Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Diurnal Dark 2h
Diurnal Dark 6h
Diurnal Light 2h
Diurnal Light 6h
Diurnal Light 10h
Diurnal Light 14h
20°C Liquid
4°C Liquid
20°C Desiccation
4°C Desiccation
20°C plate
CadmiumCl 250 µM, 24h
Dark, 24h
HL (900 µmol photons m-2 s-1, 1 h)
Cold (4°C )+ HL: 900 µmol photons m-2 s-1, 1h
Mannitol 300 mM,24h
NaCl 150 mM, 24h
UV (exactly 385 nm, 1400 µW/cm2, 1h)
pH = 9, 24h
0.0 0.19 0.07 0.7 0.19 0.5 0.92 0.07 0.65 0.0 0.94 0.28 5.27 1.25 0.87 2.75 2.53 2.14 1.33
0.0 0.0 0.2 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.78 0.19 1.32 0.65 0.19 1.3 0.43 0.87 0.84
0.0 0.0 0.2 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.78 0.19 1.32 0.65 0.19 1.3 0.43 0.87 0.84
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.15 0.19 0.0 0.46 0.05 0.66 0.63 0.34 0.56 0.49 0.41 0.84
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.15 0.19 0.0 0.46 0.05 0.66 0.63 0.34 0.56 0.49 0.41 0.84
0.13 0.1 1.46 0.75 1.37 0.61 0.02 0.0 0.12 0.0 1.29 1.49 4.92 1.26 0.93 8.04 5.73 1.87 5.4
0.0 1.11 0.29 0.68 0.62 1.01 0.0 0.1 0.34 0.44 0.01 0.15 4.49 0.03 0.01 3.66 1.68 0.01 0.02
0.73 1.69 1.47 1.36 1.28 1.43 1.49 1.49 0.86 0.89 3.7 2.22 4.92 3.21 4.4 5.22 5.9 1.99 3.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.28 1.26 0.47 2.52 1.66 1.92 1.64 1.91 1.24 1.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.04 0.0 4.85 2.68 1.24 3.32 0.79 2.73 1.0
0.0 0.75 0.73 0.1 0.66 1.54 3.7 1.99 2.19 1.14 4.8 2.72 5.33 5.46 4.0 6.26 5.8 7.44 8.69
52.26 63.78 110.61 93.22 81.89 79.25 38.84 46.79 99.34 46.42 135.17 49.25 225.41 65.36 82.12 150.35 156.16 81.42 139.99
0.23 0.37 0.0 0.03 0.81 0.24 0.0 0.0 0.0 0.02 0.61 1.56 1.89 1.06 0.96 1.6 1.02 1.81 1.5
0.0 1.27 0.31 0.56 1.41 1.55 1.42 0.02 0.75 0.54 0.44 0.28 2.65 1.76 1.32 0.85 1.17 1.73 1.57
1.77 3.8 0.93 2.53 0.29 5.56 2.43 1.83 2.82 1.5 2.02 0.66 5.87 5.06 2.76 2.47 2.83 5.54 3.69
0.46 0.0 0.22 0.19 0.27 0.93 0.24 0.29 0.37 0.09 0.14 0.04 1.48 0.31 0.34 0.7 0.5 0.75 0.26
0.0 1.4 0.18 1.13 0.21 0.45 0.44 1.95 1.6 2.05 5.67 0.91 11.3 5.9 4.32 6.09 8.86 10.57 0.58
0.14 0.42 0.43 0.72 0.33 0.56 0.14 0.1 0.03 0.17 0.92 0.02 2.18 0.87 1.03 1.2 1.6 1.41 0.76
0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.84 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.95
2.09 0.0 0.24 0.0 0.85 0.31 0.25 0.22 0.46 0.41 1.63 0.0 5.09 2.89 1.4 2.8 2.0 2.21 2.02
39.88 27.83 57.49 49.82 50.69 51.52 9.97 34.44 20.87 10.95 50.71 23.4 87.99 27.96 57.04 75.04 61.38 30.52 47.64
3.83 3.15 0.16 0.52 0.0 0.07 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.9 10.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01
0.72 0.76 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 1.31 0.02 0.0 0.12 0.0 0.13 0.13
4.27 2.59 1.66 1.24 1.06 2.32 1.14 0.69 0.23 0.27 2.53 0.32 3.6 2.64 2.96 1.86 2.77 0.99 2.28
0.24 0.27 0.36 0.49 0.0 0.47 0.09 0.4 0.78 0.16 2.15 0.55 2.9 1.91 2.75 2.45 2.14 1.46 2.86
0.24 0.27 0.36 0.49 0.0 0.47 0.09 0.4 0.78 0.16 2.15 0.55 2.9 1.91 2.75 2.45 2.14 1.46 2.86
0.24 0.27 0.36 0.49 0.0 0.47 0.09 0.4 0.78 0.16 2.15 0.55 2.9 1.91 2.75 2.45 2.14 1.46 2.86
