1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.27 0.0 0.0 0.0 2.96 0.0 0.0 2.3 0.0 5.39 8.19 0.74 7.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.15 0.05 0.35 0.02 0.33 0.42
0.13 0.04 0.31 0.17 0.0 1.33 0.14 0.77 0.48 0.1 1.89 1.84 0.48 2.47 2.26 1.83 2.92 2.56 5.29
0.0 0.0 0.73 0.0 0.47 0.0 1.4 0.25 0.0 0.0 10.94 9.5 7.36 20.05 17.49 9.82 20.18 6.64 23.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.02 0.17 0.0 0.09 0.14 0.25 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 1.67 0.84 0.85 1.36 1.12 1.98 2.78
0.03 0.02 0.35 0.15 0.11 0.14 0.03 0.15 0.24 0.08 0.8 0.02 0.11 0.33 0.24 0.17 0.35 0.38 1.44
1.51 0.59 1.42 2.5 2.16 1.08 1.28 1.83 0.45 0.09 5.8 1.68 2.52 4.93 5.42 2.28 6.75 7.16 5.99
0.0 0.0 2.94 0.0 0.15 0.0 1.01 1.62 0.18 0.0 12.05 0.0 0.05 2.26 0.04 3.79 4.63 4.48 14.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.57 0.12 0.0 0.15 2.35 0.0 0.37 1.4 1.28 1.8 1.66 1.02 4.35
7.68 4.0 3.08 3.57 2.91 4.74 8.5 5.08 5.38 0.96 12.37 2.5 10.99 13.78 14.09 13.82 12.95 11.6 19.72
0.4 1.53 0.34 0.31 0.05 0.24 0.25 0.27 0.53 0.12 0.69 0.36 0.03 1.07 1.46 2.69 2.6 1.51 2.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.05 0.21 0.14 0.42 0.25 0.18 0.66
0.05 0.0 0.02 0.0 0.24 0.05 0.13 0.0 0.06 0.18 7.74 0.74 2.8 4.22 3.59 23.44 21.97 5.44 15.88
0.26 0.61 0.0 0.45 1.16 0.87 0.72 0.2 0.8 0.12 0.97 0.46 0.81 1.7 1.71 1.25 1.84 1.42 2.57
0.43 1.05 0.45 0.72 0.0 0.59 7.26 6.65 7.59 8.19 8.83 0.19 3.77 6.56 7.59 17.66 3.57 4.94 24.52
1.87 0.24 1.35 1.03 0.99 0.16 0.98 0.12 0.49 0.54 2.55 0.26 0.62 1.51 0.27 6.12 5.36 0.0 4.93
0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.65 1.44 0.33 1.22 1.29 3.1 1.61 1.62
0.0 0.07 0.0 0.0 0.21 0.06 0.08 0.0 0.27 0.0 2.98 0.64 0.56 1.26 0.76 2.96 3.44 1.29 3.86
1.78 3.51 1.16 2.13 1.23 3.5 2.18 0.46 2.29 0.53 3.62 0.41 5.36 3.27 4.88 6.15 5.03 8.2 5.54
14.38 17.67 11.78 19.37 11.16 14.28 23.31 12.68 16.0 1.51 34.94 9.19 19.34 24.83 31.78 32.69 35.14 32.66 43.94
0.12 0.35 0.29 0.22 0.03 0.49 0.2 0.0 0.0 0.08 0.74 0.01 1.08 0.52 0.22 1.02 0.34 0.44 1.2
0.78 1.02 0.28 2.01 1.34 2.01 1.46 0.73 1.58 1.24 27.55 6.01 4.98 16.47 14.46 33.13 28.72 14.6 37.76
3.73 8.32 11.9 3.19 7.87 13.35 3.43 0.41 1.64 0.54 14.55 1.81 5.27 15.24 3.04 29.6 23.34 6.5 19.24
8.66 7.73 12.31 16.56 6.41 10.35 23.36 22.22 11.53 3.66 32.07 9.0 19.41 26.16 25.83 30.49 32.27 19.44 43.96
1.34 0.87 3.19 3.37 2.71 5.45 3.57 2.75 7.33 11.24 87.06 18.52 35.02 52.96 45.93 178.06 191.24 48.89 173.24
0.16 0.48 0.5 0.47 0.34 0.96 0.04 0.07 0.04 0.16 0.38 0.17 0.39 0.55 0.7 1.47 1.27 1.73 1.71
0.73 0.49 0.5 0.84 0.21 1.39 1.27 0.7 0.13 2.92 3.31 3.69 3.6 5.83 3.28 4.82 5.29 3.97 9.5
5.03 5.43 9.1 7.5 4.36 12.42 8.41 16.65 7.46 13.34 21.34 20.73 14.86 21.96 21.94 17.29 25.76 14.58 36.16
0.19 0.01 0.19 0.19 0.07 0.17 0.22 0.1 0.24 0.05 0.5 0.06 0.19 0.55 0.65 0.5 0.54 0.53 1.07
