1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_260 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.05 0.11 0.13 0.03 1.0 0.08
0.1 0.14 0.1 0.11 0.09 0.06 0.11 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.23 0.22 0.13 0.16 0.13 0.07 0.12 0.11 0.09 0.09 0.13 0.09 0.13 0.49 0.1 0.68 0.07 0.11 0.13 0.12 0.16 0.08 0.17 0.29 0.14 0.26 0.08 0.23 0.33 0.2 0.11 0.14 0.22 1.0 0.08
0.37 0.38 0.25 0.27 0.17 0.12 0.26 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.1 0.17 0.16 0.08 0.37 0.28 0.11 0.18 0.11 0.1 0.09 0.19 0.3 0.45 0.08 0.3 0.2 0.13 0.18 0.25 0.09 0.16 0.15 0.16 0.07 0.14 0.13 0.2 0.25 0.14 0.31 1.0 0.15
0.11 0.44 0.13 0.09 0.08 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.24 0.22 0.16 0.17 0.14 0.06 0.32 0.16 0.15 0.23 0.16 0.01 0.16 0.08 0.2 0.1 0.0 0.27 0.08 0.12 0.13 0.27 0.16 0.08 0.19 0.06 0.04 0.24 0.24 0.33 0.17 0.13 1.0 0.78 0.14
0.48 0.67 0.54 0.64 0.54 0.25 0.64 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.34 0.34 0.3 0.28 0.33 0.12 0.44 0.32 0.34 0.43 0.33 0.05 0.32 0.16 0.65 0.23 0.03 0.4 0.27 0.27 0.25 0.35 0.32 0.2 0.31 0.15 0.11 0.06 0.39 0.47 0.46 0.39 0.37 1.0 0.39
0.44 0.72 0.08 0.0 0.04 0.07 0.0 0.08 0.17 0.17 0.21 0.15 0.08 0.31 0.14 0.22 0.33 0.17 0.32 0.27 0.19 0.13 0.01 0.21 0.08 0.16 0.3 0.0 0.01 0.16 0.14 0.08 0.08 0.22 0.06 0.37 0.36 0.24 0.43 0.03 0.35 0.26 0.12 0.06 0.07 0.17 1.0 0.07
0.65 0.14 0.28 0.39 0.25 0.15 0.37 0.09 0.1 0.04 0.06 0.09 0.06 0.18 0.33 0.2 0.21 0.12 0.11 0.22 0.11 0.13 0.14 0.16 0.16 0.15 0.29 0.26 0.19 0.18 0.13 0.2 0.14 0.18 0.11 0.2 0.52 0.15 0.52 0.27 0.22 0.25 0.18 0.16 0.15 0.11 1.0 0.13
0.17 0.2 0.21 0.21 0.24 0.17 0.18 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.23 0.08 0.18 0.2 0.31 0.09 0.17 0.23 0.17 0.24 0.22 0.09 0.2 0.3 0.17 0.04 0.04 0.28 0.38 0.23 0.32 0.27 0.3 0.14 0.24 0.16 0.01 0.02 0.25 0.3 0.33 0.35 0.46 1.0 0.36
0.13 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.16 0.04 0.38 0.23 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.22 0.16 0.03 0.01 1.0 0.37 0.04
0.38 0.65 0.61 0.46 0.42 0.14 0.42 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.36 0.29 0.21 0.21 0.16 0.16 0.61 0.34 0.36 0.53 0.24 0.18 0.2 0.1 0.78 1.0 0.14 0.51 0.31 0.23 0.17 0.48 0.21 0.33 0.31 0.21 0.15 0.18 0.15 0.28 0.7 0.28 0.25 0.53 0.37
0.58 0.31 0.36 0.37 0.35 0.34 0.36 0.27 0.3 0.34 0.39 0.29 0.21 0.24 0.23 0.19 0.25 0.22 0.25 0.28 0.31 0.18 0.2 0.16 0.09 0.15 0.21 0.32 0.09 0.1 0.2 0.18 0.11 0.17 0.22 0.16 0.16 0.17 0.19 0.05 0.08 0.28 0.27 0.29 0.17 1.0 0.91 0.24
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.31 0.01 0.01 0.21 0.03 0.08 0.01 0.02 1.0 0.45 0.26 0.29 0.01 0.75 0.23
