Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
1.0 0.36 0.0 0.55 0.36 0.73 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.19 0.29 0.62 0.35 1.0 0.45 0.88 0.41 0.61 0.41 0.06 0.46 0.08 0.12 0.28 0.16 0.14 0.17 0.08
0.15 0.14 0.56 0.05 0.59 0.6 0.24 1.0 0.08 0.41 0.0 0.0 0.03 0.12 0.17 0.14 0.09 0.21 0.08
0.24 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.0 0.0 0.63 0.0 0.53 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.45 0.57 0.9 0.85 1.0 0.2 0.88 0.22 0.39 0.0 0.15 0.0 0.02 0.13 0.08 0.16 0.04 0.04
0.9 0.48 0.13 0.16 0.22 1.0 0.16 0.11 0.1 0.0 0.2 0.41 0.12 0.22 0.29 0.15 0.09 0.43 0.69
0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.42 0.0 0.0 0.43 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.08 0.21 0.17 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.11 0.0 0.2 0.0
0.63 0.0 0.0 0.31 0.64 1.0 0.0 0.2 0.08 0.22 0.08 0.0 0.21 0.12 0.47 0.08 0.15 0.1 0.62
0.0 0.0 0.11 1.0 0.99 0.24 0.0 0.04 0.05 0.05 0.01 0.0 0.05 0.03 0.12 0.12 0.2 0.02 0.0
0.08 0.04 0.02 0.0 1.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.86 0.98 0.82 0.7 0.38 0.19 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.2 0.21 0.05 0.15 0.48 0.0
0.0 0.0 0.16 0.45 1.0 0.07 0.11 0.31 0.0 0.36 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.37 0.25 1.0 0.0 0.11 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.23 0.0
0.57 1.0 0.07 0.32 0.65 0.76 0.04 0.14 0.09 0.78 0.0 0.08 0.0 0.09 0.29 0.06 0.06 0.09 0.05
0.23 0.0 0.01 0.69 1.0 0.22 0.17 0.04 0.06 0.18 0.01 0.39 0.46 0.05 0.05 0.01 0.05 0.0 0.01
0.27 0.27 0.14 0.31 1.0 0.09 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.01 0.04 0.08 0.03 0.0
0.28 0.04 0.34 0.34 1.0 0.67 0.0 0.08 0.11 0.06 0.33 0.0 0.37 0.36 0.39 0.7 0.52 0.35 0.2
0.51 0.1 0.0 0.08 0.48 1.0 0.08 0.0 0.19 0.03 0.09 0.01 0.02 0.24 0.24 0.05 0.14 0.13 0.32
0.12 0.22 0.29 0.55 1.0 0.95 0.28 0.39 0.14 0.34 0.08 0.0 0.02 0.07 0.08 0.16 0.1 0.06 0.04
0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.16 0.0 0.0 0.46 0.0
0.0 0.0 0.05 0.77 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.3 0.0 0.31 0.67 1.0 0.13 0.59 0.5 0.22 0.05 0.04 0.0 0.07 0.11 0.16 0.08 0.0 0.07 0.07
0.0 0.18 0.0 0.08 0.78 1.0 0.12 0.05 0.34 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.08 0.04 0.13 0.31
0.29 0.88 0.42 0.41 1.0 0.91 0.08 0.32 0.06 0.58 0.13 0.1 0.11 0.25 0.14 0.4 0.21 0.3 0.18
0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.23 0.27 0.86 1.0 0.08 0.0 0.03 0.03 0.19 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.02 0.35 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.83 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.06 0.0 0.0 0.05 0.44 0.57 0.64 0.15 0.0
0.18 0.37 0.16 1.0 0.48 0.19 0.36 0.32 0.24 0.53 0.1 0.22 0.14 0.16 0.33 0.13 0.1 0.17 0.05
0.26 0.32 0.18 0.27 1.0 0.64 0.1 0.0 0.3 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.09 0.05 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.68 1.0 0.36 0.18 0.0 0.0 0.31 0.21 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0
0.63 0.0 0.4 0.0 0.43 0.07 0.09 0.61 0.25 0.11 0.07 0.46 0.0 0.05 0.11 1.0 0.32 0.0 0.16
0.25 0.6 0.55 0.79 1.0 0.54 0.42 0.62 0.09 0.42 0.21 0.0 0.16 0.22 0.27 0.58 0.22 0.43 0.28
