1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.03 0.07 0.13 0.09 0.09 0.16 0.02 0.0 0.05 0.03 0.18 0.01 0.16 0.12 0.14 0.16 0.21 0.04 0.07
3.44 1.65 0.0 0.0 0.32 0.89 0.9 0.16 0.98 0.14 1.34 0.56 3.02 1.68 1.02 2.72 1.41 3.66 0.55
1.29 0.25 0.11 0.23 0.0 0.0 0.29 0.0 1.37 0.0 0.16 0.0 0.0 0.56 0.48 1.09 0.8 1.38 0.28
1.04 2.3 1.89 0.94 3.93 0.85 1.31 2.29 2.32 2.02 1.93 0.0 2.33 4.51 3.83 2.27 1.62 4.71 3.76
0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.11 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
5.4 1.6 0.0 1.49 2.23 1.3 1.09 0.36 0.83 3.0 0.08 0.0 0.0 0.21 0.0 0.24 0.2 0.0 0.0
3.84 0.98 1.49 1.05 3.82 1.8 0.34 1.99 1.88 1.71 0.06 0.0 0.0 0.22 0.0 0.15 0.0 0.27 0.06
29.62 22.97 21.45 9.65 13.02 15.22 10.53 9.26 13.48 10.17 13.87 7.45 8.91 15.83 13.34 22.82 18.63 24.12 10.03
0.14 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.05 0.06 0.1 0.02
5.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
1.32 0.1 0.71 0.31 0.73 0.0 0.25 0.46 1.27 0.29 0.13 0.38 0.08 0.38 0.16 0.33 0.55 0.55 0.16
0.42 0.25 0.39 0.27 0.04 0.17 0.09 0.08 0.14 0.31 0.25 0.02 0.64 0.34 0.3 0.31 0.33 0.65 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.0 0.02 0.09 0.02 0.0 0.01 0.11 0.01
4.11 2.39 2.0 0.86 2.81 0.88 0.16 0.0 0.16 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.23 0.15 0.15 0.07 0.79 0.47 0.53 0.08 0.67 0.96 0.23 0.0 0.21 0.46 0.26 0.4 0.13 1.29 0.45
2.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.12 0.0
1.36 0.0 0.0 0.38 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.74
0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.02 0.05 0.02 0.05 0.06 0.01
1.05 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.02
7.02 0.0 0.0 1.71 0.0 4.36 0.0 0.0 0.75 1.58 0.0 0.0 0.34 0.12 0.0 0.0 0.21 0.0 0.21
42.89 19.14 27.44 8.19 7.53 14.94 0.64 0.28 0.68 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.06 0.0
1.82 1.32 0.36 2.57 1.53 1.06 0.68 1.03 0.8 2.76 0.05 0.0 0.05 0.89 2.49 0.18 0.43 0.58 0.07
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.03 0.06 0.01
1.88 0.23 0.0 0.22 1.1 0.41 0.24 0.23 0.08 0.0 0.18 0.0 0.0 0.04 0.38 0.46 0.55 0.35 0.13
0.26 0.0 0.18 0.0 0.16 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.12 0.12 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0
2.0 3.7 1.57 1.04 0.31 1.56 0.89 0.2 2.29 0.23 0.48 0.96 0.25 0.9 0.75 1.99 1.18 3.9 0.81
1.54 0.11 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.07 0.01 0.05 0.04 0.13 0.0
0.64 0.51 0.12 0.0 0.0 0.27 0.07 0.14 0.24 1.33 0.0 0.05 0.0 0.29 0.19 0.18 0.14 0.4 0.06
0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.05 0.02
1.28 0.0 0.21 0.0 0.0 0.23 0.21 0.06 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.29 0.07 0.07 0.32 0.0
0.09 0.0 0.02 0.05 0.0 0.2 0.09 0.08 0.09 0.11 0.02 0.03 0.27 0.02 0.1 0.03 0.02 0.03 0.03
23.39 11.04 8.49 5.46 4.3 0.0 0.0 0.0 1.77 2.21 1.06 0.86 0.52 1.53 0.55 1.94 1.18 3.31 0.0
0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.0 0.0 0.02 0.12 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.03 0.1 0.0 0.2 0.13 0.06 0.07
1.18 0.0 0.2 0.01 0.0 0.26 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.18 0.0 0.2 0.01 0.0 0.26 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.8 0.31 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.56 0.33 0.0 0.1 0.0 1.11 0.64 1.09 0.38 0.0 0.33 0.73
1.06 0.26 0.39 0.58 0.28 1.18 0.56 0.34 0.63 0.24 0.29 0.03 0.14 0.19 0.38 0.9 0.87 0.41 0.35
0.14 0.24 0.17 0.07 0.19 0.63 0.12 0.22 0.15 0.16 0.1 0.0 0.34 0.09 0.09 0.11 0.16 0.39 0.12
3.82 1.49 0.98 0.95 2.04 1.46 1.37 0.25 1.37 0.54 0.2 0.35 1.47 0.16 0.06 0.27 0.14 0.38 0.34
1.43 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05
0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.45 0.09 0.05 0.0 1.21 0.44 0.14 0.5 0.5 0.34
1.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.88 0.23 0.0 0.06 0.0 0.14 0.84 0.16 0.29 0.15 0.0 0.34 0.92 0.03 0.53 1.24 0.37 1.26 0.47
0.88 0.23 0.0 0.06 0.0 0.14 0.84 0.16 0.29 0.15 0.0 0.34 0.92 0.03 0.53 1.24 0.37 1.26 0.47
