Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.08 0.13 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.26 0.04 0.1 0.0
0.0 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 1.31 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.74 13.18 8.31 8.14 8.05 9.31 39.42 23.23 25.33 19.51 7.54 7.89 2.85 8.95 10.67 8.76 9.25 10.9 6.17
0.54 0.0 0.25 0.05 0.1 0.51 0.33 0.4 0.51 0.2 0.26 0.16 0.22 0.46 0.22 0.53 0.39 0.82 0.32
0.58 0.0 0.18 0.09 0.17 0.15 0.47 0.0 0.0 0.13 0.14 0.09 0.24 0.49 0.38 0.44 0.25 1.08 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.38 0.0 0.0 0.32 0.25 0.0 0.0 0.13 0.1 0.0 0.0 0.12 0.25 0.11 0.0 0.39 0.02
0.0 0.14 0.59 0.04 0.0 0.06 0.29 0.33 0.13 0.01 0.13 0.0 0.14 0.02 0.41 0.14 0.06 0.22 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.27 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.92 0.0 0.0 0.51 0.26 1.18 0.0 0.3 0.56 0.0 0.0 0.31 0.0 0.59 0.0 0.12 0.0 0.0
0.24 0.88 0.13 0.0 0.15 0.18 0.83 0.08 0.38 0.0 0.02 0.0 0.0 0.19 0.39 0.06 0.04 0.21 0.12
0.0 2.5 7.12 1.23 0.0 1.26 1.59 0.4 0.96 1.97 2.37 2.14 0.27 5.27 10.73 2.49 2.06 7.1 4.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.61 0.25 0.11 0.0 0.0 0.45 0.22 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.15 0.82 0.36 0.27 0.14 0.13
1.88 0.14 0.06 0.76 1.83 2.23 1.57 1.54 1.45 0.87 1.08 0.99 1.04 2.37 1.87 0.82 1.36 3.47 2.98
1107.28 1179.43 1367.3 1794.87 2286.18 1558.74 8694.4 1352.38 1554.39 1148.88 1812.29 57.54 3483.0 1538.19 1294.09 965.5 955.45 1576.42 429.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.12 0.0 0.0 0.26 0.04
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.6 1.31 0.28 0.36 0.12 0.22 0.0 0.28 0.47 0.0 0.05 0.28 0.55 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.39 31.3 159.01 489.51 392.12 98.11 1687.99 739.39 277.85 104.21 475.61 7.22 420.19 373.26 504.18 504.52 169.37 652.07 373.08
0.1 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.06 0.4 0.04
10.3 10.15 3.59 7.76 6.52 3.72 26.74 1.86 13.43 17.05 3.08 14.98 17.98 3.05 1.68 3.92 4.5 6.72 4.25
5.89 0.52 1.71 1.52 1.13 0.0 165.22 43.14 17.37 11.96 3.31 0.0 13.11 1.08 33.93 19.82 3.42 50.8 0.79
12.03 16.36 60.22 199.67 161.5 43.91 833.93 383.83 169.04 44.32 275.29 4.9 256.86 203.51 208.87 262.37 105.59 271.5 256.6
0.58 0.42 0.43 0.4 0.09 0.97 0.43 0.45 0.23 0.26 0.28 0.82 0.39 0.44 0.38 0.49 0.28 0.79 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.22 0.59 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.52 0.31 0.47 1.44 0.96 0.24 1.77 3.1 0.35 0.58 0.0 0.0 1.02 3.21 1.47 2.17 1.42 0.76
0.0 0.0 0.32 0.43 0.48 0.0 1.15 0.89 0.0 0.26 0.08 0.0 0.03 0.09 0.15 0.15 0.02 0.22 0.11
0.0 1.56 0.0 0.0 0.34 0.0 0.53 0.83 1.9 0.34 1.0 0.0 0.05 0.1 1.05 0.14 1.45 0.46 0.34
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.56 0.12 0.49 0.09 0.17 0.0 0.0 0.84 0.09 0.26 0.23 0.54 0.37
