1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.8 1.63 1.23 2.37 0.17 2.17 0.0 0.0 0.42 0.16 0.08 0.46 5.23 0.25 0.26 0.84 0.84 0.12 0.08
0.8 1.63 1.23 2.37 0.17 2.17 0.0 0.0 0.42 0.16 0.08 0.46 5.23 0.25 0.26 0.84 0.84 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.61 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
2.0 5.15 0.1 0.08 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 2.28 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
1.02 3.99 0.51 1.41 1.16 0.12 0.2 0.0 0.5 0.0 0.03 0.47 4.2 0.14 0.39 0.26 0.04 0.27 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
2.03 8.64 0.0 0.0 0.0 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 3.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 1.96 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.62 0.03 0.11 0.03 0.21 0.06 0.02
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.95 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0
1.33 1.31 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.13 0.05 0.0 0.05 0.88 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01
0.0 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.63 0.0 8.16 0.13 0.49 0.55 0.0 0.14 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.52 10.8 3.35 5.65 2.38 5.55 0.73 0.7 2.98 6.02 0.7 0.59 11.01 0.75 2.17 0.38 0.66 0.69 0.45
5.12 13.31 0.63 0.54 0.66 0.91 0.0 0.0 0.75 1.6 0.12 1.69 9.66 0.0 0.59 0.05 0.02 0.21 0.06
0.0 1.5 0.36 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.41 3.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
15.38 25.09 1.26 0.0 0.75 3.48 0.37 0.0 1.14 0.0 0.0 0.21 18.92 0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 0.0
8.4 8.58 0.54 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.96 0.39 0.07 0.55 5.73 0.18 0.78 0.04 0.03 0.0 0.0
0.85 2.53 0.17 0.65 0.07 0.51 0.0 0.07 0.23 0.08 0.05 0.24 0.76 0.01 0.0 0.02 0.03 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.98 17.58 1.86 3.61 2.05 5.47 0.06 0.15 1.75 0.63 0.09 0.14 7.99 0.1 0.19 0.18 0.0 0.36 0.07
35.36 90.44 25.55 10.12 31.63 24.18 10.56 9.67 9.02 1.61 12.96 1.71 23.61 8.64 22.25 20.15 13.75 10.82 16.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 3.62 0.0 0.0 0.5 0.81 0.48 0.24
0.46 0.56 0.34 0.24 0.13 0.49 0.05 0.0 0.48 0.22 0.02 0.01 1.35 0.05 0.14 0.02 0.0 0.14 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.48 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.48 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.8 0.09 0.18 0.0 0.08 0.21 0.0 0.15 0.0 0.43 0.04 1.16 0.19 0.06 0.11 0.08 0.0 0.06
6.31 9.32 1.17 2.03 0.3 0.0 0.0 0.0 0.3 0.27 0.06 11.85 29.12 0.3 2.23 0.09 0.14 0.0 0.7
43.08 104.82 9.09 2.81 0.0 0.36 0.36 0.0 4.14 2.29 1.46 8.61 162.22 0.96 1.27 0.0 0.08 0.0 1.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.23 2.26 0.31 0.32 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 3.43 0.03 0.15 0.09 0.11 0.06 0.02
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.09 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 3.0 0.82 0.0 0.46 0.0 1.29 0.0
0.41 2.24 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.12 0.28 0.0 1.4 0.3 0.46 0.15 0.05 0.33 0.06
4.61 8.27 0.2 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.34 3.11 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08
12.78 24.1 7.03 7.07 8.0 11.4 5.69 9.97 8.06 2.37 5.32 7.69 12.02 5.31 9.88 11.37 9.12 9.44 5.54
4.24 3.51 1.56 1.29 1.86 1.98 0.31 0.12 0.31 0.39 0.34 0.12 1.63 0.51 0.27 0.42 0.34 0.64 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
11.65 13.82 1.52 1.64 0.47 0.09 0.0 0.12 0.68 0.98 0.45 1.41 23.31 0.12 0.26 0.18 0.03 0.03 0.2
10.55 7.54 0.16 0.2 1.02 3.66 0.22 0.0 1.66 4.08 0.26 1.46 9.08 0.25 0.84 0.25 0.59 0.15 0.22
10.62 28.75 0.92 0.18 2.11 0.0 0.41 0.17 0.47 0.88 0.58 0.17 27.09 0.08 1.31 0.32 0.2 0.07 0.45
6.01 7.9 0.24 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.45 0.79 0.32 0.25 13.5 0.17 0.2 0.25 0.14 0.34 0.2
3.25 13.74 2.11 2.54 1.93 0.0 1.08 0.0 1.65 1.15 0.41 0.94 31.62 0.35 1.01 1.07 0.51 0.51 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.05 0.17 0.1 0.0 0.12 0.0 0.13 0.07 0.0 0.02 0.53 0.0 0.06 0.04 0.08 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.03 5.53 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.08 2.97 0.0 0.54 0.0 0.22 0.2 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.44 0.07 0.0 1.75 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.02
2.37 3.54 0.04 0.21 0.27 0.0 0.05 0.04 0.23 0.0 0.03 0.09 2.6 0.04 0.43 0.0 0.13 0.15 0.04
0.2 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.15 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.75 0.0 0.0 0.05 0.05 0.04 0.05
0.0 2.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.03 0.06 4.4 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06
2.31 3.7 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.46 0.02 0.0 0.0 0.05 0.16 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.36 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.18 0.06 0.77 0.07 0.02 0.11 0.07 0.2 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 1.08 0.12 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.01 0.02 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.65 0.01 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.67 0.18 0.0 0.15 0.26 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.2 0.29 0.21 6.08 0.04 0.06 0.14 0.56 0.06 0.55
15.31 42.54 1.73 0.33 0.15 0.0 0.21 0.36 1.9 1.75 0.57 3.71 61.34 0.61 1.13 0.16 0.19 0.46 0.75

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)