0.51 0.33 0.37 0.71 1.0 0.67 0.45 0.86 0.63 0.08 0.31 0.01 0.11 0.54 0.55 0.29 0.35 0.37 0.18
0.09 0.48 0.25 0.35 1.0 0.48 0.47 0.46 0.23 0.06 0.04 0.14 0.09 0.11 0.01 0.15 0.18 0.29 0.21
0.59 0.76 0.17 0.67 0.22 1.0 0.38 0.15 0.25 0.03 0.06 0.0 0.1 0.17 0.85 0.01 0.0 0.63 0.65
0.68 0.46 0.0 0.26 1.0 0.0 0.16 0.0 0.17 0.07 0.24 0.15 0.0 0.04 0.23 0.0 0.07 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.05 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0
0.23 0.54 1.0 0.92 0.87 0.89 0.49 0.41 0.29 0.83 0.04 0.0 0.08 0.04 0.02 0.07 0.01 0.22 0.07
0.16 0.23 0.01 0.02 1.0 0.81 0.09 0.12 0.2 0.04 0.05 0.01 0.14 0.04 0.04 0.08 0.08 0.08 0.1
0.0 0.41 0.27 0.55 1.0 0.38 0.35 0.19 0.71 0.61 0.34 0.11 0.04 0.21 0.14 0.91 0.43 0.2 0.06
0.76 0.79 0.99 0.49 0.98 0.92 0.58 1.0 0.39 0.42 0.33 0.0 0.32 0.37 0.59 0.41 0.31 0.45 0.41
0.0 0.32 0.21 0.0 0.0 0.29 0.0 1.0 0.0 0.08 0.02 0.3 0.18 0.18 0.02 0.25 0.25 0.12 0.09
0.0 1.0 0.09 0.16 0.5 0.3 0.03 0.2 0.22 0.21 0.01 0.38 0.05 0.12 0.04 0.04 0.04 0.08 0.01
1.0 0.08 0.03 0.61 0.82 0.68 0.27 0.31 0.04 0.14 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.18 0.12 1.0 0.54 0.97 0.09 0.41 0.01 0.14 0.0 0.18 0.0 0.01 0.29 0.2 0.14 0.12 0.92 0.22
0.5 0.59 0.51 0.5 0.53 0.67 0.16 0.16 0.12 0.14 0.29 1.0 0.16 0.18 0.24 0.48 0.31 0.25 0.08
0.0 0.0 0.0 0.81 1.0 0.42 0.0 0.0 0.3 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 0.65 0.41 1.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.36 0.08 0.24 0.17 0.12 0.33 0.0 0.0 0.98 0.0
0.44 1.0 0.0 0.15 0.46 0.14 0.0 0.0 0.12 0.27 0.0 0.0 0.03 0.06 0.3 0.27 0.08 0.11 0.0
0.0 0.11 0.0 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.14 0.04 0.0 0.03 0.08
0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 0.38 0.0 0.31 0.0 0.58 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.05 0.17 0.23 0.0
0.45 0.07 0.07 0.39 0.72 0.35 1.0 0.46 0.31 0.12 0.22 0.05 0.02 0.34 0.58 0.07 0.09 0.31 0.19
0.29 0.21 0.0 0.14 0.42 1.0 0.25 0.1 0.18 0.14 0.05 0.0 0.0 0.1 0.17 0.28 0.05 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.29 0.63 0.45 0.57 0.1 0.0 0.05 0.28 0.0 0.14 0.0 0.14 0.0
0.11 0.62 0.13 0.58 1.0 1.0 0.0 0.43 0.04 0.19 0.0 0.27 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.23 0.0
0.55 0.38 0.75 0.14 0.93 1.0 0.97 0.86 0.56 0.79 0.07 0.08 0.0 0.06 0.34 0.09 0.0 0.45 0.0
0.58 0.83 0.0 0.24 1.0 0.26 0.17 0.34 0.27 0.51 0.05 0.68 0.0 0.08 0.16 0.16 0.0 0.01 0.0
0.09 0.19 0.21 0.11 1.0 0.22 0.32 0.2 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.09 0.37 0.3 0.54 1.0 0.28 0.24 0.25 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.12 0.16 0.14 0.3 0.07 0.02
1.0 0.7 0.66 0.43 0.9 0.25 0.27 0.0 0.1 0.0 0.02 0.81 0.01 0.07 0.04 0.06 0.02 0.13 0.34
0.12 0.2 0.21 0.79 1.0 0.58 0.03 0.4 0.04 0.3 0.03 0.24 0.3 0.18 0.17 0.38 0.48 0.08 0.04
0.0 1.0 0.41 0.0 0.08 0.36 0.0 0.8 0.0 0.48 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0
0.2 0.42 0.0 0.68 1.0 0.55 0.34 0.35 0.15 0.1 0.0 0.48 0.14 0.0 0.17 0.0 0.02 0.36 0.0
0.55 0.56 1.0 0.0 0.47 0.54 0.0 0.22 0.48 0.06 0.13 0.56 0.67 0.09 0.15 0.1 0.28 0.0 0.16
0.05 1.0 0.16 0.32 0.62 0.07 0.2 0.47 0.11 0.4 0.1 0.0 0.0 0.13 0.23 0.12 0.17 0.17 0.22
