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Heatmap: Cluster_164 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.16 0.35 -0.36 -0.18 0.54 0.66 0.0 -0.35 0.11 -2.43 -0.46 -1.28 -0.06 -0.18 -0.19 0.58 0.47 0.38 -0.25
0.21 0.11 -0.12 -0.02 0.1 0.46 0.09 0.08 -0.15 -2.48 -0.08 -0.96 0.14 -0.4 -0.16 0.76 0.51 0.23 -0.49
-0.15 0.16 -0.13 -0.05 -0.32 0.0 0.12 0.18 0.06 -2.25 0.04 -0.35 0.26 -0.02 0.01 0.53 0.35 0.43 -0.41
-0.57 -0.22 -0.47 -0.63 -0.62 -0.48 0.07 0.28 0.06 -1.57 0.04 -0.05 0.39 0.17 0.26 0.77 0.53 0.44 -0.07
0.43 0.56 -0.1 -0.01 -0.04 0.49 0.03 0.19 0.01 -2.09 -0.4 -0.07 0.12 -0.38 -0.29 0.36 0.07 0.14 -0.64
0.09 0.51 -0.39 0.13 -0.17 0.54 -0.11 0.03 0.26 -0.71 -0.4 -0.02 -0.02 -0.3 -0.48 0.27 0.29 0.08 -0.32
0.27 0.04 0.26 0.38 0.41 1.03 -0.84 0.29 -1.75 -1.59 -0.18 -0.4 -0.43 -0.18 0.01 0.31 0.02 0.01 -0.08
0.25 0.08 -1.13 -0.84 0.08 0.98 -0.22 -0.02 -0.57 -3.77 -0.51 -0.5 0.2 -0.25 0.09 0.83 0.4 0.67 -0.04
0.48 0.34 -0.44 0.09 0.27 0.04 0.19 0.45 0.16 -2.96 -0.12 -2.55 0.09 -0.38 -0.18 0.48 0.33 0.29 -0.19
0.09 -0.13 -0.65 -0.14 0.19 0.58 0.18 -0.13 -0.33 -1.54 -0.38 -0.86 0.1 -0.3 0.13 0.69 0.46 0.53 -0.12
-0.08 0.09 0.25 0.42 0.21 0.59 0.02 -0.02 -0.59 -1.1 -0.21 -0.59 -0.97 -0.09 0.18 0.45 0.17 0.26 -0.22
0.34 0.6 -0.53 -0.31 0.02 0.47 -0.16 0.36 0.13 -0.51 -0.59 -0.56 -0.37 -0.09 -0.17 0.32 0.38 0.14 -0.42
0.02 0.32 -0.67 0.06 0.65 0.08 -0.02 -0.14 0.38 -2.19 -0.44 -1.17 0.59 -0.6 -0.16 0.79 0.74 -0.25 -0.85
0.12 0.22 -0.02 0.26 -0.07 0.59 -0.36 -0.29 -0.55 -1.45 -0.1 -0.84 0.31 -0.07 0.07 0.39 0.16 0.43 -0.08
0.35 0.2 -0.02 -0.09 0.04 0.04 -0.14 0.36 0.11 -0.98 -0.21 -0.37 0.42 -0.56 -0.11 0.43 0.42 -0.21 -0.55
0.04 0.17 0.34 -0.09 0.01 0.31 0.03 0.01 -0.23 -0.66 -0.2 -1.6 -0.01 -0.68 -0.1 0.75 0.4 0.26 -0.11
0.1 0.64 -0.42 -0.01 0.22 0.32 0.05 -0.64 0.44 -2.49 -0.27 0.03 0.26 -0.52 0.03 0.31 0.15 0.12 -0.35
0.35 0.21 -0.31 -0.14 0.33 0.61 -0.21 -0.94 -0.3 -2.37 -0.19 -1.12 0.15 -0.18 0.04 0.77 0.4 0.4 -0.02
0.49 0.44 0.21 0.37 0.25 0.54 -0.39 -0.1 -0.25 -1.69 -0.1 -1.47 -0.03 -0.48 -0.26 0.6 0.33 0.08 -0.63
-0.05 -0.4 0.12 0.07 0.31 0.79 0.14 0.29 -0.56 -3.68 0.15 -0.39 -1.4 0.17 0.19 0.37 0.03 0.19 0.17
0.42 0.46 -0.18 0.28 0.11 0.19 0.31 -0.13 0.2 -1.06 -0.53 0.11 0.11 -0.49 -0.1 0.21 -0.02 -0.09 -0.71
-0.13 0.14 0.4 0.47 0.5 0.74 -0.24 -0.13 -1.46 -4.42 0.02 -2.55 -0.65 0.27 0.51 0.41 0.02 0.46 -0.23
0.42 0.19 -0.79 -0.16 0.25 1.05 0.17 0.2 0.09 -2.85 -0.7 0.42 0.28 -0.65 -0.5 0.39 0.03 -0.15 -0.83
0.12 0.19 -0.11 0.21 0.18 0.63 0.04 0.23 -0.57 -2.14 -0.13 -0.19 -0.12 -0.34 0.1 0.27 0.03 0.25 -0.12
0.22 0.37 -0.24 -0.53 0.46 0.58 -0.69 -0.35 -0.82 -1.15 -0.07 -3.07 0.23 -0.26 0.14 0.58 0.3 0.6 0.36
0.43 0.58 -0.56 -0.11 0.05 0.36 -0.15 -0.87 0.47 -0.92 -0.5 -0.8 0.6 -0.38 -0.22 0.56 0.34 0.24 -0.95