0.13 0.0 0.0 0.12 0.1 0.18 0.08 0.04 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.06 0.06 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.3 0.09 0.0
1.15 0.46 0.92 0.6 0.09 0.46 0.0 0.34 0.23 0.39 0.16 0.39 0.0 0.31 0.55 0.18 0.26 0.42 0.26
0.0 0.25 0.0 0.34 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.75 0.11 0.0 0.21 0.37 0.7 0.0
0.45 0.69 0.0 1.29 0.0 1.73 0.0 0.26 0.0 0.0 0.68 0.0 0.93 1.21 0.71 1.56 0.89 2.48 0.88
24.18 0.0 7.98 5.63 9.66 5.07 0.71 0.7 0.81 1.71 4.67 0.0 0.38 4.88 4.44 2.74 3.03 7.52 3.2
0.15 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.64 0.54 0.35 0.08 0.05 0.42 0.27
5.06 0.0 0.0 0.0 0.0 10.73 0.0 2.04 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 1.28 0.97 1.78 0.56 1.0 0.22
2.07 0.0 0.0 0.0 0.57 1.07 0.64 0.21 1.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.36 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.03 0.0 0.02 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.09 0.02 0.07 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.06 0.06 0.0 0.24 0.1
0.76 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.98 0.0 0.0 0.4 0.0 0.35 0.31 0.44 0.0 0.0
0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.02 0.02 0.04 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
1.61 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.8 0.21 0.07 0.0
0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.39 0.08 0.06 0.22 0.16 0.42 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.0 0.66 1.9 0.8 0.18 0.6 0.73 0.0 0.79 0.0 1.48 0.0
7.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 7.37 4.61 0.52 0.23 10.8 6.42 0.0 0.3
5.62 0.0 0.99 2.03 4.57 1.68 0.0 0.0 0.0 1.61 0.0 0.0 0.0 0.28 0.21 0.0 0.14 0.15 0.0
1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41
0.52 0.15 0.03 0.05 0.21 0.02 0.0 0.03 0.0 0.1 0.06 0.16 0.15 0.58 0.28 0.83 0.44 0.56 0.42
1.32 0.59 0.19 0.15 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08
1.4 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.36 0.5 0.24 0.41 0.0 0.29 0.23 0.22 0.0 0.45 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.09 0.0 0.43 0.02 0.0 0.0 0.2 0.0 0.04 0.1 0.39 0.03
2.14 0.0 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.87 2.26 4.86 1.92 0.0 2.15 1.95 3.01 0.0
0.66 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.29 0.0 0.32 1.21 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.15 0.03 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01
0.2 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.03 0.02 0.22 0.36 0.07 0.21 0.23 0.39 0.07
0.22 0.0 0.0 0.25 0.2 0.2 0.0 0.0 0.05 0.14 0.08 0.0 0.0 0.0 0.51 0.07 0.0 0.26 0.26
1.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.16 0.0
2.31 0.15 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.84 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.22 0.84 0.04 0.0
1.48 0.0 0.0 0.0 1.28 0.0 0.14 0.82 0.04 0.61 0.0 0.1 0.43 0.08 0.51 0.0 0.0 0.0 0.24
0.43 0.0 0.0 0.21 0.08 0.07 0.09 0.08 0.1 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.2 0.01
0.7 0.33 0.0 0.0 0.19 0.56 0.37 0.0 0.22 0.1 0.14 0.19 0.26 0.23 0.13 0.75 0.1 0.09 0.12
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.55 0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.14 0.18
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
5.62 0.0 0.0 0.0 0.0 5.77 0.0 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 1.28 0.0 0.0 0.53 0.0
0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.48 0.07 0.0 0.0 0.33 0.22 0.59 0.45 1.12 0.0
4.87 0.0 0.0 1.06 5.14 1.01 1.21 0.0 2.96 2.22 0.0 0.53 0.0 0.19 0.36 0.0 0.15 0.76 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.02
1.9 0.71 1.22 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.09 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.12 0.03 0.21 0.04 0.03 0.0
2.37 0.84 2.2 1.63 0.0 2.73 0.39 0.0 0.9 1.25 1.24 0.0 4.05 2.32 3.08 0.51 1.03 2.19 1.22
0.42 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
67.42 0.93 16.93 40.1 36.56 48.6 72.99 41.28 55.25 51.7 11.33 20.89 85.99 15.59 15.77 70.97 63.01 107.67 31.27

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)