Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Diurnal Dark 2h	Diurnal Dark 6h	Diurnal Light 2h	Diurnal Light 6h	Diurnal Light 10h	Diurnal Light 14h	20°C Liquid	4°C Liquid	20°C Desiccation	4°C Desiccation	20°C plate	CadmiumCl 250 µM, 24h	Dark, 24h	HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)	Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h	Mannitol 300 mM,24h	NaCl 150 mM, 24h	UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)	pH = 9, 24h
Zci_00010.1	0.69	0.55	0.95	0.65	0.54	0.74	0.56	0.42	0.47	0.25	0.63	0.33	0.82	0.68	1.0	0.77	0.79	0.71	0.56
Zci_00110.1	0.6	0.63	0.4	0.5	0.86	0.58	0.7	0.17	0.51	0.05	0.53	0.37	1.0	0.48	0.5	0.64	0.55	0.69	0.39
Zci_00205.1	1.0	0.84	0.41	0.7	0.17	0.81	0.06	0.02	0.03	0.0	0.22	0.83	0.94	0.47	0.49	0.28	0.39	0.35	0.45
Zci_00251.1	0.74	0.73	0.52	0.7	0.88	0.68	0.95	0.27	0.47	0.08	0.49	0.77	1.0	0.44	0.66	0.54	0.47	0.64	0.33
Zci_00273.1	0.79	1.0	0.39	0.7	0.72	0.96	0.39	0.44	0.41	0.06	0.43	0.66	0.93	0.41	0.54	0.51	0.6	0.49	0.66
Zci_00932.1	0.48	0.74	0.78	0.74	0.6	0.69	0.54	0.47	0.59	0.3	0.79	0.39	0.5	0.78	1.0	0.59	0.59	0.72	0.97
Zci_00961.1	0.0	0.0	0.0	0.17	0.04	0.49	0.27	0.07	0.0	0.18	0.05	0.0	1.0	0.08	0.16	0.07	0.11	0.09	0.02
Zci_01671.1	0.68	1.0	0.44	0.31	0.21	0.77	0.33	0.43	0.32	0.38	0.31	0.08	0.91	0.33	0.36	0.31	0.31	0.44	0.27
Zci_01789.1	0.77	0.53	0.43	0.49	0.54	0.73	0.07	0.03	0.21	0.15	0.09	0.02	1.0	0.12	0.13	0.12	0.14	0.13	0.15
Zci_01873.1	0.87	0.77	0.58	0.63	0.77	0.79	0.76	0.35	0.44	0.05	0.54	0.72	1.0	0.55	0.69	0.62	0.5	0.71	0.54
Zci_01965.2	0.67	0.5	0.47	0.58	0.5	0.65	0.36	0.45	0.31	0.15	0.66	0.46	0.51	0.67	0.41	0.83	1.0	0.63	0.79
Zci_01973.1	0.73	0.83	0.51	0.58	0.54	0.78	0.79	0.63	0.88	0.2	0.81	0.96	0.88	0.96	0.58	0.96	0.88	0.73	1.0
Zci_02086.1	0.59	0.57	0.44	0.34	0.46	0.46	0.27	0.12	0.23	0.17	0.4	0.33	1.0	0.34	0.26	0.59	0.44	0.51	0.19
Zci_02287.1	0.8	0.61	0.18	0.04	0.49	0.94	0.19	0.21	0.2	0.0	0.04	0.04	1.0	0.02	0.01	0.07	0.04	0.04	0.03
Zci_03154.1	0.54	0.47	0.34	0.48	0.25	0.78	0.16	0.07	0.08	0.12	0.3	0.06	1.0	0.26	0.11	0.3	0.34	0.2	0.14
Zci_03297.3	1.0	0.35	0.31	0.31	0.65	0.37	0.0	0.19	0.27	0.48	0.1	0.46	0.99	0.0	0.09	0.12	0.0	0.18	0.16
Zci_03492.1	0.73	0.71	0.66	0.7	0.67	0.73	0.61	0.72	0.61	0.49	0.85	0.37	0.83	0.82	1.0	0.79	0.89	0.75	0.69
Zci_04199.1	0.62	0.68	0.49	0.47	0.51	0.64	0.38	0.4	0.45	0.3	0.52	0.56	1.0	0.43	0.49	0.58	0.52	0.55	0.31
Zci_04548.1	0.66	0.79	0.58	0.62	0.64	0.53	0.61	0.24	0.7	0.12	0.59	0.66	1.0	0.62	0.78	0.6	0.56	0.55	0.51
Zci_04750.1	0.55	0.65	0.73	0.6	0.46	0.76	0.4	0.36	0.28	0.19	0.76	0.28	0.74	0.7	1.0	0.58	0.7	0.7	0.65
Zci_04757.1	0.76	0.82	0.61	0.66	0.72	0.87	0.68	0.7	0.79	0.22	0.63	0.78	1.0	0.69	0.87	0.92	0.89	0.96	0.57
