Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.81 15.7 37.82 14.5 2.89 20.8 2.7 2.98 2.27 2.9 25.73 7.96 16.96 73.71 53.69 32.4 25.67 95.54 20.97
0.03 0.36 0.74 1.33 0.37 0.86 0.48 0.38 1.09 0.48 1.35 0.59 0.71 5.79 1.43 1.05 1.38 3.67 1.13
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.09 0.55 0.35 0.24 0.0 0.77 0.0
0.0 0.2 0.92 0.37 0.18 0.0 0.83 0.95 0.89 0.9 3.3 1.41 3.01 2.64 2.84 5.17 4.29 11.8 3.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.18 0.03 0.04 3.0 0.0 0.12 0.06 0.81 0.13
4.27 1.82 1.63 0.91 4.15 15.83 0.66 0.09 0.74 0.96 2.87 5.13 0.18 41.13 2.31 8.33 6.97 12.69 3.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.41 0.45 0.0 0.0 1.35 1.26 0.15 0.55 0.67 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 1.6 2.41 1.15 1.84 0.5 1.26 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 1.6 2.41 1.15 1.84 0.5 1.26 0.44
61.08 11.32 12.33 50.74 115.57 122.11 77.27 7.08 79.76 21.8 65.07 259.98 108.77 523.32 223.21 191.86 101.48 151.41 59.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01 0.0 0.04 0.3 0.03
0.08 0.22 0.0 0.07 0.03 0.09 0.08 0.0 0.11 0.14 0.08 0.09 0.1 0.52 0.43 0.23 0.31 0.26 0.27
4.69 5.19 3.71 3.92 4.42 7.88 0.51 5.66 3.26 2.35 3.81 4.63 4.57 28.63 16.97 19.86 20.25 27.47 3.16
9.37 4.23 0.0 6.07 7.7 1.81 0.8 0.7 4.95 0.74 11.07 0.53 3.42 11.59 23.49 13.33 15.12 16.63 8.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.37 0.1 0.0 0.02 0.8 0.45 0.38 0.42 0.65 0.4
0.0 1.84 0.0 0.0 0.0 0.0 3.5 2.29 5.52 2.66 6.39 1.58 4.73 11.08 7.64 5.07 4.79 22.08 4.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.02 0.24 0.07 0.08 0.04 0.21 0.02
0.0 0.22 0.24 0.25 0.0 0.0 0.0 0.14 0.3 0.44 0.75 0.17 0.61 1.7 1.85 0.33 0.51 3.69 0.16
4.2 6.57 4.18 3.23 5.25 5.92 2.9 2.61 3.5 1.7 5.16 2.04 2.0 14.74 9.99 9.01 10.67 16.06 6.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0
1.25 0.26 0.0 0.1 0.2 1.29 0.28 0.03 0.33 0.19 0.68 1.21 0.5 3.38 2.22 0.55 0.58 6.28 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
96.24 103.99 106.06 127.06 86.99 123.85 75.5 73.79 103.88 29.81 123.34 181.69 120.44 205.33 167.74 137.08 121.96 196.71 137.02
0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 1.07 0.0 0.0 9.28 5.3 0.2 0.22 6.99 1.49
0.05 0.0 0.08 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.16 0.62 0.2 0.05 4.31 2.65 0.17 0.13 2.99 0.8
0.0 0.19 0.1 0.0 0.38 2.59 0.12 0.49 0.47 0.86 0.41 0.06 0.87 4.96 4.45 0.24 1.23 4.16 0.34
0.14 0.05 0.0 0.13 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.33 0.14 0.02 0.09 0.31 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.33 0.24 0.11 0.35 1.06 0.08 0.49 0.0 0.38 0.42 0.17 0.14 3.7 2.64 0.78 1.1 3.72 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.26 0.03 0.13 0.0 0.49 0.0 0.94 1.9 0.68 1.07 0.68 1.77 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 1.39 0.28 0.59 0.85 1.39 0.0 0.38 0.0 0.21 0.53 2.48 0.14 4.35 0.12 1.22 1.24 1.07 0.05
0.17 0.19 0.21 0.22 0.05 0.92 0.0 0.0 0.0 0.17 0.23 0.0 0.08 2.02 0.96 0.19 0.24 1.43 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 1.22 0.13 0.0 0.05 0.25 0.23
19.05 20.38 12.2 14.07 16.51 21.34 6.48 6.96 8.46 6.96 47.02 38.41 29.71 100.01 61.92 42.36 48.02 84.79 43.12
0.17 0.83 0.0 0.35 0.14 0.65 0.4 0.18 0.09 0.0 0.63 0.0 0.44 3.25 2.9 1.03 0.84 5.58 1.48
0.17 0.83 0.0 0.35 0.14 0.65 0.4 0.18 0.09 0.0 0.63 0.0 0.44 3.25 2.9 1.03 0.84 5.58 1.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.5 0.18 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.49 1.65 1.81 32.5 37.17 11.38 6.01 75.49 41.09
0.04 0.07 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.11 0.04 0.25 0.02 0.02 0.0 0.04 0.01
