1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
- - - - - - 1.51 - 2.57 - -0.03 - - 1.9 - 1.87 - - 0.88
- - - -0.85 1.49 - 1.86 0.07 2.09 0.26 - - - - - 2.09 0.03 -2.33 -
- - - - - 3.1 - - 2.99 - - - - - - - 1.31 - -
- - - - - - - - 3.63 - - - - - - - 2.73 - -
- - - - - - - - 2.86 - 1.54 - - 2.86 - -0.72 - -0.09 -
- - - -0.85 1.49 - 1.86 0.07 2.09 0.26 - - - - - 2.09 0.03 -2.33 -
- - - - - - - - 2.74 - 0.04 - - - - 3.16 1.2 - -
- - - - - - - - - - - - - 1.95 - 1.35 2.61 2.17 1.01
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.66 - - 2.67
- - - - - - 1.65 - 0.67 1.35 - -1.18 - -2.48 - 2.94 - 1.78 -
- - - - - - - - 3.7 - - - 1.34 0.61 - 0.34 - -0.54 -
- - - - - - - - - - -0.45 - - - - 3.18 1.58 2.63 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - 2.28 2.59 - - 1.45 - 0.59 - 1.03 - - - 0.89 - -
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.04 - - - 1.34 - - - - - -
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - 1.04 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - -0.06 - 3.37 2.02 1.87 -
- - - - - - - - 2.98 1.46 0.33 - - -0.46 -0.74 - 1.69 1.13 -1.67
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - 3.24 1.31 1.0 2.33 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.58 1.56 - 2.04
- - 0.28 - - -0.93 - - 2.43 - -1.23 - 1.01 0.8 -0.19 -0.17 -0.78 1.63 1.18
- - - - - 2.79 - - 3.42 - - - - -0.88 - - -0.33 - -
- 0.89 -0.13 - - -0.38 - - - 0.76 0.02 -0.23 -1.48 0.44 0.2 2.27 -0.37 1.59 -1.17
- - - - - - - - - - - - - 2.6 - 3.69 - - -
- - - - - - - - 2.97 - - - - 0.98 - 1.25 - 2.77 -
- - - - - - - - - - -0.07 - - 0.86 1.41 3.48 - 1.27 -
- - - - - - - - 4.01 - 0.63 - - 0.37 - - - - -
- - - - - - - - - - -0.11 - - 0.55 - 3.8 - 1.43 -
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.22 -1.42 - -
- - - - - - - - - - - - - 2.05 - 2.67 1.42 2.54 -
- - - - - - - - 4.02 - - - - - - 1.44 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - 2.42 -
- - - - - 2.53 - - 3.22 - 1.98 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.79 2.37 - -
- - - -0.85 1.49 - 1.86 0.07 2.09 0.26 - - - - - 2.09 0.03 -2.33 -
- - - - 2.02 - 1.86 0.69 2.35 1.65 -1.59 - - -3.25 - - - -0.46 -1.66
- - - - - - - -0.1 - - - - - -2.01 0.65 3.06 1.06 2.54 -
- - - -0.85 1.49 - 1.86 0.07 2.09 0.26 - - - - - 2.09 0.03 -2.33 -
- - - - - - - - - - - - - 2.09 - 3.88 - - -
- - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - 2.93
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- -2.36 - - - - 1.51 - 3.02 - -0.08 - 0.15 0.01 1.14 -0.38 - 0.49 -1.31
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - 3.89 - - 2.05 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.48 - 3.66 1.84 - -
-0.06 -1.7 - - 1.55 - -0.42 0.42 0.39 -18.58 -2.58 - 0.71 0.89 - 1.66 0.86 1.37 -2.3
- - 0.89 - - 1.7 - - 0.77 - -0.41 -0.26 - -0.12 - 2.67 0.61 - 0.83
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.15 1.84 2.94 - 2.47 -
- - - - - - - - - - 1.74 - - - - 3.63 1.71 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - 0.75 - - 3.02 - - - - 1.31 0.7 -0.03 0.52 1.43 -
- - - - 3.1 1.79 - - 2.79 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.76 - - - - - - - 2.46 - -
- - - - - - - 1.83 3.15 - -0.41 - - -0.46 - 0.47 0.41 1.13 -2.36
- - - - - - - - - - 1.96 - - - - 3.92 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - 3.73 - - - - 1.19 - - - 1.8 -
- - - - - - -0.37 -0.51 -0.19 -0.17 - - -1.59 -3.08 - 3.53 1.43 0.03 -
- - - - - 2.64 - - - - - - - - - 3.68 - - -
- - - - - - - - 3.93 - 0.66 - - - - - - 1.11 -
- - - - 1.61 - - - 2.95 - - - - - - - -0.49 - 2.91
- - - - - - - - - - - - - - 1.38 2.9 - 2.73 1.2
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - -0.7 3.29 1.53 - - 1.96 -0.4 - - - - 0.09
- - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - -
- - - - - - - - - - 1.5 - - 2.19 - 3.54 - - -
- 0.27 - - - - - - -1.69 0.53 -1.55 -0.83 -0.54 0.68 - 2.69 0.26 1.89 0.58
- - - - - - - - - - - - - 1.74 - 3.72 0.24 - 0.4
- - - - - - - - - - - - - 1.74 - 3.72 0.24 - 0.4
- - - - - - - - - - 0.13 - - - 0.71 3.2 0.54 2.5 -
-11.28 -10.37 -14.25 -9.4 -12.89 -11.4 -7.76 - 1.53 - -0.99 -5.2 - - 0.35 3.29 1.43 0.9 -
-11.25 -8.16 - -7.43 - -10.99 -5.3 - 2.78 - -1.37 -6.79 - - -0.38 3.25 -0.59 -0.38 -
- - - -19.89 - - 0.86 0.85 3.0 0.11 -1.89 -0.01 0.73 -0.87 -0.49 - -0.21 -0.56 -0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.