1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.68 0.0 0.61 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 0.0 0.2 0.32 0.0 0.34 0.11 0.2 0.13 0.34 0.28
0.0 1.12 2.27 0.26 0.0 0.23 0.0 0.49 0.91 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.17 0.59 0.58 0.22 0.03 0.32 0.13 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.33 0.17 0.0 0.2 0.29 0.15
0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.54 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
1.4 1.51 1.97 0.04 0.13 0.49 0.08 0.0 0.26 0.0 0.46 0.48 1.05 0.23 0.34 0.08 0.6 0.15 0.23
1.76 0.0 4.92 1.21 3.38 1.77 0.81 0.99 1.92 3.64 1.44 0.0 0.9 1.92 0.69 2.55 2.17 7.09 3.84
0.18 1.68 3.12 1.17 0.28 0.0 1.79 0.5 2.25 1.92 0.16 0.0 0.11 0.05 0.2 0.18 0.0 0.09 0.0
7.79 0.0 15.33 0.69 0.0 2.63 0.0 1.9 7.35 20.82 3.31 3.77 1.51 8.69 8.66 2.36 4.95 14.8 2.35
0.0 0.07 0.7 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.0
4.21 2.63 15.92 15.63 7.7 3.34 2.62 0.4 0.12 0.04 1.89 0.14 1.15 0.8 1.04 0.11 0.19 1.95 3.61
27.98 32.82 58.54 5.83 25.85 7.93 1.29 1.15 1.83 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
26.52 28.96 60.84 36.52 29.6 26.11 0.0 1.19 0.5 0.71 11.72 0.16 1.22 5.08 10.25 21.24 6.32 16.79 0.0
26.52 28.96 60.84 36.52 29.6 26.11 0.0 1.19 0.5 0.71 11.72 0.16 1.22 5.08 10.25 21.24 6.32 16.79 0.0
0.66 2.01 1.94 1.4 0.57 0.0 2.38 0.31 1.65 0.7 0.33 0.0 0.91 0.23 0.3 0.08 0.03 0.19 0.1
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.08 0.03 0.06 0.01
0.0 0.03 0.43 0.0 0.22 0.2 0.07 0.03 0.18 0.12 0.04 0.0 0.06 0.09 0.04 0.07 0.11 0.24 0.06
0.02 0.24 16.34 2.23 1.36 7.73 0.04 0.05 0.02 0.04 1.32 0.08 0.02 0.07 0.06 0.02 0.01 0.13 6.39
0.37 1.05 3.41 0.0 0.89 2.23 0.11 0.1 0.04 0.0 0.16 0.01 0.0 0.51 0.84 0.66 0.85 0.14 0.65
6.38 2.86 7.33 2.37 1.83 1.93 0.17 0.05 0.59 0.0 0.98 0.4 2.0 0.5 0.07 0.14 0.36 1.3 2.61
0.34 0.09 1.03 0.61 0.04 0.0 0.0 0.36 0.22 0.11 0.09 0.11 0.0 0.04 0.02 0.04 0.12 0.03 0.04
0.0 0.0 0.53 0.59 0.09 0.04 0.06 0.11 0.13 0.0 0.15 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.08 0.11
8.09 5.81 9.62 4.87 4.68 5.31 5.55 2.74 6.49 1.46 4.18 0.89 5.37 3.75 4.51 3.69 5.29 5.11 2.67
0.35 0.69 0.73 1.3 0.22 1.22 0.37 0.12 0.0 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.13
0.0 0.19 0.27 0.06 0.17 0.0 0.0 0.1 0.27 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.18 0.0
1.18 2.94 5.86 3.49 5.0 11.17 1.92 2.77 0.44 1.33 1.02 2.61 0.63 1.71 1.96 1.08 1.99 2.46 0.86
0.0 0.0 4.11 0.98 0.34 0.29 0.0 0.0 2.09 0.68 0.52 0.0 0.0 0.16 1.58 0.0 0.5 0.55 0.38
175.1 58.11 568.43 395.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.06 0.15 0.23 0.15 0.0 0.47 0.12 0.23 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.03 0.03 0.0 0.1
0.06 0.15 0.23 0.15 0.0 0.47 0.12 0.23 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.03 0.03 0.0 0.1
0.06 0.15 0.23 0.15 0.0 0.47 0.12 0.23 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.04 0.03 0.03 0.0 0.1
71.15 91.93 57.09 108.49 63.17 114.56 5.18 6.3 0.74 4.94 15.51 10.83 51.53 13.26 12.25 22.55 17.67 13.92 23.37
0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.2 0.23 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04
13.81 20.26 53.37 34.93 21.58 5.63 24.41 11.77 7.99 13.03 12.84 4.39 6.95 5.29 8.11 11.6 6.93 10.51 7.2
9.65 7.54 13.43 1.9 8.39 5.4 2.08 0.0 17.81 6.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.05 8.18 3.61 0.9 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.44 0.0 0.14 0.13 0.5 0.36
0.47 0.66 1.51 2.37 0.86 1.35 0.77 0.1 0.43 0.69 0.16 0.0 0.1 0.14 0.11 0.1 0.13 0.19 0.12
0.0 0.0 0.27 0.2 0.12 0.09 0.0 0.2 0.08 0.13 0.0 0.04 0.0 0.15 0.02 0.05 0.13 0.06 0.0
15.4 5.87 17.43 9.7 8.06 12.06 8.96 3.79 0.71 0.9 5.17 5.68 0.73 6.65 1.56 9.67 5.42 6.38 6.73
11.51 6.02 19.69 12.5 8.07 12.58 6.44 2.43 1.24 0.56 4.88 2.38 2.62 4.93 1.33 8.1 4.19 7.51 3.67
0.0 0.98 7.49 1.35 2.58 5.52 0.0 1.62 0.0 0.65 0.06 0.92 0.0 0.87 0.6 0.3 0.45 0.94 0.45
0.0 0.0 3.31 6.52 2.73 7.25 0.46 0.79 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 2.32 0.25 0.22 0.38 0.23