0.0 0.17 1.13 1.27 0.0 1.1 1.28 0.08 0.76 0.31 7.01 8.83 4.34 44.05 8.33 12.03 12.33 21.43 5.56
0.0 1.69 0.09 2.1 0.66 2.27 0.56 0.0 0.0 0.0 2.42 5.56 2.15 14.35 2.72 4.2 4.59 9.07 3.01
5.67 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.84 3.73 0.0 2.63 2.14 0.0 1.43 7.61 6.21 4.31 3.18 13.39 2.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.07 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.11 0.13 0.06 0.13 0.05 0.4 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.11 2.16 4.77 5.99 1.13 4.74 2.05 5.01 0.76 0.66 16.62 1.14 4.62 46.74 18.19 16.07 13.3 25.95 18.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.57 0.36 0.02 0.09 0.45 0.15
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.06 0.0 0.2 0.64 0.42 0.38 0.3 0.6 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.13 1.21 0.0 0.0 0.12 0.48 0.62
0.72 1.25 0.25 0.0 1.31 0.44 0.27 1.6 7.17 4.76 1.96 0.16 1.31 23.76 1.67 2.86 2.25 2.63 4.61
0.3 1.34 0.55 0.4 0.23 0.81 0.0 0.08 0.45 0.1 0.08 0.16 0.43 8.26 0.3 0.28 0.11 0.61 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.23 0.04 0.6 0.07 0.1 0.03 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.14 0.03 0.06 0.0 0.03 0.02
4.49 3.57 0.89 2.01 2.49 2.59 2.46 1.91 1.99 1.9 26.6 27.63 31.87 109.76 40.88 25.27 26.28 59.85 26.55
0.3 0.03 0.0 0.03 0.28 0.15 0.0 0.1 0.04 0.04 0.26 0.07 0.0 2.5 1.37 0.14 0.25 3.98 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.05 0.0 0.16 0.05 0.11 0.02 0.55 0.35 0.19 0.17 0.69 0.08
0.87 0.47 0.21 0.43 0.88 2.86 0.29 0.26 0.56 0.45 0.66 2.08 0.15 21.28 0.79 1.35 0.57 2.43 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0
0.9 0.06 0.0 0.22 0.84 2.53 0.07 0.42 1.75 4.8 1.36 0.95 5.02 11.32 7.99 1.09 3.24 7.27 3.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.23 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.77 0.27 0.18 0.25 0.49 0.48
5.8 6.9 1.11 1.7 4.08 7.53 2.74 1.03 3.75 2.78 7.02 3.63 3.68 12.72 8.11 12.51 8.43 11.15 6.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.06 0.06 0.25 0.0
17.55 12.65 16.6 23.28 21.33 80.66 12.6 12.4 13.29 20.94 89.57 143.57 17.83 358.27 170.04 176.38 140.29 209.39 104.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.17 0.56 0.16 0.13 0.03 1.32 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.39 0.04 0.09 1.22 0.42 0.89 0.02 0.02 14.75 5.83 1.39 1.11 18.78 1.83
0.33 0.5 0.1 0.41 0.36 0.84 0.32 0.8 0.05 0.13 5.28 5.7 2.99 13.98 5.49 10.24 5.87 10.66 5.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.5 0.41 0.39 0.52 1.48 0.11 0.18 0.12 0.2 0.51 1.86 0.48 24.14 0.87 1.28 0.91 3.04 0.64
0.27 0.3 0.58 0.51 0.45 1.69 0.48 0.08 0.45 0.12 0.97 1.32 1.18 3.85 1.21 1.2 1.08 2.03 0.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.22 0.22 0.15 0.15 0.0 0.96 0.25 0.16 0.28 0.76 0.41
0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.08 0.18 0.19 0.0 0.08 1.24 0.08 0.16 1.08 1.2 1.43 0.88 1.97 1.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.27 1.61 0.92 0.07 1.38 0.47 1.96 1.37 0.1 5.86 3.48 1.04 8.85 5.72 3.97 5.76 9.64 5.51
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 2.16 1.34 0.21 0.22 3.02 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.24 0.04 0.04 0.04 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.03 0.1 0.63 0.52 0.0 0.21 0.41 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 1.72 0.0 8.1 3.37 0.0 0.55 4.78 0.0
1.72 2.19 1.18 1.69 3.86 11.16 1.61 0.66 1.71 0.61 5.08 3.45 5.23 13.98 7.56 10.11 8.15 15.42 6.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.22 0.0 0.6 0.28 0.0 0.0 0.74 0.0 0.86 0.0 0.91 6.28 0.75 2.84 2.08 1.68 2.61

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)