Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
1.0 0.88 0.09 0.03 0.05 0.92 0.02 0.01 0.05 0.06 0.39 0.01 0.0 0.27 0.38 0.13 0.21 0.33 0.47
0.88 1.0 0.36 0.27 0.44 0.55 0.49 0.35 0.29 0.06 0.14 0.11 0.4 0.11 0.17 0.16 0.13 0.15 0.06
1.0 0.67 0.63 0.77 0.56 0.67 0.49 0.28 0.43 0.13 0.3 0.15 0.24 0.24 0.21 0.34 0.38 0.16 0.36
0.9 1.0 0.35 0.4 0.43 0.53 0.12 0.28 0.11 0.05 0.23 0.05 0.54 0.16 0.23 0.31 0.26 0.21 0.15
1.0 0.92 0.66 0.68 0.61 0.85 0.49 0.54 0.63 0.63 0.52 0.57 0.8 0.53 0.61 0.74 0.68 0.6 0.44
0.85 1.0 0.51 0.5 0.67 0.73 0.45 0.3 0.63 0.26 0.37 0.44 0.81 0.4 0.47 0.7 0.71 0.5 0.38
0.94 1.0 0.49 0.46 0.41 0.99 0.11 0.16 0.17 0.11 0.01 0.36 0.01 0.04 0.04 0.03 0.05 0.02 0.02
0.75 1.0 0.32 0.31 0.6 0.54 0.0 0.03 0.01 0.0 0.04 0.0 0.19 0.03 0.05 0.16 0.04 0.13 0.07
0.84 0.87 0.41 0.64 0.72 1.0 0.36 0.23 0.29 0.05 0.38 0.68 0.8 0.35 0.4 0.67 0.53 0.43 0.33
1.0 0.73 0.3 0.52 0.5 0.73 0.41 0.3 0.3 0.07 0.25 0.0 0.15 0.26 0.25 0.38 0.37 0.19 0.39
1.0 0.79 0.66 0.56 0.77 0.85 0.7 0.46 0.68 0.31 0.3 0.49 0.48 0.32 0.35 0.47 0.37 0.33 0.23
0.79 0.95 0.59 0.59 0.57 0.82 0.62 0.22 0.82 0.27 0.37 0.18 1.0 0.45 0.37 0.45 0.46 0.39 0.43
0.96 0.89 0.44 0.72 0.69 1.0 0.44 0.26 0.44 0.15 0.36 0.74 0.67 0.39 0.36 0.71 0.62 0.55 0.39
0.87 0.97 0.31 0.77 0.78 1.0 0.11 0.08 0.17 0.2 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 0.04 0.14 0.01
0.89 0.96 0.41 0.54 0.56 0.77 0.69 0.35 0.7 0.06 0.4 1.0 0.56 0.53 0.56 0.58 0.62 0.46 0.46
0.7 1.0 0.24 0.36 0.47 0.51 0.39 0.05 0.71 0.08 0.14 0.01 0.42 0.22 0.16 0.13 0.17 0.11 0.07
0.91 0.87 0.33 0.31 0.42 1.0 0.22 0.27 0.27 0.56 0.3 0.35 0.55 0.25 0.3 0.57 0.44 0.35 0.22
0.9 1.0 0.41 0.45 0.43 0.54 0.33 0.4 0.65 0.21 0.25 0.27 0.51 0.21 0.21 0.41 0.46 0.23 0.31
0.74 1.0 0.55 0.55 0.57 0.71 0.38 0.3 0.48 0.29 0.4 0.63 0.7 0.38 0.44 0.43 0.42 0.41 0.36
0.89 1.0 0.6 0.62 0.74 0.87 0.69 0.27 0.57 0.09 0.34 0.57 0.65 0.3 0.37 0.36 0.28 0.48 0.33
0.57 1.0 0.4 0.4 0.51 0.84 0.48 0.24 0.49 0.09 0.4 0.01 0.72 0.4 0.38 0.57 0.41 0.34 0.22
1.0 0.92 0.49 0.36 0.46 0.61 0.23 0.16 0.25 0.07 0.45 0.36 0.4 0.26 0.4 0.44 0.46 0.4 0.25
0.83 1.0 0.63 0.75 0.62 0.95 0.37 0.24 0.43 0.18 0.43 0.82 0.36 0.47 0.54 0.47 0.44 0.52 0.43
0.86 0.87 0.4 0.49 0.62 1.0 0.15 0.1 0.15 0.05 0.31 0.25 0.62 0.2 0.22 0.2 0.15 0.19 0.17
1.0 0.91 0.24 0.27 0.41 0.75 0.2 0.27 0.24 0.3 0.29 0.48 0.71 0.32 0.41 0.5 0.44 0.44 0.28
0.77 0.88 0.3 0.53 0.64 1.0 0.16 0.06 0.03 0.21 0.47 0.13 0.02 0.33 0.35 0.27 0.25 0.32 0.65
0.93 1.0 0.34 0.33 0.53 0.63 0.25 0.12 0.37 0.13 0.19 0.4 0.39 0.24 0.29 0.42 0.38 0.49 0.2
0.9 1.0 0.7 0.73 0.72 0.89 0.6 0.39 0.65 0.29 0.56 0.81 0.65 0.59 0.66 0.66 0.58 0.66 0.52
0.82 1.0 0.4 0.42 0.61 0.74 0.37 0.28 0.56 0.22 0.31 0.65 0.54 0.27 0.31 0.66 0.52 0.46 0.24
1.0 0.84 0.64 0.27 0.37 0.92 0.21 0.35 0.15 0.11 0.53 0.51 0.37 0.41 0.45 0.47 0.44 0.46 0.51
