 0.19 0.23 0.21 0.19 0.32 0.26 0.69 0.32 1.0 0.71 0.99 0.84 0.81 0.77 0.97 0.85 0.88 0.71
0.1 0.08 0.08 0.12 0.16 0.18 0.13 0.04 0.13 0.09 0.57 0.9 1.0 0.61 0.58 0.8 0.72 0.62 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.38 1.0 0.52 0.43 0.82 0.5 0.76 0.3
0.18 0.23 0.07 0.06 0.18 0.18 0.07 0.06 0.13 0.11 0.38 0.51 0.89 0.46 0.78 0.87 0.65 1.0 0.5
0.07 0.05 0.02 0.03 0.0 0.08 0.12 0.23 0.15 0.29 0.4 0.66 0.17 0.57 0.27 0.68 1.0 0.39 0.32
0.31 0.2 0.22 0.23 0.16 0.29 0.23 0.17 0.53 0.45 0.52 1.0 0.7 0.62 0.65 0.91 0.86 0.96 0.66
0.27 0.32 0.27 0.22 0.23 0.34 0.14 0.22 0.29 0.47 0.51 1.0 0.63 0.49 0.43 0.72 0.75 0.51 0.53
0.04 0.1 0.09 0.04 0.05 0.04 0.15 0.12 0.12 0.16 0.5 0.64 0.97 0.49 0.69 1.0 0.67 0.82 0.64
0.28 0.48 0.24 0.17 0.23 0.33 0.11 0.23 0.17 0.31 0.56 0.57 1.0 0.53 0.59 0.97 0.78 0.78 0.45
0.19 0.33 0.55 0.29 0.16 0.37 0.23 0.59 0.29 0.64 0.67 1.0 0.77 0.63 0.67 0.78 0.96 0.7 0.64
0.14 0.13 0.04 0.09 0.16 0.14 0.06 0.03 0.07 0.02 0.29 0.47 1.0 0.34 0.4 0.5 0.35 0.48 0.3
0.07 0.26 0.06 0.05 0.17 0.16 0.09 0.08 0.04 0.03 0.37 0.84 1.0 0.44 0.43 0.72 0.63 0.53 0.43
0.41 0.24 0.23 0.15 0.33 0.47 0.14 0.18 0.22 0.64 0.56 0.68 1.0 0.53 0.52 0.84 0.63 0.79 0.73
0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.28 0.61 0.87 0.35 0.46 0.85 0.62 1.0 0.23
0.12 0.3 0.19 0.17 0.33 0.41 0.21 0.22 0.2 0.19 0.7 0.58 0.83 0.64 0.63 0.72 0.66 1.0 0.56
0.14 0.2 0.04 0.04 0.15 0.25 0.05 0.03 0.03 0.02 0.27 1.0 0.68 0.38 0.34 0.75 0.5 0.63 0.29
0.14 0.2 0.04 0.04 0.15 0.25 0.05 0.03 0.03 0.02 0.27 1.0 0.68 0.38 0.34 0.75 0.5 0.63 0.29
0.14 0.2 0.04 0.04 0.15 0.25 0.05 0.03 0.03 0.02 0.27 1.0 0.68 0.38 0.34 0.75 0.5 0.63 0.29
0.01 0.01 0.01 0.09 0.1 0.04 0.09 0.03 0.11 0.12 0.38 0.52 0.33 0.51 0.4 0.83 0.55 1.0 0.63
0.41 0.25 0.11 0.05 0.16 0.2 0.06 0.03 0.05 0.1 0.43 1.0 0.9 0.58 0.82 0.93 0.6 0.82 0.52
0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 1.0 0.94 0.36 0.34 0.58 0.42 0.57 0.37
0.1 0.12 0.07 0.1 0.12 0.2 0.11 0.07 0.05 0.02 0.32 0.82 1.0 0.38 0.48 0.52 0.53 0.42 0.49
0.18 0.11 0.18 0.16 0.21 0.09 0.26 0.09 0.21 0.05 0.51 0.66 1.0 0.77 0.66 0.99 0.76 0.97 0.61
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.01 0.27 0.32 0.52 0.93 0.62 0.98 0.48 0.66 0.76 1.0 0.42
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.01 0.27 0.32 0.52 0.93 0.62 0.98 0.48 0.66 0.76 1.0 0.42
0.24 0.1 0.07 0.05 0.17 0.19 0.13 0.09 0.26 0.27 0.31 0.8 1.0 0.45 0.5 0.99 0.69 0.67 0.4
0.03 0.07 0.02 0.0 0.01 0.03 0.13 0.02 0.13 0.36 0.4 0.56 0.43 0.41 0.35 0.48 1.0 0.36 0.35
0.41 0.32 0.22 0.24 0.35 0.47 0.34 0.33 0.36 0.17 0.53 0.7 1.0 0.48 0.62 0.95 0.77 0.69 0.48
0.05 0.06 0.07 0.1 0.12 0.14 0.08 0.16 0.06 0.08 0.36 0.62 0.78 0.54 0.53 0.83 0.73 1.0 0.58
0.4 0.66 0.42 0.59 0.51 0.77 0.54 0.88 0.54 0.83 0.6 0.95 0.69 0.64 0.8 1.0 0.81 1.0 0.46
0.0 0.0 0.05 0.08 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 1.0 0.69 0.3 0.65 0.72 0.42 0.97 0.36
0.0 0.0 0.05 0.08 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 1.0 0.69 0.3 0.65 0.72 0.42 0.97 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.39 0.54 0.98 0.42 1.0 0.84 0.64 0.32 0.36
0.06 0.19 0.11 0.16 0.18 0.08 0.38 0.51 0.34 0.44 0.5 0.92 0.85 0.4 0.52 0.94 0.6 1.0 0.4
0.29 0.24 0.08 0.1 0.11 0.22 0.22 0.31 0.12 0.25 0.68 1.0 0.52 0.65 0.76 0.86 0.81 0.99 0.71
0.09 0.05 0.08 0.08 0.06 0.11 0.1 0.04 0.09 0.01 0.26 0.45 1.0 0.33 0.2 0.53 0.47 0.59 0.38
0.15 0.11 0.11 0.06 0.05 0.13 0.1 0.05 0.1 0.09 0.25 0.62 1.0 0.3 0.43 0.53 0.5 0.75 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)