0.34 0.34 -0.66 -0.02 0.23 0.59 0.16 -0.65 0.58 -3.41 -0.27 -0.75 0.15 -0.68 -0.35 0.79 0.38 0.2 -0.49
0.7 0.68 -0.55 -0.63 0.19 0.78 -0.21 0.17 -0.06 -0.34 -0.53 -1.12 -0.26 -0.4 -0.08 0.36 0.15 0.16 -0.63
0.36 0.13 -0.27 0.08 0.22 0.47 0.31 -0.56 0.02 -2.52 -0.36 0.37 0.51 -0.72 -0.41 0.54 0.19 -0.04 -0.65
-0.01 0.28 -0.34 -0.13 0.52 0.59 -0.01 -1.3 0.17 -3.09 -0.48 -0.24 0.19 -0.18 0.05 0.66 0.21 0.64 -0.77
-0.21 0.26 -0.46 -0.06 0.26 0.63 0.06 -0.7 0.25 -1.37 -0.28 -0.15 0.47 -0.35 -0.07 0.49 0.07 0.2 -0.28
0.0 0.1 -0.35 -0.08 0.23 0.67 0.13 -0.48 0.01 -1.86 -0.46 -0.62 0.39 -0.04 -0.16 0.53 0.24 0.34 -0.16
0.13 0.83 -0.36 -0.05 0.78 0.61 -0.05 -0.54 0.29 -0.97 -0.38 -5.2 -0.34 -0.44 -0.48 0.7 0.55 0.06 -0.76
-0.06 -0.15 -0.5 -0.36 0.23 0.36 0.18 0.25 0.18 -1.32 0.09 -2.33 0.1 -0.21 0.05 0.63 0.61 0.28 -0.3
-0.22 -0.32 0.19 0.14 -0.19 0.98 -0.13 -0.86 -0.28 -0.5 0.46 -2.41 -1.94 0.01 0.5 0.42 0.15 0.47 0.23
-0.22 -0.32 0.19 0.14 -0.19 0.98 -0.13 -0.86 -0.28 -0.5 0.46 -2.41 -1.94 0.01 0.5 0.42 0.15 0.47 0.23
-0.44 -0.03 -0.43 0.06 0.46 0.21 0.08 -1.18 -0.19 -2.62 -0.11 -0.24 0.25 0.04 -0.13 0.83 0.58 0.32 -0.0
0.33 0.51 -0.0 -0.22 0.27 0.52 -0.13 -0.31 0.01 -2.64 -0.33 -0.15 0.21 -0.46 -0.15 0.4 0.04 0.22 -0.1
0.65 0.56 0.25 0.47 -0.21 -0.08 -0.41 -0.53 -0.55 -1.13 -0.43 0.0 0.69 -0.56 -0.61 0.49 0.24 -0.06 -0.43
0.25 0.13 0.01 0.34 0.23 0.81 0.18 -0.35 -0.65 -2.5 -0.31 -1.06 -0.04 -0.15 0.02 0.64 0.27 0.15 -0.44
0.41 0.49 -0.38 0.1 -0.01 0.56 -0.09 0.47 -0.01 -0.28 -0.4 -0.82 0.03 -0.45 -0.08 0.28 0.14 -0.14 -0.83
0.46 -0.2 -0.38 -0.12 0.42 0.53 -0.28 -2.22 0.2 -2.67 0.08 0.44 0.48 -0.33 0.11 0.49 0.15 -0.04 -0.39
-0.98 -1.25 -0.28 0.05 0.31 0.1 0.17 -3.96 -0.94 -2.65 -0.25 -0.19 -0.1 0.35 -0.1 1.21 0.94 0.82 0.23
0.34 0.39 -0.64 -0.01 0.19 0.63 0.26 0.33 0.23 -1.47 -0.27 -2.36 0.06 -0.5 -0.46 0.52 0.41 -0.06 -0.16
0.11 0.28 -0.33 0.19 0.26 0.69 0.01 0.25 -0.22 -1.06 -0.53 -0.24 0.33 -0.42 -0.11 0.11 -0.02 0.19 -0.43
0.01 0.15 -0.49 -0.33 0.1 0.45 0.02 -1.03 0.06 -2.09 -0.16 -0.3 0.14 -0.04 0.1 0.67 0.49 0.55 -0.25
0.15 0.68 -0.55 -0.19 0.29 0.1 -0.21 -0.92 0.27 -2.34 -0.47 -0.06 0.26 -0.33 -0.22 0.75 0.63 0.21 -0.52
0.33 0.46 -0.9 -0.42 0.71 0.84 -0.97 -0.08 -0.96 -1.61 -0.31 -2.71 -0.54 -0.33 -0.28 0.87 0.71 0.61 0.14
0.34 0.54 0.04 -0.14 0.21 0.42 -0.14 -0.0 -0.03 -1.73 -0.38 0.22 0.02 -0.55 -0.4 0.31 -0.0 0.31 -0.34
0.05 0.18 0.06 0.67 -0.12 0.86 0.05 0.22 -0.43 -2.15 -0.3 -1.23 -0.45 -0.39 0.1 0.38 0.28 0.24 -0.31
0.05 0.14 -0.35 0.1 0.01 0.52 0.45 -0.63 0.26 -2.43 -0.15 -1.23 -0.02 -0.1 0.08 0.51 0.22 0.02 0.33
0.37 0.27 -0.34 0.24 0.12 0.22 -0.11 -0.48 -0.31 -0.9 -0.31 0.36 0.5 -0.4 -0.51 0.37 0.11 0.05 -0.13
0.18 -0.13 -0.09 0.11 0.04 0.67 0.38 -0.64 -0.0 -1.54 -0.06 -1.37 -0.6 -0.14 0.16 0.51 0.08 0.49 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.