0.97 1.0 0.71 0.85 0.67 0.81 0.49 0.28 0.66 0.26 0.44 0.1 0.59 0.47 0.49 0.5 0.68 0.39 0.41
0.96 1.0 0.16 0.4 0.31 0.45 0.0 0.04 0.03 0.02 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0
1.0 0.77 0.64 0.57 0.67 0.76 0.5 0.4 0.44 0.19 0.31 0.21 0.19 0.27 0.3 0.27 0.33 0.17 0.36
1.0 0.95 0.85 1.0 0.8 0.9 0.37 0.25 0.42 0.33 0.5 0.61 0.63 0.43 0.39 0.38 0.48 0.23 0.34
0.79 1.0 0.35 0.63 0.82 0.9 0.92 0.18 0.45 0.04 0.49 0.18 0.95 0.39 0.54 0.42 0.39 0.43 0.29
1.0 0.64 0.09 0.13 0.17 0.56 0.15 0.05 0.08 0.02 0.17 0.12 0.38 0.21 0.19 0.38 0.47 0.33 0.11
0.87 1.0 0.38 0.55 0.4 0.65 0.13 0.03 0.09 0.07 0.04 0.3 0.19 0.06 0.15 0.15 0.11 0.11 0.05
0.91 1.0 0.31 0.21 0.45 0.83 0.15 0.12 0.42 0.06 0.04 0.0 0.03 0.02 0.08 0.02 0.03 0.43 0.07
0.77 0.67 0.67 0.58 0.58 1.0 0.43 0.32 0.37 0.15 0.47 0.56 0.54 0.47 0.5 0.71 0.78 0.58 0.59
1.0 0.9 0.43 0.58 0.81 0.74 0.68 0.12 0.44 0.07 0.21 0.22 0.66 0.24 0.43 0.23 0.22 0.27 0.13
1.0 0.89 0.54 0.66 0.84 0.49 0.46 0.19 0.71 0.15 0.16 0.19 0.4 0.1 0.07 0.4 0.4 0.07 0.09
1.0 0.97 0.46 0.64 0.61 0.75 0.11 0.14 0.21 0.03 0.01 0.45 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.87 1.0 0.5 0.74 0.65 0.94 0.37 0.09 0.42 0.08 0.43 0.9 0.74 0.46 0.44 0.57 0.48 0.5 0.44
1.0 0.98 0.27 0.35 0.31 0.62 0.12 0.15 0.29 0.08 0.15 0.37 0.5 0.11 0.18 0.18 0.23 0.11 0.08
0.85 1.0 0.51 0.76 0.8 0.69 0.59 0.23 0.71 0.07 0.46 0.37 0.97 0.4 0.47 0.56 0.45 0.53 0.43
1.0 0.9 0.43 0.68 0.73 0.68 0.74 0.15 0.73 0.04 0.29 0.01 0.78 0.3 0.4 0.32 0.23 0.36 0.28
0.69 0.78 0.5 0.57 0.69 0.65 0.8 0.13 0.37 0.05 0.31 0.13 1.0 0.22 0.39 0.18 0.24 0.22 0.28
0.72 1.0 0.35 0.38 0.52 0.7 0.16 0.37 0.26 0.22 0.14 0.19 0.51 0.22 0.15 0.18 0.21 0.33 0.2
0.73 1.0 0.31 0.38 0.41 0.87 0.12 0.18 0.13 0.08 0.21 0.49 0.31 0.17 0.26 0.37 0.3 0.29 0.13
0.71 0.7 0.61 0.67 1.0 0.68 0.68 0.19 0.42 0.08 0.34 0.1 0.68 0.31 0.46 0.34 0.31 0.4 0.4
0.93 0.81 0.49 0.41 0.42 1.0 0.27 0.18 0.27 0.06 0.32 0.51 0.42 0.38 0.36 0.42 0.42 0.42 0.26
1.0 0.91 0.57 0.67 0.51 0.76 0.36 0.22 0.25 0.1 0.26 0.2 0.23 0.33 0.26 0.3 0.33 0.25 0.36
0.88 1.0 0.19 0.34 0.57 0.65 0.11 0.18 0.19 0.09 0.13 0.37 0.22 0.11 0.26 0.25 0.21 0.22 0.07
0.76 1.0 0.56 0.74 0.82 0.84 0.56 0.37 0.57 0.1 0.55 0.71 0.67 0.46 0.5 0.68 0.57 0.56 0.6
1.0 0.91 0.45 0.54 0.59 0.94 0.5 0.37 0.42 0.05 0.41 0.87 0.56 0.49 0.58 0.65 0.56 0.6 0.54
0.73 0.84 0.48 0.57 0.43 1.0 0.26 0.16 0.25 0.14 0.42 0.49 0.68 0.42 0.48 0.66 0.62 0.52 0.4
1.0 0.9 0.58 0.54 0.53 0.97 0.35 0.4 0.36 0.16 0.48 0.48 0.83 0.5 0.54 0.45 0.55 0.51 0.61
0.93 1.0 0.2 0.27 0.35 0.36 0.06 0.04 0.03 0.0 0.17 0.11 0.19 0.13 0.23 0.14 0.38 0.2 0.18
0.75 1.0 0.3 0.58 0.42 0.61 0.38 0.17 0.85 0.0 0.14 0.02 0.28 0.12 0.16 0.18 0.09 0.15 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)