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.11 0.06 0.0 0.03 0.36 0.04 0.01 0.06 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.32 0.24 1.54 1.42 0.01 0.01 0.83 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.07 0.0 0.15 0.25 1.84 6.49 5.88 1.02 0.0 0.91 0.0 0.03 0.95 0.37 0.09 0.11 0.58 0.3
0.47 0.67 0.5 0.43 1.93 3.04 7.29 4.87 1.38 0.56 1.27 0.0 0.0 0.91 2.05 0.11 0.45 1.34 0.38
0.62 1.02 1.4 0.44 0.78 0.6 1.78 1.34 0.86 2.0 0.66 0.59 0.03 1.42 1.22 0.46 0.63 1.1 0.43
4.94 5.5 2.11 5.37 17.29 7.46 331.65 44.45 50.91 16.97 2.29 0.08 14.79 3.16 10.14 2.62 2.4 3.52 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.16 0.96 0.12 0.85 0.93 2.11 0.0
0.0 0.0 0.1 0.15 0.0 0.0 1.75 0.3 0.33 0.26 0.19 0.0 0.0 0.47 0.21 0.28 0.55 0.65 0.07
0.0 0.46 0.6 0.53 0.0 0.29 2.86 0.12 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.1 0.59 0.36 0.37 0.0
0.03 0.36 0.22 0.1 0.05 0.11 1.81 0.49 0.15 0.24 0.07 0.0 0.01 0.26 0.17 0.16 0.21 0.26 0.11
0.0 0.0 0.72 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.22 0.0 0.01 0.41 0.28 0.44 0.16 0.62 0.08
0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.04 0.03 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.15 0.06 0.0 0.03 0.12 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.34 0.0 0.5 0.06 0.27 0.0
1.88 0.48 2.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 1.26 0.1 0.62 1.56 1.09 0.54 0.46 1.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.17 1.84 1.8 0.84 0.8 0.15 0.5 0.94 1.53 0.81 0.3 2.38 1.45
0.0 0.41 0.45 0.31 0.3 0.0 0.45 0.0 0.3 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.32 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 16.73 0.0 0.0 0.0 0.0 1.58 0.75 5.47 12.95 2.19 0.52 6.2 3.58 8.77 5.96 6.74 6.3 4.13
0.0 0.01 0.23 0.15 0.0 0.0 0.25 0.15 0.0 0.04 0.24 0.04 0.01 0.21 0.32 0.18 0.06 0.46 0.24
0.1 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.09 0.1 0.0 0.03 0.0 0.04 0.07 0.43 0.04 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.28 0.17 0.18 0.0 0.0 0.0 0.21 0.27 0.41 0.0 0.38 0.1
0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.17 0.19 0.12 0.0 0.21 0.11 0.0 0.0 0.05 0.13 0.1 0.01 0.03 0.01
2.5 18.35 11.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 12.63 0.72 0.0 8.63 7.92 7.97 6.66 13.07 6.04
0.0 0.15 0.0 0.13 0.0 0.11 0.71 0.0 0.17 0.0 0.09 0.04 0.0 0.29 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 1.27 0.0 0.74 1.7 2.78 4.2 0.0 0.71 0.89 0.48 0.51 0.64 1.64 0.68 0.42 0.24 0.84
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.22 0.09 0.04 0.0 0.0 0.13 0.56 0.0 0.49 0.57 0.0
1.22 0.37 1.22 0.16 0.0 0.57 1.81 0.0 0.25 0.21 0.34 0.0 0.16 0.71 1.84 0.22 0.4 1.88 0.53
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0
0.21 0.3 0.06 0.07 0.02 0.35 1.02 0.44 0.24 0.24 0.1 0.0 0.04 0.27 0.38 0.16 0.26 0.19 0.07
1.76 4.55 23.21 36.25 24.3 8.99 184.91 29.05 20.11 12.08 39.31 11.82 54.08 35.15 63.69 19.17 18.44 61.67 18.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)