Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
- - - - - - - 3.0 1.37 2.5 -1.2 - - -0.53 - - 0.71 - -
- - - - - - - - - - - - - 2.88 - - - - 3.54
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.23 - - - - - -3.09 - -3.4 - - -
- - - - - - 2.32 3.63 - - - - - 0.69 - - - - -
- - - - - - - - - -0.29 2.19 1.54 -1.42 0.28 1.07 -0.05 1.65 -1.07 1.28
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - 3.11 - - 0.08 - 3.22 - - -
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - 0.92 - - - - - - 1.51 - -0.58 1.8 - 1.99 1.25 -0.53 1.62
- - - - - - - 3.63 - - - - - - - - 1.57 1.88 -
- - - - - - - 3.98 - - - - - 1.71 - - - - -
- 1.56 - 1.57 - - - 2.88 1.77 - -1.03 - - -0.45 - - -0.69 -1.15 -
- - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - 1.11 1.23
- - - - - - - - - - 1.76 - - -1.54 - 2.66 2.12 1.68 0.47
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 3.28 1.95 - 2.43
- - - - - - - 2.75 - - - - - - - 2.26 2.91 - -
- - - - - - - 4.15 - - - - 0.31 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - 2.93 - 3.51 - - -
- - - -18.94 - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
-7.92 -4.4 -8.73 -5.3 -7.56 -17.8 - -6.85 -6.42 -7.45 0.99 -8.01 -8.24 1.56 -6.26 2.81 2.79 - -21.29
- - - - - - - 3.51 - - 2.28 - 0.57 - - - 0.39 - -
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.49 - - - - - - - 2.95 - - -
- - - - - - - 4.03 - - - - - 1.43 - - - - -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - 3.82 - -0.38 - - - - - 0.83 - 1.23 -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- 0.41 -0.12 - - - - - 0.39 - 0.79 - - 1.14 0.19 2.13 1.13 1.67 -0.67
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - 3.46 - - - - - 3.0 - - - - -
- - - - 2.85 - - 3.27 - - - - - - - - -1.59 - 0.87
- - - - - - - 2.63 - - - - - - - 2.7 - - 2.66
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - 1.37 - - - 1.71 1.52 2.73 0.92 -1.19 0.42
- - - - - - - 3.65 - - - - - - - - 2.69 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - 2.03 - - - 1.66 -1.26 - - - - 3.44 - - -0.96
- - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - 4.01
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.35 - 3.8
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.35 - 3.8
- - - - - - - - - - - - - 3.32 - 3.17 - - -
- - - - - - - - - - 1.66 - 1.02 1.7 - 1.52 2.31 1.44 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - 4.04 - - - - - 1.35 - - - - -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - - - - -0.61 - -1.28 - 2.16 - - 1.3 0.6 -0.4 1.45 1.99 1.01
- - - - - - - - - - - - - 2.71 - 3.64 - - -
- - - - - - - 3.73 - - - - - - 2.51 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - 0.65 - 3.42 1.83 - 1.66
- - - - - - - - - - 2.95 - - - - 3.5 - - -
- - 0.21 0.52 - -1.31 - - - -0.64 0.45 -1.9 1.01 -0.74 0.43 0.65 -0.04 - 2.85
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - -1.98 -0.27 - - -0.08 1.36 -0.29 0.76 -0.47 0.56 1.16 1.24 1.38 1.32
- - - - - - - 3.3 - - 0.97 - - 0.95 - - - - 2.39
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.79 - 3.6 - - -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
0.15 - - - - 0.06 - - - - - 0.14 - -4.39 - 2.38 1.54 - 2.93
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - 3.08 - - -0.03 - - - - - 0.26 1.93 2.2
- - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - 2.14
- - - - - - - - - - 2.1 - - - - 2.39 2.14 - 2.34
-28.99 -1.09 1.55 -8.81 - -0.42 - -17.0 - - -0.06 -1.4 0.5 -0.64 0.5 1.1 1.25 1.15 1.72
-28.99 -1.09 1.55 -8.81 - -0.42 - -17.0 - - -0.06 -1.4 0.5 -0.64 0.5 1.1 1.25 1.15 1.72
- - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -0.21 -2.11 2.64 1.29 - -0.25 - 1.78 1.08 0.19 0.74
- - - - - - - - - - 2.5 - - 0.46 - - 2.79 2.34 -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - 2.74 - - - 3.62 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - 3.9 - - - - - - - 2.03
- - - - - - - 3.57 - - - - - - - 2.83 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 2.69 1.89 - 3.15
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - 2.79 - - - - - - - - - 3.59
- - - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - 3.89
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - 1.68 - - 1.3 - 3.14 - - - - - - - - -0.03 1.82 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - 3.64
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 2.3 - - 3.81
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - 3.66 - - - - - 2.67 - - - - -
- - - - - - -18.82 - - 2.41 - - - 1.77 - 3.1 - 0.75 -
- - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - 2.97 - - - - - 2.18 2.73 -
- - - 1.19 - - - - - - 3.65 - - - 0.86 - - - 1.26
- - - - - - - - 0.94 - 3.01 -1.93 - -2.0 -0.28 -0.31 -1.57 0.29 2.41
- - - - - - - - - - - - - - - 3.07 - - 3.41
- - - - - - - - - - 2.58 - 1.16 - - 3.28 0.09 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.