Heatmap: Cluster_188 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.43 0.77 0.98 0.57 0.38 1.0 0.18 0.31 0.09 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.03 0.0 0.01
0.43 0.77 0.98 0.57 0.38 1.0 0.18 0.31 0.09 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.03 0.0 0.01
0.72 1.0 0.74 0.86 0.75 0.93 0.26 0.28 0.22 0.31 0.4 0.2 0.11 0.35 0.4 0.5 0.53 0.32 0.25
0.8 1.0 0.9 0.57 0.55 0.97 0.4 0.6 0.3 0.15 0.32 0.59 0.22 0.34 0.35 0.55 0.47 0.45 0.27
0.45 0.78 1.0 1.0 0.79 1.0 0.08 0.01 0.08 0.0 0.23 0.0 0.04 0.15 0.09 0.0 0.16 0.21 0.11
0.93 0.98 0.75 0.83 1.0 0.93 0.89 0.72 0.81 0.47 0.52 0.87 0.49 0.61 0.64 0.66 0.57 0.68 0.52
0.94 0.9 1.0 0.88 0.91 0.87 0.72 0.35 0.62 0.2 0.59 0.5 0.44 0.45 0.42 0.57 0.53 0.51 0.6
0.68 0.21 1.0 0.85 0.18 0.51 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 0.09 0.0
1.0 0.52 0.52 0.0 0.69 0.76 0.04 0.03 0.0 0.12 0.02 0.27 0.0 0.08 0.11 0.04 0.14 0.18 0.05
0.38 0.56 0.42 1.0 0.66 0.0 0.03 0.04 0.05 0.08 0.13 0.36 0.0 0.34 0.19 0.02 0.08 0.16 0.1
0.14 0.63 1.0 0.99 0.75 0.85 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.21 0.05 0.0
0.32 0.53 0.47 0.62 1.0 0.71 0.22 0.15 0.06 0.06 0.06 0.0 0.03 0.04 0.05 0.05 0.07 0.08 0.08
0.66 1.0 0.78 0.68 0.78 0.72 0.17 0.11 0.12 0.06 0.09 0.05 0.04 0.12 0.17 0.08 0.09 0.16 0.07
0.89 0.57 0.81 0.75 0.82 1.0 0.14 0.02 0.26 0.15 0.34 0.76 0.25 0.32 0.34 0.59 0.31 0.36 0.33
1.0 0.23 0.63 0.18 0.76 0.57 0.13 0.03 0.02 0.06 0.02 0.19 0.14 0.01 0.04 0.05 0.01 0.09 0.01
0.95 0.74 0.54 0.5 1.0 0.77 0.05 0.11 0.06 0.09 0.02 0.36 0.0 0.02 0.03 0.05 0.04 0.04 0.01
0.74 1.0 0.66 0.67 0.5 0.78 0.4 0.36 0.4 0.05 0.38 0.57 0.37 0.39 0.52 0.3 0.32 0.51 0.31
0.36 0.8 0.95 1.0 0.98 0.83 0.01 0.22 0.01 0.04 0.01 0.1 0.0 0.02 0.02 0.02 0.06 0.01 0.0
0.75 0.63 1.0 0.52 0.8 0.62 0.28 0.04 0.21 0.19 0.23 0.01 0.08 0.12 0.36 0.16 0.21 0.21 0.34
0.65 1.0 0.8 0.36 0.48 0.43 0.08 0.04 0.12 0.14 0.04 0.15 0.02 0.1 0.02 0.03 0.06 0.05 0.09
0.0 0.0 0.52 0.42 0.3 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.11
0.79 0.45 0.74 0.88 0.79 1.0 0.15 0.11 0.18 0.12 0.06 0.0 0.02 0.1 0.07 0.08 0.1 0.08 0.05
0.51 0.72 0.91 1.0 0.49 0.57 0.04 0.4 0.01 0.07 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.24 0.3 0.03 0.0
0.66 0.79 1.0 0.98 0.79 0.63 0.57 0.36 0.47 0.23 0.53 0.4 0.45 0.34 0.39 0.6 0.53 0.53 0.53
0.6 1.0 0.43 0.45 0.69 0.94 0.3 0.34 0.48 0.24 0.17 0.3 0.2 0.34 0.41 0.34 0.26 0.41 0.23
0.96 1.0 0.76 0.75 0.84 0.93 0.51 0.24 0.57 0.46 0.55 0.74 0.45 0.44 0.65 0.51 0.4 0.61 0.49
0.82 1.0 0.8 0.87 0.62 0.91 0.46 0.53 0.32 0.29 0.43 0.11 0.52 0.5 0.55 0.59 0.72 0.43 0.43
0.82 0.95 0.82 0.91 0.58 1.0 0.45 0.36 0.34 0.12 0.55 0.61 0.47 0.61 0.77 0.73 0.68 0.72 0.47
0.64 1.0 0.29 0.49 0.79 0.8 0.28 0.3 0.29 0.21 0.09 0.49 0.18 0.19 0.21 0.2 0.15 0.31 0.11
0.87 0.82 0.85 0.72 0.78 1.0 0.5 0.37 0.36 0.08 0.52 0.67 0.46 0.52 0.58 0.52 0.5 0.55 0.44