Zci_04791.1	0.89	0.9	0.74	0.71	0.65	0.82	0.73	1.0	0.68	0.52	0.54	0.95	0.83	0.49	0.7	0.78	0.69	0.68	0.39
Zci_04945.2	0.58	0.54	0.05	0.44	0.59	0.95	0.08	0.24	0.11	0.01	0.0	0.08	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Zci_05084.1	0.8	0.88	0.81	0.77	0.79	0.69	0.88	0.61	0.66	0.25	0.94	0.68	0.94	0.93	1.0	0.84	0.76	0.84	0.98
Zci_05546.1	0.69	0.76	0.48	0.6	0.49	1.0	0.4	0.51	0.35	0.61	0.38	0.2	0.68	0.42	0.46	0.65	0.66	0.61	0.35
Zci_05701.1	0.73	0.82	0.66	0.7	0.71	0.74	0.57	0.43	0.67	0.12	0.86	0.51	0.86	0.95	1.0	0.68	0.71	0.72	0.89
Zci_05705.1	0.57	0.61	0.36	0.31	0.48	0.59	0.43	0.67	0.49	0.4	0.45	0.18	1.0	0.38	0.48	0.5	0.46	0.41	0.48
Zci_05725.1	0.79	0.82	0.43	0.63	0.84	0.78	0.66	0.42	0.45	0.16	0.49	0.77	1.0	0.54	0.78	0.7	0.81	0.76	0.52
Zci_05845.1	0.94	0.73	0.69	0.75	0.94	1.0	0.7	0.46	0.6	0.28	0.47	0.74	0.91	0.54	0.59	0.9	0.7	0.74	0.5
Zci_05854.1	0.7	0.77	0.17	0.26	0.48	0.89	0.2	0.67	0.43	0.39	0.3	0.1	1.0	0.32	0.39	0.53	0.53	0.53	0.38
Zci_05965.1	0.63	0.96	0.71	1.0	0.97	0.91	0.62	0.38	0.45	0.28	0.61	0.8	0.52	0.63	0.95	0.75	0.75	0.82	0.65
Zci_05965.2	0.63	0.96	0.71	1.0	0.97	0.91	0.62	0.38	0.45	0.28	0.61	0.8	0.52	0.63	0.95	0.75	0.75	0.82	0.65
Zci_06062.2	0.19	0.07	0.29	0.1	0.41	0.98	0.09	0.0	0.2	0.12	0.07	0.0	1.0	0.1	0.14	0.0	0.19	0.0	0.03
Zci_06062.3	0.28	0.17	0.35	0.12	0.34	0.58	0.17	0.0	0.17	0.05	0.05	0.0	1.0	0.03	0.13	0.0	0.06	0.0	0.02
Zci_06216.1	0.8	0.69	0.3	0.58	0.68	0.53	0.94	0.11	0.97	0.06	0.44	0.51	1.0	0.56	0.56	0.66	0.56	0.49	0.55
Zci_06738.1	0.82	0.51	0.43	0.42	0.66	0.79	0.51	0.72	0.5	0.37	0.62	0.47	1.0	0.65	0.74	0.66	0.68	0.87	0.6
Zci_06741.2	0.59	0.17	0.13	0.0	1.0	0.24	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.25	0.92	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
Zci_07346.1	0.86	0.66	0.52	0.83	0.71	1.0	0.54	0.3	0.31	0.31	0.65	0.72	0.57	0.66	0.56	0.66	0.64	0.79	0.67
Zci_07601.1	0.88	0.72	0.28	0.37	0.45	0.48	0.35	0.12	0.25	0.05	0.31	0.44	1.0	0.29	0.57	0.29	0.21	0.31	0.32
Zci_07747.1	0.67	0.69	0.41	0.24	0.59	0.64	0.33	0.49	0.29	0.07	0.35	0.28	1.0	0.26	0.46	0.51	0.47	0.54	0.51
Zci_08208.2	0.49	0.64	0.19	0.45	0.17	1.0	0.13	0.08	0.15	0.25	0.17	0.08	0.41	0.37	0.48	0.4	0.3	0.46	0.19
Zci_08450.1	0.83	0.96	0.38	0.56	0.63	0.75	0.79	0.14	0.8	0.1	0.53	0.6	1.0	0.66	0.45	0.8	0.56	0.85	0.57
Zci_08526.1	0.55	0.57	0.39	0.36	0.55	0.59	0.32	0.11	0.31	0.13	0.27	0.41	1.0	0.33	0.38	0.44	0.47	0.54	0.29
Zci_08569.1	0.59	0.65	0.22	0.38	0.34	0.61	0.26	0.26	0.23	0.14	0.31	0.69	1.0	0.39	0.39	0.14	0.39	0.35	0.48
Zci_08724.1	0.8	0.88	0.52	0.63	0.57	0.92	0.76	0.91	0.77	0.34	0.55	0.49	1.0	0.42	0.75	0.7	0.7	0.74	0.48
Zci_08762.1	0.76	0.74	0.6	0.79	0.6	0.61	0.66	0.66	0.5	0.11	0.82	0.63	1.0	0.66	0.89	0.88	0.81	0.71	0.8
