Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.71 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.65 0.0 2.73 0.13 0.88 0.76 1.07 1.72 2.83 3.81 0.06 14.72 1.82 2.49 1.24 0.78 3.48 2.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.04 0.0 0.26 0.55 0.3 0.43 0.05 0.41 0.19 0.16 0.0 4.38 0.09 0.21 0.18 0.18 0.3 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 1.98 0.07 0.0 0.02 0.03 0.12 0.09
0.11 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03
0.38 0.0 0.06 0.0 0.0 0.37 0.12 0.0 0.19 0.0 0.08 0.0 2.81 0.22 0.0 0.08 0.42 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0 0.11 0.0 0.07 0.01
0.0 0.0 0.77 0.77 0.0 0.41 0.36 0.17 0.19 2.21 0.6 0.72 20.24 0.41 0.99 0.86 0.29 0.93 0.04
0.0 0.15 0.32 0.07 0.19 0.39 0.0 0.13 0.36 0.05 0.14 0.03 2.6 0.06 0.05 0.07 0.14 0.14 0.01
0.0 0.12 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.06 0.07 0.04 0.27 0.08 2.75 0.37 0.54 1.0 0.52 0.69 0.31
0.35 0.09 0.27 0.51 1.76 1.27 0.48 0.0 0.15 0.69 0.63 0.08 10.54 1.05 1.38 0.63 1.35 0.91 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 8.99 0.25 0.21 0.34 0.08 0.81 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48
0.85 0.3 0.0 0.29 0.15 0.06 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.06 5.63 0.28 0.12 0.02 0.02 0.17 0.02
0.37 0.26 0.12 0.29 0.18 0.37 0.08 0.03 0.23 0.07 0.29 0.08 3.2 0.23 0.18 0.2 0.21 0.32 0.35
0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.92 0.26 0.51 0.46 0.32 8.07 29.65 0.85 0.32 3.41 1.73 3.07 0.87
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.65 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.26 0.0 0.22 0.12 0.44 4.61 0.53 0.3 0.69 0.16 1.13 0.09
0.22 0.0 0.51 0.38 0.29 0.49 0.16 0.13 0.68 0.4 0.71 0.06 7.25 0.92 0.45 0.86 1.06 0.72 0.53
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.87 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 3.26 0.1 0.27 0.02 0.13 0.31 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.51 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.2 0.0 0.0 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.74 0.0 0.02 0.21 0.34 0.0 0.09 0.26 0.01 0.76 0.27 18.18 2.19 0.4 1.95 2.41 0.82 1.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 5.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 2.59 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.14 0.47 0.38 0.0 0.1 0.21 0.38 0.0 7.81 0.43 0.69 0.28 0.32 0.68 1.38
0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.11 0.0 0.08 0.0 0.18 3.51 0.04 0.12 0.29 0.08 0.85 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.39 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.38 0.03 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 5.19 26.42 1.7 1.95 8.2 4.61 8.43 2.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.18 0.11 0.21 0.59 0.04 2.64 0.21 0.42 0.54 0.21 0.61 0.15
2.79 2.0 1.98 4.41 3.41 3.26 3.29 2.19 2.12 0.82 2.66 3.23 13.16 2.34 2.09 4.69 3.66 4.53 2.62
0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.29 0.15 0.0 0.0 0.22 0.0 5.46 0.3 0.15 0.08 0.03 0.76 0.47
0.17 0.0 0.1 0.05 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 4.04 0.06 0.0 0.12 0.0 0.09 0.0
0.22 0.26 0.45 0.0 0.4 0.06 0.13 0.1 0.37 0.95 0.0 0.16 5.07 0.03 0.08 0.31 0.3 0.69 2.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.13 0.37 0.11 1.38 0.16 0.61 0.13 0.96 0.07 0.73 0.17 7.7 1.04 0.57 0.55 0.83 1.67 3.26
0.07 0.13 0.37 0.11 1.38 0.16 0.61 0.13 0.96 0.07 0.73 0.17 7.7 1.04 0.57 0.55 0.83 1.67 3.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 3.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)