0.28 0.5 0.64 0.85 0.48 1.0 0.22 0.07 0.25 0.04 0.12 0.0 0.11 0.05 0.08 0.07 0.05 0.07 0.03
0.69 0.49 0.55 0.77 1.0 0.77 0.28 0.24 0.35 0.39 0.1 0.0 0.06 0.1 0.13 0.26 0.15 0.19 0.21
0.78 0.92 0.58 0.72 0.72 1.0 0.49 0.27 0.42 0.15 0.33 0.55 0.36 0.28 0.24 0.4 0.37 0.34 0.24
1.0 0.84 0.5 0.66 0.72 0.98 0.34 0.37 0.22 0.08 0.27 0.54 0.56 0.35 0.34 0.35 0.42 0.37 0.46
0.0 1.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.92 1.0 0.89 0.77 0.9 1.0 0.44 0.54 0.42 0.39 0.45 0.79 0.45 0.38 0.47 0.53 0.49 0.42 0.35
0.52 1.0 0.83 0.6 0.6 0.56 0.03 0.08 0.19 0.31 0.13 0.46 0.04 0.2 0.16 0.19 0.27 0.11 0.15
0.63 1.0 0.45 0.55 0.55 0.74 0.71 0.56 0.58 0.11 0.25 0.46 0.3 0.24 0.36 0.51 0.36 0.42 0.19
0.57 0.5 1.0 0.41 0.39 0.38 0.25 0.36 0.16 0.34 0.06 0.09 0.06 0.03 0.05 0.06 0.05 0.05 0.06
1.0 0.66 0.52 0.55 0.76 0.76 0.18 0.2 0.23 0.07 0.17 0.4 0.25 0.15 0.19 0.36 0.31 0.24 0.25
0.69 0.16 0.76 1.0 0.78 0.38 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.03
0.87 0.94 0.7 0.49 1.0 0.86 0.42 0.15 0.48 0.47 0.03 0.02 0.27 0.04 0.03 0.04 0.05 0.07 0.01
0.74 0.57 0.8 0.99 1.0 0.73 0.27 0.1 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.07 0.05 0.14 0.07 0.21 0.21
1.0 0.8 0.37 0.89 0.51 0.71 0.06 0.07 0.06 0.06 0.15 0.23 0.03 0.19 0.16 0.2 0.51 0.17 0.16
0.54 1.0 0.91 0.6 0.47 0.66 0.03 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
1.0 1.0 0.83 0.94 0.56 0.9 0.31 0.59 0.24 0.27 0.46 0.27 0.48 0.42 0.68 0.59 0.69 0.5 0.52
0.68 0.59 0.82 0.68 0.52 1.0 0.22 0.39 0.27 0.6 0.23 0.4 0.05 0.25 0.32 0.33 0.34 0.27 0.21
0.69 0.53 0.7 0.41 0.92 1.0 0.08 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0
1.0 0.8 0.63 0.74 0.57 0.93 0.62 0.15 0.24 0.02 0.34 0.59 0.22 0.31 0.67 0.39 0.35 0.42 0.21
0.61 0.79 0.95 0.67 0.6 1.0 0.36 0.55 0.35 0.55 0.34 0.36 0.34 0.28 0.34 0.56 0.42 0.47 0.38
0.95 1.0 0.45 0.54 1.0 0.72 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.68 1.0 0.61 0.65 0.73 0.9 0.71 0.61 0.64 0.47 0.34 0.62 0.54 0.33 0.46 0.51 0.39 0.43 0.44
0.45 0.34 0.92 1.0 0.85 0.74 0.08 0.01 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.34 0.92 1.0 0.85 0.74 0.08 0.01 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.72 0.77 0.62 1.0 0.88 0.69 0.4 0.33 0.09 0.44 0.91 0.37 0.45 0.51 0.57 0.43 0.52 0.41
0.87 0.77 0.94 0.72 1.0 0.87 0.24 0.15 0.12 0.03 0.2 0.36 0.1 0.19 0.25 0.2 0.17 0.14 0.14
0.91 0.74 0.32 0.32 1.0 0.75 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.21 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.47 0.63 0.93 0.51 1.0 0.68 0.15 0.15 0.16 0.32 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.63 1.0 0.75 0.7 0.7 0.91 0.38 0.51 0.42 0.28 0.4 0.77 0.23 0.41 0.45 0.4 0.43 0.41 0.43
1.0 0.69 0.89 0.59 0.69 0.85 0.41 0.37 0.34 0.04 0.03 0.22 0.0 0.02 0.06 0.1 0.04 0.01 0.01
0.8 0.61 1.0 0.35 0.57 0.41 0.12 0.13 0.19 0.25 0.05 0.05 0.03 0.04 0.03 0.05 0.05 0.04 0.07
0.87 0.89 1.0 0.56 0.62 0.42 0.07 0.11 0.11 0.09 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)