0.0 0.2 0.41 0.43 1.0 0.0 0.01 0.07 0.08 0.17 0.21 0.32 0.0 0.1 0.03 0.04 0.12 0.08 0.29
0.7 0.55 0.0 0.24 0.9 1.0 0.1 0.1 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.26 0.87 0.17 0.11 0.22 0.0 1.0 0.0 0.56 0.19 0.0 0.13 0.08 0.0 0.05 0.62
0.34 0.52 1.0 0.4 0.87 0.58 0.28 0.82 0.62 0.48 0.28 0.28 0.08 0.53 0.5 0.79 0.56 0.65 0.26
0.0 0.19 0.0 0.12 1.0 0.33 0.0 0.0 0.3 0.34 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.05 0.17 0.06
0.38 0.96 0.24 1.0 0.86 0.5 0.0 0.06 0.39 0.38 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06
0.02 0.3 0.23 0.24 1.0 0.21 0.18 0.02 0.06 0.03 0.01 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.22 1.0 0.11 0.06 0.48 0.07 0.15 0.25 0.27 0.51 0.06 0.23 0.0 0.13 0.22 0.3 0.17 0.1 0.19
0.0 0.0 0.36 1.0 0.79 0.0 0.53 0.33 0.0 0.26 0.0 0.11 0.0 0.15 0.18 0.33 0.05 0.04 0.11
1.0 0.54 0.25 0.36 0.59 0.44 0.13 0.11 0.26 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.26 0.06 0.13 1.0 0.98 0.04 0.09 0.04 0.07 0.02 0.11 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.22 0.0
0.26 0.93 0.88 0.79 0.68 1.0 0.32 0.44 0.14 0.48 0.08 0.0 0.08 0.16 0.12 0.19 0.2 0.43 0.04
0.56 0.22 0.13 0.2 0.36 1.0 0.29 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.23 0.18 0.66 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0
0.0 0.35 0.06 0.47 0.43 1.0 0.08 0.04 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01
0.33 0.19 0.22 0.29 1.0 0.23 0.71 0.07 0.56 0.1 0.2 0.03 0.13 0.12 0.04 0.11 0.17 0.19 0.1
0.0 0.0 0.0 0.77 1.0 0.0 0.18 0.15 0.0 0.19 0.03 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0
1.0 0.28 0.53 0.7 0.55 0.97 0.22 0.29 0.1 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.14 0.02
0.28 0.26 0.78 0.37 1.0 0.41 0.42 0.17 0.08 0.03 0.13 0.15 0.32 0.42 0.29 0.42 0.23 0.62 0.14
0.3 0.32 0.34 0.52 1.0 0.2 0.05 0.0 0.05 0.09 0.2 0.0 0.02 0.31 0.19 0.03 0.16 0.51 0.16
0.0 0.0 0.0 0.08 0.31 1.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.04 0.0 0.0 0.01 0.38 0.0 0.11 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 1.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.23 0.65
0.0 0.0 1.0 0.34 0.55 0.67 0.1 0.2 0.35 0.0 0.16 0.83 0.0 0.48 0.05 0.31 0.32 0.48 0.05
0.73 1.0 0.0 0.05 0.35 0.0 0.07 0.31 0.31 0.5 0.02 0.18 0.03 0.68 0.1 0.42 0.3 0.16 0.19
0.08 0.45 0.23 0.34 1.0 0.32 0.0 0.0 0.49 0.1 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.08 0.05 0.0
1.0 0.46 0.18 0.33 0.57 0.35 0.05 0.07 0.39 0.0 0.06 0.87 0.1 0.04 0.04 0.22 0.08 0.22 0.54
0.0 0.46 0.39 0.1 1.0 0.13 0.0 0.09 0.0 0.16 0.0 0.0 0.06 0.01 0.04 0.09 0.01 0.08 0.02
0.05 0.33 1.0 0.95 0.81 0.98 0.26 0.25 0.45 0.84 0.23 0.0 0.19 0.09 0.06 0.53 0.2 0.05 0.03
0.18 1.0 0.58 0.0 0.8 0.11 0.13 0.69 0.11 0.54 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.12 0.29 0.0 0.42 0.06 1.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.16 0.13 0.15 0.2 0.21 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.34 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.64 0.09 0.65 0.08 0.66 0.14
0.7 0.41 0.36 0.41 1.0 0.82 0.23 0.07 0.11 0.18 0.24 0.0 0.15 0.24 0.31 0.08 0.09 0.51 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)