Zci_08789.1	0.82	0.88	0.4	0.44	0.6	0.74	0.52	0.66	0.33	0.44	0.44	0.08	1.0	0.5	0.85	0.54	0.44	0.77	0.45
Zci_09113.2	0.16	0.45	0.39	0.89	0.19	0.38	0.2	0.06	0.23	0.06	0.14	0.1	1.0	0.18	0.13	0.11	0.18	0.33	0.49
Zci_09140.1	0.2	1.0	0.13	0.68	0.08	0.6	0.0	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.91	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0
Zci_09279.1	0.51	0.8	0.35	0.73	0.56	1.0	0.47	0.03	0.33	0.2	0.4	0.87	0.33	0.7	0.55	0.56	0.52	0.85	0.4
Zci_09716.2	0.17	0.64	0.02	0.88	0.11	0.22	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19
Zci_10056.1	1.0	0.76	0.37	0.59	0.92	0.75	0.42	0.31	0.53	0.1	0.28	0.81	0.68	0.29	0.37	0.56	0.5	0.4	0.49
Zci_10736.1	0.49	0.55	0.43	0.52	0.63	0.63	0.82	0.46	0.73	0.37	0.51	0.68	1.0	0.83	0.94	0.92	0.82	0.89	0.44
Zci_11817.1	0.8	0.55	0.3	0.42	1.0	0.62	0.59	0.03	0.28	0.03	0.15	0.63	0.87	0.33	0.3	0.27	0.1	0.32	0.09
Zci_12305.1	0.45	0.43	0.28	0.17	0.22	0.67	0.2	0.41	0.11	0.02	0.24	0.02	1.0	0.28	0.31	0.42	0.26	0.4	0.41
Zci_13034.1	0.76	0.88	0.46	0.63	0.53	0.75	0.73	0.52	0.77	0.13	0.66	0.83	1.0	0.73	0.85	0.68	0.69	0.74	0.7
Zci_13597.1	0.66	1.0	0.29	0.55	0.76	0.62	0.15	0.12	0.18	0.13	0.04	0.49	0.98	0.02	0.0	0.22	0.04	0.28	0.1
Zci_13616.1	0.45	0.85	0.17	0.93	0.49	1.0	0.11	0.33	0.11	0.13	0.16	0.07	0.84	0.23	0.16	0.33	0.58	0.29	0.24
Zci_14083.1	0.98	0.64	0.67	0.8	0.7	0.88	0.6	0.69	0.65	0.39	0.76	0.72	1.0	0.73	0.68	0.84	0.99	0.79	0.88
Zci_14265.1	0.68	0.9	0.47	0.65	0.46	0.7	0.42	0.26	0.38	0.13	0.52	0.33	1.0	0.42	0.39	0.44	0.46	0.34	0.41
Zci_14412.2	0.53	1.0	0.79	0.78	0.84	0.76	0.41	0.06	0.2	0.07	0.5	0.52	0.49	0.59	0.82	0.63	0.52	0.7	0.39
Zci_14470.1	0.48	0.42	0.29	0.29	0.58	0.5	0.68	0.42	0.54	0.28	0.5	0.6	0.92	0.69	0.88	0.86	0.73	1.0	0.53
Zci_14701.1	0.77	1.0	0.69	0.82	0.67	0.84	0.61	0.17	0.49	0.03	0.54	0.67	0.76	0.66	0.89	0.39	0.38	0.51	0.64
Zci_14957.1	0.58	0.47	0.66	0.65	0.67	0.88	0.37	0.19	0.41	0.47	0.28	0.36	1.0	0.41	0.37	0.43	0.61	0.35	0.57
Zci_15265.1	0.55	0.48	0.15	0.36	0.62	0.49	0.6	0.12	0.4	0.05	0.41	0.72	1.0	0.58	0.85	0.71	0.64	0.8	0.38
Zci_15365.1	0.18	0.17	0.12	0.28	0.19	0.3	0.84	0.25	0.45	0.19	0.35	0.84	0.95	0.46	0.92	1.0	0.75	0.82	0.43
Zci_15574.1	0.39	0.33	0.08	0.23	0.39	0.27	0.27	0.13	0.15	0.04	0.49	0.45	0.84	0.57	0.85	0.94	0.62	1.0	0.11
Zci_15574.4	0.39	0.33	0.08	0.23	0.39	0.27	0.27	0.13	0.15	0.04	0.49	0.45	0.84	0.57	0.85	0.94	0.62	1.0	0.11
Zci_15574.6	0.39	0.33	0.08	0.23	0.39	0.27	0.27	0.13	0.15	0.04	0.49	0.45	0.84	0.57	0.85	0.94	0.62	1.0	0.11
Zci_15769.1	0.58	0.56	0.1	0.08	0.25	0.34	0.17	0.12	0.13	0.14	0.22	0.75	1.0	0.2	0.44	0.22	0.2	0.28	0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)