0.14 0.0 0.05 0.06 0.05 0.17 0.09 0.04 0.06 0.02 0.47 0.01 0.42 0.62 0.18 0.83 0.41 0.78 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.19 0.0 0.35 1.79 0.0 3.31 2.55 0.07 6.42 1.92 2.14 1.66
9.65 10.28 8.91 10.6 7.63 9.51 5.47 7.5 2.15 0.66 10.13 7.78 15.74 8.76 7.86 19.3 27.01 7.71 7.64
0.0 1.83 0.0 0.0 3.6 7.45 2.04 0.46 1.17 1.11 0.11 2.21 10.16 1.18 0.97 0.14 1.06 2.93 0.69
0.0 0.26 0.52 0.07 0.0 0.0 0.37 0.0 0.5 0.09 2.4 0.0 2.22 3.48 0.65 3.73 1.34 4.68 6.06
6.52 0.63 0.0 5.27 2.2 2.07 0.58 0.0 0.0 0.33 5.11 1.64 12.82 5.51 5.3 9.19 10.43 5.44 5.51
224.69 225.13 334.05 309.75 305.41 305.25 256.63 202.73 135.51 155.79 257.56 94.04 784.52 131.47 244.86 875.56 494.51 326.31 357.25
1.57 1.05 0.0 0.25 1.34 0.55 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 2.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
2.23 0.62 2.35 4.56 2.07 2.38 3.0 2.78 2.08 0.73 9.56 7.13 9.66 7.7 7.93 11.01 14.12 9.46 8.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.66 0.41 0.08 0.66 0.46 0.48 0.62
0.03 0.7 0.13 0.34 0.41 0.37 0.42 0.86 0.36 0.55 1.94 0.99 6.79 1.02 1.8 5.06 4.89 1.38 1.54
0.76 0.17 1.39 1.25 1.84 3.52 1.98 1.04 0.63 0.3 4.8 1.11 4.71 5.24 3.59 6.54 5.22 6.19 7.17
2.95 0.66 0.5 0.0 1.3 3.3 0.58 1.39 0.68 0.15 1.97 0.05 4.23 2.0 3.03 2.31 1.56 3.36 1.57
0.22 0.0 0.0 0.06 0.12 0.21 0.17 0.07 0.1 0.18 0.33 0.3 0.61 0.19 0.68 0.61 0.36 0.14 0.41
3.01 3.75 2.47 5.5 6.08 7.09 1.87 2.44 1.89 0.65 5.44 2.55 7.9 5.27 6.24 8.28 7.63 6.25 4.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.36 0.0 0.43 0.02 0.16 0.86 0.53 0.25 0.66
11.91 17.67 15.01 10.44 8.25 11.69 10.04 9.76 8.6 9.51 12.89 0.35 26.33 13.89 18.52 8.29 7.9 17.25 21.53
0.38 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.11 0.17 0.0 0.04 0.65 0.08 0.23 0.33 0.02 0.24 0.12
0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.06 0.0 0.0 1.01 0.04 0.0 0.11 0.0 0.24 0.17
1.12 0.46 0.66 0.39 0.32 0.0 0.08 0.03 0.08 0.1 0.65 2.77 1.87 0.97 0.66 0.81 0.01 0.49 2.73
0.37 1.66 1.82 1.06 3.08 2.85 0.55 0.55 0.59 1.5 2.18 0.95 9.27 1.4 1.73 9.06 7.61 4.35 2.36
0.12 0.0 0.27 0.15 0.0 0.31 0.65 0.26 0.31 0.21 0.2 0.5 1.61 1.02 0.51 1.26 1.63 0.41 0.27
2.93 1.82 0.66 2.31 1.6 2.77 0.98 2.42 2.08 0.86 3.22 3.72 4.51 1.55 2.28 7.79 8.01 3.17 2.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.56 1.3 0.82 1.68 1.24 1.49 0.41 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 4.24 2.53 8.21 5.87 2.12 6.11 4.29 3.43 5.1
0.02 0.0 0.0 0.0 0.29 0.14 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.59
172.91 232.25 161.93 216.76 147.68 147.42 140.09 145.3 165.6 45.89 224.69 227.24 304.85 186.74 235.42 348.66 402.99 275.58 131.37
1.18 2.45 0.89 1.17 2.12 2.41 0.28 0.6 0.39 1.18 0.99 0.22 9.31 0.65 1.31 6.14 5.91 1.52 0.89
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.15 0.19 0.0 0.46 0.05 0.66 0.63 0.34 0.56 0.49 0.41 0.84
0.96 0.0 0.67 0.52 1.78 1.07 1.48 0.68 0.13 0.0 1.5 0.02 4.26 1.67 1.9 3.01 3.39 2.16 2.23
241.75 280.17 313.67 321.17 373.23 555.28 245.36 96.7 312.94 42.74 792.84 93.99 2871.73 815.21 568.47 2909.71 2046.02 827.93 1058.59