0.07 0.09 0.1 0.03 0.08 0.02 0.03 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.23 0.07 0.07 0.13 0.07 0.04 0.09 0.11 0.06 0.03 0.04 0.13 0.19 0.15 0.4 0.07 0.08 0.17 0.09 0.2 0.12 0.32 0.07 0.14 0.46 0.27 0.44 0.01 0.02 0.3 0.05 0.03 0.46 0.0 1.0 0.01
0.03 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0
0.69 0.57 0.36 0.55 0.4 0.45 0.45 0.19 0.09 0.01 0.01 0.02 0.04 0.38 0.15 0.31 0.4 0.53 0.17 0.25 0.44 0.2 0.25 0.31 0.14 0.22 0.31 0.16 0.29 0.13 0.42 0.32 0.22 0.48 0.25 0.33 0.18 0.39 0.25 0.07 0.05 0.59 0.6 0.49 0.33 0.05 1.0 0.6
0.45 0.44 0.28 0.13 0.24 0.07 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.24 0.21 0.25 0.15 0.07 0.33 0.19 0.22 0.29 0.16 0.06 0.2 0.27 0.19 0.22 0.04 0.24 0.14 0.22 0.18 0.16 0.25 0.31 0.26 0.23 0.24 0.16 0.32 0.5 0.41 0.18 0.68 1.0 0.25
0.31 0.35 0.32 0.31 0.23 0.16 0.23 0.17 0.06 0.01 0.02 0.03 0.03 0.45 0.33 0.32 0.27 0.24 0.25 0.42 0.26 0.26 0.24 0.24 0.51 0.28 0.7 0.44 0.35 0.68 0.31 0.28 0.34 0.46 0.28 0.23 0.64 0.35 0.67 0.17 0.06 0.34 0.24 0.26 0.24 0.16 1.0 0.12
0.06 0.14 0.06 0.06 0.07 0.04 0.06 0.03 0.05 0.08 0.04 0.0 0.08 0.15 0.06 0.12 0.15 0.15 0.1 0.19 0.08 0.08 0.09 0.08 0.03 0.09 0.15 0.14 0.11 0.03 0.06 0.11 0.12 0.23 0.13 0.15 0.19 0.15 0.26 0.07 0.03 0.23 0.28 0.12 0.13 1.0 0.57 0.13
0.05 0.0 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.35 0.19 0.41 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 1.0 0.55 0.08 0.88 0.87 0.76 0.23
0.03 0.05 0.18 0.13 0.14 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.03 0.09 0.06 0.1 0.16 0.03 0.06 0.05 0.01 0.03 0.05 0.02 0.27 0.03 0.0 0.03 0.04 0.09 0.03 0.07 0.01 0.05 0.22 0.05 0.07 0.0 0.05 1.0 0.28 0.01 0.13 0.0 0.31 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.33 0.06 0.0 1.0 0.1
0.14 0.23 0.24 0.15 0.16 0.08 0.13 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.08 0.1 0.19 0.18 0.09 0.21 0.11 0.11 0.11 0.13 0.04 0.12 0.16 0.15 0.66 0.03 0.21 0.11 0.08 0.12 0.16 0.11 0.14 0.13 0.12 0.03 0.11 0.14 0.23 0.18 0.12 0.43 1.0 0.12
0.28 0.76 0.29 0.35 0.21 0.09 0.29 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.06 0.46 0.4 0.28 0.3 0.21 0.19 0.65 0.28 0.29 0.45 0.28 0.23 0.26 0.5 0.68 0.91 0.22 0.49 0.31 0.2 0.24 0.59 0.21 0.51 0.32 0.51 0.06 0.17 0.29 0.26 0.45 0.28 0.15 1.0 0.28
0.25 0.18 0.33 0.45 0.28 0.29 0.43 0.21 0.23 0.09 0.13 0.56 0.24 0.13 0.18 0.08 0.15 0.21 0.2 0.16 0.14 0.09 0.12 0.12 0.03 0.1 0.11 0.16 0.41 0.02 0.21 0.13 0.09 0.17 0.18 0.13 0.09 0.12 0.12 0.04 0.1 0.16 0.24 0.13 0.22 0.66 1.0 0.18
0.28 0.1 0.05 0.06 0.06 0.06 0.06 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.05 0.08 0.09 0.08 0.04 0.09 0.09 0.07 0.07 0.07 0.03 0.07 0.19 0.04 0.09 0.02 0.06 0.08 0.05 0.11 0.06 0.13 0.15 0.11 0.12 0.01 0.01 0.33 0.18 0.09 0.12 0.24 1.0 0.07