0.61 1.02 0.44 0.32 0.87 0.75 0.09 0.64 0.59 0.03 1.38 0.27 0.27 1.77 0.5 2.42 1.8 1.32 1.99
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.11 0.05 0.0 0.01 0.08 0.16 0.11 0.16 0.18 0.11
2.61 2.62 7.28 5.16 9.0 8.0 25.57 22.2 30.47 21.96 43.51 5.31 23.67 28.35 33.15 46.52 74.65 26.74 71.81
5.45 20.64 8.77 11.13 2.35 10.68 7.27 7.28 10.44 2.92 21.75 15.17 21.64 24.17 13.02 40.56 34.47 31.16 40.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.37 0.23 5.69 2.22 2.1 3.32
0.0 0.8 0.65 0.23 0.13 0.14 0.45 0.05 0.29 0.13 13.75 6.1 1.05 9.4 7.13 24.08 19.69 10.25 26.86
2.37 1.8 1.22 1.86 2.8 2.95 2.77 3.29 1.29 1.16 7.16 3.21 7.77 8.61 7.67 6.57 10.71 6.16 13.01
34.88 34.3 30.89 37.32 31.34 50.88 60.96 48.05 27.71 18.64 58.48 26.36 46.21 65.5 70.32 67.04 63.49 59.95 68.72
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.5 0.22 0.51 0.0 1.71 0.09 0.14 0.53 1.3 1.13 2.03 1.96 1.66
27.14 31.92 20.41 19.71 12.85 24.23 33.89 25.89 23.11 5.31 49.05 17.66 46.69 38.34 46.16 57.43 65.7 43.34 63.04
0.0 0.17 0.24 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.34 0.55 0.0 0.34 0.58 0.72 0.95 0.62 1.66 1.56
2.03 3.95 0.52 2.97 2.06 0.65 2.22 0.0 0.73 1.19 2.9 1.14 9.79 4.31 7.23 9.6 8.23 9.71 8.19
0.0 0.7 0.51 0.07 0.06 0.12 0.19 0.08 0.1 0.2 1.92 1.4 0.57 1.37 1.28 2.32 2.08 1.47 4.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.64 1.05 0.1 1.72 0.78 1.05 1.98 2.14
212.9 73.11 543.9 384.89 324.89 228.93 657.34 423.51 687.49 150.77 684.04 0.0 384.86 385.68 368.37 855.05 962.47 358.05 1124.37
5.89 6.76 22.33 18.77 13.13 10.38 122.88 105.01 148.13 57.15 107.22 13.84 86.84 59.08 64.88 163.51 187.54 110.48 290.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.49 0.93 0.0 0.0 0.26 0.81 2.19 1.13 1.79 2.95 4.4 5.27 2.56 4.4 3.01 8.83 4.97 6.88
0.0 0.21 0.36 0.17 0.97 1.05 1.91 0.29 2.06 4.55 8.34 7.59 8.1 6.49 4.32 23.54 26.73 12.83 28.52
0.85 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.5 0.0 1.75 0.37 1.17 0.0 0.22 0.98 1.21 2.71 4.09 1.48 2.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.09 0.03 0.19 0.22 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.01 0.11 0.1 0.04 0.09
0.33 0.63 0.23 0.35 0.67 0.0 0.15 0.43 0.0 0.32 1.48 0.12 2.16 2.41 1.22 6.24 3.8 5.17 6.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.57 0.0 0.33 0.89 2.76 0.22 1.73 3.15
35.35 31.45 128.72 95.86 25.31 71.22 14.55 101.98 4.74 5.94 200.26 27.11 62.14 77.42 60.59 81.97 104.96 31.73 286.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.15 0.63 1.05 3.26 0.32 1.5 1.93 3.01 3.97 2.26 4.78
0.3 0.27 0.55 0.37 1.01 0.54 0.43 1.68 1.9 1.42 37.33 5.08 23.0 19.93 16.32 83.18 87.48 19.04 85.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.56 0.43 0.2 0.65 1.59 1.45 0.82 0.95 2.82 2.09 2.25 3.63 5.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)