0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.03 0.0 0.09
0.23 0.0 4.88 0.57 0.0 2.29 0.65 0.58 1.94 2.35 0.39 0.16 0.57 1.51 2.23 1.45 1.62 3.2 1.07
20.33 24.94 25.38 23.25 18.56 18.78 19.57 10.88 19.16 5.26 17.68 4.34 23.38 18.12 21.24 21.83 20.14 16.48 15.01
0.0 0.0 0.11 0.0 0.19 0.0 0.13 0.36 0.25 0.61 0.03 0.1 0.0 0.07 0.25 0.24 0.24 0.52 0.14
41.37 45.82 115.61 79.13 55.14 39.45 36.23 9.41 34.47 22.27 35.17 0.93 37.4 26.14 25.66 13.99 14.76 37.09 39.28
0.07 0.0 0.03 0.0 0.24 0.0 0.08 0.0 0.09 0.34 0.14 0.05 0.03 0.11 0.1 0.13 0.07 0.23 0.09
0.06 0.23 0.31 0.1 0.12 0.31 0.08 0.31 0.1 0.63 0.09 0.0 0.0 0.12 0.21 0.11 0.08 0.16 0.03
0.0 1.98 1.36 1.31 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.77 1.08 0.3 0.55 0.9 0.0
0.0 3.67 0.0 3.92 0.47 3.17 1.8 1.01 0.0 0.8 0.2 0.0 0.0 0.48 0.43 0.31 0.53 0.54 0.0
0.0 0.0 0.51 0.5 0.11 0.32 0.09 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.12 0.0 0.1 0.05
1.48 3.42 14.63 4.07 1.33 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.48 3.42 14.63 4.07 1.33 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.91 1.2 2.91 0.0 0.61 1.63 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.2 0.0 0.49
47.33 43.59 69.86 51.03 44.86 46.42 35.02 22.85 14.18 16.26 24.04 7.27 47.55 19.1 19.76 21.3 22.62 19.71 28.52
0.0 0.0 0.52 0.0 0.16 0.0 0.18 0.14 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.59 0.21 4.02 0.61 1.35 0.0 0.24 0.0 0.29 3.05 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.29
0.89 1.07 0.58 1.31 0.0 0.14 0.21 0.0 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.02
79.0 56.28 155.95 89.06 60.64 28.81 10.56 1.17 9.56 0.52 5.15 0.7 50.5 4.14 1.08 1.35 2.13 17.24 10.9
0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03
12.11 61.45 124.84 8.9 2.35 8.49 0.0 0.4 2.41 0.0 0.42 1.88 0.04 1.33 5.07 9.46 3.85 14.7 1.25
0.0 0.0 0.57 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.27 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.02
0.0 18.12 22.97 23.1 6.02 14.71 5.68 2.22 5.09 2.45 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.57 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 10.81 0.0 3.79 0.53 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 4.08 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.4 0.19 0.0 0.59 0.39 0.42 0.19 0.55 0.0 0.0
0.0 0.0 0.85 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.76 2.42 0.86 1.17 1.44 0.06 0.15 0.0 0.71 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.03 0.04 0.0
0.0 0.19 0.73 0.05 0.0 0.1 0.08 0.02 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.26 0.5 0.26 0.0 0.13 0.03 0.0 0.09 0.1 0.05 0.03
0.0 0.0 0.41 0.36 0.08 0.12 0.0 0.12 0.0 0.02 0.03 0.08 0.0 0.0 0.06 0.04 0.17 0.09 0.23
2.12 0.0 3.38 0.0 0.0 0.0 0.0 3.09 3.28 6.52 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.39 0.0 0.38 0.0
0.98 2.5 5.09 1.43 0.42 0.3 0.52 1.68 0.74 4.65 0.94 0.11 0.12 0.82 1.26 1.46 1.8 1.55 1.46
0.0 0.56 0.81 1.29 0.65 0.51 0.0 0.06 0.26 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
44.89 84.89 224.03 121.21 56.5 65.04 50.05 56.47 29.23 8.98 69.49 10.59 14.92 48.91 71.42 64.77 52.1 62.77 62.7
44.89 84.89 224.03 121.21 56.5 65.04 50.05 56.47 29.23 8.98 69.49 10.59 14.92 48.91 71.42 64.77 52.1 62.77 62.7
180.57 249.72 657.48 184.77 248.54 199.5 71.17 184.16 104.5 75.12 253.85 106.09 27.84 118.28 97.08 211.26 229.32 167.91 267.43
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
21.0 93.28 659.21 480.79 76.57 30.53 0.0 0.0 0.0 0.0 50.71 0.0 15.86 8.37 17.56 22.98 8.99 34.57 222.72
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.35 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.0
0.0 0.0 0.33 0.17 0.0 0.05 0.0 0.19 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.05 0.07 0.2 0.08
0.03 0.17 0.06 0.11 0.07 0.03 0.05 0.01 0.01 0.04 0.01 0.04 0.0 0.13 0.14 0.0 0.07 0.07 0.0
0.59 0.88 0.16 1.11 0.23 0.36 0.07 0.0 0.07 0.2 0.03 0.0 0.0 0.29 0.11 0.08 0.0 0.34 0.07
0.57 0.0 2.08 2.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.08 0.09 0.18 0.04 0.22 0.4 0.0 0.57

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)