0.13 0.1 0.06 0.08 0.12 0.16 0.11 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.09 0.12 0.08 0.08 0.04 0.13 0.11 0.08 0.1 0.16 0.09 0.16 0.36 0.14 0.62 0.07 0.19 0.15 0.07 0.1 0.1 0.22 0.44 0.16 0.29 0.17 0.12 0.06 0.08 0.08 0.06 0.4 1.0 0.05
0.74 0.34 0.02 0.13 0.11 0.22 0.2 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.11 0.08 0.02 0.03 0.39 0.05 0.1 0.4 0.02 1.0 0.01 0.71 0.04 0.02 0.09 0.04 0.06 0.06 0.04 0.03 0.01 0.0 0.08 0.01 0.02 0.01 0.0 0.74 0.01
0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.03 0.01 0.08 0.06 0.21 0.02 0.01 0.15 0.02 0.2 0.17 0.0 1.0 0.16 0.02 0.34 0.23 0.45 0.0
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0 0.12 0.01 0.02 0.38 0.0 0.53 0.06 0.0 0.1 1.0 0.11 0.0
0.15 0.22 0.09 0.06 0.07 0.08 0.08 0.29 0.37 0.17 0.31 0.05 0.12 0.32 0.47 0.28 0.34 0.2 0.35 0.27 0.46 0.22 0.24 0.24 0.07 0.23 0.54 0.17 1.0 0.03 0.23 0.31 0.16 0.18 0.2 0.29 0.25 0.18 0.2 0.04 0.02 0.32 0.22 0.17 0.21 0.17 0.96 0.13
0.3 0.26 0.6 0.42 0.65 0.76 0.49 0.49 0.23 0.12 0.15 0.02 0.03 0.34 0.45 0.22 0.3 0.52 0.19 0.3 0.37 0.21 0.29 0.28 0.04 0.23 0.21 0.46 0.53 0.04 0.32 0.93 0.19 0.29 0.3 0.29 0.16 0.27 0.13 0.07 0.06 0.43 0.57 0.49 0.44 1.0 0.92 0.48
0.36 1.0 0.55 0.48 0.39 0.18 0.42 0.06 0.04 0.02 0.03 0.01 0.01 0.62 0.61 0.45 0.46 0.38 0.21 0.7 0.42 0.41 0.58 0.37 0.13 0.32 0.49 0.82 0.19 0.12 0.54 0.46 0.36 0.54 0.64 0.33 0.53 0.44 0.58 0.21 0.56 0.43 0.54 0.67 0.38 0.69 0.85 0.42
0.16 0.26 0.09 0.12 0.12 0.16 0.14 0.22 0.24 0.19 0.23 0.01 0.03 0.17 0.13 0.19 0.19 0.16 0.19 0.24 0.15 0.14 0.16 0.14 0.09 0.17 0.12 0.15 0.28 0.1 0.19 0.18 0.14 0.26 0.15 0.21 0.2 0.24 0.2 0.1 0.05 0.38 0.32 0.26 0.19 0.28 1.0 0.13
0.11 0.03 0.04 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.06 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 0.08 1.0 0.05 0.05 0.03 0.04 0.0 0.51 0.02
0.65 0.53 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.21 0.26 0.28 0.31 0.09 0.38 0.2 0.21 0.27 0.27 0.1 0.27 0.39 0.51 0.4 0.07 0.35 0.28 0.21 0.4 0.31 0.31 0.57 0.37 0.63 0.27 0.3 0.49 0.65 0.54 0.4 0.33 1.0 0.34
0.07 0.09 0.09 0.06 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.12 0.04 0.07 0.09 0.02 0.04 0.02 0.04 0.08 0.04 0.03 0.06 0.03 0.05 0.02 0.03 0.06 0.04 0.04 0.05 0.03 0.02 0.03 0.05 0.03 0.05 0.04 0.05 0.02 0.01 0.06 0.05 0.1 0.04 0.0 1.0 0.04
0.16 0.1 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.05 0.02 0.08 0.04 0.1 0.07 0.03 0.03 0.15 0.01 0.07 0.04 0.31 0.48 0.0 0.34 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.07 0.03 0.03 0.02 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 1.0 0.02
