1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_139 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
1.66 0.38 1.73 0.99 0.0 3.02 0.0 0.0 0.0 0.57 0.04 1.63 0.21 0.06 0.0 0.29 0.07 0.55 0.05
0.0 0.53 0.0 0.68 0.84 5.43 0.0 0.24 0.0 0.3 0.0 0.0 0.7 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 2.29 0.0 0.0 1.11 8.96 2.85 0.0 2.35 1.69 0.17 0.0 0.0 0.3 1.61 0.0 0.96 0.0 0.0
0.6 0.19 0.29 0.3 0.0 1.0 0.08 0.41 0.16 1.39 0.07 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 0.1 0.04 0.18
0.0 0.15 0.14 0.0 0.05 1.09 0.0 0.0 0.08 0.29 0.0 0.13 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.15 0.14 0.21 0.77 0.1 0.0 0.09 0.04 0.16 0.12 0.0 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.14 0.03 0.01 0.0 0.06 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01
11.81 4.93 2.53 4.92 5.24 28.39 4.31 2.13 13.66 13.97 3.64 6.06 13.86 2.07 2.0 9.98 7.53 4.2 1.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.54 0.81 1.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.88 3.76 0.0 0.74 6.92 0.33 0.0 0.0 6.06 0.5 3.21 0.0 0.62 0.0 0.71 0.91 0.4 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
3.84 2.36 1.76 2.3 1.89 11.94 1.33 3.16 2.65 9.75 3.15 1.23 3.5 2.07 2.08 7.23 6.74 3.62 1.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.09 0.52 0.46 0.29 0.24 1.04 0.24
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.55 0.0 0.29 0.05 0.31 0.01 0.02 0.06 0.26 0.0 0.1 0.19 0.13 0.32
6.64 6.7 3.39 3.67 6.3 19.08 4.3 4.48 6.01 11.57 3.84 4.8 5.12 3.99 5.65 6.84 5.22 5.92 4.2
1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 2.5 0.0 0.18 0.64 2.26 0.0 0.0 0.28 0.3 0.71 0.42 0.0 0.27 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.03 0.07 0.01 0.0 0.04 0.01
0.82 0.71 0.26 0.21 0.0 2.18 0.48 0.9 0.42 0.94 0.04 0.0 0.0 0.14 0.34 0.0 0.0 0.39 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 2.23 0.0 0.0 0.0 2.98 1.83 0.05 0.0 0.0 0.11 0.15 0.06 0.0 0.09 0.0
0.11 0.44 0.0 0.05 0.51 0.93 0.18 0.2 0.13 0.9 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0
0.0 0.25 0.08 0.21 0.23 0.96 0.14 0.05 0.13 0.22 0.07 0.02 0.57 0.17 0.15 0.35 0.18 0.15 0.15
0.0 0.25 0.08 0.21 0.23 0.96 0.14 0.05 0.13 0.22 0.07 0.02 0.57 0.17 0.15 0.35 0.18 0.15 0.15
0.02 0.0 0.1 0.0 0.15 0.68 0.02 0.02 0.04 0.18 0.17 0.0 0.0 0.19 0.27 0.01 0.12 0.29 0.06
2.75 3.27 2.12 0.81 0.66 6.08 0.15 1.11 3.27 5.15 0.04 1.64 1.15 0.11 0.58 0.43 0.23 0.11 0.0
0.29 0.23 0.17 0.19 0.07 0.87 0.0 0.0 0.06 0.09 0.0 0.0 0.24 0.02 0.0 0.14 0.0 0.19 0.52
0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 3.53 0.56 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.36 1.26 0.55 0.11 0.59 1.33
1.32 0.48 0.9 0.6 0.28 2.16 0.05 0.12 1.25 1.32 0.6 0.32 0.9 0.55 0.36 0.77 0.68 0.91 0.69
0.9 0.81 0.5 0.42 1.33 1.33 0.74 0.15 1.18 0.97 0.37 0.0 0.0 0.23 0.1 0.55 0.26 1.49 0.0
0.0 0.0 0.0 0.89 2.53 0.65 0.0 0.0 0.0 2.01 0.77 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.09 0.07 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.29 8.26 6.19 6.37 8.84 11.1 6.75 1.72 4.94 0.56 0.78 3.04 0.0 0.0 2.49 1.47 0.0 12.26 0.08
0.08 0.45 0.0 0.38 0.26 0.24 0.36 0.08 0.24 0.21 0.0 0.0 0.25 0.06 0.03 0.28 0.08 0.74 0.04
3.78 2.07 3.84 1.3 4.04 3.08 1.54 0.89 3.08 4.94 0.05 1.13 2.55 0.03 0.09 0.04 0.07 0.08 0.02
2.63 3.98 1.35 1.55 3.21 2.07 0.47 1.48 2.81 1.87 1.17 0.52 2.57 1.42 3.22 2.86 2.36 2.19 1.31
0.95 0.51 0.45 0.57 0.43 1.11 0.16 0.05 0.65 0.83 0.22 0.08 0.53 0.37 0.15 0.56 0.27 0.6 0.06
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.21 0.04 0.11 0.14 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.47 0.31 0.58 0.1 0.43 0.48 0.14 0.77 0.48 1.19 0.09 0.05 0.0 0.13 0.0 0.09 0.11 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
4.63 1.62 0.99 1.11 1.5 12.64 1.37 0.52 3.98 7.04 1.84 0.15 6.09 1.66 2.03 2.44 1.88 2.69 3.38
0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.27 0.13 0.22 0.08 0.72 0.0 0.0 0.11 0.63 0.09 0.28 0.05 0.05 0.13 0.39 0.06 0.03 0.01
0.37 0.91 0.55 0.88 1.01 2.8 1.3 2.44 1.57 1.97 0.03 0.04 0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.59 0.83 0.38 0.2 0.07 0.09 0.2
4.32 0.0 0.0 0.0 1.68 11.66 0.0 0.48 1.65 3.77 5.0 1.58 5.8 9.19 4.05 8.74 10.98 15.57 4.4
0.0 0.03 0.0 0.02 0.18 0.0 0.0 0.13 0.11 0.03 0.04 0.0 0.09 0.02 0.11 0.02 0.05 0.11 0.05
0.53 0.49 1.83 1.1 0.88 2.61 1.63 2.7 1.04 1.2 0.0 0.0 0.1 1.0 0.33 0.25 0.24 0.76 0.34
0.0 0.0 0.33 0.0 1.56 2.71 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.37 0.08 0.0
0.0 0.22 0.0 0.05 0.4 0.15 0.1 0.07 0.1 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 3.82 0.4 0.0 2.07 4.96 0.18 0.0 0.08 0.9 0.35 1.63 2.28 0.77 0.4
0.0 2.83 0.0 0.0 2.79 4.6 0.49 0.47 2.75 8.02 0.3 0.0 0.0 0.18 0.48 0.75 0.52 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.3 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.63 0.49 0.0 0.2 0.17 3.86 0.13 1.69 1.08 2.82 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.03 0.03 0.01
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.14 0.09 0.09 0.04 0.17 0.11 0.15
6.45 4.25 3.1 0.51 2.15 3.07 0.05 0.05 3.87 5.09 1.02 0.05 3.3 1.38 0.65 2.84 2.71 4.67 1.03
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)