1.19 4.12 1.28 0.65 0.53 0.95 0.51 0.04 0.13 0.28 2.35 0.0 3.23 1.06 2.55 2.0 2.1 2.04 3.98
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.15 0.19 0.0 0.46 0.05 0.66 0.63 0.34 0.56 0.49 0.41 0.84
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.15 0.19 0.0 0.46 0.05 0.66 0.63 0.34 0.56 0.49 0.41 0.84
1.6 1.39 1.02 1.17 1.65 2.54 1.32 1.39 0.66 0.24 1.49 1.84 2.87 1.76 1.68 3.85 2.98 2.22 1.34
2.16 4.06 9.33 1.17 3.04 4.65 0.0 1.34 1.59 0.31 3.83 19.82 12.31 4.81 2.28 10.2 8.43 10.08 14.31
0.62 0.0 0.0 0.0 0.82 0.18 0.8 0.11 0.14 0.65 0.49 0.0 1.36 0.85 1.42 0.86 0.69 1.05 0.83
1.3 1.9 0.86 0.95 2.65 2.82 0.13 0.74 1.36 0.98 2.0 0.84 5.68 1.92 1.06 6.93 4.46 2.15 1.19
0.0 0.31 0.19 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 1.74 1.54 0.77 1.03 0.76 1.89 0.55 0.99
0.0 0.0 0.0 0.06 0.39 0.0 0.02 0.0 0.69 0.09 0.92 1.72 1.19 0.23 0.0 0.08 1.47 0.88 2.08
0.54 0.0 0.29 0.03 0.2 0.12 0.0 0.06 0.08 0.0 0.35 0.11 1.15 0.34 0.34 1.27 0.68 0.37 0.66
0.55 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.05 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.23 0.13 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.0 0.26 1.02 1.6 1.61 1.36 0.98 1.22 1.53 0.56 2.24
0.0 1.5 0.06 0.0 0.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 2.44 0.19 0.78 2.75 1.91 0.01 0.04
0.11 0.19 0.06 0.11 0.07 0.02 0.04 0.09 0.17 0.05 0.44 0.44 0.82 0.55 0.56 0.43 0.59 0.64 0.15
0.11 0.19 0.06 0.11 0.07 0.02 0.04 0.09 0.17 0.05 0.44 0.44 0.82 0.55 0.56 0.43 0.59 0.64 0.44
1.02 1.91 2.16 2.38 0.73 2.27 2.68 1.22 2.41 0.55 2.82 0.41 6.56 2.91 3.67 3.27 4.39 3.28 2.22
1.31 1.91 0.93 0.82 0.8 1.49 0.95 1.16 0.72 0.34 0.73 0.17 5.0 0.38 0.59 4.01 2.98 2.35 0.57
0.0 1.51 0.0 0.0 0.06 0.47 0.0 0.0 1.85 0.15 0.0 0.65 0.95 0.0 0.0 1.13 0.54 1.96 0.06
3.42 7.27 3.1 3.44 3.18 5.56 0.4 0.38 0.23 0.82 4.01 0.06 8.27 2.8 7.73 6.4 6.18 3.0 2.91
0.34 0.0 0.0 0.48 1.58 0.97 1.15 0.4 0.47 0.75 1.08 0.0 2.44 0.8 0.76 0.4 0.87 1.24 1.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.46 0.2 0.1 0.16 0.21 0.18 0.19
5.48 4.87 3.13 2.06 2.63 8.34 3.03 3.42 5.16 5.91 6.26 2.72 19.26 6.09 7.62 13.45 11.74 9.04 4.84
2.62 3.1 4.33 3.32 1.6 2.48 3.39 0.96 3.72 0.15 7.19 3.85 9.99 7.26 8.77 7.19 8.68 6.91 8.3
1.35 0.42 0.36 0.0 0.86 0.67 2.2 0.45 0.0 2.51 3.25 2.75 4.51 2.41 2.83 5.36 7.88 2.52 5.59
0.89 5.81 0.0 2.1 0.89 5.57 3.82 0.36 8.57 2.15 2.5 1.45 7.82 2.59 2.25 4.61 2.04 5.65 3.97
0.24 0.16 0.15 0.08 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.58 1.92 0.34 0.45 0.68 0.83 1.13 0.86
6.11 6.5 2.51 6.07 7.79 11.49 3.71 3.54 4.06 1.58 11.22 3.51 12.05 12.34 13.07 13.34 13.02 14.49 10.56
12.22 1.84 0.88 1.13 5.77 10.01 1.8 1.05 2.23 3.33 16.53 1.53 21.5 14.4 20.75 21.0 17.15 7.99 11.49
0.0 1.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.73 2.57 0.0 19.84 3.11 2.63 20.49 13.94 3.4 1.81
0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.34 0.02 0.0 0.09 2.76 13.12 0.0 18.33 16.05 6.54 10.95 28.04 3.17 23.04
0.3 0.32 0.33 0.3 0.68 0.5 0.11 0.05 0.19 0.45 0.59 0.1 1.57 0.72 0.7 0.86 1.22 1.19 0.78

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)