0.44 0.12 0.32 0.57 0.28 0.13 0.46 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.15 0.1 0.15 0.14 0.21 0.16 0.12 0.09 0.11 0.1 0.23 0.1 0.18 0.15 0.38 0.18 0.13 0.14 0.09 0.17 0.13 0.12 0.21 0.12 0.19 0.1 0.97 0.16 0.15 0.07 0.18 0.37 1.0 0.11
0.22 0.1 0.07 0.05 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.12 0.18 0.12 0.19 0.17 0.05 0.11 0.11 0.07 0.09 0.11 0.05 0.11 0.18 0.16 0.27 0.04 0.07 0.11 0.13 0.16 0.08 0.13 0.21 0.14 0.3 0.14 0.18 0.24 0.3 0.13 0.16 1.0 0.97 0.14
0.04 0.06 0.03 0.04 0.04 0.03 0.04 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.05 0.04 0.04 0.05 0.03 0.03 0.06 0.08 0.04 0.05 0.04 0.04 0.05 0.1 0.04 0.05 0.04 0.05 0.06 0.04 0.1 0.04 0.04 0.11 0.06 0.13 0.01 0.01 0.11 0.06 0.03 0.07 0.04 1.0 0.03
0.48 0.24 0.27 0.22 0.2 0.12 0.2 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.24 0.42 0.2 0.36 0.25 0.09 0.29 0.18 0.19 0.18 0.2 0.1 0.23 0.22 0.22 1.0 0.09 0.23 0.19 0.17 0.21 0.21 0.28 0.41 0.21 0.28 0.16 0.29 0.29 0.27 0.25 0.25 0.29 0.9 0.15
0.07 0.47 0.51 0.65 0.69 0.97 0.71 0.41 0.21 0.02 0.03 0.02 0.0 0.39 0.49 0.37 0.63 0.52 0.16 0.54 0.65 0.45 0.59 0.37 0.21 0.31 0.29 0.39 0.24 0.13 0.66 0.65 0.23 0.29 0.36 0.42 0.49 0.37 0.26 0.01 0.03 0.26 0.83 0.64 1.0 0.32 0.66 0.68
0.64 0.66 0.83 0.7 0.65 0.39 0.72 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.57 0.54 0.47 0.64 0.58 0.21 0.64 0.63 0.5 0.63 0.52 0.26 0.47 0.55 0.41 0.32 0.16 0.71 0.6 0.24 0.44 0.52 0.71 0.72 0.46 0.39 0.03 0.02 0.76 0.84 0.58 0.66 1.0 0.96 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.0 0.0 0.08 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 1.0 0.29 0.32 0.43 0.33
0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.04 0.01 0.05 0.07 0.26 0.01 0.0 0.04 0.02 0.03 0.02 0.0 1.0 0.25 0.02 0.3 0.0 0.97 0.05
0.3 0.13 0.31 0.13 0.11 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.14 0.01 0.08 0.18 0.09 0.0 0.05 0.0 0.45 0.22 0.0 0.14 0.07 0.03 0.02 0.21 0.06 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.02 0.03 0.23 0.11 0.03 1.0 0.16
0.36 0.54 0.21 0.21 0.18 0.06 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.18 0.28 0.3 0.26 0.1 0.62 0.27 0.34 0.47 0.3 0.19 0.3 0.21 0.49 0.66 0.16 0.5 0.4 0.18 0.25 0.51 0.29 0.55 0.35 0.54 0.16 0.07 0.3 0.28 0.63 0.49 0.01 1.0 0.3
0.14 0.04 0.0 0.0 0.03 0.12 0.01 0.08 0.04 0.02 0.02 0.0 0.06 0.05 0.08 0.4 0.22 0.07 0.06 0.22 0.27 0.06 0.06 0.14 0.19 0.19 0.32 0.11 0.03 0.05 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.07 0.33 0.03 0.17 0.03 0.07 0.14 0.07 0.02 0.03 1.0 0.6 0.03
0.22 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.12 0.01 0.12 0.04 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.17 0.13 0.03 0.27 1.0 0.05 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.62 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)